Кишечная инфекция инкубационный период: 24.07.2018 Кишечные инфекции

Содержание

Кишечная инфекция — симптомы и лечение острой кишечной инфекции

Острой кишечной инфекцией (ОКИ) каждый год заболевают более полумиллиарда людей в мире. Это группа заболеваний, объединенных на основе общего признака — локализации возбудителя в кишечнике. Наблюдается с одинаковой частотой у детей и взрослых.

Этиология ОКИ

Этиология кишечных инфекций связана с попаданием в организм возбудителя болезни. Выделяют 3 основных пути, по которым они поступают в организм:

  • через пищу — обычно через продукты питания, которые не прошли достаточную гигиеническую и термическую обработку;
  • через воду — симптомы и этиология кишечных заболеваний при заражении через воду возникают при употреблении некачественной воды;
  • при бытовом контакте — через различные предметы или грязные руки.

Бактериальные ОКИ часто вызваны бактериями типа сальмонелл, кишечной палочки, а вирусные — попаданием в организм ротавирусов, энтеровирусов и т. п. Тяжелые клинические симптомы возникают при амебиазе и лямблиозе, которые относятся к сравнительно редким причинам.

Симптомы

Симптомы кишечной инфекции у взрослых и детей зависят от разновидности возбудителя. Однако есть общие признаки, указывающие на наличие заболевания: боли в животе, слабость, отсутствие аппетита, рвота, жидкий стул.

В остальном в зависимости от вида ОКИ клинический признак или несколько проявлений могут отличаться. Например, при холере лихорадки может не быть, тогда как шигеллез обязательно сопровождаются ею.

Действие болезнетворных микроорганизмов проявляется не сразу. Инкубационный период обычно составляет от 10 до 50 часов.


Острая кишечная инфекция у взрослых начинается, как правило, с незначительного недомогания, которое сменяют боли в животе и частый жидкий стул. Симптомы острой кишечной инфекции у детей как правило выражены более ярко.

Частый симптом заболеваний кишечника — острый понос. После заражения он может появиться, спустя несколько часов или дней. Вместе со рвотой диарея иногда приводит к обезвоживанию организма.

Диагностика и лечение

Специалисты клиники при подозрении ОКИ у обратившегося к ним пациента выясняют время возникновения первых симптомов и факторы риска, которые могли стать причиной болезни. 

Симптоматика ОКИ присуща и многим другим недугам, поэтому для постановки точного диагноза необходимы дополнительные исследования: анализ мочи, крови, кала, бакпосев.

Лечение острой кишечной инфекции назначается врачом после осмотра и изучения анамнеза: диетотерапия, дезинтоксикационная терапия, регидратационная терапия, лечение антибактериальными препаратами, пробиотиками. Записаться на прием к врачу тут.

Профилактика — лучшее лечение острой инфекции. Профилактические меры сводятся к простым правилам: мыть руки перед едой, пить кипяченую или бутилированную воду, мыть фрукты и овощи перед употреблением, тщательно термически обрабатывать пищу. Полные рекомендации по профилактике ОКИ можно получить на приеме у врача-диетолога.


Дата публикации: 22.09.2017  |  Дата изменения: 07.08.2020


Опасность острых кишечных инфекций в жаркий период

Вы знали, что острые кишечные инфекции наиболее опасны в жаркий период?

Елена Николаевна Абрамова, заведующая отделением кишечных инфекций ИКБ № 1, расскажет об особенностях течения этих заболеваний, и как можно избежать заражения данными инфекциями.

 

Острые кишечные инфекции (ОКИ) – это заболевания желудочно-кишечного тракта, вызываемые различными бактериями, вирусами или простейшими паразитами, и которые сопровождаются интоксикацией, болями в животе, жидким стулом и рвотой. К таким инфекциям относятся: дизентерия, сальмонеллезы, брюшной тиф, холера, иерсиниозы, пищевые токсикоинфекции и вирусные диареи (ротавирусная и норовирусная инфекции).

 

ОКИ имеют значительное распространение в летне-осенний период. Заболеваемость увеличивается в связи с повышенным употреблением овощей, фруктов и других продуктов, которые иногда забываем или недостаточно тщательно моем. Летом мы чаще пьем некипяченую воду, открывается купальный и пляжный сезон. Не стоит забывать, что инфекция может передаться через воду в водоемах.

 

Ввиду повышенной температуры воздуха летом, повышается риск порчи различных продуктов. Заражение людей ОКИ происходит при попадании возбудителя в организм человека через рот, а именно, при приеме в пищу продуктов питания, инфицированных возбудителями инфекции, употреблении воды из неизвестных источников и не подвергавшейся обеззараживанию.

 

Нельзя употреблять в пищу еду с истекшим сроком годности или скоропортящиеся продукты, которые длительное время хранились не в холодильнике.

 

Необходимо соблюдать правила личной гигиены. Достаточно помыть руки, чтобы избежать инфицирования через рукопожатия и различные предметы обихода, т.к. микроорганизмы весьма устойчивы к внешней среде. Перед приготовлением еды и приемом пищи руки тоже нужно помыть.

 

На кухне должна соблюдаться идеальная чистота. При разделке различных видов продуктов используйте отдельные ножи и доски. Тщательно мойте все поверхности и предохраняйте кухню и продукты от насекомых, грызунов и других животных. Своевременно удаляйте пищевые отходы.

 

Соблюдайте правила приготовления и хранения продуктов. После остывания приготовленной еды, храните ее в закрытой посуде с температурой не выше 5°С, но не долго. Пищу для детей лучше не подвергать хранению и употреблять сразу.

 

Клиническая картина кишечных инфекций зависит от возбудителя заболевания. Инкубационный период варьирует от нескольких часов при пищевой токсикоинфекции до нескольких дней при сальмонеллёзе и дизентерии.

Основные симптомы, на которые необходимо обратить внимание: общая вялость, слабость, плохой аппетит. Чуть позже наступает рвота, диарея, боли в животе, возможна высокая температура, озноб. Наряду с поражением кишечника могут отмечаться изменения со стороны верхних дыхательных путей. С рвотой и жидким стулом организм обезвоживается, что представляет опасность для работы сердечно-сосудистой системы и почек.

 

При возникновении симптомов острой кишечной инфекции необходимо немедленно обратиться за медицинской помощью. Проявления кишечных инфекций могут быть схожи с симптомами острой хирургической патологии, например аппендицит или острый панкреатит – правильный диагноз может поставить только врач.

Кишечные инфекции

Среди многочисленных инфекционных болезней человека значительное место занимают кишечные инфекции (КИ). Практически каждый человек на земле за свою жизнь переболевает этими заболеваниями.

Что представляют собой кишечные инфекции?

Кишечные инфекции – это целая группа заразных заболеваний, которые повреждают, в первую очередь, пищеварительный тракт.

Всего таких заболеваний более 30. Самое «безобидное» из них – так называемое пищевое отравление, а самые опасные – холера, брюшной тиф, ботулизм, сальмонеллез, бруцеллез, дизентерия и др.

Пути заражения КИ

Возбудителями кишечных инфекций могут быть: бактерии (сальмонеллез, брюшной тиф, холера), их токсины (ботулизм), а также вирусы (энтеровирус, ротавирус) и т.д.

От больных и носителей инфекции микробы выделяются во внешнюю среду с испражнениями, рвотными массами, иногда с мочой. Практически все возбудители кишечных инфекций чрезвычайно живучи. Они способны подолгу существовать в почве, воде и даже на различных предметах. Например, на ложках, тарелках, дверных ручках и мебели. Кишечные микробы не боятся холода, однако все же предпочитают жить там, где тепло и влажно. Особенно быстро они размножаются в молочных продуктах, мясном фарше, студне, а также в воде (особенно в летнее время).

В организм здорового человека возбудители кишечной инфекции попадают через рот:вместе с пищей, водой или из-за грязных рук.  Например, дизентерия может начаться, если попить парное (некипяченое) молоко или поесть сделанную из него простоквашу, творог или сметану. Кишечную палочку можно «съесть» вместе с некачественным кефиром или йогуртом. Стафилококковая инфекция комфортно себя чувствует в испорченных тортах с кремом. Возбудители сальмонеллеза (а их известно около 400 видов) попадают к человеку через любые зараженные продукты: куриное мясо и яйца, вареную колбасу, сосиски, плохо промытые или вымытые грязной водой овощи и зелень.

Изо рта микробы попадают в желудок, а затем в кишечник, где начинают усиленно размножаться. После попадания микробов в организм наступает бессимптомный инкубационный период, продолжающийся, в большинстве случаев, 6-48 часов.

Симптомы заболевания

В самом начале заболевания человека беспокоит слабость, вялость, снижение аппетита, головная боль, повышение температуры – симптомы, напоминающие обычное ОРЗ. Однако через некоторое время возникает тошнота, появляются схваткообразные боли в животе, понос с примесью слизи, гноя или крови (например, при дизентерии).

Может беспокоить жажда и озноб.

Симптомы заболевания вызывают как сами микробы, так и выделяемые ими токсины. Кишечные инфекции могут протекать в виде острого гастрита (с рвотой с болями под ложечкой), энтерита (с поносом), гастроэнтерита (с рвотой и поносом), колита (с кровью в экскрементах и нарушением стула), энтероколита (с поражением всего кишечника).

Одно из самых неприятных последствий, возникающих при кишечных инфекциях, – обезвоживание организма вследствие рвоты и/или поноса. Результатом резкого обезвоживания могут стать почечная недостаточность и другие тяжелые осложнения, в частности, дегидратационный (связанный с потерей жидкости) шок.

Диагностика и лечение КИ

Очень важно отличить кишечную инфекцию от других заболеваний со сходными симптомами: небактериального пищевого отравления (например, лекарствами), острого аппендицита, инфаркта миокарда, пневмонии, внематочной беременности и т.д.

При появлении симптомов, напоминающих острую кишечную инфекцию, необходимо обратиться к инфекционисту.  Для того, чтобы правильно поставить диагноз, врач назначает бактериологическое исследование кала или рвотных масс. Дополнительно могут применяться серологические методы диагностики (для выявления антител к возбудителям инфекции).

Лечение кишечных инфекций является комплексным и включает в себя: борьбу с микробными ядами, самими микробами, а также с обезвоживанием организма. Кроме того, больные должны соблюдать правильную диету и с помощью специальных препаратов восстанавливать нормальную микрофлору кишечника.

Меры профилактики и защиты

Кишечными инфекциями можно заболеть в любое время года. Но особенно резко возрастает их количество в летний период в связи с пренебрежениями мерами безопасности и небрежным отношением самих граждан к своему здоровью.

Чтобы уберечься от заболеваний кишечными инфекциями нужно соблюдать следующие правила:

  • Не использовать сырую воду из открытых водоемов (река, пруд, ручей и т.д.), ее можно употреблять только после кипячения.
  • Не использовать воду из источников, предназначенных для технических нужд.
  • Водопроводную воду пить только после кипячения.
  • Молочные продукты, купленные у частных владельцев, должны подвергаться термической обработке (молоко обязательно кипятить!), а лучше всего не покупать в неустановленных местах.
  • Творог «домашнего» изготовления подвергать термической обработке, готовить из него оладьи, сырники, вареники и т.п.
  • Хранить продукты питания в холоде, не допуская соприкосновения сырых и готовых продуктов и не более срока, указанного на этикетке.
  • Фрукты, овощи, ягоды, цитрусовые перед употреблением тщательно мыть проточной водой, а лучше кипяченой. Хорошо промывать овощи для салатов после их очистки.
  • Следить за чистотой рук! Обязательно мыть их перед приготовлением и приемом пищи, перед кормлением ребенка, после посещения туалета, прихода с улицы или работы.
  • Не употреблять скоропортящиеся продукты, такие как вареная колбаса, салаты, винегреты, студни, кремовые изделия, которые более часа хранились вне холодильника.

Соблюдая эти простые правила, можно защитить себя и своих близких от угрозы возникновения кишечных инфекций.

Автор: Шаранова О.А. – зам.главного врача ГССМП

Редактор: Арский Ю.М.

Художественное оформление: Бибова Е.Г.

Ответственный за выпуск: Тарашкевич И.И.

полный гид. Как выявить, вылечить и предотвратить?

Кишечные инфекции подкрадываются незаметно, но ощутимо меняют жизнь и планы. У кишечных инфекций нет сезонности, поэтому заразиться можно как летом, так и зимой. Группа риска таких инфекций — маленькие дети и пожилые люди. Лечение же зависит от особенностей возбудителя и тяжести болезни. Как уберечь себя и ребенка? Как правильно лечиться? И как организм самостоятельно защищает нас от инфекции?

Содержание

Что такое кишечные инфекции и где они живут?

Кишечные инфекции — заражение организма бактериями, вирусами или паразитами через желудочно-кишечный тракт. В норме в нашем кишечнике живет много разных видов бактерий. Но если еда, антибиотики или инфекция вызывают дисбактериоз, начинаются неприятные симптомы.

Большинство болезнетворных бактериый них попадают в организм с водой или пищей. Например, вы искупались в грязной воде и случайно проглотили немного, съели недостаточно прожаренное мясо, сырое яйцо или просроченный кефир.

Кишечные инфекции также называют «болезнью грязных рук», потому что заразиться можно и контактным способом. Недооцененный источник инфекции — пациенты без клинических проявлений болезни.

Человек остается заразным на протяжении всего цикла заболевания: от инкубационного периода до полного выздоровления. А оно может занимать до нескольких недель. Инфекция попадает в окружающую среду с фекалиями и рвотой, а вирусы передаются воздушно-капельным путем.

В летнее время риск заражения выше.

Люди чаще и ближе взаимодействуют друг с другом, срок годности продуктов сокращается, а в тепле бактерии размножаются быстрее. Важно уделять внимание детям, которые часто случайно глотают загрязненную морскую воду и пробуют на вкус всё, что видят.

Бактериальные возбудители кишечных инфекций: шигеллы, сальмонелла, холерный вибрион, стафилококки, эшерихии, бруцеллы, клостридии. Вирусные возбудители кишечных инфекций: ротавирус, энтеровирус, аденовирус. Чаще диагностируются бактериальные кишечные инфекции, связанные с заражением стафилококком и сальмонеллезом.

Как определить симптомы кишечной инфекции?

Стоит помнить, что в среднем инкубационный период кишечной инфекции составляет от 4 часов до 48 часов, в отдельных случаях доходит до 2 недель и более.

Симптомы:

  • Высокая температура
  • Многократная рвота
  • Сильные боли в животе, которые не облегчаются после рвоты
  • Продолжительный жидкий стул (в некоторых случаях со слизью или кровью)
  • При заражении вирусами также могут наблюдаться симптомы схожие с гриппозными: температура, головная боль, ноющие конечности, насморк. Есть даже такое заболевание — кишечный грипп.

Все эти симптомы можно причислить и к пищевому отравлению. Но вот на что обратить внимание, чтобы не спутать кишечную ифекцию с чем-то другим:

  • симптомы продолжаются дольше 2-3 дней;
  • рвота и диарея не прекращаются, а боли в животе не облегчаются после рвоты;
  • в стуле есть примесь слизи или крови, значительно изменился цвет мочи или фекалий;
  • вы теряете сознание или у вас есть сопутствующие хронические заболевания.

При таком течении болезни настоятельно рекомендуем обратиться к врачу. Последствия инфекций намного серьезнее последствий отравления.

Важно: не принимайте антибиотики без рекомендации врача. Тем более, если у вас вирусная инфекция. При вирусе они неэффективны и могут навредить, уничтожая кишечную микрофлору.

Как лечиться и не передать кишечную инфекцию другим?

Лечение зависит от возбудителя и тяжести заболевания. Например, дизентерию или норовирус можно вылечить дома. А вот с сальмонеллезом поможет только специалист. В любом случае для принятия решения о лечении необходимо вызвать врача и сдать лабораторные анализы.

Вот что можно сделать для начала:

  • Восстановить водно-солевой баланс. Лучше пить кипяченую или бутилированную воду с добавлением специальных растворов для регидратации
  • Принимать энтеросорбенты для облегчения интоксикации организма, а также обезболивающие и жаропонижающие
  • Исключить из диеты жареное, соленое, острое, сырое
  • Если захотелось поесть, то лучше отдать предпочтение простой еде: суп, рис, хлеб
  • Больше отдыхать

Как не заразить других, если заболели вы или ваши близкие?

  • Тщательно мойте руки
  • Регулярно дезинфицируйте места общего пользования и помещение пациента: особенно туалет, ванную комнату, кухню
  • Выделите заболевшему отдельную посуду и полотенца
  • Регулярно меняйте постельное белье и одежду и стирайте их при высокой температуре (60 °C)
  • Ограничьте круг общения, изолируйте заболевшего

Посещать общественные места рекомендуется не раньше чем через два дня после полного исчезновения симптомов, а такие места как бассейн — лучше через две недели.

Как не заразиться ротавирусом, кишечным гриппом и другими инфекциями?

Есть несколько простых правил:

  • Тщательно мыть руки с мылом после посещения общественных мест, туалетов, транспорта
  • Употреблять только термически обработанные продукты: особенно мясо, рыбу и яйца. С осторожностью — молочные и молочнокислые продукты
  • Мыть овощи и фрукты
  • Избегать продуктов с истекшим сроком годности
  • Пить только бутилированную или кипяченую воду (особенно на отдыхе), не глотать воду при купании в открытых водоёмах

Все кишечные инфекции обладают высокой степенью контагиозности, или заразительности — способности передаваться от организма к организму. Группы риска — это маленькие дети и пожилые люди, пациенты с иммунодефицитом, сотрудники медицинских учреждений и общепита.

Вы можете повторно заразиться кишечной инфекцией, потому что иммунитет к ней не вырабатывается. Однако сильная и богатая микробиота кишечника поможет не заразиться и облегчит течение болезни. Чем разнообразнее состав микробиоты, тем сильнее иммунная система и иммунный ответ организма. Поэтому так важно заботиться о полезных бактериях и удерживать их баланс в кишечнике.

Узнать, насколько разнообразна ваша микробиота, вы можете с помощью Теста микробиоты Атлас.

На заметку:

  • Кишечной инфекции наиболее подвержены дети до 5 лет, пожилые люди и люди с иммунодефицитными заболеваниями
  • У кишечной инфекции нет сезонности, но в летнее время стоит быть особенно осмотрительными: не глотать воду во время купания, следить за качеством обработки и сроком годности продуктов, не пить воду в непредназначенных местах, тщательно мыть руки и продукты
  • В зависимости от возбудителя инфекции и тяжести заболевания врач сможет назначить правильное лечение. Поэтому важно обращать внимание на симптомы, их интенсивность и длительность, обратиться к специалисту и сдать анализы
  • На 100% защититься от кишечной инфекции нельзя. Но помочь иммунитету и организму вы можете поддерживая здоровье микробиоты кишечника

Острые кишечные инфекции (ОКИ) / Новости / РЦИБ им. С.М. Магомедова

Забывая помыть перед едой руки и фрукты-овощи, мы рискуем подцепить кишечную инфекцию. В лучшем случае, это грозит многочасовым просиживанием в уборной. В худшем — инфекционной больницей и даже смертью. Заражение происходит при попадании возбудителя инфекции через рот, как правило, при употреблении зараженных пищевых продуктов и воды. Всего таких заболеваний более 30. Из них самое безобидное — так называемое пищевое отравление, а самые опасные — холера, брюшной тиф, ботулизм и т.д.

Причины Возбудителями кишечных инфекций могут быть: бактерии (сальмонеллез, брюшной тиф, холера), их токсины (ботулизм), а также вирусы (энтеровирус, ротавирус) и т.д. От больных и носителей инфекции микробы выделяются во внешнюю среду с испражнениями, рвотными массами, иногда с мочой. Практически все возбудители кишечных инфекций чрезвычайно живучи. Они способы подолгу существовать в почве, воде и даже на различных предметах. Например, на ложках, тарелках, дверных ручках и мебели. Кишечные микробы не боятся холода, однако все же предпочитают жить там, где тепло и влажно. Особенно быстро они размножаются в молочных продуктах, мясном фарше, студне, киселе, а также в воде (особенно в летнее время). В организм здорового человека возбудители кишечной инфекции попадают через рот: вместе с пищей, водой или через грязные руки. Например, дизентерия может начаться, если попить парное (некипяченое) молоко или поесть сделанную из него простоквашу, творог или сметану. Кишечную палочку можно съесть вместе с некачественным кефиром или йогуртом. Стафилококковая инфекция комфортно себя чувствует в испорченных тортах с кремом. Возбудители сальмонеллеза (а их известно около 400 видов) попадают к человеку через любые зараженные продукты: куриное мясо и яйца, вареную колбасу, сосиски, плохо промытые или вымытые грязной водой овощи и зелень. Что происходит? Изо рта микробы попадают в желудок, а затем в кишечник, где начинают усиленно размножаться. После попадания микробов в организм наступает бессимптомный инкубационный период, продолжающийся, в большинстве случаев, 6-48 часов.

Симптомы заболевания вызывают как сами микробы, так и выделяемые ими токсины. Кишечные инфекции могут протекать в виде острого гастрита (с рвотой и болями под ложечкой), энтерита (с поносом), гастроэнтерита (с рвотой и поносом), колита (с кровью в экскрементах и нарушением стула), энтероколита (с поражением всего кишечника). Одно из самых неприятных последствий, возникающих при кишечных инфекциях — обезвоживание организма вследствие рвоты и/или поноса. Особенно тяжело эти болезни протекают в раннем детском возрасте и у пожилых людей. Результатом резкого обезвоживания могут стать почечная недостаточность и другие тяжелые осложнения, в частности, дегидратационный (связанный с потерей жидкости) шок. Как проявляются? Кишечные инфекции, как и все остальные инфекционные заболевания, всегда случаются неожиданно. В самом начале заболевания человека беспокоит слабость, вялость, снижение аппетита, головная боль, повышение температуры — симптомы, напоминающие обычное ОРЗ. Однако через некоторое время возникает тошнота и рвота, появляются схваткообразные боли в животе, понос с примесью слизи, гноя или крови (например, при дизентерии). Может беспокоить жажда и озноб. Для инфекций этой группы характерны следующие симптомы (по отдельности или в сочетании друг с другом): повышенная температура; тошнота, рвота; боль в животе; понос; избыточное газообразование в кишечнике (метеоризм). Иногда кишечные инфекции не имеют видимых симптомов, но сопровождаются выделением возбудителей. В плане распространения инфекции такое носительство особенно опасно — ничего не подозревающий человек становится постоянным источником микробов, заражая окружающих.

Диагностика и лечение Очень важно отличить кишечную инфекцию от других заболеваний со сходными симптомами: небактериального пищевого отравления (например, лекарствами), острого аппендицита, инфаркта миокарда, пневмонии, внематочной беременности и т.д. При появлении симптомов, напоминающих острую кишечную инфекцию, необходимо обратиться к инфекционисту. Для того, чтобы правильно поставить диагноз, врач назначит бактериологическое исследование кала или рвотных масс. Дополнительно могут применяться серологические методы диагностики (для выявления антител к возбудителям инфекции). Если состояние пациента быстро ухудшается, срочно вызывайте «Скорую помощь», а до ее приезда оказывайте пострадавшему первую помощь.

Лечение кишечных инфекций является комплексным и включает в себя: борьбу с микробными ядами, самими микробами, а также с обезвоживанием организма. Кроме того, больные должны соблюдать правильную диету и с помощью специальных препаратов восстанавливать нормальную микрофлору кишечника. Профилактика Чтобы уберечься от острых кишечных инфекций, достаточно соблюдать следующие несложные правила: пить воду и молоко только в кипяченом виде, мыть овощи и фрукты горячей водой с мылом, соблюдать правила и сроки хранения пищевых продуктов, мыть руки перед едой и не грызть ногти.

Профилактика вирусных кишечных инфекций населения

29 Марта 2021, 15:24

В настоящее время в средствах массовой информации широко освещается тема острых кишечных инфекций вирусной этиологии.

Управление Роспотребнадзора по Волгоградской области информирует, что в последние годы во многих странах мира, Российской Федерации, в том числе и на территории области произошла активизация эпидемического процесса острыми кишечными инфекциями (ОКИ) вирусной этиологии.

За 2 месяца текущего года на территории Волгоградской области зарегистрировано 465 случаев заболеваний острыми кишечными инфекциями, показатель заболеваемости составил 97,63 на 100 тыс.населения (за 2 месяца 2020г. — 197,4). Зарегистрировано 14 случаев заболеваний кишечной инфекцией вирусной этиологии, показатель заболеваемости — 2,94 на 100 тыс.населения, ( в 2020 году за аналогичный — 50 случаев, показатель — 10,50) .

Острые кишечные инфекции вирусной этиологии отличаются высокой активностью контактно-бытовой передачи, так как заражающая доза очень небольшая, менее 10 вирусных частиц достаточно, чтобы при попадании желудочно-кишечный тракт здорового человека вызвать заболевание. Восприимчивость людей к этим инфекциям высокая.

Источником инфекции является человек (больной или носитель). Инкубационный период — от 10 часов до 7 дней, чаще — 1-3 дня. Вирусы являются преобладающими этиологическими факторами ОКИ у детей, прежде всего раннего возраста.

У взрослого человека ротавирусная (норовирусная) инфекция может проявляться небольшим кишечным расстройством, при этом после исчезновения клинических проявлений носительство вирусов может продолжаться 30-40 дней. Часто заболевание протекает и вовсе бессимптомно.

Факторами передачи инфекции могут служить разнообразные продукты, не проходящие термическую обработку. Водный путь реализуется при попадании в организм человека загрязненной возбудителем воды, куда возбудитель может попасть со стоками.

Так как симптомы большинства кишечных инфекций вирусной этиологии сходны (повышение температуры, тошнота, рвота, боли в области живота, жидкий многократный стул), диагнозы: «острая кишечная инфекция вирусной этиологии», «ротовирусная инфекция», норовирусная инфекция» и др. не может быть поставлен только на основании клинических проявлений. Диагноз в обязательном порядке должен быть подтвержден лабораторными исследованиями (обнаружение в материале от больных маркеров вирусов методом ИФА, ПЦР или другими методами, разрешенными к применению на территории Российской Федерации в установленном порядке).

При появлении симптомов характерных для кишечных инфекций (повышение температуры, тошнота, рвота, боли в области живота, жидкий многократный стул) необходимо обязательно обратиться за медицинской помощью. Самолечение недопустимо!

Иммунитет после вирусных диарей нестойкий, одной и той же инфекцией можно заболеть несколько раз.

Меры профилактики.

Вирусная кишечная инфекция опасна, но бороться с ней можно, и весьма успешно, если не пренебрегать тем, что некоторые привыкли считать мелочами:

— соблюдать правила личной гигиены, где бы вы не находились: на даче, в местах отдыха, дома или на работе;

— приобретая продукт, обратите внимание на его качество, условия реализации, не приобретайте продукты сомнительного качества;

— использовать для питья только кипяченую или бутилированную воду;

— обрабатывать принесенные с улицы детские игрушки, велосипеды и другие предметы;

— соблюдать чистоту во время приготовления пищи; тщательно мыть руки с мылом перед едой;

— приобретать пищевые продукты в установленных местах, при наличии документов, гарантирующих их качество;

— не допускается купание в местах, непредусмотренных для этой цели;

— тщательно мыть руки с мылом, и после посещения туалета.

Выполнение этих несложных советов поможет избежать заболевания и сохранит Ваше здоровье и здоровье Ваших близких!


http://34.rospotrebnadzor.ru/

стафилококк, сальмонелез — симптомы, лечение

Кишечные инфекции появляются в результате распространения вредных бактерий. Чаще всего они развиваются у детей, но нередко могут стать и причиной недомогания любого члена семьи. В этой статье мы поговорим о том, какие есть виды кишечных инфекций, как они появляются в организме человека и как их правильно и эффективно лечить.

Несмотря на схожие симптомы и способ заражения, каждый вид имеет свои отличительные черты и представляют различную опасность для человека.

Виды кишечных инфекций

Возбудитель появляется и паразитирует в желудочно-кишечном тракте. Может воспаляться слизистая оболочка желудка, нарушаться процессы пищеварения, ухудшаться общее самочувствие человека.

Вирусные инфекции 

При вирусном заражении поражаются стенки желудка, кишечника, дыхательных органов, в редких случаях могут затрагиваться другие органы. Инфекция может передаться несколькими способами: фекально-оральным, воздушно-капельным, контактно-бытовым.

Вылечить инфекцию можно всего за одну неделю, но человек может продолжать быть переносчиком еще на протяжении 3-4 недель. Важно на время лечения придерживаться строгой диеты, пить много чистой воды и применять противовирусные препараты, выписанные врачом после диагностики организма.

Бактериальные инфекции 


Такое заболевание считается более опасным, так как существует большая вероятность осложнений. Заразиться можно фекально-оральным и контактно-бытовым путем. Инфекция затрагивает желудочно-кишечный тракт, мочевыводящие каналы.

Бактерии, распространяясь в желудочно-кишечном тракте, выделяют токсичные вещества. При большом количестве таких веществ, поступающих в организм, может настать токсический шок.

Больному понадобится комплексное лечение. Нужно не только избавиться от вредоносных микроорганизмов, но и очистить организм от токсичных веществ, а также устранить симптоматику. В таких случаях прописывают антибиотики.

Протозойные инфекции

Считаются менее распространенными, но при этом очень опасными. Они передаются не только фекально-оральным и контактно-бытовым путем, но и во время полового акта. Несмотря на активное распространение в желудке и кишечнике, болезнь может продолжительное время не давать о себе знать, что в дальнейшем затруднит процесс лечения.

Симптомы кишечной инфекции у взрослых

Первые симптомы дают о себе знать достаточно быстро – проходит от 6 до 48 часов после того, как возбудитель инфекции попадает в организм. Кишечная инфекция также может начинаться как простуда: с першения в горле, невысокой температуры, до 37,5.


Появляются характерные признаки:

  • лихорадка
  • рвота, диарея
  • боль внизу живота
  • дискомфорт, иногда резкое повышение температуры тела (до 38–39 °С)
  • слабость, бледность, одышка, может быть нарушение сердечной деятельности
  • самое опасное в данном случае – потеря жидкости от рвоты и диареи

Если заболевание проходит в легкой форме, то эти симптомы могут не наблюдаться, а при острой кишечной инфекции симптоматика может принять ярко-выраженный характер.

Стафилококк


Заболевание вызывают условно-патогенные микробы, которые опасны для здоровья человека. Обитая в организме постоянно, они находятся под контролем иммунитета. Но при ослаблении защиты могут спровоцировать воспалительный процесс.

Стафилококк – это неподвижный грамположительный микроорганизм шаровидной формы, образующий многочисленные колонии. Может развиваться и паразитировать в организме без участия кислорода в закрытой среде. Штаммов бактерий насчитывается более двадцати. Некоторые из них довольно безобидны, а другие вызывают мощные патологические реакции в человеческом организме.

Патология чаще всего появляется на коже, слизистых оболочках, соединительной ткани, подкожной клетчатке, сердечной мышце. Поражая их, микробы вырабатывают токсичные вещества, провоцируют воспаления, в тяжелых случаях приводящие к сепсису, необратимым изменениям структур.

Наиболее распространенной разновидностью является золотистый стафилококк. Название получил из-за характерного желтого пигмента на поверхности. Проникая в организм, синтезирует фермент коагулазу, может вызывать гнойные воспаления почти любых внутренних органов.

Симптомы стафилококковой инфекции

Два основных признака, которые можно наблюдать в теле у зараженного человека, это интоксикация и воспалительный процесс. Могут появляться болезненные выпуклые узелки, наполненные гноем. Поражение пазух носа стафилококком проявляется банальным насморком с вязкими желтоватыми или зелеными выделениями. Также могут появиться следующие признаки:

  • заложенность в области переносицы
  • ощущение тяжести, распирания с пораженной стороны
  • затрудненное дыхание
  • густые гнойные выделения из носа
  • повышение температуры тела выше +37°С

Нередко инфекция распространяется на среднее ухо, вызывая отит: резкие стреляющие боли, снижение слуха. При поражении слизистых глаз развивается нагноение конъюнктивы, склеры краснеют и отекают. Стафилококк часто встречается у детей до 12 лет и проявляет себя точно также, как у взрослых.

Для быстрого подавления активности патогенов применяют комбинации различных групп препаратов. Относительно новые и эффективные: макролиды и фторхинолоны. Лекарства этих категорий разрушают и уничтожают белковые оболочки бактерий, не давая им времени для развития резистентности. Курс лечения стафилококка должен проводиться по четким указаниям врача и не должен прерываться.

Сальмонеллез


Еще одна разновидность бактериальной инфекции, которая поражает человека и животных, передается фекально-оральным путем, обычно поражает желудок и тонкий кишечник. Характер течения заболевания отличается в каждом конкретном случае, от бессимптомного поражения до тяжелых форм с токсическим и дегидратационным шоком.

Причиной возникновения заболевания являются бактерии сальмонеллы. Они хорошо сохраняются и долго живут в окружающей среде. Им не страшен холод, поэтому заморозка продуктов не предотвращает заражение. Зато при кипячении эти бактерии погибают мгновенно.

Сальмонеллы проникают в желудочно-кишечный тракт с пищей, водой или через загрязненные руки, беспрепятственно проходят кислотный барьер желудка и заселяются в тонком кишечнике. В борьбе с иммунными клетками они вырабатывают опасный для жизнедеятельности человека токсин. С током крови они попадают в другие внутренник органы: печень, селезенку, легкие, кости.

Симптомы сальмонеллеза:

Инкубационный период продолжается от нескольких часов до 2 суток. Резко поднимается температура тела, появляется выраженный болевой синдром, тяжесть в голове, слабость. Расстройство стула при сальмонеллезе – один из основных симптомов. Каловые массы становятся водянистыми, пенистыми и чрезвычайно зловонными. Дефекация сопровождается позывами к рвоте. Слизистая оболочка рта и язык покрываются белым налетом, становятся излишне сухими.

Пациенты, страдающие от тяжелой формы сальмонеллеза или осложнений, подлежат госпитализации. Взрослые и дети, переживающие течение инфекции в легкой форме, проходят лечение на дому. Лечение сальмонеллеза начинается с базовой процедуры промывания желудка и кишечника.

Затем восстановление баланса электролитов в организме пациента и коррекция водно-солевого баланса. Это делается с помощью потребления солевого раствора внутрь. При тяжелом обезвоживании проводится внутривенная инфузионная терапия, в состав которой входят полиионные растворы.

Лечение кишечных инфекций


При появлении признаков инфекции необходимо обратиться на прием к врачу. Многие заболевания имеют схожие симптомы. Поэтому чтобы провести грамотную терапию, необходимо пройти полную диагностику. Только лабораторные методы диагностики покажут правильный результат.

Что делать, если в семье больной?

  • Заболевшему придерживаться постельного режима. Желательно лечь в отдельную комнату, куда не стоит пускать детей. Если тошнит, принести тазик.
  • Если зараженного тошнит, накройте его пледом. Желательно таким, который легко потом отстирать.
  • Для питья выделите заболевшему отдельную посуду.

Для лечения назначают медицинские средства. Активированный уголь (1 таблетка на 10 кг веса) и другие сорбенты, регидрон (назначается при большой потере жидкости, особенно для людей с недостатком веса, при обезвоживании), жаропонижающие. Также обязательно надо пить побольше воды, можно минеральной без газов.

Из рациона питания следует убрать все молочные продукты и несколько дней соблюдать диету. Каша на воде (лучше рисовая), сухарики из белого или серого хлеба, исключить овощи и фрукты, которые вызывают брожение – виноград, капуста, черный хлеб, бобовые.

При кишечной инфекции больному назначают теплое питье. Это могут быть:

  • морсы (из свежих или замороженных ягод)
  • несладкий чай, можно травяной
  • сок (лучше разбавленный)
  • особенно хорош кисель – из-за своих вяжущих свойств

Профилактика кишечной инфекции у взрослых и детей

  • Для сырых мяса и рыбы на кухне должны быть отдельные ножи и отдельные разделочные доски. Нельзя одними приборами резать сырое мясо (рыбу) и овощи.
  • Горячие блюда должны готовиться при температуре выше 70 градусов. Такая температура смертельна для микробов.
  • Не оставляйте приготовленную пищу при комнатной температуре дольше чем на два часа.
  • Не размораживайте пищу при комнатной температуре. Лучше в холодильнике.

Где лечить кишечные инфекции в Красноярске?

В период пандемии в медицинском центре «Медюнион» оказывают все медицинские услуги согласно масочному режиму. Соблюдается дистанция между пациентами и работниками клиники, все рабочие поверхности обрабатываются каждый час. Наши пациенты могут воспользоваться масками и дезинфекторами для обработки рук.

Стоимость диагностики и лечения будет зависеть о проводимых процедур. Чтобы узнать больше информации, запишитесь на прием к нужному узкому специалисту, который проведет осмотр, назначит анализы и лечение. Чтобы записаться, позвоните по телефону +7 391 201-03-03 или заполните онлайн-форму. Укажите необходимую вам процедуру и оставьте свои данные – наш специалист перезвонит вам и обсудит удобное время процедуры.

Желудочный грипп: как долго я заразен?

Как долго я буду заразным, если у меня желудочный грипп?

Вы можете заразиться от нескольких дней до двух недель и более, в зависимости от того, какой вирус вызывает ваш желудочный грипп (гастроэнтерит).

Ряд вирусов могут вызывать гастроэнтерит, включая норовирусы и ротавирусы. Период заразности — время, в течение которого больной может передать болезнь другим, — немного отличается для каждого вируса.

  • Норовирус. Норовирус — наиболее частая причина вирусного гастроэнтерита у взрослых — вы заразны, когда начинаете чувствовать себя плохо. Симптомы обычно появляются в течение одного-двух дней после заражения.

    Хотя обычно вы чувствуете себя лучше через день или два, вы заразны в течение нескольких дней после выздоровления. После выздоровления вирус может оставаться в стуле до двух и более недель.

    Дети должны оставаться дома и не ходить в школу или детские учреждения в течение как минимум 48 часов после последней рвоты или диареи.

  • Ротавирус. Симптомы ротавируса — основной причины вирусного гастроэнтерита у младенцев и детей младшего возраста — обычно проявляются через один-три дня после контакта. Но вы заразны еще до появления симптомов и в течение двух недель после выздоровления.

Вирусы, вызывающие гастроэнтерит, передаются при тесном контакте с инфицированными людьми, например при совместном использовании еды или столовых приборов, а также при прикосновении к зараженным поверхностям и предметам.Употребление зараженной пищи также может вызвать норовирус.

Часто мытье рук водой с мылом — самый эффективный способ остановить распространение этих вирусов среди других. Если вы не можете мыть руки, используйте дезинфицирующее средство для рук на спиртовой основе, которое может уменьшить количество микробов.

Чтобы защитить других от болезней, дезинфицируйте загрязненные поверхности сразу после рвоты или диареи. Наденьте одноразовые перчатки и используйте бытовое моющее средство на основе отбеливателя или 2 чашки (0,5 литра) отбеливателя на галлон (3.8 литров) воды. Норовирус может выживать месяцами на поверхностях, недостаточно продезинфицированных с помощью отбеливающего раствора.

Также используйте одноразовые перчатки, чтобы немедленно постирать одежду или постельное белье, которые могут быть загрязнены.

Для младенцев доступны две пероральные ротавирусные вакцины — RotaTeq и Rotarix. Вакцины против норовируса проходят клинические испытания.

с

Притиш К. Тош, доктор медицины

  • Прививка от гриппа: предотвратит ли желудочный грипп?
04 марта 2020 Показать ссылки
  1. Норовирус.Центры по контролю и профилактике заболеваний. http://www.cdc.gov/norovirus/about/index.html. По состоянию на 4 февраля 2018 г.
  2. Matson DO. Острый вирусный гастроэнтерит у детей в странах с богатыми ресурсами: лечение и профилактика. https://uptodate.com/contents/search. По состоянию на 4 февраля 2018 г.
  3. Предотвратить распространение норовируса. Центры по контролю и профилактике заболеваний. https://www.cdc.gov/features/norovirus/index.html. По состоянию на 4 февраля 2018 г.
  4. Вирусный гастроэнтерит.Национальный институт диабета, болезней органов пищеварения и почек. https://www.niddk.nih.gov/health-information/digestive-diseases/viral-gastroenteritis. По состоянию на 4 февраля 2018 г.
Посмотреть больше ответов экспертов

.

Инкубационные периоды вирусного гастроэнтерита: систематический обзор

BMC Infect Dis. 2013; 13: 446.

, 1 , 2 , 1 , 2 , 3 , 4 и 2

Рейчел М. Ли

1 Департамент международного здравоохранения, Johns Hopkins Bloomberg School of Public Health, Baltimore, USA

Justin Lessler

2 Департамент эпидемиологии, Школа общественного здравоохранения Bloomberg Джонса Хопкинса, Балтимор, США

Rose A Lee

1 Department of International Health, Johns Hopkins Bloomberg School of Public Health, Балтимор, США

Kara E Rudolph

2 Департамент эпидемиологии, Школа общественного здравоохранения Bloomberg Джонса Хопкинса, Балтимор, США

Nicholas G Reich

3 Отдел биостатистики и эпидемиологии , Школа общественного здравоохранения и медицинских наук, Массачусетский университет, Амхерст, Амхерст, США

Триш М. Перл

4 Депар Департамент медицины, Отделение инфекционных заболеваний, Медицинская школа Университета Джона Хопкинса, Балтимор, США

Дерек А.Т. Каммингс

2 Департамент эпидемиологии, Школа общественного здравоохранения Блумберга Джонса Хопкинса, Балтимор, США

1 Департамент Международного здравоохранения, Школа общественного здравоохранения Блумберга Джонса Хопкинса, Балтимор, США

2 Департамент эпидемиологии, Школа общественного здравоохранения Блумберга Джонса Хопкинса, Балтимор, США

3 Отдел биостатистики и эпидемиологии, Школа общественного здравоохранения и медицинских наук, Массачусетский университет, Амхерст, Амхерст, США

4 Департамент медицины, Отделение инфекционных заболеваний, Медицинский факультет Университета Джона Хопкинса, Балтимор, США

Автор, отвечающий за переписку.

Поступило 06 марта 2013 г .; Принято 12 сентября 2013 г.

Copyright © 2013 Lee et al .; лицензиат BioMed Central Ltd. Это статья в открытом доступе, распространяемая в соответствии с условиями лицензии Creative Commons Attribution License (http://creativecommons.org/licenses/by/2.0), которая разрешает неограниченное использование, распространение и воспроизведение на любом носителе, при условии правильного цитирования оригинальной работы. Эта статья цитировалась в других статьях в PMC.
Дополнительные материалы

Дополнительный файл 1 Сравнение логарифмически нормального, гамма-распределений, распределений Вейбулла и Эрлинга.

GUID: E778F8C8-667E-4C91-903D-7B3CCDE5DCA8

Реферат

Предпосылки

Точное знание инкубационного периода важно для исследования и контроля инфекционных заболеваний и их передачи, однако сведения об инкубационном периоде имеются в литературе. часто не цитируются, противоречивы и / или не основаны на доказательствах.

Методы

При систематическом обзоре литературы по пяти кишечным вирусам, имеющим значение для общественного здравоохранения, мы нашли 256 статей с оценками инкубационного периода, в том числе 33 с данными для объединенного анализа.

Результаты

Мы подобрали логарифмически нормальное распределение для объединенных данных и обнаружили, что средний инкубационный период составляет 4,5 дня (95% ДИ 3,9-5,2 дня) для астровируса, 1,2 дня (95% ДИ 1,1-1,2 дня) для норовируса. геногрупп I и II, 1,7 дня (95% ДИ 1,5–1,8 дня) для саповирусов и 2,0 дня (95% ДИ 1,4–2,4 дня) для ротавируса.

Выводы

Наши оценки объединяют опубликованные данные и предоставляют достаточные количественные детали, позволяющие использовать эти оценки в широком спектре клинических приложений и приложений для моделирования.Это может привести к улучшению мер профилактики и контроля в условиях передачи или риска передачи.

Ключевые слова: Инкубационный период, норовирус, ротавирус, калицивирусы, астровирус, систематический обзор

Предпосылки

Острый вирусный гастроэнтерит является важной и часто недооцениваемой причиной заболеваемости и смертности во всем мире. Почти все дети перенесли хотя бы одну ротавирусную инфекцию к пяти годам. Ежегодно на ротавирус приходится около двух миллионов госпитализаций и от 350 000 до 600 000 случаев смерти детей младшего возраста [1].Несколько исследований показали, что астровирус является важной причиной острого гастроэнтерита у детей раннего возраста; исследование распространенности в Соединенном Королевстве показало, что более 70% пятилетних детей имеют антитела к вирусу [2-6]. Астровирус также упоминается как важная причина гастроэнтерита у пожилых людей [7,8]. Калицивирусы, в частности норовирусы, являются наиболее важной причиной эпидемических небактериальных гастроэнтеритов во всем мире, поражают как взрослых, так и детей и составляют от 40 до 50% всех гастроэнтеритов пищевого происхождения в США [9,10].

Астровирус, ротавирус и калицивирусы являются важными причинами инфекций, связанных с оказанием медицинской помощи, и вспышек заболеваний в медицинских учреждениях [11]. Инкубационный период (время между заражением и появлением симптомов) важен для точного эпиднадзора за инфекциями, связанными с оказанием медицинской помощи, и реализации эффективных мер борьбы со вспышками (например, когортирование и / или карантин). [12] Инкубационный период часто используется для определения заражающего воздействия во время вспышек болезней пищевого происхождения [13,14] и может помочь в диагностике, когда лабораторные ресурсы недоступны.Критерии Каплана были разработаны и часто используются для определения того, была ли вспышка вызвана норовирусом; инкубационный период — один из ключевых элементов этих критериев. [15] Другие применения точно описанного инкубационного периода включают в себя прогностические модели, которые используют инкубационный период для точного моделирования процесса заболевания, а продолжительность инкубационного периода по отношению к латентному периоду (время между заражением и переходом в инфекцию) определяет потенциальная эффективность мер контроля, нацеленных на лиц с симптомами [16].

Несмотря на важность, периоды инкубации кишечных вирусов недостаточно хорошо описаны в медицинской литературе. Информация об инкубационном периоде, как правило, состоит из одного числа («Инкубационный период ротавирусной болезни составляет приблизительно 2 дня» [17]) или плохо определенного диапазона («Инкубационный период для астровирусной болезни составляет от 1 до 5 дней…» [ 18]). Эти утверждения инкубационного периода трудно воплотить в реалии профилактики и контроля. Оценка с одним числом может представлять собой среднее значение, медианное значение, верхний предел или какой-либо другой показатель инкубационного периода.Диапазон может представлять собой исчерпывающий диапазон всех наблюдений или некоторый неопределенный квантиль (например, 95% доверительный интервал, внутренний 75% и т. Д.). Кроме того, часто неясна сила доказательств, лежащих в основе этих оценок. Заявления об инкубационном периоде часто не включают цитату, а когда цитируется, следование цепочке цитирований часто показывает, что оценка основана на ограниченных доказательствах [19].

Мы проанализировали литературу по пяти кишечным вирусам, отобранным с учетом их важности для общественного здравоохранения: астровирус, калицивирусы (геногруппы норовирусов I и II и саповирусы) и ротавирус.Посредством систематического обзора и анализа опубликованных оценок и данных мы стремимся (1) зафиксировать консенсус в медицинской литературе по этим инкубационным периодам, (2) охарактеризовать доказательства, лежащие в основе этого консенсуса, и (3) предоставить улучшенные оценки инкубационных периодов для эти инфекции. Поступая таким образом, мы надеемся, что инкубационный период будет использоваться в большем количестве приложений и выявить те области, в которых необходимы дополнительные исследования.

Методы

В этом систематическом обзоре в основном использовались методы, описанные в Lessler et al., 2009 [20]. Подробности и различия в подходах описаны ниже.

Стратегия поиска и критерии выбора

Для каждого вируса мы провели поиск в PubMed, Google Scholar и ISI Web of Knowledge 4.0, как описано Lessler et al., 2009 [20]. В PubMed мы искали слова «инкубация», «период» и название вируса, в Google Scholar мы искали фразы «инкубационный период [название вируса]» и «инкубационный период для [название вируса]», а также ISI Web of Knowledge мы искали по «инкубационному периоду» и названию вируса [20].Поиски проводились в период с 20 января 2011 г. по 16 августа 2011 г., без ограничений по самой ранней дате возврата статей. Общие варианты названия каждого вируса использовались в каждой базе данных, в частности, «астровирус», «калицивирус», «норовирус», «вирус Норо», «Норуолк», «Норуолк-подобный», «NLV», «NLV», «SRSV». »,« Зимняя рвота »,« Hyperemesis hiemis »,« Снежная гора »,« саповирус »,« вирус Саппоро »,« Саппороподобный вирус »,« ротавирус »,« дуовирус »,« агент, подобный реовирусу человека », и «агент инфантильного гастроэнтерита».Мы также рассмотрели четыре широко используемых справочника по инфекционным заболеваниям [11,21-23]. Тезисы рецензировались двумя рецензентами независимо друг от друга. Расхождения были устранены путем обсуждения и консенсуса. Этот обзор соответствует контрольным спискам систематических обзоров PRISMA и QUORUM.

Оценка

Документы, включенные в полнотекстовый обзор, были классифицированы как содержащие (1) оценку инкубационного периода, основанную на исходных данных и / или анализе, (2) отчет об инкубационном периоде (т. Е. Предоставленную ссылку), (3) ) отчет об инкубационном периоде без источника (т.д., без ссылки) или (4) без указания инкубационного периода. Все документы были также проверены на предмет данных индивидуального уровня, пригодных для объединенного анализа. Полные тексты рецензировались независимо двумя рецензентами. Расхождения были устранены путем обсуждения и консенсуса.

Абстракция данных

Отчеты инкубационного периода и данные на индивидуальном уровне, подходящие для объединенного анализа, были извлечены, как описано в Lessler et al., 2009 [20]. Поскольку во многих вспышках болезней пищевого происхождения, описанных в литературе, не сообщалось о точном времени приема пищи, мы установили стандартные интервалы воздействия, которые использовались при абстрагировании данных на индивидуальном уровне для исследований, в которых время приема пищи было указано как просто «завтрак», «обед» или «обед».Воздействие во время завтрака считалось периодом между 0:00 и 10:00, обедом между 10:00 и 14:00 и ужином между 14:00 и 0:00. Мы сообщаем диапазон инкубационных периодов таким образом, чтобы инкубационный период в этом диапазоне соответствовал прогнозам большинства исследователей (т.е.согласовался с более чем 50% опубликованных оценок) и модальным утверждением центральной тенденции.

Объединенный анализ

Сартвелл и другие показали, что натуральный логарифм инкубационных периодов острых инфекционных заболеваний имеет тенденцию к нормальному распределению; следовательно, инкубационный период следует логарифмически нормальному распределению, определяемому средним инкубационным периодом и коэффициентом дисперсии [20,24-26].При нормальном распределении примерно две трети данных попадают в одно стандартное отклонение от среднего; аналогично при логнормальном распределении примерно в двух третях случаев развиваются симптомы между медианной / дисперсией и медианной × дисперсией. Для каждого патогена все наблюдения были объединены в единый набор двухинтервальных цензурированных наблюдений; каждая точка данных содержала диапазон возможных времен воздействия, например «обед», и диапазон возможных времен появления симптомов.Поскольку время воздействия и появления симптомов редко сообщается точно, минимальный временной интервал, который мы рассмотрели, составлял один час. Если сообщалось, что время появления симптома составляет 17:00, мы записывали время появления симптома между 17:00 и 18:00. Оценки максимального правдоподобия были получены с использованием пакета coarseDataTools для R [25,27]. Доверительные интервалы рассчитывались методом начальной загрузки (500 итераций). Объединенные данные для каждой геногруппы норовирусов были проанализированы индивидуально, данные из геногрупп I и II были проанализированы вместе, и, наконец, все данные о калицивирусах человека (как геногруппы норовирусов, так и саповирусы) были объединены и проанализированы.Для выбора подходящих групп использовались байесовский информационный критерий и оценка клинически значимых различий в оценках. Результаты инкубационного периода, полученные с использованием логнормального распределения, сравнивались с результатами, полученными с использованием распределений Вейбулла и гамма-распределения; квантильные оценки оказались согласованными между распределениями (см. дополнительный файл 1). Все анализы были выполнены с использованием статистического пакета R (версия 2.11). Конкретные оценки, содержащиеся в этом обзоре, все данные, использованные в объединенном анализе, и полная библиография доступны у авторов по запросу.В помощь разработчикам моделей результаты подгонки данных с использованием распределения Эрланга доступны в дополнительных материалах (Дополнительный файл 1).

Результаты

Мы идентифицировали 256 статей с одним или несколькими заявлениями об инкубационном периоде (рисунок). Из 317 оценок, включенных в эти статьи, 91 (29%) были оригинальными, 137 (43%) давали источник, а 89 (28%) не предоставляли источник (таблица). 33 статьи содержали данные на индивидуальном уровне, подходящие для объединенного анализа (таблица). Шесть (18%) исследований были экспериментальными, а 27 (82%) — наблюдательными.В таблице приведены инкубационные периоды, указанные в литературе, и исходные данные. Оценки инкубационного периода норовирусов получили наибольшую поддержку (23 исследования). Оценка саповирусов была подтверждена меньшим количеством исследований, но эти исследования были относительно большими. Для ротавируса и астровируса было доступно менее 20 наблюдений. Оценки полного распределения каждого инкубационного периода с использованием объединенных данных показаны на рисунке и в таблице. Это обеспечивает периоды, когда 5%, 25%, 50%, 75% и 95% случаев станут симптоматическими.Мы показываем только 5-й и 95-й процентили, когда было более 20 наблюдений для отдельного вируса. Медиана инкубационного периода варьировала от 1,1 дня (для норовирусов геногруппы I) до 4,5 дня (для астровируса). Разброс от 1,22 до 1,82. Полные распределения, наложенные на гистограммы данных латентного периода, показаны на рисунке.

Процесс систематического обзора.

Таблица 1

Сводка оценок инкубационного периода в опубликованной литературе


2
Литературные оценки * (дни)
Количество оценок (%)
Участники экспериментальных исследований (n ) ψ
Диапазон Центральная тенденция Оценки без источников Исходные оценки Исходные оценки [экспериментальные / наблюдательные] 1-5
3
8 (40%)
7 (35%)
5 (25%) [1/4]
1
Калицивирусы
Норовирус
1-2
1
39 (22%)
74 (43%)
60 (35%) [15/45]
189
Геногруппы I и II
Саповирус
2
5 (36%)
2 (14%)
7 (50%) [0/7]

Ротавирус
1-4 2
37 (34%)
54 (49%)
19 (17%) [6/13]
42
Всего
89 (28%)
137 (43%) 91 (29%) [22/69] 232

Таблица 2

Исследования, включенные в объединенный анализ

.(2000) [49]
Местоположение Тип исследования N Население ion Комментарии
Астровирус
Kurtz et al.(1979) [28]
UK
Экспериментальный
4
Взрослые добровольцы в возрасте 18–50 лет

Midthun et al. (1993) [29]
USA
Экспериментальный
1
Взрослый доброволец

Mitchell et al. (1993) [30]
США
Наблюдательные
5
Дети в возрасте 6–30 месяцев
Вспышка в детском саду
Калицивирусы
9026 Норовирус

Геногруппа I
Baron et al.(1982) [31]
США
Наблюдательный
132
Взрослые и дети в возрасте от 9 месяцев до 59 лет
Вспышка, связанная с купанием в озере
Becker et al. (2000) [32]
США
Наблюдательный
54
Футболисты мужского пола колледжа
Вспышка, связанная с упакованными обедами
Dolin et al.(1971) [33]
США
Экспериментальный
5
Заключенные-мужчины в возрасте 18–45 лет

Gill et al. (1983) [34]
UK
Наблюдательный
127
Взрослые
Вспышка, связанная с потреблением сырых устриц
Hicks et al. (1996) [35]
UK
Observational
31
Гости на свадебном приеме

Hoebe et al.(2004) [36]
Нидерланды
Наблюдательный
90
Дети в возрасте 4–12 лет
Вспышка, связанная с игрой в зараженном фонтане
Курицкий и др. (1984) [37]
США
Наблюдательный
126
Взрослые и дети, посещающие любое из четырех социальных мероприятий с питанием
Вспышка, связанная с употреблением в пищу замороженных хлебобулочных изделий, приготовленных плохим кулинаром
Linco et al.(1980) [38]
Австралия
Наблюдательный
24
Гости на рождественском ужине
Вспышка, связанная с употреблением сырых устриц
Matsuhashi et al. (2003) [39]
Япония
Наблюдательный
1
Взрослый врач-мужчина
Заболевание, связанное с выполнением колоноскопии у двух инфицированных лиц
40218
[
USA
Observational
209
Взрослые
Oubreak, связанный с поеданием картофельного салата на корпоративном обеде
Taylor et al.(1981) [41]
США
Наблюдательный
329
Дети в возрасте от 5 до 12 лет
Вспышка, связанная с зараженной питьевой водой в начальной школе

Норовирус
Genogroup II
de Wit et al. (2007) [42]
Нидерланды
Наблюдательный
229
Мужчины и женщины в возрасте 17–63 лет
Вспышка, связанная с обедом для персонала
Dolin et al.(1982) [43]
США
Экспериментальный
9
Взрослые добровольцы

Gaulin et al. (1999) [44]
Канада
Observational
43
Посетители, посещающие рождественский ужин в ресторане

Gotz et al. (2002) [45]
Швеция
Наблюдательный
173
114 детей в возрасте 1–10 лет и 79 взрослых в возрасте 20–61 лет
Вспышка, связанная с обслуживанием обедов в 30 детских садах
Grotto et al.(2004) [13]
Израиль
Наблюдательный
162
Солдаты мужского и женского пола, дислоцированные на военной базе
Вспышка, связанная с салатом из столовой
Hirakata et al. (2005) [46]
Япония
Наблюдательный
628
Учащиеся начальной, младшей и старшей школы
Мексика Агент. Вспышка, связанная с обедом в ресторане во время производственной поездки
Исакбаева и др.(2005) [47]
США
Наблюдательный
2
Взрослая женщина и ребенок
Вспышка, связанная с контактом с больным ребенком во время двухчасовой игровой группы
Kirking et al. (2010) [48]
США
Наблюдательный
7
Взрослые и дети в возрасте 11–73 лет
Вспышка, связанная с воздействием рвотных масс в аэрозольной форме в самолете
UK
Observational
43
Посетители, посещающие ужин в большом отеле

Marshall et al. (2001) [50]
Австралия
Наблюдательный
46
Посетители ресторана
Вспышка, связанная с употреблением зараженной пищи в буфете
Thornhill et al. (1977) [51]
США
Экспериментальный
1
Взрослый доброволец
Гавайский агент
Труман и др.(1987) [52]
США
Наблюдательный
84
Взрослые мужчины и женщины в возрасте 16–74 лет
Вспышка, связанная с поеданием моллюсков на организованном мероприятии
Сапов





Хамфри и др. (1984) [53]
UK
Наблюдательный
14
Один ребенок в возрасте 3 лет, девять мужчин и женщин в возрасте 65–95 лет, 5 взрослых мужчин и женщин в возрасте 18–65 лет
Вспышка в учреждении по уходу за престарелыми и в семье, которая владела учреждением
Johansson et al.(2005) [54]
Швеция
Наблюдательный
9
Взрослые мужчины и женщины в возрасте 25–84 лет
Инфекция в больницах
Usuku et al. (2008) [55]
Япония
Наблюдательный
65
Шестьдесят учеников третьего класса и пять взрослых
Вспышка, связанная с рестораном в отеле
Yamashita et al.(2010) [56]
Япония
Наблюдательный
18
Взрослые мужчины и женщины в возрасте 20–70 лет
Вспышка после свадебного приема
Ротавирус
  • 4
  • Капикян и др. (1983) [57]
    США
    Экспериментальный
    4
    Взрослые добровольцы

    Morris et al.(1975) [58]
    UK
    Наблюдательный
    1
    Детский
    Инфекция в больницах
    Rodriguez et al. (1979) [59] США Наблюдательный 6 Две взрослые женщины и 4 ребенка в возрасте 18–24 месяцев Вспышка после игровой группы

    Кумулятивное распределение инкубационного периода. Показан совокупный процент случаев, у которых симптомы развиваются к данному дню согласно оценкам логнормального распределения.Доверительные интервалы рассчитывались методом начальной загрузки (500 итераций).

    Таблица 3

    Процентили времени появления симптомов и дисперсия для распределения заболеваний

    9014 **
    9382
    Оценка (95 % ДИ) времени появления симптомов (дни) *
    Дисперсия (95 % ДИ)
    5-й процентиль 25-й процентиль 50-й процентиль (медиана) 9013 75-й процентиль
    Астровирус

    4.0 (3,5-4,9)
    4,5 (3,9-5,2)
    5,3 (4,4-5,8)

    1,22 (1,04-1,30)
    Калицивирусы
    0,5 (0,5-0,5)
    0,9 (0,8-0,9)
    1,2 (1,1-1,2)
    1,7 (1,6-1,7)
    2,6 (2,6- 2,8)
    1,64 (1,61-1,71)
    Геногруппа I α
    0.4 (0,4-0,5)
    0,8 (0,7-0,8)
    1,1 (1,1-1,2)
    1,6 (1,6-1,7)
    3,0 (2,8-3,2)
    1,82 (1,75-1,90 )
    Геногруппа II β
    0,6 (0,5-0,6)
    0,9 (0,9-1,0)
    1,2 (1,2-1,3)
    1,6 (1,6-1,7) )
    2,5 (2,4-2,6)
    1,56 (1,49-1,62)
    Саповирусы ***
    0.9 (0,7-1,0)
    1,3 (1,1-1,4)
    1,7 (1,5-1,8)
    2,3 (2,0-2,4)
    3,3 (2,7-3,8)
    1,48 (1,36-1,61) )
    Ротавирус 1,6 (1,1-1,9) 2,0 (1,4-2,4) 2,5 (1,8-3,0) 1,37 (1,25-1,73)
    Кумулятивные распределения данных инкубационного и латентного периодов.

    Астровирус

    Астровирус передается фекально-оральным путем [22].Клинические симптомы включают диарею, боль в животе, головную боль, недомогание и рвоту, хотя рвота при астровирусной инфекции встречается реже, чем при ротавирусной или калицивирусной инфекциях [11,22]. Кроме того, астровирус с меньшей вероятностью вызывает обезвоживание или госпитализацию, чем ротавирус [2].

    Мы нашли 20 оценок инкубационного периода астровируса, включая пять исходных оценок, семь оценок с источниками и восемь оценок, в которых исходный источник не был предоставлен (оценки без источников).Заявления об инкубационном периоде обычно составляли от 1 до 5 дней (таблица). Было обнаружено три оригинальных исследования, содержащих данные, подходящие для объединенного анализа: два экспериментальных исследования с участием взрослых добровольцев [28,29] и обсервационное исследование, описывающее серию вспышек в детском центре в Хьюстоне, штат Техас, США [30]. На основе этих трех исследований мы оцениваем средний инкубационный период гастроэнтерита, вызванного астровирусом, в 4,5 дня (95% ДИ 3,9-5,2 дня) с разбросом 1,22 (95% ДИ 1.04-1.30) (таблица). 25% случаев станут симптоматическими к 4,0 дням (95% ДИ 3,5–4,9 дней), а 75% случаев станут симптомами к 5,3 дням (95% ДИ 4,4–5,8 дней) (таблица). Из-за ограниченности данных 5-й и 95-й процентили не оценивались. Немногие взрослые добровольцы проявляли симптомы при заражении астровирусом [28,30], что свидетельствует о низкой патогенности вируса у взрослых, которые могут быть защищены антителами, приобретенными в детстве [4,60]. Поскольку данные исследований взрослого заражения включают 50% абстрагируемых данных, подходящих для объединенного анализа на астровирус, наши результаты инкубационного периода могут быть неприменимы к первичным инфекциям или инфекциям у детей.

    Калицивирусы

    Калицивирусы (т. Е. Семейство Caliciviridae ) классически содержат четыре рода, два из которых, Norovirus и Sapovirus , вызывают острый гастроэнтерит у людей [11]. Было предложено, что пятый род калицивирусов включает два генотипа кишечного вируса крупного рогатого скота [61]. Норовирусы разделены на пять антигенно различных геногрупп, три из которых (I, II и IV) вызывают заболевания у людей [62,63]. Норовирусы геногруппы IV были охарактеризованы в сточных водах и речной воде, но, насколько нам известно, не были причастны к вспышкам заболеваний, поэтому этот обзор будет сосредоточен на норовирусах и саповирусах геногрупп I и II [64,65].Важно отметить, что недавние вспышки этих вирусов связаны с увеличением заболеваемости и смертности. Норовирусы и саповирусы передаются фекально-оральным путем и имеют несколько разные клинические проявления [11].

    Используя байесовский информационный критерий, мы определили, что все три геногруппы калицивируса человека статистически различаются с точки зрения распределения их инкубационного периода. Однако оценки инкубационных периодов, эпидемиологии и клинических проявлений калицивирусов геногрупп I и II для практических целей очень похожи [43,66].Мы предлагаем рассматривать эти две геногруппы, норовирусы, с одинаковым инкубационным периодом. Саповирусы имеют отличную эпидемиологию и клинические проявления от норовирусов геногрупп I и II, и их следует рассматривать как отдельную группу вирусов.

    Норовирусы (геногруппы I и II)

    Норовирусы вызывают примерно 90% всех вспышек эпидемического гастроэнтерита и являются важным источником вспышек болезней пищевого происхождения во всем мире [9,10,22]. Хотя передача происходит в основном фекально-оральным путем, имеются также свидетельства передачи через рвотные массы [48].Клинические симптомы включают спазмы в животе, тошноту, частую рвоту и диарею [22]. Большинство опубликованных оценок норовирусов соответствовало инкубационному периоду от 1 до 2 дней (таблица).

    Выявлен 131 документ с указанием инкубационного периода норовирусов. Эти документы содержали 60 исходных оценок, 74 оценки из источников и 39 оценок без источников. 54% всех полученных оценок инкубационного периода норовирусов цитировали одну из двух статей Kaplan et al.[15,67], или сослался на статью, в которой цитируется одна или обе эти статьи. Каплан и его коллеги объединили данные 38 вспышек норовируса в период с 1967 по 1980 год и предложили четыре критерия, которые можно использовать для характеристики вспышек норовируса: (1) посев кала, свободный от бактериальных патогенов, (2) средняя или средняя продолжительность болезни 12–60 часов, (3) рвота в ≥ 50% случаев и (4) средний или средний инкубационный период 24–48 часов [67]. Большинство опубликованных оценок инкубационного периода норовирусов соответствовали критериям Каплана (таблица).

    Основываясь на 2540 наблюдениях из 20 наблюдательных исследований и 15 наблюдений из трех экспериментальных исследований, мы оцениваем средний инкубационный период для норовирусов в 1,2 дня (95% ДИ 1,1-1,2 дня) с дисперсией 1,64 (95% ДИ 1,61- 1.71). В 5% случаев норовируса симптомы проявляются через 0,5 дня (95% ДИ 0,5–0,5 дня) после заражения, а в 95% случаев симптомы проявляются через 2,6 дня (95% ДИ 2,6–2,8 дня) (таблица).

    Геногруппа I

    На основании 1123 наблюдений из десяти наблюдательных исследований и пяти наблюдений из одного экспериментального исследования [33] мы оцениваем средний инкубационный период для норовирусов геногруппы I как 1.1 день (95% ДИ 1,1–1,2 дня) с дисперсией 1,82 (95% ДИ 1,75–1,90). В 5% случаев норовируса геногруппы I симптомы проявляются через 0,4 дня (95% ДИ 0,4–0,5 дня) после заражения, а в 95% случаев симптомы разовьются через 3,0 дня (95% ДИ 2,8–3,2 дня) (таблица).

    Геногруппа II

    Основываясь на десяти наблюдениях из двух экспериментальных исследований [43,51] и 1417 оценках из десяти обсервационных исследований [46,49], мы оцениваем средний инкубационный период для норовирусов геногруппы II как 1.2 дня (95% ДИ 1,2–1,3 дня) с дисперсией 1,56 (95% ДИ 1,49–1,62). В 5% случаев норовируса геногруппы II симптомы проявляются через 0,6 дня (95% ДИ 0,5–0,6 дня) после заражения, а в 95% случаев симптомы становятся симптоматическими через 2,5 дня (95% ДИ 2,4–2,6 дня) (таблица).

    Саповирусы

    Саповирусы в первую очередь вызывают гастроэнтерит у младенцев и детей и не являются важными патогенами во время вспышек болезней пищевого происхождения [68]. Клинические симптомы включают рвоту, обезвоживание, боль в животе и, в меньшей степени, диарею и лихорадку [69].Опубликованные оценки саповирусов соответствовали инкубационному периоду 1-3 дня (таблица).

    Выявлено 13 документов, содержащих 14 отчетов об инкубационном периоде саповирусов. Эти документы содержали семь исходных оценок, две оценки из источников и пять оценок без источников. Цитируемыми источниками были обзорная статья Блэклоу и Гринберга [70], в которой содержалась оценка без источника, и результаты наблюдательного исследования Ноэля и его коллег [71], описывающие вспышку штамма вируса Парквилл.

    Основываясь на 106 наблюдениях из четырех обсервационных исследований [53-56], мы оцениваем средний инкубационный период саповирусов в 1,7 дня (95% ДИ 1,5–1,8 дня) с дисперсией 1,48 (95% ДИ 1,36–1,61) . В 5% случаев симптомы проявляются через 0,9 дня (95% ДИ 0,7–1,0 дня) после заражения, а в 95% случаев симптомы проявляются через 3,3 дня (95% ДИ 2,7–3,8 дня) (таблица).

    Ротавирус

    Ротавирус передается фекально-оральным путем [22,72]. Ротавирус группы А вызывает более 600 000 случаев смерти младенцев и детей младшего возраста в год, в основном в развивающихся странах [73].Ротавирусы группы B преимущественно наблюдались во взрывных вспышках среди взрослых в Китае [11,74]. Ротавирусы группы C, по-видимому, не имеют значения для общественного здравоохранения [11,74]. Распространенность серотипов ротавирусов в этих группах варьируется в разных частях мира, что чрезвычайно затрудняет широкомасштабную эффективную борьбу с заболеванием [75]. Клинические симптомы включают лихорадку и рвоту, за которыми следует обильная водянистая диарея и обезвоживание [76]. Инфекции, вызывающие острое заболевание, возникают преимущественно в возрасте от 6 до 24 месяцев [76,77].У взрослых инфекции обычно протекают бессимптомно, однако заболевание было вызвано экспериментально у взрослых, и описаны вспышки среди взрослого населения [11,57,78,79].

    Мы нашли 110 оценок инкубационного периода ротавируса, включая 19 исходных оценок, 54 оценки с источниками и 37 оценок без источников. Большинство опубликованных оценок ротавируса соответствовали двухдневному инкубационному периоду (таблица).

    Основываясь на четырех наблюдениях из одного экспериментального исследования на взрослых добровольцах [57] и шести наблюдениях из двух наблюдательных исследований [58,59], мы оцениваем средний инкубационный период ротавируса как 2.0 дней (95% ДИ 1,4–2,4 дня) с дисперсией 1,37 (1,25–1,73). В 25% случаев ротавирус становится симптоматическим через 1,6 дня (95% ДИ 1,1–1,9 дня), а в 75% случаев симптомы проявляются через 2,5 дня (95% ДИ 1,8–3,0 дня) после заражения (таблица). Из-за ограниченности данных 5-й и 95-й процентили не оценивались.

    Обсуждение

    Оценка инкубационного периода инфекционных заболеваний, включая гастроэнтерит, имеет решающее значение для обоснования и обоснованности вмешательств, направленных на прекращение текущей передачи.В нашем обзоре трех основных вирусных причин гастроэнтерита мы обнаружили, что 61% из 226 оценок инкубационного периода даны со ссылкой. После изучения деревьев цитирования для этих оценок только 114 (50%) из 226 были фактически основаны на данных. Двадцать три (17%) оценок из источников ссылались на статью, которая содержала оценку без источников. Эти данные показывают, что инкубационные периоды кишечных вирусов часто считаются общеизвестными. Из источников, основанных на данных, большинство для каждого вируса можно проследить до оценок из небольшого числа оригинальных исследований, таких как Kaplan et al.статьи для геногрупп I и II норовирусов [15,67].

    Были некоторые опасения, что отдельные исследования потенциально могут иметь чрезмерное влияние на объединенный анализ. Мы провели анализ чувствительности, удалив все исследования и пересчитав оценки инкубационного периода. Мы не обнаружили качественной разницы в результатах.

    Определение инкубационного периода ограничено степенью неопределенности относительно времени заражения. Поскольку инкубационные периоды вирусного гастроэнтерита короткие, часто бывает трудно различить первичный и вторичный случаи во время вспышки.Это затрудняет получение точной информации об интервале экспозиции. Большинство обсервационных исследований, особенно исследований вспышек пищевого происхождения, решают эту проблему, рассматривая только случаи в течение определенного количества дней после заражения [34,36,37,42,44,52,80-82]. Этот метод идентификации случаев может внести систематическую ошибку за счет исключения случаев, которые попадают в конечную точку распределения инкубационного периода. Несмотря на то, что существует множество наблюдательных исследований, описывающих вспышки, вызванные ротавирусом и астровирусом, поскольку интервал воздействия для отдельных случаев не может быть определен, данные этих исследований не могут использоваться для определения инкубационного периода.

    Множество факторов могут привести к тому, что данные экспериментального заражения будут отличаться от данных естественного заражения, например, инфекционная доза или добровольцы, чей статус хозяина отличается от такового в общей популяции. Например, единственное экспериментальное исследование, внесшее данные в объединенный анализ ротавируса, проводилось с поиском добровольцев с низким уровнем антител в сыворотке [57]. Эти предубеждения усугубляются невозможностью проведения экспериментальных исследований проблем среди групп населения, наиболее подверженных риску заболеваний, среди детей и пожилых людей.Это особенно верно в отношении ротавируса и астровируса, болезней, от которых почти всегда страдают маленькие дети.

    Этот обзор был ограничен включением только опубликованных данных и условиями поиска. Из-за того, что мы включили некоторую форму «инкубационного периода» в поиск статей, вся литература по каждому вирусу не рассматривалась. Наши оценки для астровируса и ротавируса основаны на трех исследованиях и менее чем 20 наблюдениях. Из-за трудностей экспериментального изучения этих заболеваний необходимы тщательные наблюдательные исследования, чтобы получить больше доказательств, подтверждающих инкубационный период и его распространение.

    Точное знание инкубационного периода особенно важно для вирусного гастроэнтерита из-за короткой продолжительности инкубационного периода, относительно высокой частоты вторичных атак и возможности возникновения вспышек заболеваний, связанных с оказанием медицинской помощи. Как ротавирус, так и норовирус особенно трудно контролировать в медицинских учреждениях [11,83]. Фишер и его коллеги определили, что в среднем 27% пациентов в развитых странах и 32% пациентов в развивающихся странах, выписанных с диагнозом ротавирус, заразились этим вирусом в больнице [17].Кроме того, инкубационный период является важным компонентом серийного интервала (разница во времени появления симптомов в случае и в случае инфицирования), который является одним из основных факторов, определяющих скорость распространения эпидемий в популяции.

    Несмотря на лицензирование двух безопасных и эффективных вакцин, ротавирус продолжает оставаться важной проблемой общественного здравоохранения. Это особенно верно в развивающихся странах, где происходит подавляющее большинство ротавирусных заболеваний и смертей, и где ротавирусная вакцина имеет самую низкую эффективность [84].Точное знание инкубационного периода важно для понимания динамики ротавирусной болезни и борьбы с ней. По мере того как охват вакцинацией улучшается и ротавирусная инфекция перестает быть повсеместной, инкубационный период будет полезен для изучения воздействия патогенов, связанного с неэффективностью вакцинации, и потенциальных различий в восприимчивости хозяев к инфекции.

    Заключение

    После нашей работы по оценке инкубационного периода респираторных вирусов [20], в этом обзоре мы объединили опубликованные данные для оценки инкубационных периодов пяти кишечных вирусов, важных для общественного здравоохранения.Как правило, опубликованные оценки инкубационного периода описывают только центральную тенденцию или указывают на неопределенный диапазон, однако знание распределения всего инкубационного периода важно для полного понимания динамики заболевания и потенциальной эффективности мер контроля. Это особенно верно в условиях, когда инфекции могут быть взрывоопасными и иметь огромное влияние на результаты лечения пациентов. Наши оценки обеспечивают дополнительный уровень детализации, необходимый для этих и других приложений, что делает инкубационный период более полезным для исследований, клинической практики и политики общественного здравоохранения.

    Конкурирующие интересы

    Авторы заявляют, что у них нет конкурирующих интересов.

    Вклад авторов

    RML провела систематический обзор и анализ данных, а также подготовила рукопись. JL провел анализ данных и помог составить рукопись. RAL и KER провели систематический обзор. JL, DATC, TMP и NGR участвовали в разработке и концепции исследования. Все авторы прочитали и одобрили окончательную рукопись.

    Дополнительные материалы

    Дополнительный файл 1:

    Сравнение логарифмически нормального, гамма-распределений, распределений Вейбулла и Эрлинга.

    Благодарности

    Работа JL над этим проектом финансировалась за счет гранта Фонда Билла и Мелинды Гейтс (Инициатива по моделированию вакцин, 705580–3), и он является лауреатом премии NIH в области научных исследований в области развития (NIAID, K22). AI0-01). KER финансировался Отделом программ интромуральных исследований Национального института психического здоровья.

    Ссылки

    • Parashar UD, Hummelman EG, Bresee JS, Miller MA, Glass RI. Заболевания и смертность детей от ротавирусной инфекции в мире.Emerg Infect Dis. 2003. 9: 565–572. DOI: 10.3201 / eid0905.020562. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
    • Dennehy PH, Nelson SM, Spangenberger S, Noel JS, Monroe SS, Glass RI. Проспективное исследование «случай – контроль» роли астровируса в острой диарее среди госпитализированных маленьких детей. J Infect Dis. 2001; 184: 10–15. DOI: 10,1086 / 321007. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
    • Херрманн Дж. Э., Тейлор Д. Н., Эчеверрия П., Блэклоу Н. Р.. Астровирусы как причина гастроэнтерита у детей.N Engl J Med. 1991; 324: 1757–1760. DOI: 10.1056 / NEJM1903242501. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
    • Курц Дж., Ли Т. Распределение антител по возрасту астровирусного гастроэнтерита. Med Microbiol Immunol. 1978; 166: 227–230. DOI: 10.1007 / BF02121154. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
    • Rodriguez-Baez N, O’Brien R, Qiu SQ, Bass DM. Астровирус, аденовирус и ротавирус у госпитализированных детей: распространенность и связь с гастроэнтеритом. J Pediatr Gastroenterol Nutr. 2002. 35: 64–68.DOI: 10.1097 / 00005176-200207000-00014. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
    • Шастри С., Доан А.М., Гонсалес Дж., Упадхьяюла Ю., басс Д.М. Распространенность астровирусов в детской больнице. J Clin Microbiol. 1998. 36: 2571–2574. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]
    • Lewis DC, Lightfoot NF, Cubitt WD, Wilson SA. Вспышки астровируса типа 1 и ротавирусного гастроэнтерита в гериатрических стационарах. J Hosp Infect. 1989; 14: 9–14. DOI: 10.1016 / 0195-6701 (89) -X.[PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
    • Gray JJ, Wreghitt TG, Cubitt WD, Elliot PR. Вспышка гастроэнтерита в доме престарелых, связанная с астровирусом 1 типа и калицивирусом человека. J Med Virol. 1987. 23: 377–381. DOI: 10.1002 / jmv.18410. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
    • Технические данные. http://www.cdc.gov/norovirus/php/illness-outbreaks.html.
    • Долин Р. Норовирусы — проблемы, которые нужно контролировать. N Engl J Med. 2007; 357: 1072–1073. DOI: 10.1056 / NEJMp078050.[PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
    • Хоули П., Книп Д., Филдс Б. Вирусология Филда, 5-е изд. Филадельфия: Липпинкотт, Уильямс и Уилкинс; 2007. [Google Scholar]
    • Lessler J, Brookmeyer R, Perl TM. Оценка правил классификации на основе даты появления симптомов для выявления инфекций, связанных с оказанием медицинской помощи. Am J Epidemiol. 2007. 166: 1220–1229. DOI: 10,1093 / AJE / kwm188. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
    • Grotto I, Huerta M, Balicer RD, Halperin T, Cohen D, Orr N, Gdalevich M.Вспышка норовирусного гастроэнтерита на израильской военной базе. Инфекционное заболевание. 2004. 32: 339–343. DOI: 10.1007 / s15010-004-4002-3. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
    • Schmid D, Stuger HP, Lederer I, Pichler AM, Kainz-Arnfelser G, Schreier E, Allerberger F. Вспышка норовируса пищевого происхождения из-за салата, приготовленного вручную, Австрия, 2006 г. Инфекция. 2007. 35: 232–239. DOI: 10.1007 / s15010-007-6327-1. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
    • Каплан Дж. Э., Фельдман Р., Кэмпбелл Д. С., Лукабо К., Гэри Г. У.Частота болезни, аналогичной норволкской, во вспышках острого гастроэнтерита. Am J Public Health. 1982; 72: 1329–1332. DOI: 10.2105 / AJPH.72.12.1329. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
    • Fraser C, Riley S, Anderson RM, Ferguson NM. Факторы, позволяющие контролировать вспышку инфекционного заболевания. Proc Natl Acad Sci USA. 2004. 101: 6146–6151. DOI: 10.1073 / pnas.0307506101. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
    • Fischer TK, Bresee JS, Glass RI.Ротавирусные вакцины и профилактика госпитальной диареи у детей. Вакцина. 2004; 22 (Приложение 1): S49 – S54. [PubMed] [Google Scholar]
    • Blacklow NR, Herrmann JE. Астровирусный гастроэнтерит. Trans Am Clin Climatol Assoc. 1995; 106: 58–66. обсуждение 66–58. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]
    • Reich NG, Perl TM, Cummings DA, Lessler J. Визуализация клинических данных: сети цитирования для инкубационных периодов респираторных вирусных инфекций. PLoS One. 2011; 6: e19496.DOI: 10.1371 / journal.pone.0019496. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
    • Lessler J, Reich NG, Brookmeyer R, Perl TM, Nelson KE, Cummings DA. Инкубационные периоды ОРВИ: систематический обзор. Lancet Infect Dis. 2009; 9: 291–300. DOI: 10.1016 / S1473-3099 (09) 70069-6. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
    • Хейманн Д. Руководство по борьбе с инфекционными заболеваниями. 19. Вашингтон, округ Колумбия: Американская ассоциация общественного здравоохранения; 2008 г.[Google Scholar]
    • Манделл Дж., Беннет Дж., Долин Р. Принципы и практика инфекционных заболеваний. Филадельфия: Черчилль Ливингстон; 2005. [Google Scholar]
    • Пикеринг Л. Красная книга: отчет Комитета по инфекционным болезням за 2009 год. 28. Элк-Гроув-Виллидж, Иллинойс: Американская академия педиатрии; 2009. 225, 241-242, 576-579. [Google Scholar]
    • Каулинг Б.Дж., Мюллер М.П., ​​Вонг И.О., Хо Л.М., Луи М., МакГир А., Люн Г.М. Альтернативные методы оценки распределения инкубации: примеры из тяжелого острого респираторного синдрома.Эпидемиология. 2007. 18: 253–259. DOI: 10.1097 / 01.ede.0000254660.07942.fb. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
    • Рейх Н.Г., Лесслер Дж., Каммингс Д.А., Брукмейер Р. Оценка распределения инкубационного периода с помощью приблизительных данных. Stat Med. 2009. 28: 2769–2784. DOI: 10.1002 / sim.3659. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
    • Sartwell PE. Распределение инкубационных периодов инфекционного заболевания. Am J Hyg. 1950; 51: 310–318. [PubMed] [Google Scholar]
    • coarseDataTools: набор функций, помогающих анализировать грубо наблюдаемые данные.http://cran.r-project.org/web/packages/coarseDataTools.
    • Курц Дж. Б., Ли Т. В., Крейг Дж. В., Рид С. Е.. Астровирусная инфекция у добровольцев. J Med Virol. 1979; 3: 221–230. DOI: 10.1002 / jmv.18

      308. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

    • Midthun K, Greenberg HB, Kurtz JB, Gary GW, Lin FY, Kapikian AZ. Характеристика и сероэпидемиология астровируса типа 5, связанного со вспышкой гастроэнтерита в округе Марин, Калифорния. J Clin Microbiol. 1993; 31: 955–962. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]
    • Митчелл Д.К., Ван Р., Морроу А.Л., Монро С.С., Гласс Р.И., Пикеринг Л.К.Вспышки астровирусного гастроэнтерита в детских садах. J Pediatr. 1993; 123: 725–732. DOI: 10.1016 / S0022-3476 (05) 80846-7. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
    • Baron RC, Murphy FD, Greenberg HB, Davis CE, Bregman DJ, Gary GW, Hughes JM, Schonberger LB. Желудочно-кишечное заболевание Norwalk: вспышка, связанная с купанием в озере для отдыха, и вторичная передача от человека к человеку. Am J Epidemiol. 1982; 115: 163–172. [PubMed] [Google Scholar]
    • Becker KM, Moe CL, Southwick KL, MacCormack JN.Передача вируса Norwalk во время футбольного матча. N Engl J Med. 2000; 343: 1223–1227. DOI: 10.1056 / NEJM200010263431704. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
    • Dolin R, Blacklow NR, DuPont H, Formal S, Buscho RF, Kasel JA, Chames RP, Hornick R, Chanock RM. Передача острого инфекционного небактериального гастроэнтерита добровольцам при пероральном приеме фильтрата стула. J Infect Dis. 1971; 123: 307–312. DOI: 10.1093 / infdis / 123.3.307. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
    • Gill ON, Cubitt WD, McSwiggan DA, Watney BM, Bartlett CL.Эпидемия гастроэнтерита, вызванная устрицами, зараженными небольшими вирусами с круглой структурой. Br Med J (Clin Res Ed) 1983; 287: 1532–1534. DOI: 10.1136 / bmj.287.6404.1532. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
    • Hicks NJ, Beynon JH, Bingham P, Soltanpoor N, Green J. Вспышка вирусного гастроэнтерита после свадебного приема. Commun Dis Rep CDR Rev.1996; 6: R136 – R139. [PubMed] [Google Scholar]
    • Hoebe CJ, Vennema H, de Roda Husman AM, van Duynhoven YT.Вспышка норовируса среди младших школьников, игравших в фонтанчике с водой для отдыха. J Infect Dis. 2004; 189: 699–705. DOI: 10,1086 / 381534. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
    • Курицкий Дж. Н., Остерхольм М. Т., Гринберг Х. Б., Корлат Дж. А., Годес Дж. Р., Хедберг К. В., Форфанг Дж. К., Капикян А. З., Маккалоу Дж. К., Уайт К. Э. Норуолкский гастроэнтерит: вспышка болезни в сообществе, связанная с потреблением хлебобулочных изделий. Ann Intern Med. 1984; 100: 519–521. DOI: 10.7326 / 0003-4819-100-4-519. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
    • Linco SJ, Grohmann GS.Дарвиновская вспышка вирусного гастроэнтерита, связанного с устрицами. Med J Aust. 1980; 1: 211–213. [PubMed] [Google Scholar]
    • Matshuhashi N, Nishi Y, Nagoshi D, Kanemoto H. A N: Эпидемический энтерколит, возможно, в результате заражения вирусом Норуолк, проявляющийся как ишемический колит . Dig Endosc. 2003. 15: 138–141. DOI: 10.1046 / j.1443-1661.2003.00234.x. [CrossRef] [Google Scholar]
    • Чендлер Б., Беллер М., Дженкерсон С., Миддо Дж., Робертс С., Рейсдорф Э., Рауш М., Сэвидж Р., Дэвис Дж. Вспышки вирусного гастроэнтерита, подобного Норуолку, — Аляска и Висконсин, 1999.MMWR Morb Mortal Wkly Rep. 2000; 49: 207–211. [PubMed] [Google Scholar]
    • Тейлор Дж. У., Гэри Дж. У. мл., Гринберг HB. Связанный с Норуолком вирусный гастроэнтерит из-за загрязненной питьевой воды. Am J Epidemiol. 1981; 114: 584–592. [PubMed] [Google Scholar]
    • de Wit MA, Widdowson MA, Vennema H, de Bruin E, Fernandes T, Koopmans M. Крупная вспышка норовируса: пекарь, который должен был знать лучше. J Infect. 2007. 55: 188–193. DOI: 10.1016 / j.jinf.2007.04.005. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
    • Dolin R, Reichman RC, Roessner KD, Tralka TS, Schooley RT, Gary W, Morens D.Обнаружение с помощью иммунной электронной микроскопии возбудителя острого вирусного гастроэнтерита Снежной горы. J Infect Dis. 1982; 146: 184–189. DOI: 10.1093 / infdis / 146.2.184. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
    • Гаулин С., Фригон М., Пуарье Д., Фурнье С. Передача калицивируса работником еды на предсимптоматической стадии болезни. Epidemiol Infect. 1999; 123: 475–478. DOI: 10.1017 / S095026889

      9X. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
    • Gotz H, de Jong B, Lindback J, Parment PA, Hedlund KO, Torven M, Ekdahl K.Эпидемиологическое расследование вспышки пищевого гастроэнтерита, вызванного Норуолк-подобным вирусом, в 30 детских садах. Scand J Infect Dis. 2002; 34: 115–121. DOI: 10.1080 / 00365540110080133. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
    • Хираката Ю., Арисава К., Нишио О., Накагоми О. Распространение вспышек гастроэнтерита в нескольких префектурах, вызванных одним штаммом норовируса геногруппы II из туристического ресторана в Нагасаки, Япония. J Clin Microbiol. 2005; 43: 1093–1098. DOI: 10.1128 / JCM.43.3.1093-1098.2005. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
    • Исакбаева Е.Т., Буленс С.Н., Борода Р.С., Адамс С., Монро С.С., Чавес С.С., Виддоусон М.А., Гласс Р.И. Норовирус и уход за детьми: проблемы в борьбе со вспышками. Pediatr Infect Dis J. 2005; 24: 561–563. DOI: 10.1097 / 01.inf.0000164764.58715.23. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
    • Киркинг Х.Л., Кортес Дж., Беррер С., Холл А.Дж., Коэн Нью-Джерси, Липман Х., Ким С., Дейли Э.Р., Фишбейн Д.Б. Вероятная передача норовируса в самолете, октябрь 2008 г.Clin Infect Dis. 2010; 50: 1216–1221. DOI: 10,1086 / 651597. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
    • Маркс П.Дж., Випонд И.Б., Карлайл Д., Дикин Д., Фей Р.Э., Кол Е.О. Доказательства воздушно-капельной передачи Норуолк-подобного вируса (NLV) в ресторане отеля. Epidemiol Infect. 2000; 124: 481–487. DOI: 10.1017 / S095026889

      05. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

    • Marshall JA, Yuen LK, Catton MG, Gunesekere IC, Wright PJ, Bettelheim KA, Griffith JM, Lightfoot D, Hogg GG, Gregory J.и др. Множественные вспышки норволкского вирусного гастроэнтерита, связанные с рестораном в средиземноморском стиле. J Med Microbiol. 2001; 50: 143–151. [PubMed] [Google Scholar]
    • Торнхилл Т.С., Вятт Р.Г., Калица А.Р., Долин Р., Чанок Р.М., Капикян А.З. Обнаружение с помощью иммунной электронной микроскопии вирусоподобных частиц размером 26–27 нм, связанных с двумя семейными вспышками гастроэнтерита. J Infect Dis. 1977; 135: 20–27. DOI: 10.1093 / infdis / 135.1.20. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
    • Трумэн Б.И., Мадоре Х.П., Менегус М.А., Ницкин Д.Л., Долин Р.Снежная гора возбудитель гастроэнтерита от моллюсков. Am J Epidemiol. 1987; 126: 516–525. [PubMed] [Google Scholar]
    • Хамфри Т.Дж., Крукшанк Дж. Г., Кубитт В. Д.. Вспышка гастроэнтерита, ассоциированного с калицивирусами, в доме престарелых. Возможный зооноз? Дж. Хиг (Лондон) 1984; 93: 293–299. DOI: 10.1017 / S0022172400064822. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
    • Johansson PJ, Bergentoft K, Larsson PA, Magnusson G, Widell A, Thorhagen M, Hedlund KO. Вспышка гастроэнтерита у взрослых, связанная с внутрибольничными саповирусами.Scand J Infect Dis. 2005; 37: 200–204. DOI: 10.1080 / 00365540410020974. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
    • Усуку С., Кумазаки М., Китамура К., Точикубо О, Ногучи Ю. Вспышка пищевого гастроэнтерита, вызванного саповирусом, среди учеников младших классов средней школы. Jpn J Infect Dis. 2008. 61: 438–441. [PubMed] [Google Scholar]
    • Ямасита Ю., Оцука Ю., Кондо Р., Осето М., Дой М., Миямото Т., Уэда Т., Кондо Х., Танака Т., Вакита Т. и др. Молекулярная характеристика саповируса, обнаруженного при гастроэнтерите вспышка в свадебном зале.J Med Virol. 2010. 82: 720–726. DOI: 10.1002 / jmv.21646. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
    • Капикян А.З., Вятт Р.Г., Левин М.М., Блэк Р.Э., Гринберг Г.Б., Флорес Дж., Калица А.Р., Хошино Ю., Чанок Р.М. Исследования на добровольцах с ротавирусами человека. Dev Biol Stand. 1983; 53: 209–218. [PubMed] [Google Scholar]
    • Morris CA, Flewett TH, Bryden AS, Davies H. Эпидемический вирусный энтерит в детской палате длительного пребывания. Ланцет. 1975; 1: 4–5. [PubMed] [Google Scholar]
    • Родригес В.Дж., Ким Х.В., Брандт С.Д., Йолкен Р.Х., Ричард М., Арробио Дж.О., Шварц Р.Х., Капикян А.З., Чанок Р.М., Парротт Р.Х.Распространенная вспышка гастроэнтерита, вызванного ротавирусом 2 типа, с высокой частотой вторичных атак в семьях. J Infect Dis. 1979; 140: 353–357. DOI: 10.1093 / infdis / 140.3.353. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
    • Митчелл Д.К., Матсон Д.О., Кубитт В.Д., Джексон Л.Дж., Уиллкокс М.М., Пикеринг Л.К., Картер М.Дж. Распространенность антител к астровирусу 1 и 3 типов у детей и подростков в Норфолке, Вирджиния. Pediatr Infect Dis J. 1999; 18: 249–254. DOI: 10.1097 / 00006454-1990-00008. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
    • Оливер С.Л., Асобайре Э., Дастджерди А.М., Бриджер Дж.Геномная характеристика неклассифицированного кишечного вируса крупного рогатого скота Newbury agent-1 (Newbury1) подтверждает новый род в семействе Caliciviridae. Вирусология. 2006; 350: 240–250. DOI: 10.1016 / j.virol.2006.02.027. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
    • Сципиони А., Маурой А., Винье Дж., Тири Э. Норовирусы животных. Вет Дж. 2008; 178: 32–45. DOI: 10.1016 / j.tvjl.2007.11.012. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
    • Норовирус. http://www.cdc.gov/norovirus/hcp/clinical-overview.html.
    • Китадзима М., Ока Т., Харамото Е., Фануван С., Такеда Н., Катаяма К., Катаяма Х. Генетическое разнообразие норовирусов геногруппы IV в сточных водах в Японии. Lett Appl Microbiol. 2011; 52: 181–184. DOI: 10.1111 / j.1472-765X.2010.02980.x. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
    • Китадзима М., Ока Т., Харамото Э, Такеда Н., Катаяма К., Катаяма Х. Сезонное распределение и генетическое разнообразие норовирусов геногрупп I, II и IV в реке Тамагава, Япония . Environ Sci Technol. 2010; 44: 7116–7122.DOI: 10.1021 / es100346a. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
    • Кол Е.О., Эпплтон Х. Электронно-микроскопические и физические характеристики небольших круглых фекальных вирусов человека: временная схема классификации. J Med Virol. 1982; 9: 257–265. DOI: 10.1002 / jmv.18

      403. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

    • Каплан Дж. Э., Гэри Г. У., Барон Р. К., Сингх Н., Шонбергер Л. Б., Фельдман Р., Гринберг HB. Эпидемиология гастроэнтерита Норуолк и роль вируса Норуолк во вспышках острого небактериального гастроэнтерита.Ann Intern Med. 1982; 96: 756–761. DOI: 10.7326 / 0003-4819-96-6-756. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
    • Чиба С., Наката С., Нумата-Киношита К., Хонма С. Вирус Саппоро: история и недавние открытия. J Infect Dis. 2000; 181 (Дополнение 2): S303 – S308. [PubMed] [Google Scholar]
    • Дей С.К., Фан Т.Г., Нгуен Т.А., Нишио О., Салим А.Ф., Ягю Ф., Окицу С., Ушиджима Х. Распространенность саповирусной инфекции среди младенцев и детей с острым гастроэнтеритом в Дакка, Бангладеш во время 2004–2005 гг.J Med Virol. 2007. 79: 633–638. DOI: 10.1002 / jmv.20859. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
    • Blacklow NR, Greenberg HB. Вирусный гастроэнтерит. N Engl J Med. 1991; 325: 252–264. DOI: 10.1056 / NEJM1953250406. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
    • Ноэль Дж. С., Лю Б. Л., Хамфри К. Д., Родригес Е. М., Ламбден П. Р., Кларк И. Н., Дуайер Д. М., Андо Т., Гласс Р. И., Монро С. С.. Вирус Парквилля: новый генетический вариант калицивируса человека в кладе вируса Саппоро, связанный со вспышкой гастроэнтерита у взрослых.J Med Virol. 1997. 52: 173–178. DOI: 10.1002 / (SICI) 1096-9071 (199706) 52: 2 <173 :: AID-JMV10> 3.0.CO; 2-M. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
    • Епископ РФ, Дэвидсон Г.П., Холмс И.Х., Рак Б.Дж. Вирусные частицы в эпителиальных клетках слизистой оболочки двенадцатиперстной кишки у детей с острым небактериальным гастроэнтеритом. Ланцет. 1973; 2: 1281–1283. [PubMed] [Google Scholar]
    • Парашар Ю.Д., Гибсон С.Дж., Бресс Дж.С., Гласс Р.И. Ротавирус и тяжелая диарея у детей. Emerg Infect Dis. 2006. 12: 304–306. DOI: 10.3201 / eid1202.050006. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
    • Mackow E. In: Инфекции желудочно-кишечного тракта. Блазер М., Смит П., Равдин Дж., Гринберг Х., Геррант Р.Л., редактор. Нью-Йорк: Raven Press; 1995. Ротавирусы группы B и C; С. 983–1008. [Google Scholar]
    • Сантос Н., Хосино Ю. Глобальное распространение серотипов / генотипов ротавируса и его значение для разработки и внедрения эффективной ротавирусной вакцины. Rev Med Virol. 2005; 15: 29–56.DOI: 10.1002 / RMV.448. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
    • Родригес В.Дж., Ким Х.В., Арробио Дж.О., Брандт С.Д., Чанок Р.М., Капикиан А.З., Вятт Р.Г., Парротт Р.Х. Клинические особенности острого гастроэнтерита, связанного с реовирусоподобным агентом человека, у младенцев и детей раннего возраста. J Pediatr. 1977; 91: 188–193. DOI: 10.1016 / S0022-3476 (77) 80810-X. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
    • Brandt CD, Kim HW, Rodriguez WJ, Arrobio JO, Jeffries BC, Stallings EP, Lewis C, Miles AJ, Chanock RM, Kapikian AZ, Parrott RH.Детский вирусный гастроэнтерит за восемь лет исследования. J Clin Microbiol. 1983; 18: 71–78. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]
    • Эдмонсон Л. М., Эбберт Дж. О., Эванс Дж. М.. Сообщение о вспышке ротавируса среди взрослого населения дома престарелых. J Am Med Dir Assoc. 2000; 1: 175–179. [PubMed] [Google Scholar]
    • Hrdy DB. Эпидемиология ротавирусной инфекции у взрослых. Rev Infect Dis. 1987; 9: 461–469. DOI: 10.1093 / Clinids / 9.3.461. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
    • Griffin MR, Surowiec JJ, McCloskey DI, Capuano B, Pierzynski B, Quinn M, Wojnarski R, Parkin WE, Greenberg H, Gary GW.Норуолкский вирус пищевого происхождения. Am J Epidemiol. 1982; 115: 178–184. [PubMed] [Google Scholar]
    • Ганн Р.А., Яновски Х.Т., Либ С., Пратер ЕС, Гринберг Х.Б. Гастроэнтерит, вызванный вирусом Norwalk, возникший после употребления в пищу сырых устриц. Am J Epidemiol. 1982; 115: 348–351. [PubMed] [Google Scholar]
    • Malek M, Barzilay E, Kramer A, Camp B, Jaykus LA, Escudero-Abarca B, Derrick G, White P, Gerba C, Higgins C. и др. Вспышка норовирусной инфекции среди рек стропила, связанные с упакованным мясом деликатесов, Гранд-Каньон, 2005 г.Clin Infect Dis. 2009. 48: 31–37. DOI: 10,1086 / 5
      . [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
    • Саид MA, Perl TM, Sears CL. Эпидемиология здравоохранения: желудочно-кишечный грипп: норовирус в учреждениях здравоохранения и длительного ухода. Clin Infect Dis. 2008. 47: 1202–1208. DOI: 10,1086 / 5. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
    • О’Райан М., Linhares AC. Последняя информация о Rotarix: пероральная вакцина против ротавируса человека. Экспертные ревакцины. 2009. 8: 1627–1641. DOI: 10.1586 / erv.09.136. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

    Инкубационные периоды вирусного гастроэнтерита: систематический обзор

    BMC Infect Dis.2013; 13: 446.

    , 1 , 2 , 1 , 2 , 3 , 4 и 2

    Рейчел М. Ли

    1 Департамент международного здравоохранения, Johns Hopkins Bloomberg School of Public Health, Baltimore, USA

    Justin Lessler

    2 Департамент эпидемиологии, Школа общественного здравоохранения Bloomberg Джонса Хопкинса, Балтимор, США

    Rose A Lee

    1 Department of International Health, Johns Hopkins Bloomberg School of Public Health, Балтимор, США

    Kara E Rudolph

    2 Департамент эпидемиологии, Школа общественного здравоохранения Bloomberg Джонса Хопкинса, Балтимор, США

    Nicholas G Reich

    3 Отдел биостатистики и эпидемиологии , Школа общественного здравоохранения и медицинских наук, Массачусетский университет, Амхерст, Амхерст, США

    Триш М. Перл

    4 Депар Департамент медицины, Отделение инфекционных заболеваний, Медицинская школа Университета Джона Хопкинса, Балтимор, США

    Дерек А.Т. Каммингс

    2 Департамент эпидемиологии, Школа общественного здравоохранения Блумберга Джонса Хопкинса, Балтимор, США

    1 Департамент Международного здравоохранения, Школа общественного здравоохранения Блумберга Джонса Хопкинса, Балтимор, США

    2 Департамент эпидемиологии, Школа общественного здравоохранения Блумберга Джонса Хопкинса, Балтимор, США

    3 Отдел биостатистики и эпидемиологии, Школа общественного здравоохранения и медицинских наук, Массачусетский университет, Амхерст, Амхерст, США

    4 Департамент медицины, Отделение инфекционных заболеваний, Медицинский факультет Университета Джона Хопкинса, Балтимор, США

    Автор, отвечающий за переписку.

    Поступило 06 марта 2013 г .; Принято 12 сентября 2013 г.

    Copyright © 2013 Lee et al .; лицензиат BioMed Central Ltd. Это статья в открытом доступе, распространяемая в соответствии с условиями лицензии Creative Commons Attribution License (http://creativecommons.org/licenses/by/2.0), которая разрешает неограниченное использование, распространение и воспроизведение на любом носителе, при условии правильного цитирования оригинальной работы. Эта статья цитировалась в других статьях в PMC.
    Дополнительные материалы

    Дополнительный файл 1 Сравнение логарифмически нормального, гамма-распределений, распределений Вейбулла и Эрлинга.

    GUID: E778F8C8-667E-4C91-903D-7B3CCDE5DCA8

    Реферат

    Предпосылки

    Точное знание инкубационного периода важно для исследования и контроля инфекционных заболеваний и их передачи, однако сведения об инкубационном периоде имеются в литературе. часто не цитируются, противоречивы и / или не основаны на доказательствах.

    Методы

    При систематическом обзоре литературы по пяти кишечным вирусам, имеющим значение для общественного здравоохранения, мы нашли 256 статей с оценками инкубационного периода, в том числе 33 с данными для объединенного анализа.

    Результаты

    Мы подобрали логарифмически нормальное распределение для объединенных данных и обнаружили, что средний инкубационный период составляет 4,5 дня (95% ДИ 3,9-5,2 дня) для астровируса, 1,2 дня (95% ДИ 1,1-1,2 дня) для норовируса. геногрупп I и II, 1,7 дня (95% ДИ 1,5–1,8 дня) для саповирусов и 2,0 дня (95% ДИ 1,4–2,4 дня) для ротавируса.

    Выводы

    Наши оценки объединяют опубликованные данные и предоставляют достаточные количественные детали, позволяющие использовать эти оценки в широком спектре клинических приложений и приложений для моделирования.Это может привести к улучшению мер профилактики и контроля в условиях передачи или риска передачи.

    Ключевые слова: Инкубационный период, норовирус, ротавирус, калицивирусы, астровирус, систематический обзор

    Предпосылки

    Острый вирусный гастроэнтерит является важной и часто недооцениваемой причиной заболеваемости и смертности во всем мире. Почти все дети перенесли хотя бы одну ротавирусную инфекцию к пяти годам. Ежегодно на ротавирус приходится около двух миллионов госпитализаций и от 350 000 до 600 000 случаев смерти детей младшего возраста [1].Несколько исследований показали, что астровирус является важной причиной острого гастроэнтерита у детей раннего возраста; исследование распространенности в Соединенном Королевстве показало, что более 70% пятилетних детей имеют антитела к вирусу [2-6]. Астровирус также упоминается как важная причина гастроэнтерита у пожилых людей [7,8]. Калицивирусы, в частности норовирусы, являются наиболее важной причиной эпидемических небактериальных гастроэнтеритов во всем мире, поражают как взрослых, так и детей и составляют от 40 до 50% всех гастроэнтеритов пищевого происхождения в США [9,10].

    Астровирус, ротавирус и калицивирусы являются важными причинами инфекций, связанных с оказанием медицинской помощи, и вспышек заболеваний в медицинских учреждениях [11]. Инкубационный период (время между заражением и появлением симптомов) важен для точного эпиднадзора за инфекциями, связанными с оказанием медицинской помощи, и реализации эффективных мер борьбы со вспышками (например, когортирование и / или карантин). [12] Инкубационный период часто используется для определения заражающего воздействия во время вспышек болезней пищевого происхождения [13,14] и может помочь в диагностике, когда лабораторные ресурсы недоступны.Критерии Каплана были разработаны и часто используются для определения того, была ли вспышка вызвана норовирусом; инкубационный период — один из ключевых элементов этих критериев. [15] Другие применения точно описанного инкубационного периода включают в себя прогностические модели, которые используют инкубационный период для точного моделирования процесса заболевания, а продолжительность инкубационного периода по отношению к латентному периоду (время между заражением и переходом в инфекцию) определяет потенциальная эффективность мер контроля, нацеленных на лиц с симптомами [16].

    Несмотря на важность, периоды инкубации кишечных вирусов недостаточно хорошо описаны в медицинской литературе. Информация об инкубационном периоде, как правило, состоит из одного числа («Инкубационный период ротавирусной болезни составляет приблизительно 2 дня» [17]) или плохо определенного диапазона («Инкубационный период для астровирусной болезни составляет от 1 до 5 дней…» [ 18]). Эти утверждения инкубационного периода трудно воплотить в реалии профилактики и контроля. Оценка с одним числом может представлять собой среднее значение, медианное значение, верхний предел или какой-либо другой показатель инкубационного периода.Диапазон может представлять собой исчерпывающий диапазон всех наблюдений или некоторый неопределенный квантиль (например, 95% доверительный интервал, внутренний 75% и т. Д.). Кроме того, часто неясна сила доказательств, лежащих в основе этих оценок. Заявления об инкубационном периоде часто не включают цитату, а когда цитируется, следование цепочке цитирований часто показывает, что оценка основана на ограниченных доказательствах [19].

    Мы проанализировали литературу по пяти кишечным вирусам, отобранным с учетом их важности для общественного здравоохранения: астровирус, калицивирусы (геногруппы норовирусов I и II и саповирусы) и ротавирус.Посредством систематического обзора и анализа опубликованных оценок и данных мы стремимся (1) зафиксировать консенсус в медицинской литературе по этим инкубационным периодам, (2) охарактеризовать доказательства, лежащие в основе этого консенсуса, и (3) предоставить улучшенные оценки инкубационных периодов для эти инфекции. Поступая таким образом, мы надеемся, что инкубационный период будет использоваться в большем количестве приложений и выявить те области, в которых необходимы дополнительные исследования.

    Методы

    В этом систематическом обзоре в основном использовались методы, описанные в Lessler et al., 2009 [20]. Подробности и различия в подходах описаны ниже.

    Стратегия поиска и критерии выбора

    Для каждого вируса мы провели поиск в PubMed, Google Scholar и ISI Web of Knowledge 4.0, как описано Lessler et al., 2009 [20]. В PubMed мы искали слова «инкубация», «период» и название вируса, в Google Scholar мы искали фразы «инкубационный период [название вируса]» и «инкубационный период для [название вируса]», а также ISI Web of Knowledge мы искали по «инкубационному периоду» и названию вируса [20].Поиски проводились в период с 20 января 2011 г. по 16 августа 2011 г., без ограничений по самой ранней дате возврата статей. Общие варианты названия каждого вируса использовались в каждой базе данных, в частности, «астровирус», «калицивирус», «норовирус», «вирус Норо», «Норуолк», «Норуолк-подобный», «NLV», «NLV», «SRSV». »,« Зимняя рвота »,« Hyperemesis hiemis »,« Снежная гора »,« саповирус »,« вирус Саппоро »,« Саппороподобный вирус »,« ротавирус »,« дуовирус »,« агент, подобный реовирусу человека », и «агент инфантильного гастроэнтерита».Мы также рассмотрели четыре широко используемых справочника по инфекционным заболеваниям [11,21-23]. Тезисы рецензировались двумя рецензентами независимо друг от друга. Расхождения были устранены путем обсуждения и консенсуса. Этот обзор соответствует контрольным спискам систематических обзоров PRISMA и QUORUM.

    Оценка

    Документы, включенные в полнотекстовый обзор, были классифицированы как содержащие (1) оценку инкубационного периода, основанную на исходных данных и / или анализе, (2) отчет об инкубационном периоде (т. Е. Предоставленную ссылку), (3) ) отчет об инкубационном периоде без источника (т.д., без ссылки) или (4) без указания инкубационного периода. Все документы были также проверены на предмет данных индивидуального уровня, пригодных для объединенного анализа. Полные тексты рецензировались независимо двумя рецензентами. Расхождения были устранены путем обсуждения и консенсуса.

    Абстракция данных

    Отчеты инкубационного периода и данные на индивидуальном уровне, подходящие для объединенного анализа, были извлечены, как описано в Lessler et al., 2009 [20]. Поскольку во многих вспышках болезней пищевого происхождения, описанных в литературе, не сообщалось о точном времени приема пищи, мы установили стандартные интервалы воздействия, которые использовались при абстрагировании данных на индивидуальном уровне для исследований, в которых время приема пищи было указано как просто «завтрак», «обед» или «обед».Воздействие во время завтрака считалось периодом между 0:00 и 10:00, обедом между 10:00 и 14:00 и ужином между 14:00 и 0:00. Мы сообщаем диапазон инкубационных периодов таким образом, чтобы инкубационный период в этом диапазоне соответствовал прогнозам большинства исследователей (т.е.согласовался с более чем 50% опубликованных оценок) и модальным утверждением центральной тенденции.

    Объединенный анализ

    Сартвелл и другие показали, что натуральный логарифм инкубационных периодов острых инфекционных заболеваний имеет тенденцию к нормальному распределению; следовательно, инкубационный период следует логарифмически нормальному распределению, определяемому средним инкубационным периодом и коэффициентом дисперсии [20,24-26].При нормальном распределении примерно две трети данных попадают в одно стандартное отклонение от среднего; аналогично при логнормальном распределении примерно в двух третях случаев развиваются симптомы между медианной / дисперсией и медианной × дисперсией. Для каждого патогена все наблюдения были объединены в единый набор двухинтервальных цензурированных наблюдений; каждая точка данных содержала диапазон возможных времен воздействия, например «обед», и диапазон возможных времен появления симптомов.Поскольку время воздействия и появления симптомов редко сообщается точно, минимальный временной интервал, который мы рассмотрели, составлял один час. Если сообщалось, что время появления симптома составляет 17:00, мы записывали время появления симптома между 17:00 и 18:00. Оценки максимального правдоподобия были получены с использованием пакета coarseDataTools для R [25,27]. Доверительные интервалы рассчитывались методом начальной загрузки (500 итераций). Объединенные данные для каждой геногруппы норовирусов были проанализированы индивидуально, данные из геногрупп I и II были проанализированы вместе, и, наконец, все данные о калицивирусах человека (как геногруппы норовирусов, так и саповирусы) были объединены и проанализированы.Для выбора подходящих групп использовались байесовский информационный критерий и оценка клинически значимых различий в оценках. Результаты инкубационного периода, полученные с использованием логнормального распределения, сравнивались с результатами, полученными с использованием распределений Вейбулла и гамма-распределения; квантильные оценки оказались согласованными между распределениями (см. дополнительный файл 1). Все анализы были выполнены с использованием статистического пакета R (версия 2.11). Конкретные оценки, содержащиеся в этом обзоре, все данные, использованные в объединенном анализе, и полная библиография доступны у авторов по запросу.В помощь разработчикам моделей результаты подгонки данных с использованием распределения Эрланга доступны в дополнительных материалах (Дополнительный файл 1).

    Результаты

    Мы идентифицировали 256 статей с одним или несколькими заявлениями об инкубационном периоде (рисунок). Из 317 оценок, включенных в эти статьи, 91 (29%) были оригинальными, 137 (43%) давали источник, а 89 (28%) не предоставляли источник (таблица). 33 статьи содержали данные на индивидуальном уровне, подходящие для объединенного анализа (таблица). Шесть (18%) исследований были экспериментальными, а 27 (82%) — наблюдательными.В таблице приведены инкубационные периоды, указанные в литературе, и исходные данные. Оценки инкубационного периода норовирусов получили наибольшую поддержку (23 исследования). Оценка саповирусов была подтверждена меньшим количеством исследований, но эти исследования были относительно большими. Для ротавируса и астровируса было доступно менее 20 наблюдений. Оценки полного распределения каждого инкубационного периода с использованием объединенных данных показаны на рисунке и в таблице. Это обеспечивает периоды, когда 5%, 25%, 50%, 75% и 95% случаев станут симптоматическими.Мы показываем только 5-й и 95-й процентили, когда было более 20 наблюдений для отдельного вируса. Медиана инкубационного периода варьировала от 1,1 дня (для норовирусов геногруппы I) до 4,5 дня (для астровируса). Разброс от 1,22 до 1,82. Полные распределения, наложенные на гистограммы данных латентного периода, показаны на рисунке.

    Процесс систематического обзора.

    Таблица 1

    Сводка оценок инкубационного периода в опубликованной литературе


    2
    Литературные оценки * (дни)
    Количество оценок (%)
    Участники экспериментальных исследований (n ) ψ
    Диапазон Центральная тенденция Оценки без источников Исходные оценки Исходные оценки [экспериментальные / наблюдательные] 1-5
    3
    8 (40%)
    7 (35%)
    5 (25%) [1/4]
    1
    Калицивирусы
    Норовирус
    1-2
    1
    39 (22%)
    74 (43%)
    60 (35%) [15/45]
    189
    Геногруппы I и II
    Саповирус
    2
    5 (36%)
    2 (14%)
    7 (50%) [0/7]

    Ротавирус
    1-4 2
    37 (34%)
    54 (49%)
    19 (17%) [6/13]
    42
    Всего
    89 (28%)
    137 (43%) 91 (29%) [22/69] 232

    Таблица 2

    Исследования, включенные в объединенный анализ

    .(2000) [49]
    Местоположение Тип исследования N Население ion Комментарии
    Астровирус
    Kurtz et al.(1979) [28]
    UK
    Экспериментальный
    4
    Взрослые добровольцы в возрасте 18–50 лет

    Midthun et al. (1993) [29]
    USA
    Экспериментальный
    1
    Взрослый доброволец

    Mitchell et al. (1993) [30]
    США
    Наблюдательные
    5
    Дети в возрасте 6–30 месяцев
    Вспышка в детском саду
    Калицивирусы
    9026 Норовирус

    Геногруппа I
    Baron et al.(1982) [31]
    США
    Наблюдательный
    132
    Взрослые и дети в возрасте от 9 месяцев до 59 лет
    Вспышка, связанная с купанием в озере
    Becker et al. (2000) [32]
    США
    Наблюдательный
    54
    Футболисты мужского пола колледжа
    Вспышка, связанная с упакованными обедами
    Dolin et al.(1971) [33]
    США
    Экспериментальный
    5
    Заключенные-мужчины в возрасте 18–45 лет

    Gill et al. (1983) [34]
    UK
    Наблюдательный
    127
    Взрослые
    Вспышка, связанная с потреблением сырых устриц
    Hicks et al. (1996) [35]
    UK
    Observational
    31
    Гости на свадебном приеме

    Hoebe et al.(2004) [36]
    Нидерланды
    Наблюдательный
    90
    Дети в возрасте 4–12 лет
    Вспышка, связанная с игрой в зараженном фонтане
    Курицкий и др. (1984) [37]
    США
    Наблюдательный
    126
    Взрослые и дети, посещающие любое из четырех социальных мероприятий с питанием
    Вспышка, связанная с употреблением в пищу замороженных хлебобулочных изделий, приготовленных плохим кулинаром
    Linco et al.(1980) [38]
    Австралия
    Наблюдательный
    24
    Гости на рождественском ужине
    Вспышка, связанная с употреблением сырых устриц
    Matsuhashi et al. (2003) [39]
    Япония
    Наблюдательный
    1
    Взрослый врач-мужчина
    Заболевание, связанное с выполнением колоноскопии у двух инфицированных лиц
    40218
    [
    USA
    Observational
    209
    Взрослые
    Oubreak, связанный с поеданием картофельного салата на корпоративном обеде
    Taylor et al.(1981) [41]
    США
    Наблюдательный
    329
    Дети в возрасте от 5 до 12 лет
    Вспышка, связанная с зараженной питьевой водой в начальной школе

    Норовирус
    Genogroup II
    de Wit et al. (2007) [42]
    Нидерланды
    Наблюдательный
    229
    Мужчины и женщины в возрасте 17–63 лет
    Вспышка, связанная с обедом для персонала
    Dolin et al.(1982) [43]
    США
    Экспериментальный
    9
    Взрослые добровольцы

    Gaulin et al. (1999) [44]
    Канада
    Observational
    43
    Посетители, посещающие рождественский ужин в ресторане

    Gotz et al. (2002) [45]
    Швеция
    Наблюдательный
    173
    114 детей в возрасте 1–10 лет и 79 взрослых в возрасте 20–61 лет
    Вспышка, связанная с обслуживанием обедов в 30 детских садах
    Grotto et al.(2004) [13]
    Израиль
    Наблюдательный
    162
    Солдаты мужского и женского пола, дислоцированные на военной базе
    Вспышка, связанная с салатом из столовой
    Hirakata et al. (2005) [46]
    Япония
    Наблюдательный
    628
    Учащиеся начальной, младшей и старшей школы
    Мексика Агент. Вспышка, связанная с обедом в ресторане во время производственной поездки
    Исакбаева и др.(2005) [47]
    США
    Наблюдательный
    2
    Взрослая женщина и ребенок
    Вспышка, связанная с контактом с больным ребенком во время двухчасовой игровой группы
    Kirking et al. (2010) [48]
    США
    Наблюдательный
    7
    Взрослые и дети в возрасте 11–73 лет
    Вспышка, связанная с воздействием рвотных масс в аэрозольной форме в самолете
    UK
    Observational
    43
    Посетители, посещающие ужин в большом отеле

    Marshall et al. (2001) [50]
    Австралия
    Наблюдательный
    46
    Посетители ресторана
    Вспышка, связанная с употреблением зараженной пищи в буфете
    Thornhill et al. (1977) [51]
    США
    Экспериментальный
    1
    Взрослый доброволец
    Гавайский агент
    Труман и др.(1987) [52]
    США
    Наблюдательный
    84
    Взрослые мужчины и женщины в возрасте 16–74 лет
    Вспышка, связанная с поеданием моллюсков на организованном мероприятии
    Сапов





    Хамфри и др. (1984) [53]
    UK
    Наблюдательный
    14
    Один ребенок в возрасте 3 лет, девять мужчин и женщин в возрасте 65–95 лет, 5 взрослых мужчин и женщин в возрасте 18–65 лет
    Вспышка в учреждении по уходу за престарелыми и в семье, которая владела учреждением
    Johansson et al.(2005) [54]
    Швеция
    Наблюдательный
    9
    Взрослые мужчины и женщины в возрасте 25–84 лет
    Инфекция в больницах
    Usuku et al. (2008) [55]
    Япония
    Наблюдательный
    65
    Шестьдесят учеников третьего класса и пять взрослых
    Вспышка, связанная с рестораном в отеле
    Yamashita et al.(2010) [56]
    Япония
    Наблюдательный
    18
    Взрослые мужчины и женщины в возрасте 20–70 лет
    Вспышка после свадебного приема
    Ротавирус
  • 4
  • Капикян и др. (1983) [57]
    США
    Экспериментальный
    4
    Взрослые добровольцы

    Morris et al.(1975) [58]
    UK
    Наблюдательный
    1
    Детский
    Инфекция в больницах
    Rodriguez et al. (1979) [59] США Наблюдательный 6 Две взрослые женщины и 4 ребенка в возрасте 18–24 месяцев Вспышка после игровой группы

    Кумулятивное распределение инкубационного периода. Показан совокупный процент случаев, у которых симптомы развиваются к данному дню согласно оценкам логнормального распределения.Доверительные интервалы рассчитывались методом начальной загрузки (500 итераций).

    Таблица 3

    Процентили времени появления симптомов и дисперсия для распределения заболеваний

    9014 **
    9382
    Оценка (95 % ДИ) времени появления симптомов (дни) *
    Дисперсия (95 % ДИ)
    5-й процентиль 25-й процентиль 50-й процентиль (медиана) 9013 75-й процентиль
    Астровирус

    4.0 (3,5-4,9)
    4,5 (3,9-5,2)
    5,3 (4,4-5,8)

    1,22 (1,04-1,30)
    Калицивирусы
    0,5 (0,5-0,5)
    0,9 (0,8-0,9)
    1,2 (1,1-1,2)
    1,7 (1,6-1,7)
    2,6 (2,6- 2,8)
    1,64 (1,61-1,71)
    Геногруппа I α
    0.4 (0,4-0,5)
    0,8 (0,7-0,8)
    1,1 (1,1-1,2)
    1,6 (1,6-1,7)
    3,0 (2,8-3,2)
    1,82 (1,75-1,90 )
    Геногруппа II β
    0,6 (0,5-0,6)
    0,9 (0,9-1,0)
    1,2 (1,2-1,3)
    1,6 (1,6-1,7) )
    2,5 (2,4-2,6)
    1,56 (1,49-1,62)
    Саповирусы ***
    0.9 (0,7-1,0)
    1,3 (1,1-1,4)
    1,7 (1,5-1,8)
    2,3 (2,0-2,4)
    3,3 (2,7-3,8)
    1,48 (1,36-1,61) )
    Ротавирус 1,6 (1,1-1,9) 2,0 (1,4-2,4) 2,5 (1,8-3,0) 1,37 (1,25-1,73)
    Кумулятивные распределения данных инкубационного и латентного периодов.

    Астровирус

    Астровирус передается фекально-оральным путем [22].Клинические симптомы включают диарею, боль в животе, головную боль, недомогание и рвоту, хотя рвота при астровирусной инфекции встречается реже, чем при ротавирусной или калицивирусной инфекциях [11,22]. Кроме того, астровирус с меньшей вероятностью вызывает обезвоживание или госпитализацию, чем ротавирус [2].

    Мы нашли 20 оценок инкубационного периода астровируса, включая пять исходных оценок, семь оценок с источниками и восемь оценок, в которых исходный источник не был предоставлен (оценки без источников).Заявления об инкубационном периоде обычно составляли от 1 до 5 дней (таблица). Было обнаружено три оригинальных исследования, содержащих данные, подходящие для объединенного анализа: два экспериментальных исследования с участием взрослых добровольцев [28,29] и обсервационное исследование, описывающее серию вспышек в детском центре в Хьюстоне, штат Техас, США [30]. На основе этих трех исследований мы оцениваем средний инкубационный период гастроэнтерита, вызванного астровирусом, в 4,5 дня (95% ДИ 3,9-5,2 дня) с разбросом 1,22 (95% ДИ 1.04-1.30) (таблица). 25% случаев станут симптоматическими к 4,0 дням (95% ДИ 3,5–4,9 дней), а 75% случаев станут симптомами к 5,3 дням (95% ДИ 4,4–5,8 дней) (таблица). Из-за ограниченности данных 5-й и 95-й процентили не оценивались. Немногие взрослые добровольцы проявляли симптомы при заражении астровирусом [28,30], что свидетельствует о низкой патогенности вируса у взрослых, которые могут быть защищены антителами, приобретенными в детстве [4,60]. Поскольку данные исследований взрослого заражения включают 50% абстрагируемых данных, подходящих для объединенного анализа на астровирус, наши результаты инкубационного периода могут быть неприменимы к первичным инфекциям или инфекциям у детей.

    Калицивирусы

    Калицивирусы (т. Е. Семейство Caliciviridae ) классически содержат четыре рода, два из которых, Norovirus и Sapovirus , вызывают острый гастроэнтерит у людей [11]. Было предложено, что пятый род калицивирусов включает два генотипа кишечного вируса крупного рогатого скота [61]. Норовирусы разделены на пять антигенно различных геногрупп, три из которых (I, II и IV) вызывают заболевания у людей [62,63]. Норовирусы геногруппы IV были охарактеризованы в сточных водах и речной воде, но, насколько нам известно, не были причастны к вспышкам заболеваний, поэтому этот обзор будет сосредоточен на норовирусах и саповирусах геногрупп I и II [64,65].Важно отметить, что недавние вспышки этих вирусов связаны с увеличением заболеваемости и смертности. Норовирусы и саповирусы передаются фекально-оральным путем и имеют несколько разные клинические проявления [11].

    Используя байесовский информационный критерий, мы определили, что все три геногруппы калицивируса человека статистически различаются с точки зрения распределения их инкубационного периода. Однако оценки инкубационных периодов, эпидемиологии и клинических проявлений калицивирусов геногрупп I и II для практических целей очень похожи [43,66].Мы предлагаем рассматривать эти две геногруппы, норовирусы, с одинаковым инкубационным периодом. Саповирусы имеют отличную эпидемиологию и клинические проявления от норовирусов геногрупп I и II, и их следует рассматривать как отдельную группу вирусов.

    Норовирусы (геногруппы I и II)

    Норовирусы вызывают примерно 90% всех вспышек эпидемического гастроэнтерита и являются важным источником вспышек болезней пищевого происхождения во всем мире [9,10,22]. Хотя передача происходит в основном фекально-оральным путем, имеются также свидетельства передачи через рвотные массы [48].Клинические симптомы включают спазмы в животе, тошноту, частую рвоту и диарею [22]. Большинство опубликованных оценок норовирусов соответствовало инкубационному периоду от 1 до 2 дней (таблица).

    Выявлен 131 документ с указанием инкубационного периода норовирусов. Эти документы содержали 60 исходных оценок, 74 оценки из источников и 39 оценок без источников. 54% всех полученных оценок инкубационного периода норовирусов цитировали одну из двух статей Kaplan et al.[15,67], или сослался на статью, в которой цитируется одна или обе эти статьи. Каплан и его коллеги объединили данные 38 вспышек норовируса в период с 1967 по 1980 год и предложили четыре критерия, которые можно использовать для характеристики вспышек норовируса: (1) посев кала, свободный от бактериальных патогенов, (2) средняя или средняя продолжительность болезни 12–60 часов, (3) рвота в ≥ 50% случаев и (4) средний или средний инкубационный период 24–48 часов [67]. Большинство опубликованных оценок инкубационного периода норовирусов соответствовали критериям Каплана (таблица).

    Основываясь на 2540 наблюдениях из 20 наблюдательных исследований и 15 наблюдений из трех экспериментальных исследований, мы оцениваем средний инкубационный период для норовирусов в 1,2 дня (95% ДИ 1,1-1,2 дня) с дисперсией 1,64 (95% ДИ 1,61- 1.71). В 5% случаев норовируса симптомы проявляются через 0,5 дня (95% ДИ 0,5–0,5 дня) после заражения, а в 95% случаев симптомы проявляются через 2,6 дня (95% ДИ 2,6–2,8 дня) (таблица).

    Геногруппа I

    На основании 1123 наблюдений из десяти наблюдательных исследований и пяти наблюдений из одного экспериментального исследования [33] мы оцениваем средний инкубационный период для норовирусов геногруппы I как 1.1 день (95% ДИ 1,1–1,2 дня) с дисперсией 1,82 (95% ДИ 1,75–1,90). В 5% случаев норовируса геногруппы I симптомы проявляются через 0,4 дня (95% ДИ 0,4–0,5 дня) после заражения, а в 95% случаев симптомы разовьются через 3,0 дня (95% ДИ 2,8–3,2 дня) (таблица).

    Геногруппа II

    Основываясь на десяти наблюдениях из двух экспериментальных исследований [43,51] и 1417 оценках из десяти обсервационных исследований [46,49], мы оцениваем средний инкубационный период для норовирусов геногруппы II как 1.2 дня (95% ДИ 1,2–1,3 дня) с дисперсией 1,56 (95% ДИ 1,49–1,62). В 5% случаев норовируса геногруппы II симптомы проявляются через 0,6 дня (95% ДИ 0,5–0,6 дня) после заражения, а в 95% случаев симптомы становятся симптоматическими через 2,5 дня (95% ДИ 2,4–2,6 дня) (таблица).

    Саповирусы

    Саповирусы в первую очередь вызывают гастроэнтерит у младенцев и детей и не являются важными патогенами во время вспышек болезней пищевого происхождения [68]. Клинические симптомы включают рвоту, обезвоживание, боль в животе и, в меньшей степени, диарею и лихорадку [69].Опубликованные оценки саповирусов соответствовали инкубационному периоду 1-3 дня (таблица).

    Выявлено 13 документов, содержащих 14 отчетов об инкубационном периоде саповирусов. Эти документы содержали семь исходных оценок, две оценки из источников и пять оценок без источников. Цитируемыми источниками были обзорная статья Блэклоу и Гринберга [70], в которой содержалась оценка без источника, и результаты наблюдательного исследования Ноэля и его коллег [71], описывающие вспышку штамма вируса Парквилл.

    Основываясь на 106 наблюдениях из четырех обсервационных исследований [53-56], мы оцениваем средний инкубационный период саповирусов в 1,7 дня (95% ДИ 1,5–1,8 дня) с дисперсией 1,48 (95% ДИ 1,36–1,61) . В 5% случаев симптомы проявляются через 0,9 дня (95% ДИ 0,7–1,0 дня) после заражения, а в 95% случаев симптомы проявляются через 3,3 дня (95% ДИ 2,7–3,8 дня) (таблица).

    Ротавирус

    Ротавирус передается фекально-оральным путем [22,72]. Ротавирус группы А вызывает более 600 000 случаев смерти младенцев и детей младшего возраста в год, в основном в развивающихся странах [73].Ротавирусы группы B преимущественно наблюдались во взрывных вспышках среди взрослых в Китае [11,74]. Ротавирусы группы C, по-видимому, не имеют значения для общественного здравоохранения [11,74]. Распространенность серотипов ротавирусов в этих группах варьируется в разных частях мира, что чрезвычайно затрудняет широкомасштабную эффективную борьбу с заболеванием [75]. Клинические симптомы включают лихорадку и рвоту, за которыми следует обильная водянистая диарея и обезвоживание [76]. Инфекции, вызывающие острое заболевание, возникают преимущественно в возрасте от 6 до 24 месяцев [76,77].У взрослых инфекции обычно протекают бессимптомно, однако заболевание было вызвано экспериментально у взрослых, и описаны вспышки среди взрослого населения [11,57,78,79].

    Мы нашли 110 оценок инкубационного периода ротавируса, включая 19 исходных оценок, 54 оценки с источниками и 37 оценок без источников. Большинство опубликованных оценок ротавируса соответствовали двухдневному инкубационному периоду (таблица).

    Основываясь на четырех наблюдениях из одного экспериментального исследования на взрослых добровольцах [57] и шести наблюдениях из двух наблюдательных исследований [58,59], мы оцениваем средний инкубационный период ротавируса как 2.0 дней (95% ДИ 1,4–2,4 дня) с дисперсией 1,37 (1,25–1,73). В 25% случаев ротавирус становится симптоматическим через 1,6 дня (95% ДИ 1,1–1,9 дня), а в 75% случаев симптомы проявляются через 2,5 дня (95% ДИ 1,8–3,0 дня) после заражения (таблица). Из-за ограниченности данных 5-й и 95-й процентили не оценивались.

    Обсуждение

    Оценка инкубационного периода инфекционных заболеваний, включая гастроэнтерит, имеет решающее значение для обоснования и обоснованности вмешательств, направленных на прекращение текущей передачи.В нашем обзоре трех основных вирусных причин гастроэнтерита мы обнаружили, что 61% из 226 оценок инкубационного периода даны со ссылкой. После изучения деревьев цитирования для этих оценок только 114 (50%) из 226 были фактически основаны на данных. Двадцать три (17%) оценок из источников ссылались на статью, которая содержала оценку без источников. Эти данные показывают, что инкубационные периоды кишечных вирусов часто считаются общеизвестными. Из источников, основанных на данных, большинство для каждого вируса можно проследить до оценок из небольшого числа оригинальных исследований, таких как Kaplan et al.статьи для геногрупп I и II норовирусов [15,67].

    Были некоторые опасения, что отдельные исследования потенциально могут иметь чрезмерное влияние на объединенный анализ. Мы провели анализ чувствительности, удалив все исследования и пересчитав оценки инкубационного периода. Мы не обнаружили качественной разницы в результатах.

    Определение инкубационного периода ограничено степенью неопределенности относительно времени заражения. Поскольку инкубационные периоды вирусного гастроэнтерита короткие, часто бывает трудно различить первичный и вторичный случаи во время вспышки.Это затрудняет получение точной информации об интервале экспозиции. Большинство обсервационных исследований, особенно исследований вспышек пищевого происхождения, решают эту проблему, рассматривая только случаи в течение определенного количества дней после заражения [34,36,37,42,44,52,80-82]. Этот метод идентификации случаев может внести систематическую ошибку за счет исключения случаев, которые попадают в конечную точку распределения инкубационного периода. Несмотря на то, что существует множество наблюдательных исследований, описывающих вспышки, вызванные ротавирусом и астровирусом, поскольку интервал воздействия для отдельных случаев не может быть определен, данные этих исследований не могут использоваться для определения инкубационного периода.

    Множество факторов могут привести к тому, что данные экспериментального заражения будут отличаться от данных естественного заражения, например, инфекционная доза или добровольцы, чей статус хозяина отличается от такового в общей популяции. Например, единственное экспериментальное исследование, внесшее данные в объединенный анализ ротавируса, проводилось с поиском добровольцев с низким уровнем антител в сыворотке [57]. Эти предубеждения усугубляются невозможностью проведения экспериментальных исследований проблем среди групп населения, наиболее подверженных риску заболеваний, среди детей и пожилых людей.Это особенно верно в отношении ротавируса и астровируса, болезней, от которых почти всегда страдают маленькие дети.

    Этот обзор был ограничен включением только опубликованных данных и условиями поиска. Из-за того, что мы включили некоторую форму «инкубационного периода» в поиск статей, вся литература по каждому вирусу не рассматривалась. Наши оценки для астровируса и ротавируса основаны на трех исследованиях и менее чем 20 наблюдениях. Из-за трудностей экспериментального изучения этих заболеваний необходимы тщательные наблюдательные исследования, чтобы получить больше доказательств, подтверждающих инкубационный период и его распространение.

    Точное знание инкубационного периода особенно важно для вирусного гастроэнтерита из-за короткой продолжительности инкубационного периода, относительно высокой частоты вторичных атак и возможности возникновения вспышек заболеваний, связанных с оказанием медицинской помощи. Как ротавирус, так и норовирус особенно трудно контролировать в медицинских учреждениях [11,83]. Фишер и его коллеги определили, что в среднем 27% пациентов в развитых странах и 32% пациентов в развивающихся странах, выписанных с диагнозом ротавирус, заразились этим вирусом в больнице [17].Кроме того, инкубационный период является важным компонентом серийного интервала (разница во времени появления симптомов в случае и в случае инфицирования), который является одним из основных факторов, определяющих скорость распространения эпидемий в популяции.

    Несмотря на лицензирование двух безопасных и эффективных вакцин, ротавирус продолжает оставаться важной проблемой общественного здравоохранения. Это особенно верно в развивающихся странах, где происходит подавляющее большинство ротавирусных заболеваний и смертей, и где ротавирусная вакцина имеет самую низкую эффективность [84].Точное знание инкубационного периода важно для понимания динамики ротавирусной болезни и борьбы с ней. По мере того как охват вакцинацией улучшается и ротавирусная инфекция перестает быть повсеместной, инкубационный период будет полезен для изучения воздействия патогенов, связанного с неэффективностью вакцинации, и потенциальных различий в восприимчивости хозяев к инфекции.

    Заключение

    После нашей работы по оценке инкубационного периода респираторных вирусов [20], в этом обзоре мы объединили опубликованные данные для оценки инкубационных периодов пяти кишечных вирусов, важных для общественного здравоохранения.Как правило, опубликованные оценки инкубационного периода описывают только центральную тенденцию или указывают на неопределенный диапазон, однако знание распределения всего инкубационного периода важно для полного понимания динамики заболевания и потенциальной эффективности мер контроля. Это особенно верно в условиях, когда инфекции могут быть взрывоопасными и иметь огромное влияние на результаты лечения пациентов. Наши оценки обеспечивают дополнительный уровень детализации, необходимый для этих и других приложений, что делает инкубационный период более полезным для исследований, клинической практики и политики общественного здравоохранения.

    Конкурирующие интересы

    Авторы заявляют, что у них нет конкурирующих интересов.

    Вклад авторов

    RML провела систематический обзор и анализ данных, а также подготовила рукопись. JL провел анализ данных и помог составить рукопись. RAL и KER провели систематический обзор. JL, DATC, TMP и NGR участвовали в разработке и концепции исследования. Все авторы прочитали и одобрили окончательную рукопись.

    Дополнительные материалы

    Дополнительный файл 1:

    Сравнение логарифмически нормального, гамма-распределений, распределений Вейбулла и Эрлинга.

    Благодарности

    Работа JL над этим проектом финансировалась за счет гранта Фонда Билла и Мелинды Гейтс (Инициатива по моделированию вакцин, 705580–3), и он является лауреатом премии NIH в области научных исследований в области развития (NIAID, K22). AI0-01). KER финансировался Отделом программ интромуральных исследований Национального института психического здоровья.

    Ссылки

    • Parashar UD, Hummelman EG, Bresee JS, Miller MA, Glass RI. Заболевания и смертность детей от ротавирусной инфекции в мире.Emerg Infect Dis. 2003. 9: 565–572. DOI: 10.3201 / eid0905.020562. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
    • Dennehy PH, Nelson SM, Spangenberger S, Noel JS, Monroe SS, Glass RI. Проспективное исследование «случай – контроль» роли астровируса в острой диарее среди госпитализированных маленьких детей. J Infect Dis. 2001; 184: 10–15. DOI: 10,1086 / 321007. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
    • Херрманн Дж. Э., Тейлор Д. Н., Эчеверрия П., Блэклоу Н. Р.. Астровирусы как причина гастроэнтерита у детей.N Engl J Med. 1991; 324: 1757–1760. DOI: 10.1056 / NEJM1903242501. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
    • Курц Дж., Ли Т. Распределение антител по возрасту астровирусного гастроэнтерита. Med Microbiol Immunol. 1978; 166: 227–230. DOI: 10.1007 / BF02121154. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
    • Rodriguez-Baez N, O’Brien R, Qiu SQ, Bass DM. Астровирус, аденовирус и ротавирус у госпитализированных детей: распространенность и связь с гастроэнтеритом. J Pediatr Gastroenterol Nutr. 2002. 35: 64–68.DOI: 10.1097 / 00005176-200207000-00014. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
    • Шастри С., Доан А.М., Гонсалес Дж., Упадхьяюла Ю., басс Д.М. Распространенность астровирусов в детской больнице. J Clin Microbiol. 1998. 36: 2571–2574. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]
    • Lewis DC, Lightfoot NF, Cubitt WD, Wilson SA. Вспышки астровируса типа 1 и ротавирусного гастроэнтерита в гериатрических стационарах. J Hosp Infect. 1989; 14: 9–14. DOI: 10.1016 / 0195-6701 (89) -X.[PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
    • Gray JJ, Wreghitt TG, Cubitt WD, Elliot PR. Вспышка гастроэнтерита в доме престарелых, связанная с астровирусом 1 типа и калицивирусом человека. J Med Virol. 1987. 23: 377–381. DOI: 10.1002 / jmv.18410. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
    • Технические данные. http://www.cdc.gov/norovirus/php/illness-outbreaks.html.
    • Долин Р. Норовирусы — проблемы, которые нужно контролировать. N Engl J Med. 2007; 357: 1072–1073. DOI: 10.1056 / NEJMp078050.[PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
    • Хоули П., Книп Д., Филдс Б. Вирусология Филда, 5-е изд. Филадельфия: Липпинкотт, Уильямс и Уилкинс; 2007. [Google Scholar]
    • Lessler J, Brookmeyer R, Perl TM. Оценка правил классификации на основе даты появления симптомов для выявления инфекций, связанных с оказанием медицинской помощи. Am J Epidemiol. 2007. 166: 1220–1229. DOI: 10,1093 / AJE / kwm188. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
    • Grotto I, Huerta M, Balicer RD, Halperin T, Cohen D, Orr N, Gdalevich M.Вспышка норовирусного гастроэнтерита на израильской военной базе. Инфекционное заболевание. 2004. 32: 339–343. DOI: 10.1007 / s15010-004-4002-3. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
    • Schmid D, Stuger HP, Lederer I, Pichler AM, Kainz-Arnfelser G, Schreier E, Allerberger F. Вспышка норовируса пищевого происхождения из-за салата, приготовленного вручную, Австрия, 2006 г. Инфекция. 2007. 35: 232–239. DOI: 10.1007 / s15010-007-6327-1. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
    • Каплан Дж. Э., Фельдман Р., Кэмпбелл Д. С., Лукабо К., Гэри Г. У.Частота болезни, аналогичной норволкской, во вспышках острого гастроэнтерита. Am J Public Health. 1982; 72: 1329–1332. DOI: 10.2105 / AJPH.72.12.1329. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
    • Fraser C, Riley S, Anderson RM, Ferguson NM. Факторы, позволяющие контролировать вспышку инфекционного заболевания. Proc Natl Acad Sci USA. 2004. 101: 6146–6151. DOI: 10.1073 / pnas.0307506101. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
    • Fischer TK, Bresee JS, Glass RI.Ротавирусные вакцины и профилактика госпитальной диареи у детей. Вакцина. 2004; 22 (Приложение 1): S49 – S54. [PubMed] [Google Scholar]
    • Blacklow NR, Herrmann JE. Астровирусный гастроэнтерит. Trans Am Clin Climatol Assoc. 1995; 106: 58–66. обсуждение 66–58. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]
    • Reich NG, Perl TM, Cummings DA, Lessler J. Визуализация клинических данных: сети цитирования для инкубационных периодов респираторных вирусных инфекций. PLoS One. 2011; 6: e19496.DOI: 10.1371 / journal.pone.0019496. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
    • Lessler J, Reich NG, Brookmeyer R, Perl TM, Nelson KE, Cummings DA. Инкубационные периоды ОРВИ: систематический обзор. Lancet Infect Dis. 2009; 9: 291–300. DOI: 10.1016 / S1473-3099 (09) 70069-6. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
    • Хейманн Д. Руководство по борьбе с инфекционными заболеваниями. 19. Вашингтон, округ Колумбия: Американская ассоциация общественного здравоохранения; 2008 г.[Google Scholar]
    • Манделл Дж., Беннет Дж., Долин Р. Принципы и практика инфекционных заболеваний. Филадельфия: Черчилль Ливингстон; 2005. [Google Scholar]
    • Пикеринг Л. Красная книга: отчет Комитета по инфекционным болезням за 2009 год. 28. Элк-Гроув-Виллидж, Иллинойс: Американская академия педиатрии; 2009. 225, 241-242, 576-579. [Google Scholar]
    • Каулинг Б.Дж., Мюллер М.П., ​​Вонг И.О., Хо Л.М., Луи М., МакГир А., Люн Г.М. Альтернативные методы оценки распределения инкубации: примеры из тяжелого острого респираторного синдрома.Эпидемиология. 2007. 18: 253–259. DOI: 10.1097 / 01.ede.0000254660.07942.fb. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
    • Рейх Н.Г., Лесслер Дж., Каммингс Д.А., Брукмейер Р. Оценка распределения инкубационного периода с помощью приблизительных данных. Stat Med. 2009. 28: 2769–2784. DOI: 10.1002 / sim.3659. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
    • Sartwell PE. Распределение инкубационных периодов инфекционного заболевания. Am J Hyg. 1950; 51: 310–318. [PubMed] [Google Scholar]
    • coarseDataTools: набор функций, помогающих анализировать грубо наблюдаемые данные.http://cran.r-project.org/web/packages/coarseDataTools.
    • Курц Дж. Б., Ли Т. В., Крейг Дж. В., Рид С. Е.. Астровирусная инфекция у добровольцев. J Med Virol. 1979; 3: 221–230. DOI: 10.1002 / jmv.18

      308. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

    • Midthun K, Greenberg HB, Kurtz JB, Gary GW, Lin FY, Kapikian AZ. Характеристика и сероэпидемиология астровируса типа 5, связанного со вспышкой гастроэнтерита в округе Марин, Калифорния. J Clin Microbiol. 1993; 31: 955–962. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]
    • Митчелл Д.К., Ван Р., Морроу А.Л., Монро С.С., Гласс Р.И., Пикеринг Л.К.Вспышки астровирусного гастроэнтерита в детских садах. J Pediatr. 1993; 123: 725–732. DOI: 10.1016 / S0022-3476 (05) 80846-7. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
    • Baron RC, Murphy FD, Greenberg HB, Davis CE, Bregman DJ, Gary GW, Hughes JM, Schonberger LB. Желудочно-кишечное заболевание Norwalk: вспышка, связанная с купанием в озере для отдыха, и вторичная передача от человека к человеку. Am J Epidemiol. 1982; 115: 163–172. [PubMed] [Google Scholar]
    • Becker KM, Moe CL, Southwick KL, MacCormack JN.Передача вируса Norwalk во время футбольного матча. N Engl J Med. 2000; 343: 1223–1227. DOI: 10.1056 / NEJM200010263431704. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
    • Dolin R, Blacklow NR, DuPont H, Formal S, Buscho RF, Kasel JA, Chames RP, Hornick R, Chanock RM. Передача острого инфекционного небактериального гастроэнтерита добровольцам при пероральном приеме фильтрата стула. J Infect Dis. 1971; 123: 307–312. DOI: 10.1093 / infdis / 123.3.307. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
    • Gill ON, Cubitt WD, McSwiggan DA, Watney BM, Bartlett CL.Эпидемия гастроэнтерита, вызванная устрицами, зараженными небольшими вирусами с круглой структурой. Br Med J (Clin Res Ed) 1983; 287: 1532–1534. DOI: 10.1136 / bmj.287.6404.1532. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
    • Hicks NJ, Beynon JH, Bingham P, Soltanpoor N, Green J. Вспышка вирусного гастроэнтерита после свадебного приема. Commun Dis Rep CDR Rev.1996; 6: R136 – R139. [PubMed] [Google Scholar]
    • Hoebe CJ, Vennema H, de Roda Husman AM, van Duynhoven YT.Вспышка норовируса среди младших школьников, игравших в фонтанчике с водой для отдыха. J Infect Dis. 2004; 189: 699–705. DOI: 10,1086 / 381534. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
    • Курицкий Дж. Н., Остерхольм М. Т., Гринберг Х. Б., Корлат Дж. А., Годес Дж. Р., Хедберг К. В., Форфанг Дж. К., Капикян А. З., Маккалоу Дж. К., Уайт К. Э. Норуолкский гастроэнтерит: вспышка болезни в сообществе, связанная с потреблением хлебобулочных изделий. Ann Intern Med. 1984; 100: 519–521. DOI: 10.7326 / 0003-4819-100-4-519. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
    • Linco SJ, Grohmann GS.Дарвиновская вспышка вирусного гастроэнтерита, связанного с устрицами. Med J Aust. 1980; 1: 211–213. [PubMed] [Google Scholar]
    • Matshuhashi N, Nishi Y, Nagoshi D, Kanemoto H. A N: Эпидемический энтерколит, возможно, в результате заражения вирусом Норуолк, проявляющийся как ишемический колит . Dig Endosc. 2003. 15: 138–141. DOI: 10.1046 / j.1443-1661.2003.00234.x. [CrossRef] [Google Scholar]
    • Чендлер Б., Беллер М., Дженкерсон С., Миддо Дж., Робертс С., Рейсдорф Э., Рауш М., Сэвидж Р., Дэвис Дж. Вспышки вирусного гастроэнтерита, подобного Норуолку, — Аляска и Висконсин, 1999.MMWR Morb Mortal Wkly Rep. 2000; 49: 207–211. [PubMed] [Google Scholar]
    • Тейлор Дж. У., Гэри Дж. У. мл., Гринберг HB. Связанный с Норуолком вирусный гастроэнтерит из-за загрязненной питьевой воды. Am J Epidemiol. 1981; 114: 584–592. [PubMed] [Google Scholar]
    • de Wit MA, Widdowson MA, Vennema H, de Bruin E, Fernandes T, Koopmans M. Крупная вспышка норовируса: пекарь, который должен был знать лучше. J Infect. 2007. 55: 188–193. DOI: 10.1016 / j.jinf.2007.04.005. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
    • Dolin R, Reichman RC, Roessner KD, Tralka TS, Schooley RT, Gary W, Morens D.Обнаружение с помощью иммунной электронной микроскопии возбудителя острого вирусного гастроэнтерита Снежной горы. J Infect Dis. 1982; 146: 184–189. DOI: 10.1093 / infdis / 146.2.184. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
    • Гаулин С., Фригон М., Пуарье Д., Фурнье С. Передача калицивируса работником еды на предсимптоматической стадии болезни. Epidemiol Infect. 1999; 123: 475–478. DOI: 10.1017 / S095026889

      9X. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
    • Gotz H, de Jong B, Lindback J, Parment PA, Hedlund KO, Torven M, Ekdahl K.Эпидемиологическое расследование вспышки пищевого гастроэнтерита, вызванного Норуолк-подобным вирусом, в 30 детских садах. Scand J Infect Dis. 2002; 34: 115–121. DOI: 10.1080 / 00365540110080133. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
    • Хираката Ю., Арисава К., Нишио О., Накагоми О. Распространение вспышек гастроэнтерита в нескольких префектурах, вызванных одним штаммом норовируса геногруппы II из туристического ресторана в Нагасаки, Япония. J Clin Microbiol. 2005; 43: 1093–1098. DOI: 10.1128 / JCM.43.3.1093-1098.2005. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
    • Исакбаева Е.Т., Буленс С.Н., Борода Р.С., Адамс С., Монро С.С., Чавес С.С., Виддоусон М.А., Гласс Р.И. Норовирус и уход за детьми: проблемы в борьбе со вспышками. Pediatr Infect Dis J. 2005; 24: 561–563. DOI: 10.1097 / 01.inf.0000164764.58715.23. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
    • Киркинг Х.Л., Кортес Дж., Беррер С., Холл А.Дж., Коэн Нью-Джерси, Липман Х., Ким С., Дейли Э.Р., Фишбейн Д.Б. Вероятная передача норовируса в самолете, октябрь 2008 г.Clin Infect Dis. 2010; 50: 1216–1221. DOI: 10,1086 / 651597. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
    • Маркс П.Дж., Випонд И.Б., Карлайл Д., Дикин Д., Фей Р.Э., Кол Е.О. Доказательства воздушно-капельной передачи Норуолк-подобного вируса (NLV) в ресторане отеля. Epidemiol Infect. 2000; 124: 481–487. DOI: 10.1017 / S095026889

      05. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

    • Marshall JA, Yuen LK, Catton MG, Gunesekere IC, Wright PJ, Bettelheim KA, Griffith JM, Lightfoot D, Hogg GG, Gregory J.и др. Множественные вспышки норволкского вирусного гастроэнтерита, связанные с рестораном в средиземноморском стиле. J Med Microbiol. 2001; 50: 143–151. [PubMed] [Google Scholar]
    • Торнхилл Т.С., Вятт Р.Г., Калица А.Р., Долин Р., Чанок Р.М., Капикян А.З. Обнаружение с помощью иммунной электронной микроскопии вирусоподобных частиц размером 26–27 нм, связанных с двумя семейными вспышками гастроэнтерита. J Infect Dis. 1977; 135: 20–27. DOI: 10.1093 / infdis / 135.1.20. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
    • Трумэн Б.И., Мадоре Х.П., Менегус М.А., Ницкин Д.Л., Долин Р.Снежная гора возбудитель гастроэнтерита от моллюсков. Am J Epidemiol. 1987; 126: 516–525. [PubMed] [Google Scholar]
    • Хамфри Т.Дж., Крукшанк Дж. Г., Кубитт В. Д.. Вспышка гастроэнтерита, ассоциированного с калицивирусами, в доме престарелых. Возможный зооноз? Дж. Хиг (Лондон) 1984; 93: 293–299. DOI: 10.1017 / S0022172400064822. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
    • Johansson PJ, Bergentoft K, Larsson PA, Magnusson G, Widell A, Thorhagen M, Hedlund KO. Вспышка гастроэнтерита у взрослых, связанная с внутрибольничными саповирусами.Scand J Infect Dis. 2005; 37: 200–204. DOI: 10.1080 / 00365540410020974. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
    • Усуку С., Кумазаки М., Китамура К., Точикубо О, Ногучи Ю. Вспышка пищевого гастроэнтерита, вызванного саповирусом, среди учеников младших классов средней школы. Jpn J Infect Dis. 2008. 61: 438–441. [PubMed] [Google Scholar]
    • Ямасита Ю., Оцука Ю., Кондо Р., Осето М., Дой М., Миямото Т., Уэда Т., Кондо Х., Танака Т., Вакита Т. и др. Молекулярная характеристика саповируса, обнаруженного при гастроэнтерите вспышка в свадебном зале.J Med Virol. 2010. 82: 720–726. DOI: 10.1002 / jmv.21646. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
    • Капикян А.З., Вятт Р.Г., Левин М.М., Блэк Р.Э., Гринберг Г.Б., Флорес Дж., Калица А.Р., Хошино Ю., Чанок Р.М. Исследования на добровольцах с ротавирусами человека. Dev Biol Stand. 1983; 53: 209–218. [PubMed] [Google Scholar]
    • Morris CA, Flewett TH, Bryden AS, Davies H. Эпидемический вирусный энтерит в детской палате длительного пребывания. Ланцет. 1975; 1: 4–5. [PubMed] [Google Scholar]
    • Родригес В.Дж., Ким Х.В., Брандт С.Д., Йолкен Р.Х., Ричард М., Арробио Дж.О., Шварц Р.Х., Капикян А.З., Чанок Р.М., Парротт Р.Х.Распространенная вспышка гастроэнтерита, вызванного ротавирусом 2 типа, с высокой частотой вторичных атак в семьях. J Infect Dis. 1979; 140: 353–357. DOI: 10.1093 / infdis / 140.3.353. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
    • Митчелл Д.К., Матсон Д.О., Кубитт В.Д., Джексон Л.Дж., Уиллкокс М.М., Пикеринг Л.К., Картер М.Дж. Распространенность антител к астровирусу 1 и 3 типов у детей и подростков в Норфолке, Вирджиния. Pediatr Infect Dis J. 1999; 18: 249–254. DOI: 10.1097 / 00006454-1990-00008. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
    • Оливер С.Л., Асобайре Э., Дастджерди А.М., Бриджер Дж.Геномная характеристика неклассифицированного кишечного вируса крупного рогатого скота Newbury agent-1 (Newbury1) подтверждает новый род в семействе Caliciviridae. Вирусология. 2006; 350: 240–250. DOI: 10.1016 / j.virol.2006.02.027. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
    • Сципиони А., Маурой А., Винье Дж., Тири Э. Норовирусы животных. Вет Дж. 2008; 178: 32–45. DOI: 10.1016 / j.tvjl.2007.11.012. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
    • Норовирус. http://www.cdc.gov/norovirus/hcp/clinical-overview.html.
    • Китадзима М., Ока Т., Харамото Е., Фануван С., Такеда Н., Катаяма К., Катаяма Х. Генетическое разнообразие норовирусов геногруппы IV в сточных водах в Японии. Lett Appl Microbiol. 2011; 52: 181–184. DOI: 10.1111 / j.1472-765X.2010.02980.x. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
    • Китадзима М., Ока Т., Харамото Э, Такеда Н., Катаяма К., Катаяма Х. Сезонное распределение и генетическое разнообразие норовирусов геногрупп I, II и IV в реке Тамагава, Япония . Environ Sci Technol. 2010; 44: 7116–7122.DOI: 10.1021 / es100346a. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
    • Кол Е.О., Эпплтон Х. Электронно-микроскопические и физические характеристики небольших круглых фекальных вирусов человека: временная схема классификации. J Med Virol. 1982; 9: 257–265. DOI: 10.1002 / jmv.18

      403. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

    • Каплан Дж. Э., Гэри Г. У., Барон Р. К., Сингх Н., Шонбергер Л. Б., Фельдман Р., Гринберг HB. Эпидемиология гастроэнтерита Норуолк и роль вируса Норуолк во вспышках острого небактериального гастроэнтерита.Ann Intern Med. 1982; 96: 756–761. DOI: 10.7326 / 0003-4819-96-6-756. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
    • Чиба С., Наката С., Нумата-Киношита К., Хонма С. Вирус Саппоро: история и недавние открытия. J Infect Dis. 2000; 181 (Дополнение 2): S303 – S308. [PubMed] [Google Scholar]
    • Дей С.К., Фан Т.Г., Нгуен Т.А., Нишио О., Салим А.Ф., Ягю Ф., Окицу С., Ушиджима Х. Распространенность саповирусной инфекции среди младенцев и детей с острым гастроэнтеритом в Дакка, Бангладеш во время 2004–2005 гг.J Med Virol. 2007. 79: 633–638. DOI: 10.1002 / jmv.20859. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
    • Blacklow NR, Greenberg HB. Вирусный гастроэнтерит. N Engl J Med. 1991; 325: 252–264. DOI: 10.1056 / NEJM1953250406. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
    • Ноэль Дж. С., Лю Б. Л., Хамфри К. Д., Родригес Е. М., Ламбден П. Р., Кларк И. Н., Дуайер Д. М., Андо Т., Гласс Р. И., Монро С. С.. Вирус Парквилля: новый генетический вариант калицивируса человека в кладе вируса Саппоро, связанный со вспышкой гастроэнтерита у взрослых.J Med Virol. 1997. 52: 173–178. DOI: 10.1002 / (SICI) 1096-9071 (199706) 52: 2 <173 :: AID-JMV10> 3.0.CO; 2-M. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
    • Епископ РФ, Дэвидсон Г.П., Холмс И.Х., Рак Б.Дж. Вирусные частицы в эпителиальных клетках слизистой оболочки двенадцатиперстной кишки у детей с острым небактериальным гастроэнтеритом. Ланцет. 1973; 2: 1281–1283. [PubMed] [Google Scholar]
    • Парашар Ю.Д., Гибсон С.Дж., Бресс Дж.С., Гласс Р.И. Ротавирус и тяжелая диарея у детей. Emerg Infect Dis. 2006. 12: 304–306. DOI: 10.3201 / eid1202.050006. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
    • Mackow E. In: Инфекции желудочно-кишечного тракта. Блазер М., Смит П., Равдин Дж., Гринберг Х., Геррант Р.Л., редактор. Нью-Йорк: Raven Press; 1995. Ротавирусы группы B и C; С. 983–1008. [Google Scholar]
    • Сантос Н., Хосино Ю. Глобальное распространение серотипов / генотипов ротавируса и его значение для разработки и внедрения эффективной ротавирусной вакцины. Rev Med Virol. 2005; 15: 29–56.DOI: 10.1002 / RMV.448. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
    • Родригес В.Дж., Ким Х.В., Арробио Дж.О., Брандт С.Д., Чанок Р.М., Капикиан А.З., Вятт Р.Г., Парротт Р.Х. Клинические особенности острого гастроэнтерита, связанного с реовирусоподобным агентом человека, у младенцев и детей раннего возраста. J Pediatr. 1977; 91: 188–193. DOI: 10.1016 / S0022-3476 (77) 80810-X. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
    • Brandt CD, Kim HW, Rodriguez WJ, Arrobio JO, Jeffries BC, Stallings EP, Lewis C, Miles AJ, Chanock RM, Kapikian AZ, Parrott RH.Детский вирусный гастроэнтерит за восемь лет исследования. J Clin Microbiol. 1983; 18: 71–78. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]
    • Эдмонсон Л. М., Эбберт Дж. О., Эванс Дж. М.. Сообщение о вспышке ротавируса среди взрослого населения дома престарелых. J Am Med Dir Assoc. 2000; 1: 175–179. [PubMed] [Google Scholar]
    • Hrdy DB. Эпидемиология ротавирусной инфекции у взрослых. Rev Infect Dis. 1987; 9: 461–469. DOI: 10.1093 / Clinids / 9.3.461. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
    • Griffin MR, Surowiec JJ, McCloskey DI, Capuano B, Pierzynski B, Quinn M, Wojnarski R, Parkin WE, Greenberg H, Gary GW.Норуолкский вирус пищевого происхождения. Am J Epidemiol. 1982; 115: 178–184. [PubMed] [Google Scholar]
    • Ганн Р.А., Яновски Х.Т., Либ С., Пратер ЕС, Гринберг Х.Б. Гастроэнтерит, вызванный вирусом Norwalk, возникший после употребления в пищу сырых устриц. Am J Epidemiol. 1982; 115: 348–351. [PubMed] [Google Scholar]
    • Malek M, Barzilay E, Kramer A, Camp B, Jaykus LA, Escudero-Abarca B, Derrick G, White P, Gerba C, Higgins C. и др. Вспышка норовирусной инфекции среди рек стропила, связанные с упакованным мясом деликатесов, Гранд-Каньон, 2005 г.Clin Infect Dis. 2009. 48: 31–37. DOI: 10,1086 / 5
      . [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
    • Саид MA, Perl TM, Sears CL. Эпидемиология здравоохранения: желудочно-кишечный грипп: норовирус в учреждениях здравоохранения и длительного ухода. Clin Infect Dis. 2008. 47: 1202–1208. DOI: 10,1086 / 5. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
    • О’Райан М., Linhares AC. Последняя информация о Rotarix: пероральная вакцина против ротавируса человека. Экспертные ревакцины. 2009. 8: 1627–1641. DOI: 10.1586 / erv.09.136. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

    Инкубационные периоды вирусного гастроэнтерита: систематический обзор

    BMC Infect Dis.2013; 13: 446.

    , 1 , 2 , 1 , 2 , 3 , 4 и 2

    Рейчел М. Ли

    1 Департамент международного здравоохранения, Johns Hopkins Bloomberg School of Public Health, Baltimore, USA

    Justin Lessler

    2 Департамент эпидемиологии, Школа общественного здравоохранения Bloomberg Джонса Хопкинса, Балтимор, США

    Rose A Lee

    1 Department of International Health, Johns Hopkins Bloomberg School of Public Health, Балтимор, США

    Kara E Rudolph

    2 Департамент эпидемиологии, Школа общественного здравоохранения Bloomberg Джонса Хопкинса, Балтимор, США

    Nicholas G Reich

    3 Отдел биостатистики и эпидемиологии , Школа общественного здравоохранения и медицинских наук, Массачусетский университет, Амхерст, Амхерст, США

    Триш М. Перл

    4 Депар Департамент медицины, Отделение инфекционных заболеваний, Медицинская школа Университета Джона Хопкинса, Балтимор, США

    Дерек А.Т. Каммингс

    2 Департамент эпидемиологии, Школа общественного здравоохранения Блумберга Джонса Хопкинса, Балтимор, США

    1 Департамент Международного здравоохранения, Школа общественного здравоохранения Блумберга Джонса Хопкинса, Балтимор, США

    2 Департамент эпидемиологии, Школа общественного здравоохранения Блумберга Джонса Хопкинса, Балтимор, США

    3 Отдел биостатистики и эпидемиологии, Школа общественного здравоохранения и медицинских наук, Массачусетский университет, Амхерст, Амхерст, США

    4 Департамент медицины, Отделение инфекционных заболеваний, Медицинский факультет Университета Джона Хопкинса, Балтимор, США

    Автор, отвечающий за переписку.

    Поступило 06 марта 2013 г .; Принято 12 сентября 2013 г.

    Copyright © 2013 Lee et al .; лицензиат BioMed Central Ltd. Это статья в открытом доступе, распространяемая в соответствии с условиями лицензии Creative Commons Attribution License (http://creativecommons.org/licenses/by/2.0), которая разрешает неограниченное использование, распространение и воспроизведение на любом носителе, при условии правильного цитирования оригинальной работы. Эта статья цитировалась в других статьях в PMC.
    Дополнительные материалы

    Дополнительный файл 1 Сравнение логарифмически нормального, гамма-распределений, распределений Вейбулла и Эрлинга.

    GUID: E778F8C8-667E-4C91-903D-7B3CCDE5DCA8

    Реферат

    Предпосылки

    Точное знание инкубационного периода важно для исследования и контроля инфекционных заболеваний и их передачи, однако сведения об инкубационном периоде имеются в литературе. часто не цитируются, противоречивы и / или не основаны на доказательствах.

    Методы

    При систематическом обзоре литературы по пяти кишечным вирусам, имеющим значение для общественного здравоохранения, мы нашли 256 статей с оценками инкубационного периода, в том числе 33 с данными для объединенного анализа.

    Результаты

    Мы подобрали логарифмически нормальное распределение для объединенных данных и обнаружили, что средний инкубационный период составляет 4,5 дня (95% ДИ 3,9-5,2 дня) для астровируса, 1,2 дня (95% ДИ 1,1-1,2 дня) для норовируса. геногрупп I и II, 1,7 дня (95% ДИ 1,5–1,8 дня) для саповирусов и 2,0 дня (95% ДИ 1,4–2,4 дня) для ротавируса.

    Выводы

    Наши оценки объединяют опубликованные данные и предоставляют достаточные количественные детали, позволяющие использовать эти оценки в широком спектре клинических приложений и приложений для моделирования.Это может привести к улучшению мер профилактики и контроля в условиях передачи или риска передачи.

    Ключевые слова: Инкубационный период, норовирус, ротавирус, калицивирусы, астровирус, систематический обзор

    Предпосылки

    Острый вирусный гастроэнтерит является важной и часто недооцениваемой причиной заболеваемости и смертности во всем мире. Почти все дети перенесли хотя бы одну ротавирусную инфекцию к пяти годам. Ежегодно на ротавирус приходится около двух миллионов госпитализаций и от 350 000 до 600 000 случаев смерти детей младшего возраста [1].Несколько исследований показали, что астровирус является важной причиной острого гастроэнтерита у детей раннего возраста; исследование распространенности в Соединенном Королевстве показало, что более 70% пятилетних детей имеют антитела к вирусу [2-6]. Астровирус также упоминается как важная причина гастроэнтерита у пожилых людей [7,8]. Калицивирусы, в частности норовирусы, являются наиболее важной причиной эпидемических небактериальных гастроэнтеритов во всем мире, поражают как взрослых, так и детей и составляют от 40 до 50% всех гастроэнтеритов пищевого происхождения в США [9,10].

    Астровирус, ротавирус и калицивирусы являются важными причинами инфекций, связанных с оказанием медицинской помощи, и вспышек заболеваний в медицинских учреждениях [11]. Инкубационный период (время между заражением и появлением симптомов) важен для точного эпиднадзора за инфекциями, связанными с оказанием медицинской помощи, и реализации эффективных мер борьбы со вспышками (например, когортирование и / или карантин). [12] Инкубационный период часто используется для определения заражающего воздействия во время вспышек болезней пищевого происхождения [13,14] и может помочь в диагностике, когда лабораторные ресурсы недоступны.Критерии Каплана были разработаны и часто используются для определения того, была ли вспышка вызвана норовирусом; инкубационный период — один из ключевых элементов этих критериев. [15] Другие применения точно описанного инкубационного периода включают в себя прогностические модели, которые используют инкубационный период для точного моделирования процесса заболевания, а продолжительность инкубационного периода по отношению к латентному периоду (время между заражением и переходом в инфекцию) определяет потенциальная эффективность мер контроля, нацеленных на лиц с симптомами [16].

    Несмотря на важность, периоды инкубации кишечных вирусов недостаточно хорошо описаны в медицинской литературе. Информация об инкубационном периоде, как правило, состоит из одного числа («Инкубационный период ротавирусной болезни составляет приблизительно 2 дня» [17]) или плохо определенного диапазона («Инкубационный период для астровирусной болезни составляет от 1 до 5 дней…» [ 18]). Эти утверждения инкубационного периода трудно воплотить в реалии профилактики и контроля. Оценка с одним числом может представлять собой среднее значение, медианное значение, верхний предел или какой-либо другой показатель инкубационного периода.Диапазон может представлять собой исчерпывающий диапазон всех наблюдений или некоторый неопределенный квантиль (например, 95% доверительный интервал, внутренний 75% и т. Д.). Кроме того, часто неясна сила доказательств, лежащих в основе этих оценок. Заявления об инкубационном периоде часто не включают цитату, а когда цитируется, следование цепочке цитирований часто показывает, что оценка основана на ограниченных доказательствах [19].

    Мы проанализировали литературу по пяти кишечным вирусам, отобранным с учетом их важности для общественного здравоохранения: астровирус, калицивирусы (геногруппы норовирусов I и II и саповирусы) и ротавирус.Посредством систематического обзора и анализа опубликованных оценок и данных мы стремимся (1) зафиксировать консенсус в медицинской литературе по этим инкубационным периодам, (2) охарактеризовать доказательства, лежащие в основе этого консенсуса, и (3) предоставить улучшенные оценки инкубационных периодов для эти инфекции. Поступая таким образом, мы надеемся, что инкубационный период будет использоваться в большем количестве приложений и выявить те области, в которых необходимы дополнительные исследования.

    Методы

    В этом систематическом обзоре в основном использовались методы, описанные в Lessler et al., 2009 [20]. Подробности и различия в подходах описаны ниже.

    Стратегия поиска и критерии выбора

    Для каждого вируса мы провели поиск в PubMed, Google Scholar и ISI Web of Knowledge 4.0, как описано Lessler et al., 2009 [20]. В PubMed мы искали слова «инкубация», «период» и название вируса, в Google Scholar мы искали фразы «инкубационный период [название вируса]» и «инкубационный период для [название вируса]», а также ISI Web of Knowledge мы искали по «инкубационному периоду» и названию вируса [20].Поиски проводились в период с 20 января 2011 г. по 16 августа 2011 г., без ограничений по самой ранней дате возврата статей. Общие варианты названия каждого вируса использовались в каждой базе данных, в частности, «астровирус», «калицивирус», «норовирус», «вирус Норо», «Норуолк», «Норуолк-подобный», «NLV», «NLV», «SRSV». »,« Зимняя рвота »,« Hyperemesis hiemis »,« Снежная гора »,« саповирус »,« вирус Саппоро »,« Саппороподобный вирус »,« ротавирус »,« дуовирус »,« агент, подобный реовирусу человека », и «агент инфантильного гастроэнтерита».Мы также рассмотрели четыре широко используемых справочника по инфекционным заболеваниям [11,21-23]. Тезисы рецензировались двумя рецензентами независимо друг от друга. Расхождения были устранены путем обсуждения и консенсуса. Этот обзор соответствует контрольным спискам систематических обзоров PRISMA и QUORUM.

    Оценка

    Документы, включенные в полнотекстовый обзор, были классифицированы как содержащие (1) оценку инкубационного периода, основанную на исходных данных и / или анализе, (2) отчет об инкубационном периоде (т. Е. Предоставленную ссылку), (3) ) отчет об инкубационном периоде без источника (т.д., без ссылки) или (4) без указания инкубационного периода. Все документы были также проверены на предмет данных индивидуального уровня, пригодных для объединенного анализа. Полные тексты рецензировались независимо двумя рецензентами. Расхождения были устранены путем обсуждения и консенсуса.

    Абстракция данных

    Отчеты инкубационного периода и данные на индивидуальном уровне, подходящие для объединенного анализа, были извлечены, как описано в Lessler et al., 2009 [20]. Поскольку во многих вспышках болезней пищевого происхождения, описанных в литературе, не сообщалось о точном времени приема пищи, мы установили стандартные интервалы воздействия, которые использовались при абстрагировании данных на индивидуальном уровне для исследований, в которых время приема пищи было указано как просто «завтрак», «обед» или «обед».Воздействие во время завтрака считалось периодом между 0:00 и 10:00, обедом между 10:00 и 14:00 и ужином между 14:00 и 0:00. Мы сообщаем диапазон инкубационных периодов таким образом, чтобы инкубационный период в этом диапазоне соответствовал прогнозам большинства исследователей (т.е.согласовался с более чем 50% опубликованных оценок) и модальным утверждением центральной тенденции.

    Объединенный анализ

    Сартвелл и другие показали, что натуральный логарифм инкубационных периодов острых инфекционных заболеваний имеет тенденцию к нормальному распределению; следовательно, инкубационный период следует логарифмически нормальному распределению, определяемому средним инкубационным периодом и коэффициентом дисперсии [20,24-26].При нормальном распределении примерно две трети данных попадают в одно стандартное отклонение от среднего; аналогично при логнормальном распределении примерно в двух третях случаев развиваются симптомы между медианной / дисперсией и медианной × дисперсией. Для каждого патогена все наблюдения были объединены в единый набор двухинтервальных цензурированных наблюдений; каждая точка данных содержала диапазон возможных времен воздействия, например «обед», и диапазон возможных времен появления симптомов.Поскольку время воздействия и появления симптомов редко сообщается точно, минимальный временной интервал, который мы рассмотрели, составлял один час. Если сообщалось, что время появления симптома составляет 17:00, мы записывали время появления симптома между 17:00 и 18:00. Оценки максимального правдоподобия были получены с использованием пакета coarseDataTools для R [25,27]. Доверительные интервалы рассчитывались методом начальной загрузки (500 итераций). Объединенные данные для каждой геногруппы норовирусов были проанализированы индивидуально, данные из геногрупп I и II были проанализированы вместе, и, наконец, все данные о калицивирусах человека (как геногруппы норовирусов, так и саповирусы) были объединены и проанализированы.Для выбора подходящих групп использовались байесовский информационный критерий и оценка клинически значимых различий в оценках. Результаты инкубационного периода, полученные с использованием логнормального распределения, сравнивались с результатами, полученными с использованием распределений Вейбулла и гамма-распределения; квантильные оценки оказались согласованными между распределениями (см. дополнительный файл 1). Все анализы были выполнены с использованием статистического пакета R (версия 2.11). Конкретные оценки, содержащиеся в этом обзоре, все данные, использованные в объединенном анализе, и полная библиография доступны у авторов по запросу.В помощь разработчикам моделей результаты подгонки данных с использованием распределения Эрланга доступны в дополнительных материалах (Дополнительный файл 1).

    Результаты

    Мы идентифицировали 256 статей с одним или несколькими заявлениями об инкубационном периоде (рисунок). Из 317 оценок, включенных в эти статьи, 91 (29%) были оригинальными, 137 (43%) давали источник, а 89 (28%) не предоставляли источник (таблица). 33 статьи содержали данные на индивидуальном уровне, подходящие для объединенного анализа (таблица). Шесть (18%) исследований были экспериментальными, а 27 (82%) — наблюдательными.В таблице приведены инкубационные периоды, указанные в литературе, и исходные данные. Оценки инкубационного периода норовирусов получили наибольшую поддержку (23 исследования). Оценка саповирусов была подтверждена меньшим количеством исследований, но эти исследования были относительно большими. Для ротавируса и астровируса было доступно менее 20 наблюдений. Оценки полного распределения каждого инкубационного периода с использованием объединенных данных показаны на рисунке и в таблице. Это обеспечивает периоды, когда 5%, 25%, 50%, 75% и 95% случаев станут симптоматическими.Мы показываем только 5-й и 95-й процентили, когда было более 20 наблюдений для отдельного вируса. Медиана инкубационного периода варьировала от 1,1 дня (для норовирусов геногруппы I) до 4,5 дня (для астровируса). Разброс от 1,22 до 1,82. Полные распределения, наложенные на гистограммы данных латентного периода, показаны на рисунке.

    Процесс систематического обзора.

    Таблица 1

    Сводка оценок инкубационного периода в опубликованной литературе


    2
    Литературные оценки * (дни)
    Количество оценок (%)
    Участники экспериментальных исследований (n ) ψ
    Диапазон Центральная тенденция Оценки без источников Исходные оценки Исходные оценки [экспериментальные / наблюдательные] 1-5
    3
    8 (40%)
    7 (35%)
    5 (25%) [1/4]
    1
    Калицивирусы
    Норовирус
    1-2
    1
    39 (22%)
    74 (43%)
    60 (35%) [15/45]
    189
    Геногруппы I и II
    Саповирус
    2
    5 (36%)
    2 (14%)
    7 (50%) [0/7]

    Ротавирус
    1-4 2
    37 (34%)
    54 (49%)
    19 (17%) [6/13]
    42
    Всего
    89 (28%)
    137 (43%) 91 (29%) [22/69] 232

    Таблица 2

    Исследования, включенные в объединенный анализ

    .(2000) [49]
    Местоположение Тип исследования N Население ion Комментарии
    Астровирус
    Kurtz et al.(1979) [28]
    UK
    Экспериментальный
    4
    Взрослые добровольцы в возрасте 18–50 лет

    Midthun et al. (1993) [29]
    USA
    Экспериментальный
    1
    Взрослый доброволец

    Mitchell et al. (1993) [30]
    США
    Наблюдательные
    5
    Дети в возрасте 6–30 месяцев
    Вспышка в детском саду
    Калицивирусы
    9026 Норовирус

    Геногруппа I
    Baron et al.(1982) [31]
    США
    Наблюдательный
    132
    Взрослые и дети в возрасте от 9 месяцев до 59 лет
    Вспышка, связанная с купанием в озере
    Becker et al. (2000) [32]
    США
    Наблюдательный
    54
    Футболисты мужского пола колледжа
    Вспышка, связанная с упакованными обедами
    Dolin et al.(1971) [33]
    США
    Экспериментальный
    5
    Заключенные-мужчины в возрасте 18–45 лет

    Gill et al. (1983) [34]
    UK
    Наблюдательный
    127
    Взрослые
    Вспышка, связанная с потреблением сырых устриц
    Hicks et al. (1996) [35]
    UK
    Observational
    31
    Гости на свадебном приеме

    Hoebe et al.(2004) [36]
    Нидерланды
    Наблюдательный
    90
    Дети в возрасте 4–12 лет
    Вспышка, связанная с игрой в зараженном фонтане
    Курицкий и др. (1984) [37]
    США
    Наблюдательный
    126
    Взрослые и дети, посещающие любое из четырех социальных мероприятий с питанием
    Вспышка, связанная с употреблением в пищу замороженных хлебобулочных изделий, приготовленных плохим кулинаром
    Linco et al.(1980) [38]
    Австралия
    Наблюдательный
    24
    Гости на рождественском ужине
    Вспышка, связанная с употреблением сырых устриц
    Matsuhashi et al. (2003) [39]
    Япония
    Наблюдательный
    1
    Взрослый врач-мужчина
    Заболевание, связанное с выполнением колоноскопии у двух инфицированных лиц
    40218
    [
    USA
    Observational
    209
    Взрослые
    Oubreak, связанный с поеданием картофельного салата на корпоративном обеде
    Taylor et al.(1981) [41]
    США
    Наблюдательный
    329
    Дети в возрасте от 5 до 12 лет
    Вспышка, связанная с зараженной питьевой водой в начальной школе

    Норовирус
    Genogroup II
    de Wit et al. (2007) [42]
    Нидерланды
    Наблюдательный
    229
    Мужчины и женщины в возрасте 17–63 лет
    Вспышка, связанная с обедом для персонала
    Dolin et al.(1982) [43]
    США
    Экспериментальный
    9
    Взрослые добровольцы

    Gaulin et al. (1999) [44]
    Канада
    Observational
    43
    Посетители, посещающие рождественский ужин в ресторане

    Gotz et al. (2002) [45]
    Швеция
    Наблюдательный
    173
    114 детей в возрасте 1–10 лет и 79 взрослых в возрасте 20–61 лет
    Вспышка, связанная с обслуживанием обедов в 30 детских садах
    Grotto et al.(2004) [13]
    Израиль
    Наблюдательный
    162
    Солдаты мужского и женского пола, дислоцированные на военной базе
    Вспышка, связанная с салатом из столовой
    Hirakata et al. (2005) [46]
    Япония
    Наблюдательный
    628
    Учащиеся начальной, младшей и старшей школы
    Мексика Агент. Вспышка, связанная с обедом в ресторане во время производственной поездки
    Исакбаева и др.(2005) [47]
    США
    Наблюдательный
    2
    Взрослая женщина и ребенок
    Вспышка, связанная с контактом с больным ребенком во время двухчасовой игровой группы
    Kirking et al. (2010) [48]
    США
    Наблюдательный
    7
    Взрослые и дети в возрасте 11–73 лет
    Вспышка, связанная с воздействием рвотных масс в аэрозольной форме в самолете
    UK
    Observational
    43
    Посетители, посещающие ужин в большом отеле

    Marshall et al. (2001) [50]
    Австралия
    Наблюдательный
    46
    Посетители ресторана
    Вспышка, связанная с употреблением зараженной пищи в буфете
    Thornhill et al. (1977) [51]
    США
    Экспериментальный
    1
    Взрослый доброволец
    Гавайский агент
    Труман и др.(1987) [52]
    США
    Наблюдательный
    84
    Взрослые мужчины и женщины в возрасте 16–74 лет
    Вспышка, связанная с поеданием моллюсков на организованном мероприятии
    Сапов





    Хамфри и др. (1984) [53]
    UK
    Наблюдательный
    14
    Один ребенок в возрасте 3 лет, девять мужчин и женщин в возрасте 65–95 лет, 5 взрослых мужчин и женщин в возрасте 18–65 лет
    Вспышка в учреждении по уходу за престарелыми и в семье, которая владела учреждением
    Johansson et al.(2005) [54]
    Швеция
    Наблюдательный
    9
    Взрослые мужчины и женщины в возрасте 25–84 лет
    Инфекция в больницах
    Usuku et al. (2008) [55]
    Япония
    Наблюдательный
    65
    Шестьдесят учеников третьего класса и пять взрослых
    Вспышка, связанная с рестораном в отеле
    Yamashita et al.(2010) [56]
    Япония
    Наблюдательный
    18
    Взрослые мужчины и женщины в возрасте 20–70 лет
    Вспышка после свадебного приема
    Ротавирус
  • 4
  • Капикян и др. (1983) [57]
    США
    Экспериментальный
    4
    Взрослые добровольцы

    Morris et al.(1975) [58]
    UK
    Наблюдательный
    1
    Детский
    Инфекция в больницах
    Rodriguez et al. (1979) [59] США Наблюдательный 6 Две взрослые женщины и 4 ребенка в возрасте 18–24 месяцев Вспышка после игровой группы

    Кумулятивное распределение инкубационного периода. Показан совокупный процент случаев, у которых симптомы развиваются к данному дню согласно оценкам логнормального распределения.Доверительные интервалы рассчитывались методом начальной загрузки (500 итераций).

    Таблица 3

    Процентили времени появления симптомов и дисперсия для распределения заболеваний

    9014 **
    9382
    Оценка (95 % ДИ) времени появления симптомов (дни) *
    Дисперсия (95 % ДИ)
    5-й процентиль 25-й процентиль 50-й процентиль (медиана) 9013 75-й процентиль
    Астровирус

    4.0 (3,5-4,9)
    4,5 (3,9-5,2)
    5,3 (4,4-5,8)

    1,22 (1,04-1,30)
    Калицивирусы
    0,5 (0,5-0,5)
    0,9 (0,8-0,9)
    1,2 (1,1-1,2)
    1,7 (1,6-1,7)
    2,6 (2,6- 2,8)
    1,64 (1,61-1,71)
    Геногруппа I α
    0.4 (0,4-0,5)
    0,8 (0,7-0,8)
    1,1 (1,1-1,2)
    1,6 (1,6-1,7)
    3,0 (2,8-3,2)
    1,82 (1,75-1,90 )
    Геногруппа II β
    0,6 (0,5-0,6)
    0,9 (0,9-1,0)
    1,2 (1,2-1,3)
    1,6 (1,6-1,7) )
    2,5 (2,4-2,6)
    1,56 (1,49-1,62)
    Саповирусы ***
    0.9 (0,7-1,0)
    1,3 (1,1-1,4)
    1,7 (1,5-1,8)
    2,3 (2,0-2,4)
    3,3 (2,7-3,8)
    1,48 (1,36-1,61) )
    Ротавирус 1,6 (1,1-1,9) 2,0 (1,4-2,4) 2,5 (1,8-3,0) 1,37 (1,25-1,73)
    Кумулятивные распределения данных инкубационного и латентного периодов.

    Астровирус

    Астровирус передается фекально-оральным путем [22].Клинические симптомы включают диарею, боль в животе, головную боль, недомогание и рвоту, хотя рвота при астровирусной инфекции встречается реже, чем при ротавирусной или калицивирусной инфекциях [11,22]. Кроме того, астровирус с меньшей вероятностью вызывает обезвоживание или госпитализацию, чем ротавирус [2].

    Мы нашли 20 оценок инкубационного периода астровируса, включая пять исходных оценок, семь оценок с источниками и восемь оценок, в которых исходный источник не был предоставлен (оценки без источников).Заявления об инкубационном периоде обычно составляли от 1 до 5 дней (таблица). Было обнаружено три оригинальных исследования, содержащих данные, подходящие для объединенного анализа: два экспериментальных исследования с участием взрослых добровольцев [28,29] и обсервационное исследование, описывающее серию вспышек в детском центре в Хьюстоне, штат Техас, США [30]. На основе этих трех исследований мы оцениваем средний инкубационный период гастроэнтерита, вызванного астровирусом, в 4,5 дня (95% ДИ 3,9-5,2 дня) с разбросом 1,22 (95% ДИ 1.04-1.30) (таблица). 25% случаев станут симптоматическими к 4,0 дням (95% ДИ 3,5–4,9 дней), а 75% случаев станут симптомами к 5,3 дням (95% ДИ 4,4–5,8 дней) (таблица). Из-за ограниченности данных 5-й и 95-й процентили не оценивались. Немногие взрослые добровольцы проявляли симптомы при заражении астровирусом [28,30], что свидетельствует о низкой патогенности вируса у взрослых, которые могут быть защищены антителами, приобретенными в детстве [4,60]. Поскольку данные исследований взрослого заражения включают 50% абстрагируемых данных, подходящих для объединенного анализа на астровирус, наши результаты инкубационного периода могут быть неприменимы к первичным инфекциям или инфекциям у детей.

    Калицивирусы

    Калицивирусы (т. Е. Семейство Caliciviridae ) классически содержат четыре рода, два из которых, Norovirus и Sapovirus , вызывают острый гастроэнтерит у людей [11]. Было предложено, что пятый род калицивирусов включает два генотипа кишечного вируса крупного рогатого скота [61]. Норовирусы разделены на пять антигенно различных геногрупп, три из которых (I, II и IV) вызывают заболевания у людей [62,63]. Норовирусы геногруппы IV были охарактеризованы в сточных водах и речной воде, но, насколько нам известно, не были причастны к вспышкам заболеваний, поэтому этот обзор будет сосредоточен на норовирусах и саповирусах геногрупп I и II [64,65].Важно отметить, что недавние вспышки этих вирусов связаны с увеличением заболеваемости и смертности. Норовирусы и саповирусы передаются фекально-оральным путем и имеют несколько разные клинические проявления [11].

    Используя байесовский информационный критерий, мы определили, что все три геногруппы калицивируса человека статистически различаются с точки зрения распределения их инкубационного периода. Однако оценки инкубационных периодов, эпидемиологии и клинических проявлений калицивирусов геногрупп I и II для практических целей очень похожи [43,66].Мы предлагаем рассматривать эти две геногруппы, норовирусы, с одинаковым инкубационным периодом. Саповирусы имеют отличную эпидемиологию и клинические проявления от норовирусов геногрупп I и II, и их следует рассматривать как отдельную группу вирусов.

    Норовирусы (геногруппы I и II)

    Норовирусы вызывают примерно 90% всех вспышек эпидемического гастроэнтерита и являются важным источником вспышек болезней пищевого происхождения во всем мире [9,10,22]. Хотя передача происходит в основном фекально-оральным путем, имеются также свидетельства передачи через рвотные массы [48].Клинические симптомы включают спазмы в животе, тошноту, частую рвоту и диарею [22]. Большинство опубликованных оценок норовирусов соответствовало инкубационному периоду от 1 до 2 дней (таблица).

    Выявлен 131 документ с указанием инкубационного периода норовирусов. Эти документы содержали 60 исходных оценок, 74 оценки из источников и 39 оценок без источников. 54% всех полученных оценок инкубационного периода норовирусов цитировали одну из двух статей Kaplan et al.[15,67], или сослался на статью, в которой цитируется одна или обе эти статьи. Каплан и его коллеги объединили данные 38 вспышек норовируса в период с 1967 по 1980 год и предложили четыре критерия, которые можно использовать для характеристики вспышек норовируса: (1) посев кала, свободный от бактериальных патогенов, (2) средняя или средняя продолжительность болезни 12–60 часов, (3) рвота в ≥ 50% случаев и (4) средний или средний инкубационный период 24–48 часов [67]. Большинство опубликованных оценок инкубационного периода норовирусов соответствовали критериям Каплана (таблица).

    Основываясь на 2540 наблюдениях из 20 наблюдательных исследований и 15 наблюдений из трех экспериментальных исследований, мы оцениваем средний инкубационный период для норовирусов в 1,2 дня (95% ДИ 1,1-1,2 дня) с дисперсией 1,64 (95% ДИ 1,61- 1.71). В 5% случаев норовируса симптомы проявляются через 0,5 дня (95% ДИ 0,5–0,5 дня) после заражения, а в 95% случаев симптомы проявляются через 2,6 дня (95% ДИ 2,6–2,8 дня) (таблица).

    Геногруппа I

    На основании 1123 наблюдений из десяти наблюдательных исследований и пяти наблюдений из одного экспериментального исследования [33] мы оцениваем средний инкубационный период для норовирусов геногруппы I как 1.1 день (95% ДИ 1,1–1,2 дня) с дисперсией 1,82 (95% ДИ 1,75–1,90). В 5% случаев норовируса геногруппы I симптомы проявляются через 0,4 дня (95% ДИ 0,4–0,5 дня) после заражения, а в 95% случаев симптомы разовьются через 3,0 дня (95% ДИ 2,8–3,2 дня) (таблица).

    Геногруппа II

    Основываясь на десяти наблюдениях из двух экспериментальных исследований [43,51] и 1417 оценках из десяти обсервационных исследований [46,49], мы оцениваем средний инкубационный период для норовирусов геногруппы II как 1.2 дня (95% ДИ 1,2–1,3 дня) с дисперсией 1,56 (95% ДИ 1,49–1,62). В 5% случаев норовируса геногруппы II симптомы проявляются через 0,6 дня (95% ДИ 0,5–0,6 дня) после заражения, а в 95% случаев симптомы становятся симптоматическими через 2,5 дня (95% ДИ 2,4–2,6 дня) (таблица).

    Саповирусы

    Саповирусы в первую очередь вызывают гастроэнтерит у младенцев и детей и не являются важными патогенами во время вспышек болезней пищевого происхождения [68]. Клинические симптомы включают рвоту, обезвоживание, боль в животе и, в меньшей степени, диарею и лихорадку [69].Опубликованные оценки саповирусов соответствовали инкубационному периоду 1-3 дня (таблица).

    Выявлено 13 документов, содержащих 14 отчетов об инкубационном периоде саповирусов. Эти документы содержали семь исходных оценок, две оценки из источников и пять оценок без источников. Цитируемыми источниками были обзорная статья Блэклоу и Гринберга [70], в которой содержалась оценка без источника, и результаты наблюдательного исследования Ноэля и его коллег [71], описывающие вспышку штамма вируса Парквилл.

    Основываясь на 106 наблюдениях из четырех обсервационных исследований [53-56], мы оцениваем средний инкубационный период саповирусов в 1,7 дня (95% ДИ 1,5–1,8 дня) с дисперсией 1,48 (95% ДИ 1,36–1,61) . В 5% случаев симптомы проявляются через 0,9 дня (95% ДИ 0,7–1,0 дня) после заражения, а в 95% случаев симптомы проявляются через 3,3 дня (95% ДИ 2,7–3,8 дня) (таблица).

    Ротавирус

    Ротавирус передается фекально-оральным путем [22,72]. Ротавирус группы А вызывает более 600 000 случаев смерти младенцев и детей младшего возраста в год, в основном в развивающихся странах [73].Ротавирусы группы B преимущественно наблюдались во взрывных вспышках среди взрослых в Китае [11,74]. Ротавирусы группы C, по-видимому, не имеют значения для общественного здравоохранения [11,74]. Распространенность серотипов ротавирусов в этих группах варьируется в разных частях мира, что чрезвычайно затрудняет широкомасштабную эффективную борьбу с заболеванием [75]. Клинические симптомы включают лихорадку и рвоту, за которыми следует обильная водянистая диарея и обезвоживание [76]. Инфекции, вызывающие острое заболевание, возникают преимущественно в возрасте от 6 до 24 месяцев [76,77].У взрослых инфекции обычно протекают бессимптомно, однако заболевание было вызвано экспериментально у взрослых, и описаны вспышки среди взрослого населения [11,57,78,79].

    Мы нашли 110 оценок инкубационного периода ротавируса, включая 19 исходных оценок, 54 оценки с источниками и 37 оценок без источников. Большинство опубликованных оценок ротавируса соответствовали двухдневному инкубационному периоду (таблица).

    Основываясь на четырех наблюдениях из одного экспериментального исследования на взрослых добровольцах [57] и шести наблюдениях из двух наблюдательных исследований [58,59], мы оцениваем средний инкубационный период ротавируса как 2.0 дней (95% ДИ 1,4–2,4 дня) с дисперсией 1,37 (1,25–1,73). В 25% случаев ротавирус становится симптоматическим через 1,6 дня (95% ДИ 1,1–1,9 дня), а в 75% случаев симптомы проявляются через 2,5 дня (95% ДИ 1,8–3,0 дня) после заражения (таблица). Из-за ограниченности данных 5-й и 95-й процентили не оценивались.

    Обсуждение

    Оценка инкубационного периода инфекционных заболеваний, включая гастроэнтерит, имеет решающее значение для обоснования и обоснованности вмешательств, направленных на прекращение текущей передачи.В нашем обзоре трех основных вирусных причин гастроэнтерита мы обнаружили, что 61% из 226 оценок инкубационного периода даны со ссылкой. После изучения деревьев цитирования для этих оценок только 114 (50%) из 226 были фактически основаны на данных. Двадцать три (17%) оценок из источников ссылались на статью, которая содержала оценку без источников. Эти данные показывают, что инкубационные периоды кишечных вирусов часто считаются общеизвестными. Из источников, основанных на данных, большинство для каждого вируса можно проследить до оценок из небольшого числа оригинальных исследований, таких как Kaplan et al.статьи для геногрупп I и II норовирусов [15,67].

    Были некоторые опасения, что отдельные исследования потенциально могут иметь чрезмерное влияние на объединенный анализ. Мы провели анализ чувствительности, удалив все исследования и пересчитав оценки инкубационного периода. Мы не обнаружили качественной разницы в результатах.

    Определение инкубационного периода ограничено степенью неопределенности относительно времени заражения. Поскольку инкубационные периоды вирусного гастроэнтерита короткие, часто бывает трудно различить первичный и вторичный случаи во время вспышки.Это затрудняет получение точной информации об интервале экспозиции. Большинство обсервационных исследований, особенно исследований вспышек пищевого происхождения, решают эту проблему, рассматривая только случаи в течение определенного количества дней после заражения [34,36,37,42,44,52,80-82]. Этот метод идентификации случаев может внести систематическую ошибку за счет исключения случаев, которые попадают в конечную точку распределения инкубационного периода. Несмотря на то, что существует множество наблюдательных исследований, описывающих вспышки, вызванные ротавирусом и астровирусом, поскольку интервал воздействия для отдельных случаев не может быть определен, данные этих исследований не могут использоваться для определения инкубационного периода.

    Множество факторов могут привести к тому, что данные экспериментального заражения будут отличаться от данных естественного заражения, например, инфекционная доза или добровольцы, чей статус хозяина отличается от такового в общей популяции. Например, единственное экспериментальное исследование, внесшее данные в объединенный анализ ротавируса, проводилось с поиском добровольцев с низким уровнем антител в сыворотке [57]. Эти предубеждения усугубляются невозможностью проведения экспериментальных исследований проблем среди групп населения, наиболее подверженных риску заболеваний, среди детей и пожилых людей.Это особенно верно в отношении ротавируса и астровируса, болезней, от которых почти всегда страдают маленькие дети.

    Этот обзор был ограничен включением только опубликованных данных и условиями поиска. Из-за того, что мы включили некоторую форму «инкубационного периода» в поиск статей, вся литература по каждому вирусу не рассматривалась. Наши оценки для астровируса и ротавируса основаны на трех исследованиях и менее чем 20 наблюдениях. Из-за трудностей экспериментального изучения этих заболеваний необходимы тщательные наблюдательные исследования, чтобы получить больше доказательств, подтверждающих инкубационный период и его распространение.

    Точное знание инкубационного периода особенно важно для вирусного гастроэнтерита из-за короткой продолжительности инкубационного периода, относительно высокой частоты вторичных атак и возможности возникновения вспышек заболеваний, связанных с оказанием медицинской помощи. Как ротавирус, так и норовирус особенно трудно контролировать в медицинских учреждениях [11,83]. Фишер и его коллеги определили, что в среднем 27% пациентов в развитых странах и 32% пациентов в развивающихся странах, выписанных с диагнозом ротавирус, заразились этим вирусом в больнице [17].Кроме того, инкубационный период является важным компонентом серийного интервала (разница во времени появления симптомов в случае и в случае инфицирования), который является одним из основных факторов, определяющих скорость распространения эпидемий в популяции.

    Несмотря на лицензирование двух безопасных и эффективных вакцин, ротавирус продолжает оставаться важной проблемой общественного здравоохранения. Это особенно верно в развивающихся странах, где происходит подавляющее большинство ротавирусных заболеваний и смертей, и где ротавирусная вакцина имеет самую низкую эффективность [84].Точное знание инкубационного периода важно для понимания динамики ротавирусной болезни и борьбы с ней. По мере того как охват вакцинацией улучшается и ротавирусная инфекция перестает быть повсеместной, инкубационный период будет полезен для изучения воздействия патогенов, связанного с неэффективностью вакцинации, и потенциальных различий в восприимчивости хозяев к инфекции.

    Заключение

    После нашей работы по оценке инкубационного периода респираторных вирусов [20], в этом обзоре мы объединили опубликованные данные для оценки инкубационных периодов пяти кишечных вирусов, важных для общественного здравоохранения.Как правило, опубликованные оценки инкубационного периода описывают только центральную тенденцию или указывают на неопределенный диапазон, однако знание распределения всего инкубационного периода важно для полного понимания динамики заболевания и потенциальной эффективности мер контроля. Это особенно верно в условиях, когда инфекции могут быть взрывоопасными и иметь огромное влияние на результаты лечения пациентов. Наши оценки обеспечивают дополнительный уровень детализации, необходимый для этих и других приложений, что делает инкубационный период более полезным для исследований, клинической практики и политики общественного здравоохранения.

    Конкурирующие интересы

    Авторы заявляют, что у них нет конкурирующих интересов.

    Вклад авторов

    RML провела систематический обзор и анализ данных, а также подготовила рукопись. JL провел анализ данных и помог составить рукопись. RAL и KER провели систематический обзор. JL, DATC, TMP и NGR участвовали в разработке и концепции исследования. Все авторы прочитали и одобрили окончательную рукопись.

    Дополнительные материалы

    Дополнительный файл 1:

    Сравнение логарифмически нормального, гамма-распределений, распределений Вейбулла и Эрлинга.

    Благодарности

    Работа JL над этим проектом финансировалась за счет гранта Фонда Билла и Мелинды Гейтс (Инициатива по моделированию вакцин, 705580–3), и он является лауреатом премии NIH в области научных исследований в области развития (NIAID, K22). AI0-01). KER финансировался Отделом программ интромуральных исследований Национального института психического здоровья.

    Ссылки

    • Parashar UD, Hummelman EG, Bresee JS, Miller MA, Glass RI. Заболевания и смертность детей от ротавирусной инфекции в мире.Emerg Infect Dis. 2003. 9: 565–572. DOI: 10.3201 / eid0905.020562. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
    • Dennehy PH, Nelson SM, Spangenberger S, Noel JS, Monroe SS, Glass RI. Проспективное исследование «случай – контроль» роли астровируса в острой диарее среди госпитализированных маленьких детей. J Infect Dis. 2001; 184: 10–15. DOI: 10,1086 / 321007. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
    • Херрманн Дж. Э., Тейлор Д. Н., Эчеверрия П., Блэклоу Н. Р.. Астровирусы как причина гастроэнтерита у детей.N Engl J Med. 1991; 324: 1757–1760. DOI: 10.1056 / NEJM1903242501. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
    • Курц Дж., Ли Т. Распределение антител по возрасту астровирусного гастроэнтерита. Med Microbiol Immunol. 1978; 166: 227–230. DOI: 10.1007 / BF02121154. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
    • Rodriguez-Baez N, O’Brien R, Qiu SQ, Bass DM. Астровирус, аденовирус и ротавирус у госпитализированных детей: распространенность и связь с гастроэнтеритом. J Pediatr Gastroenterol Nutr. 2002. 35: 64–68.DOI: 10.1097 / 00005176-200207000-00014. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
    • Шастри С., Доан А.М., Гонсалес Дж., Упадхьяюла Ю., басс Д.М. Распространенность астровирусов в детской больнице. J Clin Microbiol. 1998. 36: 2571–2574. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]
    • Lewis DC, Lightfoot NF, Cubitt WD, Wilson SA. Вспышки астровируса типа 1 и ротавирусного гастроэнтерита в гериатрических стационарах. J Hosp Infect. 1989; 14: 9–14. DOI: 10.1016 / 0195-6701 (89) -X.[PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
    • Gray JJ, Wreghitt TG, Cubitt WD, Elliot PR. Вспышка гастроэнтерита в доме престарелых, связанная с астровирусом 1 типа и калицивирусом человека. J Med Virol. 1987. 23: 377–381. DOI: 10.1002 / jmv.18410. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
    • Технические данные. http://www.cdc.gov/norovirus/php/illness-outbreaks.html.
    • Долин Р. Норовирусы — проблемы, которые нужно контролировать. N Engl J Med. 2007; 357: 1072–1073. DOI: 10.1056 / NEJMp078050.[PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
    • Хоули П., Книп Д., Филдс Б. Вирусология Филда, 5-е изд. Филадельфия: Липпинкотт, Уильямс и Уилкинс; 2007. [Google Scholar]
    • Lessler J, Brookmeyer R, Perl TM. Оценка правил классификации на основе даты появления симптомов для выявления инфекций, связанных с оказанием медицинской помощи. Am J Epidemiol. 2007. 166: 1220–1229. DOI: 10,1093 / AJE / kwm188. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
    • Grotto I, Huerta M, Balicer RD, Halperin T, Cohen D, Orr N, Gdalevich M.Вспышка норовирусного гастроэнтерита на израильской военной базе. Инфекционное заболевание. 2004. 32: 339–343. DOI: 10.1007 / s15010-004-4002-3. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
    • Schmid D, Stuger HP, Lederer I, Pichler AM, Kainz-Arnfelser G, Schreier E, Allerberger F. Вспышка норовируса пищевого происхождения из-за салата, приготовленного вручную, Австрия, 2006 г. Инфекция. 2007. 35: 232–239. DOI: 10.1007 / s15010-007-6327-1. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
    • Каплан Дж. Э., Фельдман Р., Кэмпбелл Д. С., Лукабо К., Гэри Г. У.Частота болезни, аналогичной норволкской, во вспышках острого гастроэнтерита. Am J Public Health. 1982; 72: 1329–1332. DOI: 10.2105 / AJPH.72.12.1329. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
    • Fraser C, Riley S, Anderson RM, Ferguson NM. Факторы, позволяющие контролировать вспышку инфекционного заболевания. Proc Natl Acad Sci USA. 2004. 101: 6146–6151. DOI: 10.1073 / pnas.0307506101. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
    • Fischer TK, Bresee JS, Glass RI.Ротавирусные вакцины и профилактика госпитальной диареи у детей. Вакцина. 2004; 22 (Приложение 1): S49 – S54. [PubMed] [Google Scholar]
    • Blacklow NR, Herrmann JE. Астровирусный гастроэнтерит. Trans Am Clin Climatol Assoc. 1995; 106: 58–66. обсуждение 66–58. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]
    • Reich NG, Perl TM, Cummings DA, Lessler J. Визуализация клинических данных: сети цитирования для инкубационных периодов респираторных вирусных инфекций. PLoS One. 2011; 6: e19496.DOI: 10.1371 / journal.pone.0019496. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
    • Lessler J, Reich NG, Brookmeyer R, Perl TM, Nelson KE, Cummings DA. Инкубационные периоды ОРВИ: систематический обзор. Lancet Infect Dis. 2009; 9: 291–300. DOI: 10.1016 / S1473-3099 (09) 70069-6. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
    • Хейманн Д. Руководство по борьбе с инфекционными заболеваниями. 19. Вашингтон, округ Колумбия: Американская ассоциация общественного здравоохранения; 2008 г.[Google Scholar]
    • Манделл Дж., Беннет Дж., Долин Р. Принципы и практика инфекционных заболеваний. Филадельфия: Черчилль Ливингстон; 2005. [Google Scholar]
    • Пикеринг Л. Красная книга: отчет Комитета по инфекционным болезням за 2009 год. 28. Элк-Гроув-Виллидж, Иллинойс: Американская академия педиатрии; 2009. 225, 241-242, 576-579. [Google Scholar]
    • Каулинг Б.Дж., Мюллер М.П., ​​Вонг И.О., Хо Л.М., Луи М., МакГир А., Люн Г.М. Альтернативные методы оценки распределения инкубации: примеры из тяжелого острого респираторного синдрома.Эпидемиология. 2007. 18: 253–259. DOI: 10.1097 / 01.ede.0000254660.07942.fb. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
    • Рейх Н.Г., Лесслер Дж., Каммингс Д.А., Брукмейер Р. Оценка распределения инкубационного периода с помощью приблизительных данных. Stat Med. 2009. 28: 2769–2784. DOI: 10.1002 / sim.3659. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
    • Sartwell PE. Распределение инкубационных периодов инфекционного заболевания. Am J Hyg. 1950; 51: 310–318. [PubMed] [Google Scholar]
    • coarseDataTools: набор функций, помогающих анализировать грубо наблюдаемые данные.http://cran.r-project.org/web/packages/coarseDataTools.
    • Курц Дж. Б., Ли Т. В., Крейг Дж. В., Рид С. Е.. Астровирусная инфекция у добровольцев. J Med Virol. 1979; 3: 221–230. DOI: 10.1002 / jmv.18

      308. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

    • Midthun K, Greenberg HB, Kurtz JB, Gary GW, Lin FY, Kapikian AZ. Характеристика и сероэпидемиология астровируса типа 5, связанного со вспышкой гастроэнтерита в округе Марин, Калифорния. J Clin Microbiol. 1993; 31: 955–962. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]
    • Митчелл Д.К., Ван Р., Морроу А.Л., Монро С.С., Гласс Р.И., Пикеринг Л.К.Вспышки астровирусного гастроэнтерита в детских садах. J Pediatr. 1993; 123: 725–732. DOI: 10.1016 / S0022-3476 (05) 80846-7. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
    • Baron RC, Murphy FD, Greenberg HB, Davis CE, Bregman DJ, Gary GW, Hughes JM, Schonberger LB. Желудочно-кишечное заболевание Norwalk: вспышка, связанная с купанием в озере для отдыха, и вторичная передача от человека к человеку. Am J Epidemiol. 1982; 115: 163–172. [PubMed] [Google Scholar]
    • Becker KM, Moe CL, Southwick KL, MacCormack JN.Передача вируса Norwalk во время футбольного матча. N Engl J Med. 2000; 343: 1223–1227. DOI: 10.1056 / NEJM200010263431704. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
    • Dolin R, Blacklow NR, DuPont H, Formal S, Buscho RF, Kasel JA, Chames RP, Hornick R, Chanock RM. Передача острого инфекционного небактериального гастроэнтерита добровольцам при пероральном приеме фильтрата стула. J Infect Dis. 1971; 123: 307–312. DOI: 10.1093 / infdis / 123.3.307. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
    • Gill ON, Cubitt WD, McSwiggan DA, Watney BM, Bartlett CL.Эпидемия гастроэнтерита, вызванная устрицами, зараженными небольшими вирусами с круглой структурой. Br Med J (Clin Res Ed) 1983; 287: 1532–1534. DOI: 10.1136 / bmj.287.6404.1532. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
    • Hicks NJ, Beynon JH, Bingham P, Soltanpoor N, Green J. Вспышка вирусного гастроэнтерита после свадебного приема. Commun Dis Rep CDR Rev.1996; 6: R136 – R139. [PubMed] [Google Scholar]
    • Hoebe CJ, Vennema H, de Roda Husman AM, van Duynhoven YT.Вспышка норовируса среди младших школьников, игравших в фонтанчике с водой для отдыха. J Infect Dis. 2004; 189: 699–705. DOI: 10,1086 / 381534. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
    • Курицкий Дж. Н., Остерхольм М. Т., Гринберг Х. Б., Корлат Дж. А., Годес Дж. Р., Хедберг К. В., Форфанг Дж. К., Капикян А. З., Маккалоу Дж. К., Уайт К. Э. Норуолкский гастроэнтерит: вспышка болезни в сообществе, связанная с потреблением хлебобулочных изделий. Ann Intern Med. 1984; 100: 519–521. DOI: 10.7326 / 0003-4819-100-4-519. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
    • Linco SJ, Grohmann GS.Дарвиновская вспышка вирусного гастроэнтерита, связанного с устрицами. Med J Aust. 1980; 1: 211–213. [PubMed] [Google Scholar]
    • Matshuhashi N, Nishi Y, Nagoshi D, Kanemoto H. A N: Эпидемический энтерколит, возможно, в результате заражения вирусом Норуолк, проявляющийся как ишемический колит . Dig Endosc. 2003. 15: 138–141. DOI: 10.1046 / j.1443-1661.2003.00234.x. [CrossRef] [Google Scholar]
    • Чендлер Б., Беллер М., Дженкерсон С., Миддо Дж., Робертс С., Рейсдорф Э., Рауш М., Сэвидж Р., Дэвис Дж. Вспышки вирусного гастроэнтерита, подобного Норуолку, — Аляска и Висконсин, 1999.MMWR Morb Mortal Wkly Rep. 2000; 49: 207–211. [PubMed] [Google Scholar]
    • Тейлор Дж. У., Гэри Дж. У. мл., Гринберг HB. Связанный с Норуолком вирусный гастроэнтерит из-за загрязненной питьевой воды. Am J Epidemiol. 1981; 114: 584–592. [PubMed] [Google Scholar]
    • de Wit MA, Widdowson MA, Vennema H, de Bruin E, Fernandes T, Koopmans M. Крупная вспышка норовируса: пекарь, который должен был знать лучше. J Infect. 2007. 55: 188–193. DOI: 10.1016 / j.jinf.2007.04.005. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
    • Dolin R, Reichman RC, Roessner KD, Tralka TS, Schooley RT, Gary W, Morens D.Обнаружение с помощью иммунной электронной микроскопии возбудителя острого вирусного гастроэнтерита Снежной горы. J Infect Dis. 1982; 146: 184–189. DOI: 10.1093 / infdis / 146.2.184. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
    • Гаулин С., Фригон М., Пуарье Д., Фурнье С. Передача калицивируса работником еды на предсимптоматической стадии болезни. Epidemiol Infect. 1999; 123: 475–478. DOI: 10.1017 / S095026889

      9X. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
    • Gotz H, de Jong B, Lindback J, Parment PA, Hedlund KO, Torven M, Ekdahl K.Эпидемиологическое расследование вспышки пищевого гастроэнтерита, вызванного Норуолк-подобным вирусом, в 30 детских садах. Scand J Infect Dis. 2002; 34: 115–121. DOI: 10.1080 / 00365540110080133. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
    • Хираката Ю., Арисава К., Нишио О., Накагоми О. Распространение вспышек гастроэнтерита в нескольких префектурах, вызванных одним штаммом норовируса геногруппы II из туристического ресторана в Нагасаки, Япония. J Clin Microbiol. 2005; 43: 1093–1098. DOI: 10.1128 / JCM.43.3.1093-1098.2005. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
    • Исакбаева Е.Т., Буленс С.Н., Борода Р.С., Адамс С., Монро С.С., Чавес С.С., Виддоусон М.А., Гласс Р.И. Норовирус и уход за детьми: проблемы в борьбе со вспышками. Pediatr Infect Dis J. 2005; 24: 561–563. DOI: 10.1097 / 01.inf.0000164764.58715.23. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
    • Киркинг Х.Л., Кортес Дж., Беррер С., Холл А.Дж., Коэн Нью-Джерси, Липман Х., Ким С., Дейли Э.Р., Фишбейн Д.Б. Вероятная передача норовируса в самолете, октябрь 2008 г.Clin Infect Dis. 2010; 50: 1216–1221. DOI: 10,1086 / 651597. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
    • Маркс П.Дж., Випонд И.Б., Карлайл Д., Дикин Д., Фей Р.Э., Кол Е.О. Доказательства воздушно-капельной передачи Норуолк-подобного вируса (NLV) в ресторане отеля. Epidemiol Infect. 2000; 124: 481–487. DOI: 10.1017 / S095026889

      05. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

    • Marshall JA, Yuen LK, Catton MG, Gunesekere IC, Wright PJ, Bettelheim KA, Griffith JM, Lightfoot D, Hogg GG, Gregory J.и др. Множественные вспышки норволкского вирусного гастроэнтерита, связанные с рестораном в средиземноморском стиле. J Med Microbiol. 2001; 50: 143–151. [PubMed] [Google Scholar]
    • Торнхилл Т.С., Вятт Р.Г., Калица А.Р., Долин Р., Чанок Р.М., Капикян А.З. Обнаружение с помощью иммунной электронной микроскопии вирусоподобных частиц размером 26–27 нм, связанных с двумя семейными вспышками гастроэнтерита. J Infect Dis. 1977; 135: 20–27. DOI: 10.1093 / infdis / 135.1.20. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
    • Трумэн Б.И., Мадоре Х.П., Менегус М.А., Ницкин Д.Л., Долин Р.Снежная гора возбудитель гастроэнтерита от моллюсков. Am J Epidemiol. 1987; 126: 516–525. [PubMed] [Google Scholar]
    • Хамфри Т.Дж., Крукшанк Дж. Г., Кубитт В. Д.. Вспышка гастроэнтерита, ассоциированного с калицивирусами, в доме престарелых. Возможный зооноз? Дж. Хиг (Лондон) 1984; 93: 293–299. DOI: 10.1017 / S0022172400064822. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
    • Johansson PJ, Bergentoft K, Larsson PA, Magnusson G, Widell A, Thorhagen M, Hedlund KO. Вспышка гастроэнтерита у взрослых, связанная с внутрибольничными саповирусами.Scand J Infect Dis. 2005; 37: 200–204. DOI: 10.1080 / 00365540410020974. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
    • Усуку С., Кумазаки М., Китамура К., Точикубо О, Ногучи Ю. Вспышка пищевого гастроэнтерита, вызванного саповирусом, среди учеников младших классов средней школы. Jpn J Infect Dis. 2008. 61: 438–441. [PubMed] [Google Scholar]
    • Ямасита Ю., Оцука Ю., Кондо Р., Осето М., Дой М., Миямото Т., Уэда Т., Кондо Х., Танака Т., Вакита Т. и др. Молекулярная характеристика саповируса, обнаруженного при гастроэнтерите вспышка в свадебном зале.J Med Virol. 2010. 82: 720–726. DOI: 10.1002 / jmv.21646. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
    • Капикян А.З., Вятт Р.Г., Левин М.М., Блэк Р.Э., Гринберг Г.Б., Флорес Дж., Калица А.Р., Хошино Ю., Чанок Р.М. Исследования на добровольцах с ротавирусами человека. Dev Biol Stand. 1983; 53: 209–218. [PubMed] [Google Scholar]
    • Morris CA, Flewett TH, Bryden AS, Davies H. Эпидемический вирусный энтерит в детской палате длительного пребывания. Ланцет. 1975; 1: 4–5. [PubMed] [Google Scholar]
    • Родригес В.Дж., Ким Х.В., Брандт С.Д., Йолкен Р.Х., Ричард М., Арробио Дж.О., Шварц Р.Х., Капикян А.З., Чанок Р.М., Парротт Р.Х.Распространенная вспышка гастроэнтерита, вызванного ротавирусом 2 типа, с высокой частотой вторичных атак в семьях. J Infect Dis. 1979; 140: 353–357. DOI: 10.1093 / infdis / 140.3.353. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
    • Митчелл Д.К., Матсон Д.О., Кубитт В.Д., Джексон Л.Дж., Уиллкокс М.М., Пикеринг Л.К., Картер М.Дж. Распространенность антител к астровирусу 1 и 3 типов у детей и подростков в Норфолке, Вирджиния. Pediatr Infect Dis J. 1999; 18: 249–254. DOI: 10.1097 / 00006454-1990-00008. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
    • Оливер С.Л., Асобайре Э., Дастджерди А.М., Бриджер Дж.Геномная характеристика неклассифицированного кишечного вируса крупного рогатого скота Newbury agent-1 (Newbury1) подтверждает новый род в семействе Caliciviridae. Вирусология. 2006; 350: 240–250. DOI: 10.1016 / j.virol.2006.02.027. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
    • Сципиони А., Маурой А., Винье Дж., Тири Э. Норовирусы животных. Вет Дж. 2008; 178: 32–45. DOI: 10.1016 / j.tvjl.2007.11.012. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
    • Норовирус. http://www.cdc.gov/norovirus/hcp/clinical-overview.html.
    • Китадзима М., Ока Т., Харамото Е., Фануван С., Такеда Н., Катаяма К., Катаяма Х. Генетическое разнообразие норовирусов геногруппы IV в сточных водах в Японии. Lett Appl Microbiol. 2011; 52: 181–184. DOI: 10.1111 / j.1472-765X.2010.02980.x. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
    • Китадзима М., Ока Т., Харамото Э, Такеда Н., Катаяма К., Катаяма Х. Сезонное распределение и генетическое разнообразие норовирусов геногрупп I, II и IV в реке Тамагава, Япония . Environ Sci Technol. 2010; 44: 7116–7122.DOI: 10.1021 / es100346a. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
    • Кол Е.О., Эпплтон Х. Электронно-микроскопические и физические характеристики небольших круглых фекальных вирусов человека: временная схема классификации. J Med Virol. 1982; 9: 257–265. DOI: 10.1002 / jmv.18

      403. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

    • Каплан Дж. Э., Гэри Г. У., Барон Р. К., Сингх Н., Шонбергер Л. Б., Фельдман Р., Гринберг HB. Эпидемиология гастроэнтерита Норуолк и роль вируса Норуолк во вспышках острого небактериального гастроэнтерита.Ann Intern Med. 1982; 96: 756–761. DOI: 10.7326 / 0003-4819-96-6-756. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
    • Чиба С., Наката С., Нумата-Киношита К., Хонма С. Вирус Саппоро: история и недавние открытия. J Infect Dis. 2000; 181 (Дополнение 2): S303 – S308. [PubMed] [Google Scholar]
    • Дей С.К., Фан Т.Г., Нгуен Т.А., Нишио О., Салим А.Ф., Ягю Ф., Окицу С., Ушиджима Х. Распространенность саповирусной инфекции среди младенцев и детей с острым гастроэнтеритом в Дакка, Бангладеш во время 2004–2005 гг.J Med Virol. 2007. 79: 633–638. DOI: 10.1002 / jmv.20859. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
    • Blacklow NR, Greenberg HB. Вирусный гастроэнтерит. N Engl J Med. 1991; 325: 252–264. DOI: 10.1056 / NEJM1953250406. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
    • Ноэль Дж. С., Лю Б. Л., Хамфри К. Д., Родригес Е. М., Ламбден П. Р., Кларк И. Н., Дуайер Д. М., Андо Т., Гласс Р. И., Монро С. С.. Вирус Парквилля: новый генетический вариант калицивируса человека в кладе вируса Саппоро, связанный со вспышкой гастроэнтерита у взрослых.J Med Virol. 1997. 52: 173–178. DOI: 10.1002 / (SICI) 1096-9071 (199706) 52: 2 <173 :: AID-JMV10> 3.0.CO; 2-M. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
    • Епископ РФ, Дэвидсон Г.П., Холмс И.Х., Рак Б.Дж. Вирусные частицы в эпителиальных клетках слизистой оболочки двенадцатиперстной кишки у детей с острым небактериальным гастроэнтеритом. Ланцет. 1973; 2: 1281–1283. [PubMed] [Google Scholar]
    • Парашар Ю.Д., Гибсон С.Дж., Бресс Дж.С., Гласс Р.И. Ротавирус и тяжелая диарея у детей. Emerg Infect Dis. 2006. 12: 304–306. DOI: 10.3201 / eid1202.050006. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
    • Mackow E. In: Инфекции желудочно-кишечного тракта. Блазер М., Смит П., Равдин Дж., Гринберг Х., Геррант Р.Л., редактор. Нью-Йорк: Raven Press; 1995. Ротавирусы группы B и C; С. 983–1008. [Google Scholar]
    • Сантос Н., Хосино Ю. Глобальное распространение серотипов / генотипов ротавируса и его значение для разработки и внедрения эффективной ротавирусной вакцины. Rev Med Virol. 2005; 15: 29–56.DOI: 10.1002 / RMV.448. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
    • Родригес В.Дж., Ким Х.В., Арробио Дж.О., Брандт С.Д., Чанок Р.М., Капикиан А.З., Вятт Р.Г., Парротт Р.Х. Клинические особенности острого гастроэнтерита, связанного с реовирусоподобным агентом человека, у младенцев и детей раннего возраста. J Pediatr. 1977; 91: 188–193. DOI: 10.1016 / S0022-3476 (77) 80810-X. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
    • Brandt CD, Kim HW, Rodriguez WJ, Arrobio JO, Jeffries BC, Stallings EP, Lewis C, Miles AJ, Chanock RM, Kapikian AZ, Parrott RH.Детский вирусный гастроэнтерит за восемь лет исследования. J Clin Microbiol. 1983; 18: 71–78. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]
    • Эдмонсон Л. М., Эбберт Дж. О., Эванс Дж. М.. Сообщение о вспышке ротавируса среди взрослого населения дома престарелых. J Am Med Dir Assoc. 2000; 1: 175–179. [PubMed] [Google Scholar]
    • Hrdy DB. Эпидемиология ротавирусной инфекции у взрослых. Rev Infect Dis. 1987; 9: 461–469. DOI: 10.1093 / Clinids / 9.3.461. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
    • Griffin MR, Surowiec JJ, McCloskey DI, Capuano B, Pierzynski B, Quinn M, Wojnarski R, Parkin WE, Greenberg H, Gary GW.Норуолкский вирус пищевого происхождения. Am J Epidemiol. 1982; 115: 178–184. [PubMed] [Google Scholar]
    • Ганн Р.А., Яновски Х.Т., Либ С., Пратер ЕС, Гринберг Х.Б. Гастроэнтерит, вызванный вирусом Norwalk, возникший после употребления в пищу сырых устриц. Am J Epidemiol. 1982; 115: 348–351. [PubMed] [Google Scholar]
    • Malek M, Barzilay E, Kramer A, Camp B, Jaykus LA, Escudero-Abarca B, Derrick G, White P, Gerba C, Higgins C. и др. Вспышка норовирусной инфекции среди рек стропила, связанные с упакованным мясом деликатесов, Гранд-Каньон, 2005 г.Clin Infect Dis. 2009. 48: 31–37. DOI: 10,1086 / 5
      . [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
    • Саид MA, Perl TM, Sears CL. Эпидемиология здравоохранения: желудочно-кишечный грипп: норовирус в учреждениях здравоохранения и длительного ухода. Clin Infect Dis. 2008. 47: 1202–1208. DOI: 10,1086 / 5. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
    • О’Райан М., Linhares AC. Последняя информация о Rotarix: пероральная вакцина против ротавируса человека. Экспертные ревакцины. 2009. 8: 1627–1641. DOI: 10.1586 / erv.09.136. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

    % PDF-1.6 % 776 0 объект > эндобдж xref 776 78 0000000016 00000 н. 0000002185 00000 н. 0000002359 00000 п. 0000002548 00000 н. 0000002987 00000 н. 0000003110 00000 н. 0000003268 00000 н. 0000003426 00000 н. 0000003584 00000 н. 0000003742 00000 н. 0000003900 00000 н. 0000004059 00000 н. 0000004218 00000 н. 0000004377 00000 н. 0000004536 00000 н. 0000004694 00000 н. 0000004852 00000 н. 0000005010 00000 н. 0000005168 00000 н. 0000005901 00000 н. 0000006605 00000 н. 0000006766 00000 н. 0000007210 00000 н. 0000007343 00000 п. 0000007481 00000 н. 0000007625 00000 н. 0000007765 00000 н. 0000007802 00000 н. 0000009471 00000 п. 0000010770 00000 п. 0000011214 00000 п. 0000012724 00000 п. 0000014037 00000 п. 0000015474 00000 п. 0000016896 00000 п. 0000018209 00000 п. 0000019719 00000 п. 0000019858 00000 п. 0000019946 00000 п. 0000020034 00000 п. 0000020118 00000 п. 0000020206 00000 п. 0000020292 00000 п. 0000020376 00000 п. 0000020463 00000 п. 0000020553 00000 п. 0000020647 00000 п. 0000020737 00000 п. 0000020879 00000 п. 0000020967 00000 п. 0000023661 00000 п. 0000052641 00000 п. 0000052891 00000 п. 0000078350 00000 п. 0000078606 00000 п. 0000078850 00000 п. 0000102824 00000 н. 0000103092 00000 н. 0000126243 00000 н. 0000126507 00000 н. 0000140455 00000 н. 0000140704 00000 н. 0000140940 00000 п. 0000141269 00000 н. 0000153864 00000 н. 0000154119 00000 н. 0000154337 00000 н. 0000154635 00000 н. 0000168185 00000 н. 0000168453 00000 н. 0000168669 00000 н. 0000168957 00000 н. 0000181832 00000 н. 0000182096 00000 н. 0000182316 00000 н. 0000182616 00000 н. 0000182661 00000 н. 0000001856 00000 н. трейлер ] >> startxref 0 %% EOF 853 0 объект > поток xb«f« t` * `b HB` $ lL ‘+ 94T2 | a ||} Z @ A! AA @ `= L, l $ N0` @ A + sT ŷ ݌ a [S ܐ˰ | NgCav &> F020b»fa`

    Инфекция шигеллами (шигеллез) — профилактика и контроль заболеваний, Департамент общественного здравоохранения Сан-Франциско

    Шигеллез — это высокоинфекционное кишечное заболевание, вызываемое семейством бактерий, называемых шигеллами.

    Симптомы

    • Инкубационный период составляет 12–96 часов, что означает, что заболевание обычно начинается через 12–96 часов после попадания бактерий шигеллы в организм.
    • Основным признаком инфекции шигеллы является диарея, которая может быть водянистой, кровянистой или и тем, и другим. Многие люди с шигеллой также испытывают лихорадку, боли в животе и тошноту. Может возникнуть рвота, но не всегда.
    • Симптомы обычно длятся 4-7 дней. Люди с легким заболеванием обычно поправляются без специального лечения.
    • При более тяжелой инфекции шигеллы у пациентов может развиться настолько тяжелая диарея, что наступает обезвоживание. Иногда шигеллез вызывает судороги, инфекцию кровотока или артрит и редко может привести к смерти.

    Как распространяется шигелла

    • Shigella очень заразна и очень легко распространяется. Заразиться шигеллой может любой человек.
    • Когда люди заражаются, микроорганизмы Shigella присутствуют в их стуле или диарее.
      • Распространение инфекции может произойти, когда крошечные частицы инфицированного стула попадают в рот другого человека.
      • В США инфекция Shigella обычно передается от человека к человеку при межличностном контакте.
        • Например, Shigella может передаваться среди маленьких детей, находящихся в детских учреждениях, которые все используют одни и те же игрушки, или среди бездомных взрослых, которые не могут должным образом мыть руки.
    • Известно также, что шигелла распространяется при половом контакте, при употреблении в пищу сырых продуктов, зараженных инфицированным человеком, работающим с пищевыми продуктами, или при употреблении зараженных жидкостей.

    Диагностика и лечение

    • Шигелла диагностируется специалистами здравоохранения путем сбора образца стула или диареи и отправки его в микробиологическую лабораторию для посева.
    • Большинство лабораторий также могут проводить тесты на чувствительность к антибиотикам (чтобы выяснить, какой антибиотик будет эффективен в уничтожении бактерий Shigella).
    • Люди с легкими заболеваниями обычно поправляются самостоятельно, без специального лечения.
    • Однако курс эффективных антибиотиков может помочь сократить продолжительность болезни
    • С точки зрения общественного здравоохранения, эффективное лечение также делает пациента менее заразным для других, уменьшая диарею и устраняя бактерии Shigella из стула

    Как предотвратить шигеллез

    • Мытье рук! Тщательно вымойте руки водой с мылом или дезинфицирующим средством для рук.Делайте это часто, прежде чем есть, пить или прикасаться к лицу. Обязательно протрите под ногтями.
    • Дети должны быть под присмотром при мытье рук в детских садах и дома.
    • По возможности, маленькие дети с инфекцией Shigella, которые все еще носят подгузники, не должны контактировать с неинфицированными детьми.
    • Во время полового контакта избегайте незащищенного прямого орально-анального контакта и обязательно тщательно мойте руки, другие части тела и любые предметы после секса.
    • Путешествуя по развивающимся странам, где инфекция Shigella более распространена: пейте только обработанную или кипяченую воду и ешьте только приготовленную горячую пищу или фрукты / овощи, которые вы очистите после тщательного мытья.

    Ресурсы

    Информационный бюллетень о норовирусе — Министерство здравоохранения Миннесоты

    Пересмотрено в июне 2009 г.

    Загрузите версию этого документа для печати:
    Информационный бюллетень по норовирусу (PDF)
    Испанский (PDF)

    Что такое норовирус?

    Норовирусы — это группа вирусов (ранее известных как вирусы типа Norwalk), которые могут вызывать гастроэнтерит, воспаление желудка и кишечника.Норовирус — основная причина вспышек болезней пищевого происхождения в Миннесоте.

    Эту инфекцию часто ошибочно называют «желудочным гриппом». Норовирус — это , а не , связанный с гриппом (гриппом), который является распространенным респираторным заболеванием, вызываемым вирусом гриппа.

    Какие симптомы?

    Общие симптомы норовирусной инфекции включают рвоту, диарею и спазмы желудка. Менее распространенные симптомы могут включать субфебрильную температуру или озноб, головную боль и боли в мышцах.Симптомы обычно появляются через 1-2 дня после приема вируса, но могут появиться уже через 12 часов после заражения. Болезнь обычно возникает внезапно. Инфицированный человек может чувствовать себя очень больным и часто, иногда без предупреждения, много раз в день рвать. Иногда люди, инфицированные норовирусом, не имеют никаких симптомов, но все же могут передавать вирус другим.

    Как долго это длится?

    Большинство людей выздоравливают через 1-2 дня и не имеют долгосрочных последствий для здоровья. Обезвоживание может быть проблемой у очень молодых, пожилых людей или людей с ослабленной иммунной системой.Иногда инфицированные люди могут испытывать более легкие симптомы в течение недели и более.

    Как распространяется?

    Норовирусы очень заразны. Они обнаруживаются в стуле (фекалиях) или рвоте инфицированных людей. Оттуда норовирусы передаются в пищу, воду или поверхности руками инфицированных людей, которые не вымылись должным образом после посещения туалета.

    Люди заражаются норовирусом от:

    • Употребление в пищу или питье жидкостей, зараженных инфицированным человеком.
    • Употребление в пищу сырых моллюсков, выловленных из загрязненных вод.
    • Прикосновение к загрязненным поверхностям или предметам, а затем прикосновение ко рту или прием пищи без предварительного мытья рук.

    Что делать, если у меня появились симптомы?

    • Пейте много жидкости, чтобы не обезвоживаться.
    • Часто мойте руки и не готовьте пищу для других.
    • Обратитесь к своему врачу (но помните, что антибиотики не лечат вирусы).

    Как предотвратить заражение норовирусом?

    • Вымойте руки теплой мыльной водой в течение 20 секунд
      • После посещения туалета
      • После смены подгузников
      • Перед приготовлением продуктов
      • Перед едой
        • Чаще мойте руки, если кто-то из членов вашей семьи заболел.
    • Очистите и продезинфицируйте поверхности раствором бытового отбеливателя сразу после рвоты или диарейного происшествия.
    • Приготовьте устрицы на пару перед их употреблением.
    • Не готовьте пищу для других, пока у вас есть симптомы, и в течение как минимум 3 дней после выздоровления.

    Чтобы сообщить о подозрении на заболевание пищевого происхождения, позвоните на горячую линию Департамента здравоохранения Миннесоты по вопросам болезней пищевого происхождения по номеру 1-877-FOOD-ILL (или 651-201-5655 из городов-побратимов).

    Leave a Reply

    Ваш адрес email не будет опубликован. Обязательные поля помечены *