Сравнительная характеристика вирусов и бактерий: дайте сравнительную характеристику клеток бактерий и вирусов

Posted on 30.09.1978 by alexxlab

Содержание

ТЕСТОВЫЕ ЗАДАНИЯ ДЛЯ ПРОМЕЖУТОЧНОЙ АТТЕСТАЦИИ

1.ОСНОВНОЙ НОСИТЕЛЬ ГЕНЕТИЧЕСКОЙ ИНФОРМАЦИИ БАКТЕРИЙ:

1. плазмида

2. нуклеоид

3. транспозон

4. ядро

2.ФУНКЦИЮ ДВИЖЕНИЯ У БАКТЕРИЙ ВЫПОЛНЯЮТ:

1. пили

2. псевдоподии

3. жгутики

4. капсулы

3.ОСНОВНОЕ ВЕЩЕСТВО (БИОГЕТЕРОПОЛИМЕР) КЛЕТОЧНОЙ СТЕНКИ ГРАМПОЛОЖИТЕЛЬНЫХ БАКТЕРИЙ:

1. пептидогликан

2. липополисахарид

3. волютин

4. флагеллин

4.ОКРАСКА БАКТЕРИЙ ПО МЕТОДУ ГРАМА ПОЗВОЛЯЕТ ВЫЯВИТЬ:

1. наличие жгутиков

2. наличие ядра

3. наличие кислотоустойчивости у бактерии

4. особенности расположения включений

5. особенности строения клеточной стенки

5.ТЕМНОПОЛЬНАЯ МИКРОСКОПИЯ ПОЗВОЛЯЕТ ВЫЯВИТЬ:

1. наличие и характер подвижности бактерий

наличие капсулы

3. наличие споры

4. особенности строения клеточной стенки

5. особенности расположения включений

6.ФУНКЦИИ СПОР БАКТЕРИЙ:

1. защита генетического материала от неблагоприятных воздействий окружающей среды

2. защита генетического материала от неблагоприятных воздействий в организме человека

3. размножение

4. запас питательных веществ

5. антифагоцитарные свойства

7.МИКРООРГАНИЗМЫ, ИМЕЮЩИЕ ИЗВИТУЮ ФОРМУ:

1. Chlamydia trachomatis

2. Corynebacterium diphtheriae

3. Leptospira interrogans

4. Mycoplasma pneumoniae

5. Ureaplasma urealyticum

8.МИКРООРГАНИЗМЫ, ИМЕЮЩИЕ ИЗВИТУЮ ФОРМУ:

1. Rickettsia prowazekii

2. Candida albicans

3. Treponema pallidum

4. Legionella pneumophila

5. Streptococcus mutans

9.К ЭУКАРИОТАМ ОТНОСЯТСЯ:

1. стафилококки

2. клостридии

3. стрептококки

4. кандиды

10.В ОСНОВУ КЛАССИФИКАЦИИ БАКТЕРИЙ НА ГРАМПОЛОЖИТЕЛЬНЫЕ И ГРАМОТРИЦАТЕЛЬНЫЕ ПОЛОЖЕНО СТРОЕНИЕ:

1. клеточной стенки

2. цитоплазматической мембраны

3. жгутиков

4. эндоспор

11.ЛИПОПОЛИСАХАРИД БАКТЕРИАЛЬНОЙ КЛЕТКИ РАСПОЛОЖЕН В:

1. цитоплазматической мембране микоплазм

2. наружной мембране клеточной стенки грамположительных бактерий

3. мезосоме

4. наружной мембране клеточной стенки грамотрицательных бактерий

5. цитоплазме

12.ИЗВИТЫЕ ФОРМЫ БАКТЕРИЙ:

1. актиномицеты

2. хламидии

3. микобактерии

4. спирохеты

13.НЕ ИМЕЮТ КЛЕТОЧНОГО СТРОЕНИЯ:

1. Бактерии

2. Прионы

3. Простейшие

4. Грибы

14.ЗАБОЛЕВАНИЯ, ВЫЗЫВАЕМЫЕ ПРОСТЕЙШИМИ:

1. Токсоплазмоз

2. Гонорея

3. Актиномикоз

4. Лепра

5. Кандидоз

15.ЭУКАРИОТЫ НЕ ИМЕЮТ:

1. Оформленного ядра

2. Рибосом

3. Митохондрий

4. Нуклеоида

5. Клеточного строения

16.В СОСТАВЕ КЛЕТОЧНОЙ СТЕНКИ ГРАМПОЛОЖИТЕЛЬНЫХ БАКТЕРИЙ ИМЕЕТСЯ:

1. Наружная мембрана

2. Тейхоевые кислоты

3. Эргостерол

4. Липополисахарид

5. Волютин

17.АКТИНОМИЦЕТЫ – ЭТО:

1. Грибы

2. Извитые бактерии

3. Ветвящиеся бактерии

4. Простейшие

5. Гельминты

18.ПРОКАРИОТЫ НЕ ИМЕЮТ:

1. Клеточного строения

2. Оформленного ядра

3. Рибосом

4. Нуклеоида

19.СПОРООБРАЗУЮЩИЕ БАКТЕРИИ:

1. Salmonella typhi

2. Clostridium tetani

3. Bordetella pertussis

4. Mycobacterium tuberculosis

5. Vibrio cholerae

20.К КИСЛОТОУСТОЙЧИВЫМ БАКТЕРИЯМ ОТНОСЯТСЯ:

1. Микоплазмы

2. Вибрионы

3. Шигеллы

4. Микобактерии

5. Спирохеты

21.МЕТОДЫ ИЗУЧЕНИЯ СТРУКТУРНОЙ ОРГАНИЗАЦИИ ВИРУСОВ:

1. Световая микроскопия

2. Фазово-контрастная микроскопия

3. Темнопольная микроскопия

4. Электронная микроскопия

5. Люминисцентная микроскопия

22.ЛПС ВХОДИТ В СОСТАВ КЛЕТОЧНОЙ СТЕНКИ БАКТЕРИЙ:

1. Стафилококков

2. Микобактерий

3. Шигелл

4. Клостридий

5. Актиномицетов

23.МИКРООРГАНИЗМЫ, У КОТОРЫХ ОТСУТСТВИЕ КЛЕТОЧНОЙ СТЕНКИ ВСЕГДА ДЕТЕРМИНИРОВАНО ГЕНЕТИЧЕСКИ:

1. Протопласты

2. Хламидии

3. Сферопласты

4. Микоплазмы

5. Риккетсии

24.БАКТЕРИИ, ИМЕЮЩИЕ МНОГО ЖГУТИКОВ ВОКРУГ КЛЕТКИ:

1. Амфитрихи

2. Перитрихи

3. Спирохеты

4. Микоплазмы

5. Порины

25. МИКРООРГАНИЗМЫ, НЕ ИМЕЮЩИЕ КЛЕТОЧНОЙ СТЕНКИ:

1. Амфитрихи

2. Перитрихи

3. Спирохеты

4. Микоплазмы

5. Порины

26.МИКРОБЫ, НЕ ИМЕЮЩИЕ КЛЕТОЧНОГО СТРОЕНИЯ:

1. Прокариоты

2. Порины

3. Простейшие

4. Прионы

27.ТИНКТОРИАЛЬНЫЕ СВОЙСТВА БАКТЕРИЙ ХАРАКТЕРИЗУЮТ:

1. Устойчивость во внешней среде

2. Устойчивость к действию физических факторов

3. Чувствительность к бактериофагам

4. Отношение к определенному методу окрашивания

28.УСТОЙЧИВОСТЬ НЕСПОРООБРАЗУЮЩИХ БАКТЕРИЙ К КИСЛОТАМ, ЩЕЛОЧАМ И СПИРТАМ ОБУСЛОВЛЕНА ВЫСОКИМ СОДЕРЖАНИЕМ В КЛЕТОЧНОЙ СТЕНКЕ:

1. Пептидогликана

2. Тейхоевых кислот

3. Пептидных мостиков

4. Восков и липидов

29.ДРОЖЖЕПОДОБНЫЕ ГРИБЫ:

1. Бациллы

2. Мукор

3. Кандиды

4. Клостридии

5. Стрептококки

30.ДРОЖЖЕПОДОБНЫЕ ГРИБЫ:

1. Аспергиллы

2. Мукор

3. Кандиды

4. Клостридии

31.ДРОЖЖЕПОДОБНЫЕ ГРИБЫ:

1. Пенициллы

2. Мукор

3. Кандиды

4. Актиномицеты

32.ГИФАЛЬНЫЕ ГРИБЫ:

1. Актиномицеты

2. Мукор

3. Кандиды

4. Микобактерии

5. Сахаромицеты

33.ГИФАЛЬНЫЕ ГРИБЫ:

1. Актиномицеты

2. Аспергиллы

3. Кандиды

4. Микобактерии

34.КОККИ, РАСПОЛАГАЮЩИЕСЯ В ВИДЕ ЦЕПОЧЕК:

1. Стрептобациллы

2. Мукор

3. Кандида

4. Стрептококки

5. Стафилококки

35.КОККИ, РАСПОЛАГАЮЩИЕСЯ В ВИДЕ ЦЕПОЧЕК:

1. Стрептобациллы

2. Сарцины

3. Диплобациллы

4. Стрептококки

5. Стафилококки

36.КОККИ, РАСПОЛАГАЮЩИЕСЯ ПОПАРНО:

1. Диплококки

2. Сарцины

3. Диплобациллы

4. Стрептококки

5. Стафилококки

37.КОККИ, РАСПОЛАГАЮЩИЕСЯ В ВИДЕ СКОПЛЕНИЙ, НАПОМИНАЮЩИХ ГРОЗДИ ВИНОГРАДА:

1. Диплококки

2. Сарцины

3. Тетракокки

4. Стрептококки

5. Стафилококки

38.БАКТЕРИИ, ДИАМЕТР СПОР У КОТОРЫХ БОЛЬШЕ ТОЛЩИНЫ КЛЕТКИ:

1. Бациллы

2. Мукор

3. Кандиды

4. Клостридии

5. Сарцины

39.КИСЛОТОУСТОЙЧИВЫЕ БАКТЕРИИ:

1. Стафилококки

2. Риккетсии

3. Эшерихии

4. Микобактерии

5. Актиномицеты

40.КИСЛОТОУСТОЙЧИВЫЕ БАКТЕРИИ:

1. Криптоспоридии

2. Хламидии

3. Микрококки

4. Микобактерии

5. Актиномицеты

41.КИСЛОТОУСТОЙЧИВЫЕ БАКТЕРИИ:

1. M. pneumoniae

2. M. leprae

3. S. pneumoniae

4. L. pneumophila

5. A. bovis

42.ФУНКЦИЯ ДВИЖЕНИЯ У БАКТЕРИЙ

1. Пили

2. Жгутики

3. Псевдоподии

4. Порины

5. Включения

43.АДГЕЗИЯ БАКТЕРИЙ К ЭУКАРИОТИЧЕСКИМ КЛЕТКАМ

1. Пили

2. Жгутики

3. Псевдоподии

4. Порины

5. Включения

44.ПРОЧНЫЙ СЛИЗИСТЫЙ СЛОЙ, РАСПОЛАГАЮЩИЙСЯ СНАРУЖИ КЛЕТОЧНОЙ СТЕНКИ БАКТЕРИЙ:

1. Чехол

2. Мукоид

3. Наружная мембрана

4. Капсула

5. Капсид

45.ПРОЧНЫЙ СЛИЗИСТЫЙ СЛОЙ, РАСПОЛАГАЮЩИЙСЯ СНАРУЖИ КЛЕТОЧНОЙ СТЕНКИ БАКТЕРИЙ:

1. Нуклеокапсид

2. Цитоплазматическая мембрана

3. Наружная мембрана

4. Капсула

5. Капсид

46.ПРОЧНЫЙ СЛИЗИСТЫЙ СЛОЙ, РАСПОЛАГАЮЩИЙСЯ СНАРУЖИ КЛЕТОЧНОЙ СТЕНКИ БАКТЕРИЙ:

1. Нуклеокапсид

2. Цитоплазматическая мембрана

3. Кутикула

4. Капсула

5. Пелликула

47.ДЛЯ ОКРАСКИ СПОР У БАКТЕРИЙ ИСПОЛЬЗУЮТ:

1. Окраску по Нейссеру

2. Окраску по Граму

3. Окраску по Бурри-Гинсу

4. Окраску по Ауеске

48.ДЛЯ ОКРАСКИ СПОР У БАКТЕРИЙ ИСПОЛЬЗУЮТ:

1. Окраску по Здродовскому

2. Окраску по Леффлеру

3. Окраску по Бурри-Гинсу

4. Окраску по Ауеске

49.ОРГАНЫ ДВИЖЕНИЯ У БАКТЕРИЙ:

1. Перитрихи

2. Пили

3. Трихомонады

4. Псевдоподии

5. Жгутики

50.БАКТЕРИИ, ПОКРЫТЫЕ ЖГУТИКАМИ СО ВСЕХ СТОРОН КЛЕТКИ:

1. Перитрихи

2. Амфитрихи

3. Трихомонады

4. Лофотрихи

5. Монотрихи

51.БАКТЕРИИ, ПОКРЫТЫЕ ЖГУТИКАМИ СО ВСЕХ СТОРОН КЛЕТКИ:

1. Перитрихи

2. Амфитрихи

3. Лофотрихи

4. Монотрихи

52.БАКТЕРИИ, ПОКРЫТЫЕ ЖГУТИКАМИ СО ВСЕХ СТОРОН КЛЕТКИ:

1. Перитрихи

2. Амфитрихи

3. Псевдоподии

4. Лофотрихи

5. Монотрихи

53.БАКТЕРИИ, ИМЕЮЩИЕ ОДИН ЖГУТИК:

1. Перитрихи

2. Амфитрихи

3. Лофотрихи

4. Монотрихи

54.БАКТЕРИИ, ИМЕЮЩИЕ ПУЧОК ЖГУТИКОВ НА ОДНОМ ПОЛЮСЕ КЛЕТКИ:

1. Перитрихи

2. Амфитрихи

3. Лофотрихи

4. Монотрихи

55.БАКТЕРИИ, ИМЕЮЩИЕ ЖГУТИКИ НА ДВУХ ПОЛЮСАХ КЛЕТКИ:

1. Перитрихи

2. Амфитрихи

3. Лофотрихи

4. Монотрихи

56.ЛИПОПОЛИСАХАРИД БАКТЕРИАЛЬНОЙ КЛЕТКИ РАСПОЛОЖЕН В:

1. цитоплазматической мембране

2. наружной мембране грамположительных бактерий

3. мезосоме

4. наружной мембране грамотрицательных бактерий

5. суперкапсиде

57.ДЛЯ ОБНАРУЖЕНИЯ КАПСУЛ У БАКТЕРИЙ В ЧИСТОЙ КУЛЬТУРЕ ИСПОЛЬЗУЮТ ОКРАСКУ:

1. По Цилю-Нельсену

2. По Ауеске

3. По Граму

4. По Бурри-Гинсу

58.ТАКСОНОМИЧЕСКАЯ КАТЕГОРИЯ, ОБЪЕДИНЯЮЩАЯ ВИДЫ МИКРООРГАНИЗМОВ С НАИБОЛЬШИМ КОЛИЧЕСТВОМ СХОДНЫХ ПРИЗНАКОВ И СВОЙСТВ:

1. Семейство

2. Род

3. Вид

4. Домен

59.БАКТЕРИИ, У КОТОРЫХ ОТСУТСТВИЕ КЛЕТОЧНОЙ СТЕНКИ ВСЕГДА ДЕТЕРМИНИРОВАНО ГЕНЕТИЧЕСКИ:

1. Протопласты

2. Хламидии

3. Сферопласты

4. Уреоплазмы

5. Л-формы

60.БАКТЕРИИ, ИМЕЮЩИЕ МНОГО ЖГУТИКОВ ВОКРУГ КЛЕТКИ:

1. Амфитрихи

2. Перитрихи

3. Спирохеты

4. Трихомонады

5. Порины

61.МИКРОБЫ, НЕ ИМЕЮЩИЕ КЛЕТОЧНОЙ СТЕНКИ:

1. Амфитрихи

2. Спириллы

3. Спирохеты

4. Вирусы

5. Порины

62.МИКРОБЫ, НЕ ИМЕЮЩИЕ КЛЕТОЧНОГО СТРОЕНИЯ:

1. Прокариоты

2. Порины

3. Простейшие

4. Прионы

5. Архебактерии

63.ТИНКТОРИАЛЬНЫЕ СВОЙСТВА БАКТЕРИЙ ХАРАКТЕРИЗУЮТ:

1. Устойчивость во внешней среде

2. Устойчивость к действию кислорода

3. Чувствительность к бактериофагам

4. Отношение к определенному методу окрашивания

5. Форму и размер клеток микроорганизмов

64.ТИНКТОРИАЛЬНЫЕ СВОЙСТВА БАКТЕРИЙ ХАРАКТЕРИЗУЮТ:

1. Чувствительность к антибиотикам

2. Устойчивость к действию кислорода

3. Колонии микроорганизмов

4. Отношение к определенному методу окрашивания

5. Форму и размер клеток микроорганизмов

65.УСТОЙЧИВОСТЬ НЕСПОРООБРАЗУЮЩИХ БАКТЕРИЙ К КИСЛОТАМ, ЩЕЛОЧАМ И СПИРТАМ ОБУСЛОВЛЕНА ВЫСОКИМ СОДЕРЖАНИЕМ В КЛЕТОЧНОЙ СТЕНКЕ:

1. Пептидогликана

2. Тейхоевых кислот

3. Пептидных мостиков

4. Восков и миколовых кислот

5. Волютина

66.ДРОЖЖЕПОДОБНЫЕ ГРИБЫ:

1. Аспергиллы

2. Мукор

3. Кандиды

4. Пенициллы

5. Трихомонады

67. ПАЛОЧКОВИДНЫЕ БАКТЕРИИ, РАСПОЛАГАЮЩИЕСЯ В ВИДЕ ЦЕПОЧЕК:

1. Бациллы

2. Вибрионы

3. Трепонемы

4. Сарцины

5. Стрептококки

68.ПАЛОЧКОВИДНЫЕ БАКТЕРИИ, РАСПОЛАГАЮЩИЕСЯ В ВИДЕ ЦЕПОЧЕК:

1. Бациллы

2. Вибрионы

3. Трепонемы

4. Спириллы

5. Бифидобактерии

69.ПАЛОЧКОВИДНЫЕ БАКТЕРИИ, РАСПОЛАГАЮЩИЕСЯ В ВИДЕ ЦЕПОЧЕК:

1. Стрептобациллы

2. Диплококки

3. Стрептококки

4. Борелии

5. Лептоспиры

70.БАКТЕРИИ, ДИАМЕТР СПОР У КОТОРЫХ СООТВЕТСТВУЕТ ТОЛЩИНЕ ВЕГЕТАТИВНОЙ КЛЕТКИ:

1. Бациллы

2. Мукор

3. Риккетсии

4. Клостридии

5. Стрептококки

71.БАКТЕРИИ, ДИАМЕТР СПОР У КОТОРЫХ СООТВЕТСТВУЕТ ТОЛЩИНЕ ВЕГЕТАТИВНОЙ КЛЕТКИ:

1. Бациллы

2. Мукор

3. Риккетсии

4. Хламидии

5. Аспергиллы

72.КИСЛОТОУСТОЙЧИВЫЕ БАКТЕРИИ:

1. Клебсиеллы

2. Микроспоридии

3. Бабезии

4. Микобактерии

5. Микоплазмы

73.ФУНКЦИЯ ДВИЖЕНИЯ У БАКТЕРИЙ:

1. Пили

2. Жгутики

3. Псевдоподии

4. Порины

5. Пелликула

74.АДГЕЗИЯ БАКТЕРИЙ К ЭУКАРИОТИЧЕСКИМ КЛЕТКАМ:

1. Пили

2. Жгутики

3. Псевдоподии

4. Порины

5. Нуклеокапсид

75.ПРОЧНЫЙ СЛИЗИСТЫЙ СЛОЙ, РАСПОЛАГАЮЩИЙСЯ СНАРУЖИ КЛЕТОЧНОЙ СТЕНКИ БАКТЕРИЙ:

1. Чехол

2. Мукоид

3. Наружная мембрана

4. Капсула

5. Гликокаликс

76.ДЛЯ ОКРАСКИ СПОР У БАКТЕРИЙ ИСПОЛЬЗУЮТ:

1. Окраску по Нейссеру

2. Окраску по Здродовскому

3. Окраску по Бурри-Гинсу

4. Окраску по Ауеске

5. Окраску по Романовскому-Гимзе

77.ОРГАНЫ ДВИЖЕНИЯ У БАКТЕРИЙ:

1. Перитрихи

2. Пили

3. Трихомонады

4. Псевдоподии

5. Жгутики

78.ВОЛЮТИН КОРИНЕБАКТЕРИЙ РАСПОЛОЖЕН В:

1. Цитоплазматической мембране

2. Наружной мембране грамположительных бактерий

3. Мезосоме

4. Наружной мембране грамотрицательных бактерий

5. Цитоплазме

79.ДЛЯ ОБНАРУЖЕНИЯ ЖГУТИКОВ У БАКТЕРИЙ ИСПОЛЬЗУЮТ ОКРАСКУ:

1. По Цилю-Нельсену

2. По Ауеске

3. По Граму

4. По Бурри-Гинсу

5. По Леффлеру

80. ТАКСОНОМИЧЕСКАЯ КАТЕГОРИЯ, ОБЪЕДИНЯЮЩАЯ ВИДЫ МИКРООРГАНИЗМОВ С НАИБОЛЬШИМ КОЛИЧЕСТВОМ СХОДНЫХ ПРИЗНАКОВ И СВОЙСТВ:

1. Семейство

2. Род

3. Вид

4. Домен

5. Биовар

81.ВТОРОЕ СЛОВО В ЛАТИНСКОМ НАЗВАНИИ МИКРООРГАНИЗМОВ ОБОЗНАЧАЕТ:

1. Семейство

2. Род

3. Вид

4. Домен

5. Биовар

82.ПЕРВОЕ СЛОВО В ЛАТИНСКОМ НАЗВАНИИ МИКРООРГАНИЗМОВ ОБОЗНАЧАЕТ:

1. Семейство

2. Род

3. Вид

4. Домен

5. Биовар

83.СПОРООБРАЗУЮЩИЕ БАКТЕРИИ:

1. эшерихии

2. шигеллы

3. клостридии

4. риккетсии

84.СПОРООБРАЗУЮЩИЕ БАКТЕРИИ:

1. бациллы

2. бифидобактерии

3. спирохеты

4. риккетсии

85.СПОРООБРАЗУЮЩИЕ БАКТЕРИИ:

1. клостридии

2. бифидобактерии

3. вибрионы

4. кандиды

86.БАКТЕРИИ, В КЛЕТОЧНОЙ СТЕНКЕ КОТОРЫХ СОДЕРЖИТСЯ МНОГОСЛОЙНЫЙ ПЕПТИДОГЛИКАН:

1. грамположительные

2. грамотрицательные

3. микоплазмы

4. протопласты

87.МИКРООРГАНИЗМЫ, НЕ ИМЕЮЩИЕ КЛЕТОЧНОЙ СТЕНКИ:

1. микоплазмы

2. актиномицеты

3. риккетсии

4. хламидии

88.БИОЛОГИЧЕСКАЯ РОЛЬ ПЛАЗМИД:

1. внехромосомные факторы наследственности

2. локомоторная функция

3. инвазия бактерий

4. регуляция осмотического давления

89.НЕ ИМЕЮТ КЛЕТОЧНОГО СТРОЕНИЯ:

1. вирусы

2. бактерии

3. грибы

4. простейшие

90.ГРАМПОЛОЖИТЕЛЬНЫЕ ПАЛОЧКИ – ВОЗБУДИТЕЛИ:

1. газовой гангрены

2. туляремии

3. колиэнтерита

4. бруцеллеза

91.ВЕТВЯЩИЕСЯ БАКТЕРИИ:

1. бифидобактерии

2. трепонемы

3. лептоспиры

4. аскомицеты

92.ПРОСТЕЙШИЕ:

1. относятся к эукариотам

2. относятся к прокариотам

3. окрашиваются по Цилю-Нельсену

4. имеют дизъюнктивный способ репродукции

93. ВИРУСЫ:

1. имеют РНК и ДНК

2. имеют капсид

3. окрашиваются по Граму

4. изучаются в световом микроскопе

94.ВИРУСЫ:

1. имеют РНК или ДНК

2. имеют клеточное строение

3. имеют нуклеоид

4. изучаются в световом микроскопе

95.ВИРУСЫ:

1. имеют РНК и ДНК

2. имеют клеточное строение

3. размножаются дизъюнктивно

4. изучаются в световом микроскопе

96.ВИРУСЫ:

1. имеют клеточное строение

2. измеряют в нм

3. изучают в световом микроскопе

4. содержат нуклеоид

97.ВИРУСЫ:

1. имеют клеточное строение

2. имеют нуклеокапсид

3. изучаются в световом микроскопе

4. содержат нуклеоид

98.ВИРУСЫ:

1. имеют РНК и ДНК

2. имеют клеточное строение

3. имеют нуклеоид

4. изучаются в электронном микроскопе

99.САРЦИНЫ:

1. Относятся к простейшим

2. Являются эукариотами

3. Являются кокками

4. Грамотрицательные палочки

100.АМЕБЫ:

1. Относятся к простейшим

2. Являются прокариотами

3. Являются кокками

4. Грамотрицательные палочки

101.АМЕБЫ:

1. Образуют цисты

2. Образуют жгутики

3. Образуют споры

4. Образуют цепочки из кокков

102.ПЛАЗМОДИИ МАЛЯРИИ:

1. Относятся к простейшим

2. Являются прокариотами

3. Являются кокками

4. Грамотрицательные палочки

103.АСКОМИЦЕТЫ:

1. Являются грибами

2. Грамположительные палочки

3. Являются кокками

4. Являются бактериями

104.АКТИНОМИЦЕТЫ:

1. Относятся к простейшим

2. Являются прокариотами

3. Являются кокками

4. Грамотрицательные палочки

105.РИККЕТСИИ:

1. Относятся к простейшим

2. Являются прокариотами

3. Являются вирусами

4. Грамположительные палочки

106.БИФИДОБАКТЕРИИ:

1. Относятся к простейшим

2. Являются прокариотами

3. Являются кокками

4. Грамотрицательные палочки

107.ХЛАМИДИИ:

1. Относятся к простейшим

2. Являются эукариотами

3. Выявляются внутриклеточно

4. Извитые бактерии

108.ХЛАМИДИИ:

1. Образуют споры

2. Являются эукариотами

3. Кислотоустойчивые бактерии

4. Грамотрицательные бактерии

109.ТОКСОПЛАЗМЫ:

1. Относятся к простейшим

2. Являются прокариотами

3. Являются кокками

4. Грамотрицательные палочки

110.ЛЯМБЛИИ:

1. Относятся к простейшим

2. Являются прокариотами

3. Являются кокками

4. Грамотрицательные палочки

111.ТРИПАНОСОМЫ:

1. Относятся к простейшим

2. Являются прокариотами

3. Являются кокками

4. Грамотрицательные палочки

112.ТРЕПОНЕМЫ:

1. Относятся к простейшим

2. Являются прокариотами

3. Являются кокками

4. Грамотрицательные палочки

113.БОРРЕЛИИ:

1. Относятся к простейшим

2. Являются прокариотами

3. Являются кокками

4. Грамотрицательные палочки

114.ОСНОВНАЯ ТАКСОНОМИЧЕСКАЯ ЕДИНИЦА В НОМЕНКЛАТУРЕ МИКРООРГАНИЗМОВ

1. царство

2. домен (империя)

3. вид

4. семейство

115.СОВОКУПНОСТЬ МИКРООРГАНИЗМОВ С ВНУТРИВИДОВЫМИ ОТЛИЧИЯМИ ПО БИОЛОГИЧЕСКИМ СВОЙСТВАМ

1. эковар

2. серовар

3. биовар

4. хемовар

5. фаговар

116.СОВОКУПНОСТЬ МИКРООРГАНИЗМОВ С ВНУТРИВИДОВЫМИ ОТЛИЧИЯМИ ПО ФЕРМЕНТАТИВНОЙ АКТИВНОСТИ

1. эковар

2. серовар

3. биовар

4. хемовар

5. фаговар

117.ОСНОВНОЙ НОСИТЕЛЬ ГЕНЕТИЧЕСКОЙ ИНФОРМАЦИИ БАКТЕРИЙ

1. плазмида

2. нуклеоид

3. транспозон

4. ядро

118.ОСНОВНОЙ НОСИТЕЛЬ ГЕНЕТИЧЕСКОЙ ИНФОРМАЦИИ БАКТЕРИЙ

1. плазмида

2. нуклеоид

3. нуклеокапсид

4. ядро

119.СТРУКТУРА БАКТЕРИАЛЬНОЙ КЛЕТКИ, ПОЗВОЛЯЮЩАЯ ПЕРЕЖИВАТЬ НЕБЛАГОПРИЯТНЫЕ УСЛОВИЯ ВНЕШНЕЙ СРЕДЫ

1. спора

2. капсула

3. клеточная стенка

4. рибосомы

5. мезосомы

120.БАКТЕРИИ, У КОТОРЫХ ЖГУТИКИ РАСПОЛАГАЮТСЯ ПО ВСЕЙ ПОВЕРХНОСТИ БАКТЕРИАЛЬНОЙ КЛЕТКИ

1. монотрих

2. амфитрих

3. лофотрих

4. перитрих

121.ОРГАН ДВИЖЕНИЯ БАКТЕРИЙ

1. пили

2. псевдоподии

3. жгутики

4. капсула

122.БАКТЕРИИ, ИМЕЮЩИЕ ОДИН ЖГУТИК

1. перитрих

2. амфитрих

3. лофотрих

4. монотрих

123.СПОСОБ РАЗМНОЖЕНИЯ БАКТЕРИЙ

1. спорообразование

2. бинарное деление

3. почкование

4. фрагментация

124.СУЩНОСТЬ НАУЧНОГО ОТКРЫТИЯ Д.И.ИВАНОВСКОГО

1. создание первого микроскопа

2. открытие вирусов

3. открытие явления фагоцитоза

4. получение антирабической вакцины

5. открытие явления трансформации

125.МИКРООРГАНИЗМЫ, НЕ ИМЕЮЩИЕ КЛЕТОЧНОЙ СТЕНКИ

1. хламидии

2. кандиды

3. микоплазмы

4. актиномицеты

126.ТРЕПОНЕМЫ:

1. Имеют 10-12 мелких завитков

2. Имеют форму кокков

3. Грамположительны

4. Неподвижны

127.НУКЛЕОИД БАКТЕРИЙ:

1. Содержит 2-3 ядрышка

2. Нить ДНК замкнута в кольцо

3. Связан с ЛПС

4. Имеет ядерную оболочку

128. ЗАСЛУГОЙ КАКОГО УЧЁНОГО ЯВЛЯЕТСЯ ОТКРЫТИЕ ХОЛЕРНОГО ВИБРИОНА

1. Р.Кох

2. Л.Пастер

3. И.И.Мечников

4. Д.И.Ивановский

5. Л.А.Тарасевич

129.ВЕТВЯЩИЕСЯ БАКТЕРИИ:

1. Актиномицеты

2. Спириллы

3. Вибрионы

4. Спирохеты

130.ЗАСЛУГОЙ КАКОГО УЧЁНОГО ЯВЛЯЕТСЯ ИЗОБРЕТЕНИЕ ВАКЦИНЫ ПРОТИВ БЕШЕНСТВА

1. Р.Кох

2. Л.Пастер

3. И.И.Мечников

4. Д.И.Ивановский

5. Л.А.Тарасевич

131.ОДНОЙ ИЗ ГЛАВНЫХ ЗАСЛУГ И.И.МЕЧНИКОВА В РАЗВИТИИ МИКРОБИОЛОГИИ ЯВЛЯЕТСЯ

1. впервые предложил метод выделения чистой культуры

2. создание фагоцитарной теории иммунитета

3. открытие вирусов

4. изучение круговорота веществ в природе

5. изобретение вакцины против бешенства

132.ТЕМНОПОЛЬНАЯ МИКРОСКОПИЯ ПОЗВОЛЯЕТ ВЫЯВИТЬ

1. наличие и характер подвижности бактерий

2. наличие капсулы

3. наличие споры

4. особенности строения клеточной стенки

5. особенности расположения включений

133.МЕТОД НЕЙССЕРА ИСПОЛЬЗУЕТСЯ ДЛЯ:

1. выявления спор

2. обнаружения жгутиков

3. выявления зерен волютина

4. окраски жировых включений

5. окраски ядерной субстанции

134.НАЗОВИТЕ МЕТОД, ПРИМЕНЯЕМЫЙ ДЛЯ ОКРАСКИ ВОЗБУДИТЕЛЕЙ ТУБЕРКУЛЕЗА

1. Циля-Нильсена

2. Ауески

3. Бурри-Гинса

4. Нейссера

5. Здродовского

135.КИСЛОТОУСТОЙЧИВОСТЬ БАКТЕРИЙ ОБЕСПЕЧИВАЕТ:

1. наличие капсулы

2. многослойность пептидогликана клеточной стенки

3. присутствие в клеточной стенке и цитоплазме липидов, восковых веществ и оксикислот

4. наличие включений волютина

5. отсутствие клеточной стенки

136.МИКРОСКОП СОЗДАЛ:

1. Антони ван Левенгук

2. Дмитрий Ивановский

3. Лаццаро Спаланцани

4. Илья Мечников

5. Александр Флеминг

137.СПОРООБРАЗУЮЩИЕ БАКТЕРИИ:

1. Salmonella typhi

2. Clostridium tetani

3. Bordetella pertussis

4. Mycobacterium tuberculosis

5. Vibrio cholerae

138.ИЗВИТЫЕ ФОРМЫ БАКТЕРИЙ:

1. Актиномицеты

2. Хламидии

3. Микобактерии

4. Спирохеты

139.ЛИПОПОЛИСАХАРИД БАКТЕРИАЛЬНОЙ КЛЕТКИ РАСПОЛОЖЕН В:

1. Цитоплазматической мембране

2. Наружной мембране грамположительных бактерий

3. Мезосоме

4. Наружной мембране грамотрицательных бактерий

5. Цитоплазме

140.КИСЛОТОУСТОЙЧИВЫЕ БАКТЕРИИ:

1. Стафилококки

2. Стрептококки

3. Эшерихии

4. Микобактерии

5. Микоплазмы

141.БИОЛОГИЧЕСКАЯ РОЛЬ ПЛАЗМИД

1. внехромосомные факторы наследственности

2. локомоторная функция

3. инвазия бактерий

4. спорообразование

142.БАКТЕРИИ, ИМЕЮЩИЕ ЖГУТИКИ НА ОБОИХ ПОЛЮСАХ

1. амфитрихи

2. симпатрихи

3. перитрихи

4. лофотрихи

5. монотрихи

143.КОККИ, РАСПОЛАГАЮЩИЕСЯ В ВИДЕ ЦЕПОЧЕК

1. менигококки

2. гонококки

3. клостридии

4. стрептококки

5. стафилококки

144.ФУНКЦИИ ПИЛЕЙ I ТИПА

1. дополнительный запас питательных веществ

2. защита от неблагоприятных условий внешней среды

3. обеспечение адгезии и питания клетки

4. участие в росте и делении клетки

5. участие в движении

145.ТИНКТОРИАЛЬНЫЕ СВОЙСТВА БАКТЕРИЙ – ЭТО

1. способность вызвать инфекцию

2. форма, строение, структура и взаиморасположение

3. способность разлагать белки и углеводы

4. отношение к окраске

5. тип и характер роста на средах

146.АНТИРАБИЧЕСКАЯ ВАКЦИНА ВПЕРВЫЕ ПОЛУЧЕНА

1. Мечниковым

2. Кохом

3. Сэбином

4. Солком

5. Пастером

147.ВЕЩЕСТВА, ОБЕСПЕЧИВАЮЩИЕ ТЕРМОУСТОЙЧИВОСТЬ СПОР

1. липотейхоевые кислоты

2. миколовые кислоты

3. глутаминовые кислоты

4. дипиколиновая кислота + ионы Са

5. тейхоевые кислоты

148.МИКРООРГАНИЗМЫ, ОТЛИЧАЮЩИЕСЯ ПО АНТИГЕННЫМ СВОЙСТВАМ

1. серовары

2. фаговары

3. биовары

4. хемовары

149.МИКРОБЫ, НЕ ИМЕЮЩИЕ КЛЕТОЧНОГО СТРОЕНИЯ:

1. прокариоты

2. порины

3. простейшие

4. прионы

150.ТИНКТОРИАЛЬНЫЕ СВОЙСТВА БАКТЕРИЙ ХАРАКТЕРИЗУЮТ:

1. Устойчивость во внешней среде

2. Устойчивость к действию физических факторов

3. Чувствительность к бактериофагам

4. Отношение к определенному методу окрашивания

151.КАПСУЛЬНЫЕ МИКРООРГАНИЗМЫ

1. Klebsiella pneumoniae

2. Treponema pallidum

3. Bifidobacterium bifidum

4. Candida albicans

152.КАПСУЛООБРАЗУЮЩИЕ БАКТЕРИИ:

1. Penicillium notatum

2. Streptococcus pneumoniae

3. Treponema pallidum

4. Brucella melitensis

5. Candida albicans

153.КАПСУЛУ ОБРАЗУЮТ:

1. Plasmodium vivax

2. Klebsiella pneumoniae

3. Treponema pallidum

4. Entamoeba coli

5. Candida albicans

154.КАПСУЛУ ОБРАЗУЮТ:

1. пневмококки

2. вирус гриппа

3. пневмоцисты

4. вирус герпеса

155.КАПСУЛУ ОБРАЗУЮТ:

1. Клебсиеллы

2. Вирус натуральной оспы

3. Пневмоцисты

4. Пенициллы

156.ДРОЖЖЕПОДОБНЫЕ ГРИБЫ

1. Бациллы

2. Мукор

3. Кандиды

4. Клостридии

5. Аспергиллы

6. Пенициллы

157.КАПСУЛУ ВЫЯВЛЯЮТ ПО МЕТОДУ

1. Бурри-Гинса

2. Циля-Нельсена

3. Грама

4. Фельгена

158.БАКТЕРИИ, ДИАМЕТР СПОР У КОТОРЫХ БОЛЬШЕ ТОЛЩИНЫ КЛЕТКИ:

1. Бациллы

2. Мукор

3. Кандида

4. Клостридии

5. Стрептококки

159.ДАЙТЕ ХАРАКТЕРИСТИКУ ПРОСТЕЙШИХ:

1. . Не имеют ядра

2. . Относятся к эукариотам

3. . Относятся к прокариотам

4. . Окрашиваются по Цилю-Нельсену

160.ФУНКЦИИ ЛПС:

1. Антигенная

2. Ферментативная

3. Адгезивная

4. Секреторная

161.ТАКСОНОМИЧЕСКАЯ КАТЕГОРИЯ, ОБЪЕДИНЯЮЩАЯ ВИДЫ МИКРООРГАНИЗМОВ С НАИБОЛЬШИМ КОЛИЧЕСТВОМ СХОДНЫХ ПРИЗНАКОВ И СВОЙСТВ

1. Семейство

2. Род

3. Вид

4. Штамм

5. Серовар

162.ОРГАНЫ ДВИЖЕНИЯ У БАКТЕРИЙ

1. Пили

2. Псевдоподии

3. Жгутики

4. Трихомонады

163.ДЛЯ ОКРАСКИ СПОР У БАКТЕРИЙ ИСПОЛЬЗУЮТ:

1. Окраску по Нейссеру

2. Окраску по Граму

3. Окраску по Бурри-Гинсу

4. Окраску по Ауеске

164.ФУНКЦИИ ЛПС:

1. Токсическая

2. Ферментативная

3. Адгезивная

4. Секреторная

165.ДАЙТЕ ХАРАКТЕРИСТИКУ ПРОСТЕЙШИХ:

1. Имеют оформленное ядро

2. Размножаются спорами

3. Относятся к прокариотам

4. Окрашиваются по Цилю-Нельсену

166.ДАЙТЕ ХАРАКТЕРИСТИКУ ПРОСТЕЙШИХ:

1. Имеют нуклеокапсид

2. Размножаются спорами

3. Относятся к прокариотам

4. Окрашиваются по Романовскому-Гимзе

167.ДАЙТЕ ХАРАКТЕРИСТИКУ ПРОСТЕЙШИХ:

1. Могут образовывать цисты

2. Размножаются спорами

3. Относятся к прокариотам

4. Окрашиваются метахроматически

168.ПРОСТЕЙШИЕ:

1. Многоклеточные

2. Размножаются спорами

3. Относятся к прокариотам

4. Могут иметь сложный цикл развития со сменой хозяев

169.ПРОСТЕЙШИЕ:

1. Могут образовывать цисты

2. Размножаются спорами

3. Относятся к прокариотам

4. Имеют 70 S рибосомы

170.ПРОСТЕЙШИЕ:

1. Размножаются дизъюнктивным способом

2. Размножаются спорами

3. Относятся к прокариотам

4. Имеют 80 S рибосомы

171.ПЛАЗМОДИИ МАЛЯРИИ:

1. Размножаются дизъюнктивным способом

2. Размножаются спорами

3. Относятся к эукариотам

4. Имеют 70 S рибосомы

172.ПЛАЗМОДИИ МАЛЯРИИ:

1. Размножаются в организме комара

2. Размножаются спорами

3. Относятся к прокариотам

4. Образуют цисты

173.ПЛАЗМОДИИ МАЛЯРИИ:

1. Размножаются дизъюнктивным способом

2. Обнаруживают в крови больного человека

3. Относятся к прокариотам

4. Образуют споры

174.ПЛАЗМОДИИ МАЛЯРИИ:

1. Размножаются дизъюнктивным способом

2. Размножаются спорами

3. Относятся к прокариотам

4. Имеют апикальный комплекс

175.ТОКСОПЛАЗМЫ:

1. Размножаются дизъюнктивным способом

2. Размножаются спорами

3. Относятся к прокариотам

4. Имеют апикальный комплекс

176.ТОКСОПЛАЗМЫ:

1. Размножаются дизъюнктивным способом

2. Размножаются спорами

3. Относятся к эукариотам

4. Имеют нуклеоид

177.ТОКСОПЛАЗМЫ:

1. Размножаются в организме комара

2. Размножаются спорами

3. Относятся к прокариотам

4. Передаются человеку от кошек

178. ДИЗЕНТЕРИЙНЫЕ АМЕБЫ:

1. Вызывают шигеллез

2. Неподвижны

3. Образуют псевдоподии

4. Имеют жгутики

179.ДИЗЕНТЕРИЙНЫЕ АМЕБЫ:

1. Вызывают токсоплазмоз

2. Передаются половым путем

3. Образуют цисты

4. Имеют реснички

180.ДИЗЕНТЕРИЙНЫЕ АМЕБЫ:

1. Вызывают кишечный иерсиниоз

2. Существуют в просветной и пристеночной формах

3. Образуют споры

4. Имеют реснички

181.ДИЗЕНТЕРИЙНЫЕ АМЕБЫ:

1. Вызывают кишечный эшерихиоз

2. Образуют цисты

3. Относятся к прокариотам

4. Размножаются в организме клещей

182.БАЛАНТИДИИ:

1. Вызывают амебную дизентерию

2. Образуют цисты

3. Относятся к прокариотам

4. Размножаются в организме клещей

183.БАЛАНТИДИИ:

1. Вызывают амебную дизентерию

2. Образуют псевдоподии

3. Относятся к прокариотам

4. Имеют реснички для передвижения

184.БАЛАНТИДИИ:

1. Передаются половым путем

2. Размножаются в организме комара

3. Относятся к эукариотам

4. Размножаются спорами

185.ВСЕ ПЕРЕЧИСЛЕННОЕ НИЖЕ ВЕРНО, КРОМЕ:

1. Аспергиллы относятся к высшим грибам

2. Аспергиллы относятся к дрожжевым грибам

3. Аспергиллы относятся к эукариотам

4. Аспергиллы размножаются спорами

186.ВСЕ ПЕРЕЧИСЛЕННОЕ НИЖЕ ВЕРНО, КРОМЕ:

1. Аспергиллы относятся к высшим грибам

2. Аспергиллы могут размножаться половым путем

3. Аспергиллы относятся к прокариотам

4. Аспергиллы размножаются спорами

187.ВСЕ ПЕРЕЧИСЛЕННОЕ НИЖЕ ВЕРНО, КРОМЕ:

1. Аспергиллы относятся к высшим грибам

2. Аспергиллы могут размножаться половым путем

3. Аспергиллы относятся к актиномицетам

4. Аспергиллы образуют гифы

188.ВСЕ ПЕРЕЧИСЛЕННОЕ НИЖЕ ВЕРНО, КРОМЕ:

1. Аспергиллы имеют септированный мицелий

2. Аспергиллы образуют конидии

3. Аспергиллы относятся к низшим грибам

4. Аспергиллы образуют спорангии

189.ВСЕ ПЕРЕЧИСЛЕННОЕ НИЖЕ ВЕРНО, КРОМЕ:

1. Аспергиллы имеют воздушный мицелий

2. Аспергиллы имеют субстратный мицелий

3. Аспергиллы имеют несептированный мицелий

4. Аспергиллы имеют оформленное ядро

190.ВСЕ ПЕРЕЧИСЛЕННОЕ НИЖЕ ВЕРНО, КРОМЕ:

1. Пенициллы относятся к высшим грибам

2. Пенициллы относятся к дрожжевым грибам

3. Пенициллы относятся к эукариотам

4. Пенициллы размножаются спорами

191.ВСЕ ПЕРЕЧИСЛЕННОЕ НИЖЕ ВЕРНО, КРОМЕ:

1. Пенициллы относятся к высшим грибам

2. Пенициллы могут размножаться половым путем

3. Пенициллы относятся к прокариотам

4. Пенициллы размножаются спорами

192.ВСЕ ПЕРЕЧИСЛЕННОЕ НИЖЕ ВЕРНО, КРОМЕ:

1. Пенициллы относятся к высшим грибам

2. Пенициллы могут размножаться половым путем

3. Пенициллы относятся к актиномицетам

4. Пенициллы образуют гифы

193.ВСЕ ПЕРЕЧИСЛЕННОЕ НИЖЕ ВЕРНО, КРОМЕ:

1. Пенициллы имеют септированный мицелий

2. Пенициллы образуют конидии

3. Пенициллы относятся к низшим грибам

4. Пенициллы образуют гифы

194.ВСЕ ПЕРЕЧИСЛЕННОЕ НИЖЕ ВЕРНО, КРОМЕ:

1. Пенициллы имеют воздушный мицелий

2. Пенициллы имеют субстратный мицелий

3. Пенициллы имеют несептированный мицелий

4. Пенициллы имеют оформленное ядро

195.ВСЕ ПЕРЕЧИСЛЕННОЕ НИЖЕ ВЕРНО, КРОМЕ:

1. Грибы рода Mucor относятся к высшим грибам

2. Грибы рода Mucor образуюут псевдомицелий

3. Грибы рода Mucor относятся к эукариотам

4. Грибы рода Mucor размножаются спорами

196.ВСЕ ПЕРЕЧИСЛЕННОЕ НИЖЕ ВЕРНО, КРОМЕ:

1. Грибы рода Mucor относятся к аскомицетам

2. Грибы рода Mucor могут размножаться половым путем

3. Грибы рода Mucor относятся к эукариотам

4. Грибы рода Mucor размножаются спорами

197.ВСЕ ПЕРЕЧИСЛЕННОЕ НИЖЕ ВЕРНО, КРОМЕ:

1. Грибы рода Mucor относятся к низсшим грибам

2. Грибы рода Mucor могут размножаться половым путем

3. Грибы рода Mucor относятся к актиномицетам

4. Грибы рода Mucor образуют гифы

198.ВСЕ ПЕРЕЧИСЛЕННОЕ НИЖЕ ВЕРНО, КРОМЕ:

1. Грибы рода Mucor имеют несептированный мицелий

2. Грибы рода Mucor образуют конидии

3. Грибы рода Mucor относятся к низшим грибам

4. Грибы рода Mucor образуют спорангии

199.ВСЕ ПЕРЕЧИСЛЕННОЕ НИЖЕ ВЕРНО, КРОМЕ:

1. Грибы рода Mucor имеют воздушный мицелий

2. Грибы рода Mucor имеют субстратный мицелий

3. Грибы рода Mucor имеют несептированный мицелий

4. Грибы рода Mucor имеют псевдомицелий

200.ВСЕ ПЕРЕЧИСЛЕННОЕ НИЖЕ ВЕРНО, КРОМЕ:

1. Грибы рода Mucor относятся к диморфным грибам

2. Грибы рода Mucor относятся к низшим грибам

3. Грибы рода Mucor относятся к эукариотам

4. Грибы рода Mucor размножаются спорами

201.ГРИБЫ РОДА MUCOR:

1. вызывают муковисцидоз

2. вызывают мукоромикоз

3. вызывают микоплазмоз

4. вызывают гистоплазмоз

202.ПЕНИЦИЛЛЫ:

1. вызывают пенициллиоз

2. вызывают мукоромикоз

3. вызывают микоплазмоз

4. вызывают аспергиллез

203.АСПЕРГИЛЛЫ:

1. вызывают аспергиллез

2. вызывают мукоромикоз

3. вызывают эрготизм

4. вызывают микоплазмоз

204.АКТИНОМИЦЕТЫ:

1. вызывают актиноплазмоз

2. вызывают мукоромикоз

3. вызывают микоплазмоз

4. вызывают актиномикоз

205.КАНДИДЫ:

1. вызывают кандидатоксикоз

2. вызывают мукоромикоз

3. вызывают микоплазмоз

4. вызывают кандидамикоз

206.ВСЕ ПЕРЕЧИСЛЕННОЕ НИЖЕ ВЕРНО, КРОМЕ:

1. Кандиды относятся к высшим грибам

2. Кандиды образуют псевдомицелий

3. Кандиды относятся к прокариотам

4. Кандиды грамположительны

207.ВСЕ ПЕРЕЧИСЛЕННОЕ НИЖЕ ВЕРНО, КРОМЕ:

1. Кандиды относятся к высшим грибам

2. Кандиды могут размножаться почкованием

3. Кандиды относятся к зигомицетам

4. Кандиды образуют бластоспоры

208.КАНДИДЫ:

1. имеют септированный мицелий

2. образуют конидии

3. относятся к высшим грибам

4. образуют спорангии

209.КАНДИДЫ:

1. имеют воздушный мицелий

2. имеют субстратный мицелий

3. имеют несептированный мицелий

4. имеют псевдомицелий

210.КАНДИДЫ:

1. образуют конидии

2. образуют спорангии

3. образуют хламидоспоры

4. образуют зигоспоры

211.КАНДИДЫ:

1. относятся к низшим грибам

2. могут размножаться половым путем

3. относятся к актиномицетам

4. образуют гифы

212.ВСЕ ПЕРЕЧИСЛЕННОЕ НИЖЕ ВЕРНО, КРОМЕ:

1. Кандиды относятся к высшим грибам

2. Кандиды могут размножаться почкованием

3. Кандиды образуют гладкие колонии на среде Сабуро

4. Кандиды не окрашиваются по Граму

213.КАНДИДЫ:

1. образуют элементарные тельца

2. образуют гифы

3. образуют хламидоспоры

4. образуют ретикулярные тельца

214.ВСЕ ПЕРЕЧИСЛЕННОЕ НИЖЕ ВЕРНО, КРОМЕ:

1. Пенициллы имеют воздушный мицелий

2. Пенициллы имеют субстратный мицелий

3. Пенициллы имеют септированный мицелий

4. Пенициллы образуют гладкие колонии на среде Сабуро

215.МИКРОСКОПИЧЕСКИЕ ГРИБЫ:

1. Содержат нуклеокапсид

2. Являются прокариотами

3. Содержат в клетках хлорофилл

4. Содержат в клетках хитин

216.ВСЕ ПЕРЕЧИСЛЕННОЕ НИЖЕ ВЕРНО, КРОМЕ:

1. Микроскопические грибы культивируют на среде Сабуро

2. Микроскопические грибы являются прокариотами

3. Микроскопические грибы содержат в клетках эргостерол

4. Микроскопические грибы содержат в клетках хитин

217.ВСЕ ПЕРЕЧИСЛЕННОЕ НИЖЕ ВЕРНО, КРОМЕ:

1. Дрожжевые грибы культивируют на среде Сабуро

2. Дрожжевые грибы являются эукариотами

3. Дрожжевые грибы содержат в клетках эргостерол

4. Дрожжевые грибы имеют септированный мицелий

218.ВИРОИДЫ:

1. Внеклеточная форма вирусов

2. Инфекционные РНК растений

3. Инфекционные белки человека

4. Вирусы бактерий

219.ВИРОИДЫ:

1. Внутриклеточная форма вирусов

2. Инфекционные РНК растений

3. Элементарные тельца хламидий

4. Вирусы растений

220.ВИРОИДЫ:

1. Разновидность вирусов человека

2. Инфекционные РНК растений

3. Элементарные тельца хламидий

4. Ретикулярные тельца хламидий

221.ПРИОНЫ:

1. Внеклеточная форма вирусов

2. Инфекционные РНК растений

3. Инфекционные белки человека

4. Вирусы бактерий

222.ПРИОНЫ:

1. Внеклеточная форма вирусов

2. Инфекционные РНК растений

3. Инфекционные белки животных

4. Вирусы растений

223.ПРИОНЫ:

1. Нуклеокапсиды вирусов

2. Инфекционные РНК растений

3. Инфекционные белки человека

4. Белки в наружной мембране клеточной стенки грамотрицательных бактерий

224.ПРИОНЫ:

1. Разновидность прокариотов

2. Белки клеточной стенки грамположительных бактерий

3. Инфекционные белки человека

4. Белки клеточной стенки грамотрицательных бактерий

225.ПРИОНЫ:

1. Инфекционные белки бактерий

2. Инфекционные белки животных

3. Инфекционные белки вирусов

4. Инфекционные РНК растений

226.ЛЕЙШМАНИИ:

1. Относятся к простейшим

2. Относятся к грибам

3. Относятся к прокариотам

4. Относятся к неклеточным микробам

227.ЛЕЙШМАНИИ:

1. Имеют оформленное ядро

2. Образуют споры

3. Передвигаются с помощью псевдоподий

4. Передвигаются с помощью ресничек

228.ЛЕЙШМАНИИ:

1. Передвигаются с помощью жгутиков

2. Неподвижны

3. Образуют псевдоподии

4. Образуют элементарные и ретикулярные тельца

229.ВСЕ ПЕРЕЧИСЛЕННОЕ НИЖЕ ВЕРНО, КРОМЕ:

1. Лейшмании относятся к эукариотам

2. Лейшмании относятся к простейшим

3. Лейшмании относятся к жгутиконосцам

4. Лейшмании относятся споровикам

230.ТРИХОМОНАДЫ:

1. Вызывают токсоплазмоз

2. Передаются половым путем

3. Образуют псевдоподии

4. Имеют реснички

231.ТРИХОМОНАДЫ:

1. Образуют реснички

2. Неподвижны

3. Образуют псевдоподии

4. Имеют жгутики

232.ТРИХОМОНАДЫ:

1. Передвигаются с помощью жгутиков

2. Неподвижны

3. Образуют псевдоподии

4. Образуют элементарные и ретикулярные тельца

233.ТРИХОМОНАДЫ:

1. Имеют два ядра

2. Передаются водным путем

3. Образуют псевдоподии

4. Относятся к простейшим

234.ЛЯМБЛИИ:

1. Вызывают кишечный иерсиниоз

2. Передаются водным путем

3. Образуют псевдоподии

4. Имеют реснички

235.ЛЯМБЛИИ:

1. Вызывают амебную дизентерию

2. Неподвижны

3. Образуют псевдоподии

4. Имеют жгутики

236.ВИРИОН:

1. Внеклеточная форма вируса

2. Инфекционная РНК растений

3. Вирус бактерий

4. Вирус растений

237.ВИРИОН:

1. Внутриклеточная форма вирусов

2. Внеклеточная форма вируса

3. Элементарное тельце хламидий

4. Ретикулярное тельце хламидий

238.ВИРИОН:

1. Внутриклеточная форма вируса

2. Разновидность прокариотов

3. Разновидность архебактерий

4. Вирус без нуклеокапсида

239.КАПСИД ВИРУСА:

1. Состоит из капсомеров

2. Находится снаружи от суперкапсида

3. Содержит хитин

4. Содержит пептидогликан

240.НУКЛЕОКАПСИД ВИРУСА:

1. Состоит из капсомеров

2. Находится снаружи от суперкапсида

3. Содержит хитин

4. Содержит пептидогликан

241.КАПСИД ВИРУСА:

1. Окружает РНК или ДНК

2. Окружает суперкапсид

3. Имеет гликопротеиновые шипы

4. Содержит эргостерол

242.НУКЛЕОКАПСИД ВИРУСА:

1. Содержит РНК или ДНК

2. Находится снаружи от суперкапсида

3. Имеет гликопротеиновые шипы

4. Содержит пептидогликан

243.УСТОЙЧИВОСТЬ НЕСПОРООБРАЗУЮЩИХ БАКТЕРИЙ К КИСЛОТАМ, ЩЕЛОЧАМ И СПИРТАМ ОБУСЛОВЛЕНА ВЫСОКИМ СОДЕРЖАНИЕМ В КЛЕТОЧНОЙ СТЕНКЕ:

1. Пептидогликана

2. Соединений серы

3. Соединений азота

4. Восков и липидов

244.ПО МЕТОДУ ЦИЛЯ-НЕЛЬСЕНА В СИНИЙ ЦВЕТ ОКРАШИВАЮТСЯ:

1. Микобактерии туберкулеза

2. Кислотоустойчивые бактерии

3. Микоплазмы пневмонии

4. Некислотоустойчивые бактерии

245.К КИСЛОТОУСТОЙЧИВЫМ БАКТЕРИЯМ ОТНОСЯТСЯ:

1. Стафилококки

2. Бациллы

3. Клостридии

4. Микобактерии

246.СЛИЗИСТЫЙ СЛОЙ РАЗЛИЧНОЙ ТОЛЩИНЫ, РАСПОЛАГАЮЩИЙСЯ СНАРУЖИ КЛЕТОЧНОЙ СТЕНКИ БАКТЕРИЙ:

1. Внешняя оболочка

2. Клеточная стенка

3. Наружная мембрана

4. Капсула

247.ТИНКТОРИАЛЬНЫЕ СВОЙСТВА БАКТЕРИЙ ЗАКЛЮЧАЮТСЯ В:

1. Устойчивости во внешней среде

2. Устойчивости к действию физических факторов

3. Чувствительности к бактериофагам.

4. Отношении к определенному методу окраски

248.БАКТЕРИИ БЕЗ КЛЕТОЧНОЙ СТЕНКИ:

1. Хламидии

2. Риккетсии

3. Лептоспиры

4. Микоплазмы

249.КАПСУЛУ БАКТЕРИЙ ОБНАРУЖИВАЮТ В ЧИСТОЙ КУЛЬТУРЕ, ИСПОЛЬЗУЯ ОКРАСКУ:

1. По Цилю – Нельсену

2. По Ауеске

3. По Граму

4. По Бурри – Гинсу

250.К КИСЛОТОУСТОЙЧИВЫМ БАКТЕРИЯМ ОТНОСЯТСЯ:

1. Микрококки

2. Микоплазмы

3. Актиномицеты

4. Микобактерии

251.ПРОКАРИОТЫ:

1 Грибы

2 Простейшие

3 Вирусы

4 Прионы

5 Бактерии

252.К КИСЛОТОУСТОЙЧИВЫМ БАКТЕРИЯМ ОТНОСЯТСЯ:

1 Микоплазмы

2 Вибрионы

3 Шигеллы

4 Микобактерии

5 Спирохеты

253.МЕТОДЫ ИЗУЧЕНИЯ СТРУКТУРНОЙ ОРГАНИЗАЦИИ ВИРУСОВ:

1 Световая микроскопия

2 Фазово-контрастная микроскопия

3 Темнопольная микроскопия

4 Электронная микроскопия

5 Люминисцентная микроскопия

254.БАКТЕРИИ, У КОТОРЫХ ЖГУТИКИ РАСПОЛОЖЕНЫ ПО ПЕРИМЕТРУ КЛЕТКИ:

1 Амфитрихи

2 Перитрихи

3 Спирохеты

4 Монотрихи

5 Лофотрихи

6 Лептотрихии

255.ТИНКТОРИАЛЬНЫЕ СВОЙСТВА БАКТЕРИЙ ХАРАКТЕРИЗУЮТ:

1 Устойчивость во внешней среде

2 Устойчивость к действию физических факторов

3 Чувствительность к бактериофагам

4 Отношение к определенному методу окрашивания

5 Биохимическую активность

6 Устойчивость к антибиотикам

256.ДРОЖЖЕПОДОБНЫЕ ГРИБЫ:

1 Актиномицеты

2 Мукор

3 Кандиды

4 Микобактерии

5 Аспергиллы

6 Микоплазмы

257.КОККИ, РАСПОЛАГАЮЩИЕСЯ В ВИДЕ ЦЕПОЧЕК:

1 Сарцины

2 Пневмококки

3 Нейссерии

4 Стрептобациллы

5 Стрептококки

6 Стафилококки

258.БАКТЕРИИ, ДИАМЕТР СПОР У КОТОРЫХ БОЛЬШЕ ТОЛЩИНЫ КЛЕТКИ:

1 Бациллы

2 Аспергиллы

3 Кандиды

4 Клостридии

5 Пенициллы

6 Стафилококки

7 Трепонемы

259.КИСЛОТОУСТОЙЧИВЫЕ БАКТЕРИИ:

1 Стафилококки

2 Стрептококки

3 Эшерихии

4 Микобактерии

5 Микоплазмы

6 Уреаплазмы

7 Микрококки

8 Актиномицеты

260.ФУНКЦИЯ ДВИЖЕНИЯ У БАКТЕРИЙ:

1 Пили

2 Жгутики

3 Псевдоподии

4 Порины

5 Включения

6 Споры

7 Мезосомы

8 Реснички

261.АДГЕЗИЯ БАКТЕРИЙ К ЭУКАРИОТИЧЕСКИМ КЛЕТКАМ:

1 Пили

2 Реснички

3 Псевдоподии

4 Порины

5 Включения

6 Споры

7 Прионы

262.ДЛЯ ОКРАСКИ СПОР У БАКТЕРИЙ ИСПОЛЬЗУЮТ:

1 Окраску по Нейссеру

2 Окраску по Леффлеру

3 Окраску по Бурри-Гинсу

4 Окраску по Ауеске

5 Окраску по Здродовскому

263.ОРГАНЕЛЛЫ ДВИЖЕНИЯ У БАКТЕРИЙ:

1 Перитрихи

2 Пили

3 Трихомонады

4 Псевдоподии

5 Жгутики

6 Реснички

7 Лофотрихи

8 Псевдомонады

264.ЛИПОПОЛИСАХАРИД БАКТЕРИАЛЬНОЙ КЛЕТКИ РАСПОЛОЖЕН В:

1 Цитоплазматической мембране

2 Наружной мембране клеточной стенки грамположительных бактерий

3 Мезосоме

4 Наружной мембране клеточной стенки грамотрицательных бактерий

5 Цитоплазме

6 Нуклеокапсиде

265.ФУНКЦИИ ФИМБРИЙ (ПИЛЕЙ) У БАКТЕРИЙ:

1 Генетическая

2 Адгезивная

3 Двигательная

4 Информационная

5 Защитная

6 Репаративная

266.ДЛЯ ОБНАРУЖЕНИЯ КАПСУЛ У БАКТЕРИЙ В ЧИСТОЙ КУЛЬТУРЕ ИСПОЛЬЗУЮТ:

1 Окраску по Цилю-Нельсену

2 Окраску по Ауеске

3 Окраску по Граму

4 Окраску по Бурри-Гинсу

5 Окраску по Нейссеру

6 Окраску по Леффлеру

267.МЕТОДЫ ИЗУЧЕНИЯ СТРУКТУРНОЙ ОРГАНИЗАЦИИ ВИРУСОВ:

1 Световая микроскопия

2 Фазово-контрастная микроскопия

3 Темнопольная микроскопия

4 Электронная микроскопия

5 Люминесцентная микроскопия

6 Микроскорпия с помощью стереоскопической лупы

268.СФОРМИРОВАННАЯ ВИРУСНАЯ ЧАСТИЦА:

1 Прион

2 Порин

3 Вирион

4 Вироид

5 Провирус

6 Профаг

7 Эписома

269.СПОРООБРАЗУЮЩИЕ БАКТЕРИИ РАЗМНОЖАЮТСЯ:

1 Дизъюнктивно

2 Митотически

3 Спорами

4 Фрагментами мицелия

5 Бинарным делением

6 Половым путем

7 Почкованием

270.МЕТОДЫ ИЗУЧЕНИЯ СТРУКТУРНОЙ ОРГАНИЗАЦИИ ВИРУСОВ:

1 Световая микроскопия

2 Фазово-контрастная микроскопия

3 Темнопольная микроскопия

4 Электронная микроскопия

5 Люминесцентная микроскопия

6 Микроскопия с помощью стереоскопической лупы

271.СПОРООБРАЗУЮЩИЕ БАКТЕРИИ:

1. бациллы

2. шигеллы

3. клостридии

4. клебсиеллы

272.ГРИБЫ РОДА MUCOR:

1. вызывают муковисцидоз

2. вызывают мукоромикоз

3. вызывают микоплазмоз

4. вызывают микотоксикоз

273.АСПЕРГИЛЛЫ:

1. вызывают аспергиллез

2. вызывают мукоромикоз

3. вызывают микотоксикоз

4. вызывают микоплазмоз

274.БАКТЕРИИ, В КЛЕТОЧНОЙ СТЕНКЕ КОТОРЫХ СОДЕРЖИТСЯ МНОГОСЛОЙНЫЙ ПЕПТИДОГЛИКАН:

1. грамположительные

2. грамотрицательные

3. толстостенные

4. некислотоустойчивые

275.МИКРООРГАНИЗМЫ, НЕ ИМЕЮЩИЕ КЛЕТОЧНОЙ СТЕНКИ:

1. хламидии

2. L- формы

3. микоплазмы

4.актиномицеты

276.БИОЛОГИЧЕСКАЯ РОЛЬ ПЛАЗМИД:

1. внехромосомные факторы наследственности

2. локомоторная функция

3. инвазия бактерий

4. детерминируют дополнительные свойства бактерий

5. регуляция осмотического давления

277.НЕ ИМЕЮТ КЛЕТОЧНОГО СТРОЕНИЯ:

1. бактерии

2. грибы

3. прионы

4. простейшие

5. вирусы

278.ГРАМПОЛОЖИТЕЛЬНЫЕ ПАЛОЧКИ – ВОЗБУДИТЕЛИ:

1. газовой гангрены

2. туляремии

3. сибирской язвы

4. бруцеллеза

5. скарлатины

279.ВЕТВЯЩИЕСЯ БАКТЕРИИ:

1. аскомицеты

2. актиномицеты

3. бифидобактерии

4. лактобактерии

280.ДАЙТЕ ХАРАКТЕРИСТИКУ ПРОСТЕЙШИХ:

1. имеют ядро

2. относятся к эукариотам

3. относятся к прокариотам

4. окрашиваются по Романовскому-Гимзе

281.ОСОБЕННОСТИ ВИРУСОВ:

1. не имеют клеточного строения

2. содержат ДНК или РНК

3. облигатные внутриклеточные паразиты

4. дизъюнктивный способ репродукции

282.ОСНОВНЫЕ МОРФОЛОГИЧЕСКИЕ РАЗНОВИДНОСТИ БАКТЕРИЙ:

1. Кокки

2. Извитые

3. Палочки

4. Ветвящиеся и нитевидные

283.В СОСТАВ ПЕПТИДОГЛИКАНА ВХОДЯТ:

1. Тейхоевые кислоты

2. N-ацетилглюкозамин

3. N-ацетилмурамовая кислота

4. Липополисахарид (ЛПС)

5. Пептидный мостик из аминокислот

284.НАРУЖНАЯ МЕМБРАНА ГРАМОТРИЦАТЕЛЬНЫХ БАКТЕРИЙ СОДЕРЖИТ:

1. ЛПС

2. Порины

3. Липид А

4. Пептидогликан

285.ГРАМПОЛОЖИТЕЛЬНЫЕ БАКТЕРИИ:

1. Стафилококки

2. Хламидии

3. Стрептококки

4. Эшерихии

286.ГРАМПОЛОЖИТЕЛЬНЫЕ БАКТЕРИИ:

1. Стафилококки

2. Микобактерии

3. Стрептококки

4. Клостридии

5. Бациллы

287.ОБРАЗОВАНИЕ ЭНДОСПОР У БАКТЕРИЙ СТИМУЛИРУЮТ:

1. Недостаток питательных веществ

2. Изменение температуры окружающей среды

3. Изменение кислотности окружающей среды

4. Попадание в организм человека или животного

288.СЛОЖНЫЕ МЕТОДЫ ОКРАСКИ БАКТЕРИЙ:

1. Окраска по Цилю-Нельсену

2. Окраска по Нейссеру

3. Окраска по Граму

4. Окраска фуксином

5. Окраска по Бурри-Гинсу

289.СЛОЖНЫЕ ДИФФЕРЕНЦИАЛЬНЫЕ МЕТОДЫ ОКРАСКИ БАКТЕРИЙ:

Окраска по Цилю-Нельсену

2. Окраска по Нейссеру

Окраска по Граму

4. Окраска метиленовым синим

5. Окраска по Бурри-Гинсу

290.СВОЙСТВА СПИРОХЕТ:

1. Извитая форма

2. Подвижны

3. Имеют периплазматические жгутики (фибриллы)

4. Грамотрицательны

5. Образуют споры

291.РИККЕТСИИ:

1. Облигатные внутриклеточные паразиты

2. Прокариоты

3. Грамотрицательны

4. Окрашиваются по методу Здродовского

5. Грамположительны

292.ПРИЗНАКИ ГРИБОВ:

1. Отсутствует хлорофилл

2. Имеют жесткую клеточную стенку

3. Содержат стеролы в клеточной стенке

4. Эукариоты

5. Основа клеточной стенки — пептидогликан

293.ПРИЗНАКИ ГРИБОВ:

1. Имеют нуклеоид

2. Имеют оформленное ядро

3. Образуют цисты

4. Имеют митохондрии

5. Размножаются спорами

294.ПРИЗНАКИ ГРАМПОЛОЖИТЕЛЬНЫХ БАКТЕРИЙ:

1. В клеточной стенке есть тейхоевые кислоты

2. Некоторые могут образовывать споры

3. Основной компонент клеточной стенки — пептидогликан

4. Отдельные представители кислотоустойчивы

5. В состав клеточной стенки входит наружная мембрана

295.ГРАМОТРИЦАТЕЛЬНЫЕ БАКТЕРИИ:

1. Нейссерии

2. Эшерихии

3. Вибрионы

4. Стрептококки

5. Бациллы

296.ГРАМОТРИЦАТЕЛЬНЫЕ БАКТЕРИИ:

1. Нейссерии

2. Трепонемы

3. Микобактерии

4. Вейллонеллы

5. Энтерококки

297.ФУНКЦИИ ЛПС:

1. Антигенная

2. Ферментативная

3. Токсическая

4. Секреторная

298.СВОЙСТВА ХЛАМИДИЙ:

1. Грамотрицательные

2. Грамположительны

3. Облигатные внутриклеточные паразиты

4. Факультативные внутриклеточные паразиты

5. Прокариоты

299.МИКРОБЫ, У КОТОРЫХ РИГИДНОСТЬ КЛЕТОЧНОЙ СТЕНКИ ОБУСЛОВЛИВАЕТ ПЕПТИДОГЛИКАН:

1. Грамотрицательные бактерии

2. Актиномицеты

3. Грамположительные бактерии

4. Грибы

300.ЗЕРНА ВОЛЮТИНА:

1. Цитоплазматические включения

2. Окрашиваются по Ауеске

3. Окрашиваются по Нейссеру

4. Отличаются метахромазией

5. Содержат полифосфаты

301.ИЗВИТЫЕ ФОРМЫ БАКТЕРИЙ:

1. Актиномицеты

2. Спириллы

3. Микобактерии

4. Спирохеты

302.МЕТОДЫ ИЗУЧЕНИЯ ПОДВИЖНОСТИ СПИРОХЕТ:

1. Окраска серебрением по Морозову

2. Микроскопия в темном поле

3. Электронная микроскопия

4. Фазово-контрастная микроскопия

303.МИЦЕЛИЙ ГРИБОВ – ЭТО:

1. Клетка, лишенная цитоплазматической мембраны

2. Совокупность гиф

3. Совокупность хламидоспор

4. Многоядерная структура

304.СТРУКТУРНЫЕ ОСОБЕННОСТИ ПРОКАРИОТОВ:

1. Константа седиментации рибосом 70S

2. Имеется нуклеоид

3. Отсутствует аппарат Гольджи

4. Отсутствует ядерная мембрана

305.НУКЛЕОИД БАКТЕРИЙ:

1. Содержит 2-3 ядрышка

2. Нить ДНК замкнута в кольцо

3. Связан с ЛПС

4. Не имеет ядерной оболочки

306.ПРИЗНАКИ ГРАМОТРИЦАТЕЛЬНЫХ БАКТЕРИЙ:

1. Клеточная стенка состоит из внешней (наружной) мембраны и внутреннего ригидного пептидогликанового слоя

2. Имеется периплазматическое пространство

3. Имеется ЛПС и липопротеин в составе внешней мембраны

4. Отсутствует пептидогликан

307.ЦИТОПЛАЗМАТИЧЕСКИЕ ВКЛЮЧЕНИЯ У БАКТЕРИЙ:

1. Зерна гликогена

2. Митохондрии

3. Зерна волютина

4. Рибосомы

308.ВЕТВЯЩИЕСЯ БАКТЕРИИ:

1. Актиномицеты

2. Спириллы

3. Бифидобактерии

4. Спирохеты

309.ПРОСТЕЙШИЕ:

1. Имеют клеточное строение

2. Относятся к эукариотам

3. Относятся к прокариотам

4. В основном обладают микроскопическими размерами

5. Окрашиваются по Романовскому-Гимзе

310.ТРЕПОНЕМЫ:

1. Имеют 10-14 мелких завитков

2. Имеют форму кокков

3. Относятся к спирохетам

4. Грамположительны

5. Неподвижны

311.ЭУКАРИОТЫ:

1. Простейшие

2. Эубактерии

3. Грибы

4. Прионы

312.КЛЕТОЧНУЮ СТЕНКУ ИМЕЮТ:

1. Бактерии

2. Простейшие

3. Грибы

4. Прионы

313.ФУНКЦИИ ФИМБРИЙ (ПИЛЕЙ) У БАКТЕРИЙ:

1. Половое размножение

2. Прикрепление к субстрату

3. Двигательная

4. Участие в обмене генетической информацией

314.ГРАМОТРИЦАТЕЛЬНЫЕ БАКТЕРИИ С ТИПИЧНОЙ ПОЛНОЦЕННОЙ КЛЕТОЧНОЙ СТЕНКОЙ:

1. Риккетсии

2. Микоплазмы

3. Хламидии

4. L-формы

315.В СОСТАВ КЛЕТОЧНОЙ СТЕНКИ ГРАМПОЛОЖИТЕЛЬНЫХ БАКТЕРИЙ ВХОДИТ:

1. пептидогликан

2. липополисахарид

3. волютин

4. флагеллин

5. тейхоевые кислоты

316.МОРФОЛОГИЧЕСКИЕ И ТИНКТОРИАЛЬНЫЕ СВОЙСТВА СТАФИЛОКОККОВ:

1. круглая форма клетки

2. грамположительны

3. грамотрицательны

4. располагаются в виде гроздьев винограда

5. располагаются в виде цепочек

317.ФУНКЦИИ СПОР БАКТЕРИЙ:

1. защита генетического материала от неблагоприятных воздействий окружающей среды

2. защита генетического материала от неблагоприятных воздействий в организме человека

3. размножение

4. запас питательных веществ

5. сохранение вида

318.УСЛОВИЯ, СПОСОБСТВУЮЩИЕ ОБРАЗОВАНИЮ СПОР:

1. низкая температура

2. снижение содержания в окружающей среде питательных веществ

3. полноценное питание и влажность

4. попадание в организм

5. высушивание

319.СУБТЕРМИНАЛЬНОЕ РАСПОЛОЖЕНИЕ СПОР ХАРАКТЕРНО ДЛЯ ВОЗБУДИТЕЛЯ:

1. сыпного тифа

2. газовой анаэробной инфекции

3. сибирской язвы

4. ботулизма

5. столбняка

320.МИКРООРГАНИЗМЫ, ИМЕЮЩИЕ ВКЛЮЧЕНИЯ В ВИДЕ ЗЁРЕН ВОЛЮТИНА:

1. Candida albicans

2. Staphylococcus aureus

3. Corynebacterium diphtheriae

4. Mycoplasma hominis

5. Сhlamydophila pneumoniae

321.МИКРООРГАНИЗМЫ, ИМЕЮЩИЕ ВКЛЮЧЕНИЯ В ВИДЕ ЗЁРЕН ВОЛЮТИНА:

1. Corynebacterium pseudodiphtherithicum

2. Mycobacterium tuberculosis

3. Corynebacterium diphtheriae

4. Mycoplasma hominis

5. Clostridium tetani

322.МИКРООРГАНИЗМЫ, ИМЕЮЩИЕ ИЗВИТУЮ ФОРМУ:

1. Chlamydia trachomatis

2. Corynebacterium diphtheriae

3. Leptospira interrogans

4. Mycoplasma pneumoniae

5. Borrelia recurrentis

323.ОКРАСКА БАКТЕРИЙ ПО МЕТОДУ ГРАМА ПОЗВОЛЯЕТ ВЫЯВИТЬ:

1. форму клетки

2.наличие жгутиков

3.наличие кислотоустойчивости у бактерии

4.особенности расположения включений

5.особенности строения клеточной стенки

324.БАКТЕРИИ В КЛЕТОЧНОЙ СТЕНКЕ КОТОРЫХ СОДЕРЖИТСЯ МНОГОСЛОЙНЫЙ ПЕПТИДОГЛИКАН:

1. грамположительные

2. грамотрицательные

3. спорообразующие

4. микоплазмы

325.К ЭУКАРИОТАМ ОТНОСЯТСЯ:

1. аскомицеты

2. клостридии

3. плазмодии

4. грибы рода Candida

326.БАКТЕРИИ В КЛЕТОЧНОЙ СТЕНКЕ КОТОРЫХ СОДЕРЖИТСЯ МНОГОСЛОЙНЫЙ ПЕПТИДОГЛИКАН:

1. грамположительные

2. микоплазмы

3. кислотоустойчивые

4. уреоплазмы

327.БАКТЕРИИ В КЛЕТОЧНОЙ СТЕНКЕ КОТОРЫХ СОДЕРЖИТСЯ МНОГОСЛОЙНЫЙ ПЕПТИДОГЛИКАН:

1. грамположительные

2. неспорообразующие грамотрицательные

3. спорообразующие

4. неспорообразующие грамположительные

328.ЛИПОПОЛИСАХАРИД БАКТЕРИЙ:

1. входит в состав клеточной стенки грамотрицательных бактерий

2. входит в состав клеточной стенки грамположительных бактерий

3. эндотоксин

4. экзотоксин

5. О-антиген

329.ЛИПОПОЛИСАХАРИД ВХОДИТ В СОСТАВ КЛЕТОЧНОЙ СТЕНКИ:

1. сальмонелл

2. актиномицет

3. клостридий

4. нейссерий

5. эшерихий

330.МИКРОСКОПИЧЕСКИЙ МЕТОД ИНФОРМАТИВЕН ПРИ ДИАГНОСТИКЕ:

1. дизентерии

2. коклюша

3. туберкулеза

4. бруцеллеза

5. гонореи

6. малярии

331.СПОРЫ ОБРАЗУЮТ ВОЗБУДИТЕЛИ:

1. чумы

2. туляремии

3. бруцеллеза

4. сибирской язвы

5. столбняка

6. скарлатины

332.В ОСНОВУ КЛАССИФИКАЦИИ БАКТЕРИЙ ПОЛОЖЕНО:

1. строение клеточной стенки

2. наличие цитоплазматической мембраны

3. наличие жгутиков

4. наличие эндоспор

5. особенности строения генома

333.К СПИРОХЕТАМ ОТНОСЯТСЯ

1. лептоспиры

2. вибрионы

3. микоплазмы

4. трепонемы

334.МИКРООРГАНИЗМЫ, ЧАСТИЧНО ИЛИ ПОЛНОСТЬЮ УТРАТИВШИЕ КЛЕТОЧНУЮ СТЕНКУ ПОД ДЕЙСТВИЕМ ФАКТОРОВ ВНЕШНЕЙ СРЕДЫ:

1. прионы

2. протопласты

3. плазмодии

4. хламидии

5. сферопласты

6. Л-формы

335.БАКТЕРИИ, ИМЕЮЩИЕ МНОГО ЖГУТИКОВ ВОКРУГ КЛЕТКИ:

1. амфитрихи

2. перитрихи

3. спирохеты

4. микоплазмы

5. вибрионы

6. эшерихии

336.ДИПЛОКОККИ:

1. менингококки

2. гонококки

3. пневмококки

4. стафилококки

337.ДЛЯ ОКРАСКИ СПОР БАКТЕРИЙ ИСПОЛЬЗУЮТ:

1. Окраску по Нейссеру

2. Окраску по Граму

3. Окраску по Бурри-Гинсу

4. Окраску по Ауеске

5. Окраску по Цилю-Нельсену

338.СПОРООБРАЗУЮЩИЕ БАКТЕРИИ:

1. Salmonella typhi

2. Clostridium tetani

3. Bordetella pertussis

4. Clostridium botulinum

5. Bacillus anthracis

339.ИЗВИТЫЕ ФОРМЫ БАКТЕРИЙ:

1. актиномицеты

2. спириллы

3. боррелии

4. спирохеты

340.ТРЕПОНЕМЫ:

1. Имеют 10-12 мелких завитков

2. Имеют форму кокков

3. Грамположительны

4. Подвижны

5. Грамотрицательны

341.ДАЙТЕ ХАРАКТЕРИСТИКУ ПРОСТЕЙШИХ:

1. имеют ядро

2. относятся к эукариотам

3. относятся к прокариотам

4. окрашиваются по Романовскому-Гимзе

342.ГРИБЫ:

1. аскомицеты

2. мукор

3. кандида

4. клостридии

5. актиномицеты

6. пеницилл

343.ВЕТВЯЩИЕСЯ БАКТЕРИИ:

1. актиномицеты

2. спириллы

3. вибрионы

4. спирохеты

5. бифидобактерии

344.ДАЙТЕ ХАРАКТЕРИСТИКУ ПРОСТЕЙШИХ:

1. имеют ядро

2. относятся к эукариотам

3. имеют митохондрии

4. имеют 80S рибосомы

345.ФУНКЦИИ КЛЕТОЧНОЙ СТЕНКИ БАКТЕРИЙ:

1. Контакт с внешней средой

2. Участвует в обмене веществ

3. Защищает от действия внешних вредных факторов

4. Поддерживает постоянную форму

346.ПРИЗНАКИ ГРАМПОЛОЖИТЕЛЬНЫХ БАКТЕРИЙ:

1. В клеточной стенке есть тейхоевые кислоты

2. Некоторые могут образовывать споры

3. В клеточной стенке есть липотейхоевые кислоты

4. Отдельные представители кислотоустойчивы

347.ФУНКЦИИ ПИЛЕЙ (ВОРСИНОК, ФИМБРИЙ):

1. Адгезия бактерий к субстрату

2. Участие в передаче генов

3. Служат рецептором для бактериофагов

4. Являются антигенами

348.НЕ ИМЕЮТ КЛЕТОЧНОЙ СТЕНКИ:

1. Цисты амеб

2. Протопласты бактерий

3. Трофозоиты плазмодиев

4. Сферопласты бактерий

349.РЕВЕРСИЯ КЛЕТОЧНОЙ СТЕНКИ ВОЗМОЖНА У:

1. Микоплазм

2. Протопластов

3. Трепонем

4. Сферопластов

350.БАКТЕРИИ МОГУТ ПРЕВРАЩАТЬСЯ В L-ФОРМЫ ПОД ДЕЙСТВИЕМ:

1. Плазмид вирулентности

2. Антибиотиков

3. Конвертирующего бактериофага

4. Лизоцима

351.РЕАГЕНТЫ ДЛЯ ОКРАСКИ ПО ГРАМУ

1. Тушь

3. Водный фуксин

2. Этанол

4. Раствор Люголя

352.РЕАГЕНТЫ ДЛЯ ОКРАСКИ ПО ЦИЛЮ-НЕЛЬСЕНУ

1. Этанол

2. Метиленовый синий

3. Генциан фиолетовый

4. Карболовый фуксин

353.КЛЕТОЧНОЕ СТРОЕНИЕ ИМЕЮТ:

1 Бактерии

2 Вирусы

3 Прионы

4 Простейшие

5 Грибы

354.КОМПОНЕНТЫ КЛЕТКИ МИКРОБОВ-ЭУКАРИОТОВ:

1 Рибосомы 80s

2 Рибосомы 70s

3 Мезосомы

4 Митохондрии

5 Ядро

6 Нуклеоид

355.ЛПС ВХОДИТ В СОСТАВ КЛЕТОЧНОЙ СТЕНКИ БАКТЕРИЙ:

1 Стафилококков

2 Нейссерий

3 Шигелл

4 Клостридий

5 Актиномицетов

356.СТРУКТУРА БАКТЕРИЙ, СОДЕРЖАЩАЯ ЛПС:

1 Нуклеоид

2 Цитоплазма

3 Цитоплазматическая мембрана

4 Клеточная стенка грамотрицательных бактерий

5 Капсула

357.ГРАМПОЛОЖИТЕЛЬНЫЕ КОККИ:

1 Стафилококки

2 Стрептококки

3 Пептострептококки

4 Гонококки

5 Энтерококки

358.КЛЕТОЧНЫЕ ФОРМЫ МИКРОБОВ:

1 Прокариоты

2 Вирусы

3 Эукариоты

4 Грибы

5 Прионы

359.ПРОКАРИОТЫ ИМЕЮТ:

1 Клеточное строение

2 Оформленное ядро

3 Рибосомы

4 Митохондрии

5 Нуклеоид

360.ФУНКЦИИ ЛПС:

1 Антигенная

2 Генетическая

3 Токсическая

4 Репродуктивная

5 Репаративная

361.КОМПОНЕНТЫ КЛЕТОЧНОЙ СТЕНКИ ГРАМОТРИЦАТЕЛЬНЫХ МИКРООРГАНИЗМОВ:

1 Пептидогликан

2 Тейхоевые кислоты

3 Липополисахарид

4 Наружная мембрана

5 Стеролы

362.ГРАМПОЛОЖИТЕЛЬНЫЕ КОККИ:

1 Стафилококки

2 Стрептококки

3 Энтерококки

4 Пептострептококки

5 Пневмококки

363.К ИЗВИТЫМ БАКТЕРИЯМ ОТНОСЯТСЯ:

1 Микоплазмы

2 Боррелии

3 Актиномицеты

4 Трепонемы

5 Лептоспиры

364.ЭУКАРИОТЫ ИМЕЮТ:

1 Клеточное строение

2 Оформленное ядро

3 Рибосомы

4 Митохондрии

5 Нуклеоид

365.КОМПОНЕНТЫ БАКТЕРИАЛЬНОЙ (ПРОКАРИОТИЧЕСКОЙ) КЛЕТКИ:

1 Рибосомы 80s

2 Пептидогликан

3 ЦПМ

4 Митохондрии

5 Нуклеоид

366.ЛИПОПОЛИСАХАРИД КЛЕТОЧНОЙ СТЕНКИ:

1 Является эндотоксином

2 Является О-антигеном

3 Является колицином

4 Состоит из липида А, ядра ЛПС и О-специфической части

5 Содержится только у грамотрицательных бактерий

367.В СОСТАВЕ КЛЕТОЧНОЙ СТЕНКИ ГРАМПОЛОЖИТЕЛЬНЫХ БАКТЕРИЙ ИМЕЮТСЯ:

1 Пептидогликан

2 Стеролы

3 Липополисахарид

4 Тейхоевые кислоты

5 Наружная мембрана

368.АКТИНОМИЦЕТЫ – ЭТО:

1 Грибы

2 Извитые бактерии

3 Ветвящиеся бактерии

4 Простейшие

5 Гельминты

6 Прокариоты

369.ВИРУСЫ:

1 Не имеют клеточного строения

2 Содержат один тип нуклеиновой кислоты

3 Размножаются бинарным делением

4 Растут на сложных питательных средах

5 Имеют нуклеокапсид

370.КОККИ – ВОЗБУДИТЕЛИ:

1 Чумы

2 Эпидемического цереброспинального менингита

3 Сифилиса

4 Гонореи

5 Скарлатины

371.НЕКЛОСТРИДИАЛЬНЫЕ ОБЛИГАТНЫЕ АНАЭРОБЫ:

1 Стафилококки

2 Бактероиды

3 Пептококки

4 Нейссерии

5 Пептострептококки

372.СПОРООБРАЗУЮЩИЕ БАКТЕРИИ:

1 Salmonella typhi

2 Clostridium tetani

3 Bordetella pertussis

4 Bacillus anthracis

5 Vibrio cholerae

373.ЗАБОЛЕВАНИЯ, ВЫЗЫВАЕМЫЕ ПРОСТЕЙШИМИ:

1 Токсоплазмоз

2 Гонорея

3 Актиномикоз

4 Малярия

5 Амебиаз

6 Кандидоз

374.СПОРЫ ОБРАЗУЮТ ВОЗБУДИТЕЛИ:

1 Чумы

2 Хламидиоза

3 Сибирской язвы

4 Бруцеллеза

5 Столбняка

375.ГРАМОТРИЦАТЕЛЬНЫЕ ПАЛОЧКИ – ВОЗБУДИТЕЛИ:

1 Чумы

2 Холеры

3 Сибирской язвы

4 Дифтерии

5 Шигеллеза

376.НЕСПОРООБРАЗУЮЩИЕ ОБЛИГАТНЫЕ АНАЭРОБЫ:

1 Бактероиды

2 Фузобактерии

3 Пептококки

4 Клостридии

5 Вибрионы

377.ЗАБОЛЕВАНИЯ, ВЫЗЫВАЕМЫЕ ПРОСТЕЙШИМИ:

1 Трипаносомоз

2 Лейшманиоз

3 Трихомониаз

4 Лептоспироз

5 Кандидоз

378.ЗАБОЛЕВАНИЯ, ВЫЗЫВАЕМЫЕ ПРОСТЕЙШИМИ:

1 Сальмонеллез

2 Трихомониаз

3 Кандидоз

4 Малярия

5 Микоплазмоз

379.ПРОКАРИОТЫ ИМЕЮТ:

1 Клеточную стенку

2 Митохондрии

3 Нуклеоид

4 Рибосомы

5 Аппарат Гольджи

380.К ИЗВИТЫМ БАКТЕРИЯМ ОТНОСЯТСЯ:

1 Трепонемы

2 Бифидобактерии

3 Актиномицеты

4 Спириллы

5 Спирохеты

381.ЛИПОПОЛИСАХАРИД КЛЕТОЧНОЙ СТЕНКИ:

1 Является эндотоксином

2 Является О-антигеном

3 Является Н-антигеном

4 Является колицином

5 Имеется только у грамположительных бактерий

382.ВИРУСЫ:

1 Не имеют клеточного строения

2 Содержат один тип нуклеиновой кислоты

3 Содержат пептидогликан

4 Имеют нуклеоид

5 Имеют нуклеокапсид

383.ЛПС ВХОДИТ В СОСТАВ КЛЕТОЧНОЙ СТЕНКИ:

1 Вибрионов

2 Клостридий

3 Нейссерий

4 Стафилококков

5 Актиномицет

384.ОКРАСКУ ПО ЦИЛЮ-НЕЛЬСЕНУ ПРИМЕНЯЮТ ДЛЯ ВЫЯВЛЕНИЯ:

1 Спирохет

2 Микобактерий туберкулеза

3 Стафилококков

4 Кислотоустойчивых бактерий

5 Клостридий

385. ПРОКАРИОТЫ ОТЛИЧАЮТСЯ:

1 Наличием митохондрий

2 Наличием пептидогликана

3 Наличием рибосом 70S

4 Наличием хитина

386.К ГРИБАМ ОТНОСЯТСЯ:

1 Микроспоридии

2 Аскомицеты

3 Дрожжи

4 Актиномицеты

5 Боррелии

387.ГРИБЫ РОДА CANDIDA:

1 Представители нормальной микрофлоры

2 Вызывают поражение слизистых оболочек

3 Относятся к гифальным грибам

4 Относятся к зигомицетам

388.ВОЗБУДИТЕЛЕЙ МАЛЯРИИ ДИФФЕРЕНЦИРУЮТ С УЧЕТОМ:

1 Количества мерозоитов в стадии деления паразита

2 Количества и форм трофозоитов

3 Особенностей эритроцитов

4 Формы гамонтов

389.ЗАБОЛЕВАНИЯ, ВЫЗЫВАЕМЫЕ ПРОСТЕЙШИМИ:

1 Сальмонеллез

2 Трихомониаз

3 Кандидоз

4 Малярия

5 Микоплазмоз

390.ГРАМПОЛОЖИТЕЛЬНЫЕ МИКРООРГАНИЗМЫ:

1 Клостридии

2 Сальмонеллы

3 Спирохеты

4 Лактобактерии

391.ОБРАЗОВАНИЕ ЭНДОСПОР У БАКТЕРИЙ СТИМУЛИРУЮТ:

1 Недостаток питательных веществ

2 Изменение температуры окружающей среды

3 Изменение кислотности окружающей среды

4 Попадание в организм человека

5 Изменение газового состава атмосферы

6 Попадание в организм животного

392.СВОЙСТВА СПИРОХЕТ:

1 Извитая форма клетки

2 Подвижны

3 Имеют периплазматические жгутики (фибриллы)

4 Грамотрицательны

5 Образуют споры

6 Перитрихи

7 Ветвящиеся бактерии

393.РИККЕТСИИ:

1 Облигатные внутриклеточные паразиты

2 Прокариоты

3 Грамотрицательны

4 Имеют один тип нуклеиновой кислоты

5 Относятся к вирусам

6 Не имеют клеточного строения

394.БАКТЕРИИ, У КОТОРЫХ ОТСУТСТВИЕ КЛЕТОЧНОЙ СТЕНКИ ВСЕГДА ДЕТЕРМИНИРОВАНО ГЕНЕТИЧЕСКИ:

1 Протопласты

2 Хламидии

3 Сферопласты

4 Микоплазмы

5 Риккетсии

6 Вироиды

7 Уреаплазмы

395.ПРИЗНАКИ ГРИБОВ:

1 Отсутствует хлорофилл

2 Могут образовывать мицелий

3 Содержат стеролы в цитоплазматической мембране

4 Прокариоты

5 Основа клеточной стенки — пептидогликан

6 Образуют споры

7 Имеют нуклеоид

396.БАКТЕРИИ БЕЗ КЛЕТОЧНОЙ СТЕНКИ:

1 Амфитрихи

2 Спирохеты

3 Микоплазмы

4 Хлоропласты

5 Л-формы

6 Протопласты

7 Сферопласты

397.БАКТЕРИИ БЕЗ КЛЕТОЧНОЙ СТЕНКИ

1. Микоплазмы

2. Хлоропласты

3. L-формы

4. Протопласты

5. Сферопласты

398.БАКТЕРИИ БЕЗ КЛЕТОЧНОЙ СТЕНКИ:

1. Микоплазмы

2. L-формы

3. Протопласты

4. Сферопласты

399.МИКРОБЫ, НЕ ИМЕЮЩИЕ КЛЕТОЧНОГО СТРОЕНИЯ:

1 Прокариоты

2 Порины

3 Простейшие

4 Прионы

5 Вироиды

6 Вирусы

7 Микоплазмы

8 Бактериофаги

400.МИКРОБЫ, НЕ ИМЕЮЩИЕ КЛЕТОЧНОГО СТРОЕНИЯ:

1. Порины

2. Прионы

3. Вироиды

4. Вирусы

5. Бактериофаги

401.МИКРОБЫ, НЕ ИМЕЮЩИЕ КЛЕТОЧНОГО СТРОЕНИЯ:

1. Прокариоты

2. Вирусы

3. Эукариоты

4. Прионы

402.МИКРОБЫ, НЕ ИМЕЮЩИЕ КЛЕТОЧНОГО СТРОЕНИЯ:

1. Прокариоты

2. Простейшие

3. Прионы

4. Микоплазмы

5. Бактериофаги

403.ПРИЗНАКИ ГРАМПОЛОЖИТЕЛЬНЫХ БАКТЕРИЙ:

1 В клеточной стенке имеются тейхоевые кислоты

2 Некоторые могут образовывать споры

3 Основной компонент клеточной стенки — пептидогликан

4 Отдельные представители кислотоустойчивы

5 В состав клеточой стенки входит наружная мембрана

6 Не содержат пептидогликан

404.ПРИЗНАКИ ГРАМПОЛОЖИТЕЛЬНЫХ БАКТЕРИЙ:

1 В клеточной стенке имеются тейхоевые кислоты

2 Некоторые могут образовывать споры

3 Основной компонент клеточной стенки — пептидогликан

4 Отдельные представители кислотоустойчивы

405.ПРИЗНАКИ ГРАМПОЛОЖИТЕЛЬНЫХ БАКТЕРИЙ:

1 В клеточной стенке имеются тейхоевые кислоты

2 Некоторые могут образовывать споры

3 Основной компонент клеточной стенки — липополисахарид

4 Отдельные представители кислотоустойчивы

406.ПРИЗНАКИ ГРАМОТРИЦАТЕЛЬНЫХ БАКТЕРИЙ:

1 В клеточной стенке имеются тейхоевые кислоты

2 В состав клеточой стенки входит наружная мембрана

3 Не содержат тейхоевые кислоты

4 Отдельные представители кислотоустойчивы

5 Не содержат пептидогликан

407.ПРИЗНАКИ ГРАМОТРИЦАТЕЛЬНЫХ БАКТЕРИЙ:

1 В клеточной стенке имеются липотейхоевые кислоты

2 Содержат миколовые кислоты

3 Клеточная стенка имеет функцию эндотоксина

4 Клеточная стенка имеет функцию О-антигена

5 В состав клеточой стенки входит наружная мембрана

408.ГРАМОТРИЦАТЕЛЬНЫЕ БАКТЕРИИ:

1 Нейссерии

2 Эшерихии

3 Вибрионы

4 Стрептококки

5 Энтерококки

409.ФУНКЦИИ ЛПС:

1 Антигенная

2 Ферментативная

3 Токсическая

4 Секреторная

410.ГРАМОТРИЦАТЕЛЬНЫЕ БАКТЕРИИ:

1 Нейссерии

2 Эшерихии

3 Вибрионы

4 Хламидии

5 Риккетсии

6 Трепонемы

411.ФУНКЦИИ ЛПС:

1 Антигенная

2 Генетическая

3 Токсическая

4 Секреторная

5 Антимикробная

412.ГРАМПОЛОЖИТЕЛЬНЫЕ БАКТЕРИИ:

1 Бациллы

2 Пневмококки

3 Вибрионы

4 Стрептококки

5 Энтерококки

413.ГРАМПОЛОЖИТЕЛЬНЫЕ БАКТЕРИИ:

1 Нейссерии

2 Клостридии

3 Микобактерии

4 Кандиды

5 Микоплазмы

6 Боррелии

414.ГРАМОТРИЦАТЕЛЬНЫЕ БАКТЕРИИ:

1 Нейссерии

2 Эшерихии

3 Вибрионы

4 Стрептококки

5 Бациллы

6 Трепонемы

7 Клостридии

415.ФУНКЦИИ ЛПС:

1 Антигенная

2 Ферментативная

3 Токсическая

4 Секреторная

5 Генетическая

6 Мутагенная

7 Репаративная

416.УСТОЙЧИВОСТЬ МИКОБАКТЕРИЙ К КИСЛОТАМ, ЩЕЛОЧАМ И СПИРТАМ ОБУСЛОВЛЕНА ВЫСОКИМ СОДЕРЖАНИЕМ В КЛЕТОЧНОЙ СТЕНКЕ:

1 Пептидогликана

2 Тейхоевых кислот

3 Пептидных мостиков

4 Восков и липидов

5 Миколовых кислот

6 Дипиколината кальция

7 Волютина

417.СВОЙСТВА ХЛАМИДИЙ:

1 Грамотрицательные бактерии

2 Имеют извитую форму

3 Облигатные внутриклеточные паразиты

4 Не имеют клеточного строения

5 Эукариоты

6 Культивируются на простых питательных средах

418.МИКРОБЫ, У КОТОРЫХ В КЛЕТОЧНОЙ СТЕНКЕ СОДЕРЖИТСЯ ПЕПТИДОГЛИКАН:

1 Грамотрицательные бактерии

2 Актиномицеты

3 Грамположительные бактерии

4 Кандиды

5 Аспергиллы

6 Пенициллы

419.ЗЕРНА ВОЛЮТИНА:

1 Цитоплазматические включения

2 Окрашиваются по Ауеске

3 Окрашиваются по Нейссеру

4 Отличаются метахромазией

5 Содержат пептидогликан

6 Являются мезосомами

420.ИЗВИТЫЕ ФОРМЫ БАКТЕРИЙ:

1 Актиномицеты

2 Спириллы

3 Микобактерии

4 Микоплазмы

5 Трепонемы

6 Боррелии

7 Лептоспиры

8 Вибрионы

421.МЕТОДЫ ИЗУЧЕНИЯ ПОДВИЖНОСТИ ЖИВЫХ БАКТЕРИЙ:

1 Окраска по Граму

2 Микроскопия в тёмном поле

3 Электронная микроскопия

4 Окраска по Леффлеру

5 С помощью стереоскопической лупы

6 В нативном препарате «висячая капля»

422.СТРУКТУРНЫЕ ОСОБЕННОСТИ ПРОКАРИОТОВ:

1 Константа седиментации рибосом 70S

2 Имеется нуклеоид

3 Имеется аппарат Гольджи

4 Отсутствует ядерная мембрана

5 Имеется нуклеокапсид

6 Имеются митохондрии

7 Имеются мезосомы

423.НУКЛЕОИД БАКТЕРИЙ:

1 Содержит 2-3 ядрышка

2 Двунитевая ДНК замкнута в кольцо

3 Не имеет ядерной оболочки

4 Содержит пептидогликан

5 Содержит гистоны

6 Содержит рибосомы

7 Состоит из одной нити ДНК

424.ПРИЗНАКИ ГРАМОТРИЦАТЕЛЬНЫХ БАКТЕРИЙ:

1 Клеточная стенка имеет наружную мембрану

2 Клеточная стенка содержит пептидогликан

3 Клеточная стенка содержит тейхоевые кислоты

4 Имеется периплазматическое пространство

5 Клеточная стенка содержит ЛПС

6 Клеточная стенка содержит мезосомы

425.ВЕТВЯЩИЕСЯ БАКТЕРИИ:

1 Актиномицеты

2 Спириллы

3 Бифидобактерии

4 Спирохеты

5 Вибрионы

6 Аспергиллы

426.ПРОСТЕЙШИЕ:

1 Имеют клеточное строение

2 Относятся к эукариотам

3 Образуют споры

4 Одноклеточные

5 Окрашиваются по Романовскому-Гимзе

6 Размножаются дизъюнктивно

427.ТРЕПОНЕМЫ:

1 Имеют 10-12 мелких завитков

2 Имеют форму кокков

3 Относятся к спирохетам

4 Грамотрицательны

5 Подвижны

6 Перитрихи

428.ЭУКАРИОТЫ:

1 Простейшие

2 Эубактерии

3 Грибы

4 Прионы

5 Эубиотики

6 Энтерококки

429.ГРАМОТРИЦАТЕЛЬНЫЕ БАКТЕРИИ:

1 Риккетсии

2 Микоплазмы

3 Хламидии

4 Нейссерии

5 Трепонемы

6 Пневмококки

430.ЗАБОЛЕВАНИЯ, ВЫЗЫВАЕМЫЕ ПРОСТЕЙШИМИ:

1 Токсоплазмоз

2 Гонорея

3 Актиномикоз

4 Кандидоз

5 Трихомониаз

6 Балантидиаз

7 Шигеллез

8 Амебиаз

9 Трихофития

431.СВОЙСТВА ХЛАМИДИЙ:

1 Грамположительные бактерии

2 Имеют сложный цикл развития

3 Облигатные внутриклеточные паразиты

4 Не имеют клеточного строения

5 Эукариоты

432.СВОЙСТВА ХЛАМИДИЙ:

1 Грамотрицательные бактерии

2 Имеют сложный цикл развития

3 Существуют в виде элеменарных телец

4 Существуют в виде ретикулярных телец

5 Прокариоты

433.СВОЙСТВА ХЛАМИДИЙ:

1 Грамположительные бактерии

2 Имеют сложный цикл развития

3 Существуют в виде элеменарных телец

4 Внутриклеточная форма называется вирион

5 Существуют в виде телец Пашена

434.СВОЙСТВА ХЛАМИДИЙ:

1 Грамотрицательные бактерии

2 Внутри клетки образует ретикулярные тельца

3 Внеклеточная форма – элементарные тельца

4 Внутриклеточная форма называется вирион

5 Относится к неклеточным формам жизни

435.МИКРОБЫ, У КОТОРЫХ В КЛЕТОЧНОЙ СТЕНКЕ СОДЕРЖИТСЯ ПЕПТИДОГЛИКАН:

1 Грамотрицательные бактерии

2 Актиномицеты

3 Грамположительные бактерии

4 Микобактерии

5 Микоплазмы

436.ЗЕРНА ВОЛЮТИНА:

1 Цитоплазматические включения

2 Окрашиваются по Ауеске

3 Окрашиваются по Нейссеру

4 Отличаются метахромазией

5 Содержат дипиколинат кальция

437.ЗЕРНА ВОЛЮТИНА:

1 Цитоплазматические включения

2 Защищают от фагоцитоза

3 Окрашиваются по Нейссеру

4 Отличаются метахромазией

5 Содержат полифосфаты

438.ЗЕРНА ВОЛЮТИНА:

1 Цитоплазматические включения

2 Защищают от фагоцитоза

3 Окрашиваются по Нейссеру

4 Придают бактериям кислотоустойчивость

5 Содержат полифосфаты

439.ЗЕРНА ВОЛЮТИНА:

1 Цитоплазматические включения

2 Обнаруживают у коринебактерий дифтерии

3 Окрашиваются по Нейссеру

4 Отличаются метахромазией

5 Содержат полифосфаты

440.ИЗВИТЫЕ ФОРМЫ БАКТЕРИЙ:

1 Актиномицеты

2 Спириллы

3 Трепонемы

4 Боррелии

5 Лептоспиры

6 Спирохеты

441.ИЗВИТЫЕ ФОРМЫ БАКТЕРИЙ:

1 Актиномицеты

2 Спириллы

3 Микобактерии

4 Микоплазмы

5 Спирохеты

442.МЕТОДЫ ИЗУЧЕНИЯ ПОДВИЖНОСТИ ЖИВЫХ БАКТЕРИЙ:

1 В нативном препарате «висячая капля»

2 Микроскопия в тёмном поле

3 Электронная микроскопия

4 В нативном препарате «раздавленная капля»

5. С помощью стереоскопической лупы

443.СТРУКТУРНЫЕ ОСОБЕННОСТИ ПРОКАРИОТОВ:

1 Константа седиментации рибосом 80S

2 Имеется нуклеоид

3 Имеются мезосомы

4 Отсутствует ядерная мембрана

5 Имеется нуклеокапсид

6 Имеются митохондрии

444.НУКЛЕОИД БАКТЕРИЙ:

1 Содержит 2-3 ядрышка

2 Двунитевая ДНК замкнута в кольцо

3 Не имеет ядерной оболочки

4 Содержит пептидогликан

5 Содержит гистоны

6. Имеет гаплоидный набор генов

445.ПРИЗНАКИ ГРАМОТРИЦАТЕЛЬНЫХ БАКТЕРИЙ:

1 Клеточная стенка имеет наружную мембрану

2 Клеточная стенка содержит пептидогликан

3 Клеточная стенка содержит липотейхоевые кислоты

4 Имеется периплазматическое пространство

5 Клеточная стенка содержит ЛПС

6 Бактериальная клетка содержит нуклеокапсид

446.ВЕТВЯЩИЕСЯ БАКТЕРИИ:

1 Актиномицеты

2 Спириллы

3 Бифидобактерии

4 Стрептомицеты

5 Аспергиллы

447.ПРОСТЕЙШИЕ:

1 Имеют клеточное строение

2 Относятся к прокариотам

3 Могут образовывать цисты

4 Одноклеточные

5 Могут иметь сложный цикл развития

6 Размножаются дизъюнктивно

448.ПРОСТЕЙШИЕ:

1 Имеют клеточное строение

2 Относятся к эукариотам

3 Образуют споры в неблагоприятных условиях

4 Многоклеточные

5 Могут иметь сложный цикл развития

6 Размножаются дизъюнктивно

449.ТРЕПОНЕМЫ:

1 Имеют 3-8 крупных завитков

2 Имеют фибриллы

3 Относятся к спирохетам

4 Грамотрицательны

5 Подвижны

450.ЭУКАРИОТЫ:

1 Простейшие

2 Эубактерии

3 Грибы

4 Архебактерии

5 Эубиотики

451.ГРАМОТРИЦАТЕЛЬНЫЕ БАКТЕРИИ:

1 Риккетсии

2 Лептоспиры

3 Хламидии

4 Легионеллы

5 Трепонемы

6 Боррелии

452.ЗАБОЛЕВАНИЯ, ВЫЗЫВАЕМЫЕ ВИРУСАМИ:

1 Ящур

2 Паротит

3 Полиомиелит

4 Клещевой энцефалит

5 Сибирская язва

6 Ветряная оспа

453.ЗАБОЛЕВАНИЯ, ВЫЗЫВАЕМЫЕ ВИРУСАМИ:

1 Ящур

2 Мелиоидоз

3 Сап

4 Натуральная оспа

5 Сибирская язва

6 Чума

454.ЗАБОЛЕВАНИЯ, ВЫЗЫВАЕМЫЕ ВИРУСАМИ:

1 Цитомегалия

2 Синдром ошпаренной кожи

3 Синдром хронической усталости

4 Бешенство (гидрофобия)

5 Гистоплазмоз

6 Туляремия

455.ГРИБЫ РАЗМНОЖАЮТСЯ:

1 Дизъюнктивно

2 Вегетативно

3 Спорами

4 Фрагментацией мицелия

5 Бинарным делением

6 Половым путём

7 Бесполым путём

456.СПИРОХЕТЫ:

1 Имеют форму запятой

2 Грамотрицательные бактерии

3 Подвижны

4 Имеют жгутики

5 Размножаются дизъюнктивно

6 Относятся к извитым бактериям

7 Плохо окрашиваются анилиновыми красителями

8 Амфитрихи

457.МИКОПЛАЗМЫ:

1 Грамотрицательные бактерии

2 Образуют споры

3 Относятся к Л-формам бактерий

4 Устойчивы к пенициллину

5 Лишены клеточной стенки

6 Вызывают микоплазмозы

7 Содержат стеролы в составе ЦПМ

8 Вызывают микобактериозы

9 Вызывают актиномикозы

458.ЗАБОЛЕВАНИЯ, ВЫЗЫВАЕМЫЕ ГРИБАМИ:

1 Пенициллиоз

2 Аспергиллез

3 Стафилококкоз

4 Трихофития

5 Криптококкоз

6 Криптоспоридиоз

459.ЗАБОЛЕВАНИЯ, ВЫЗЫВАЕМЫЕ ПРОСТЕЙШИМИ:

1 Малярия

2 Лейшманиоз

3 Иерсиниоз

4 Лептоспироз

5 Трихомониаз

6 Балантидиаз

7 Сальмонеллёз

8 Легионеллёз

460.НЕКЛЕТОЧНЫЕ ФОРМЫ ЖИЗНИ:

1 Вирусы

2 Вироиды

3 Прионы

4 Порины

5 Бактериофаги

6 Эубактерии

7 Архебактерии

461.ЗАБОЛЕВАНИЯ, ВЫЗЫВАЕМЫЕ ГРИБАМИ:

1 Токсоплазмоз

2 Гонорея

3 Актиномикоз

4 Лепра

5 Кандидоз

6 Мукороз

462.ЗАБОЛЕВАНИЯ, ВЫЗЫВАЕМЫЕ ГРИБАМИ:

1 Микотоксикоз

2 Микобактериоз

3 Микоплазмоз

4 Актиномикоз

5 Афлатоксикоз

6 Микроспория

463.ЗАБОЛЕВАНИЯ, ВЫЗЫВАЕМЫЕ ГРИБАМИ:

1 Микобактериоз

2 Дерматомикозы

3 Онихомикозы

4 Системные микозы

5 Поверхностные микозы

6 Микоплазмоз

464.ЗАБОЛЕВАНИЯ, ВЫЗЫВАЕМЫЕ ГРИБАМИ:

1 Пенициллиоз

2 Аспергиллез

3 Стафилококкоз

4 Трихофития

5 Криптококкоз

6 Криптоспоридиоз

465.ЗАБОЛЕВАНИЯ, ВЫЗЫВАЕМЫЕ ПРОСТЕЙШИМИ:

1 Малярия

2 Лейшманиоз

3 Иерсиниоз

4 Лептоспироз

5 Трихомониаз

6 Балантидиаз

7 Сальмонеллёз

8 Легионеллёз

466.НЕКЛЕТОЧНЫЕ ФОРМЫ ЖИЗНИ:

1 Вирусы

2 Вироиды

3 Прионы

4 Порины

5 Бактериофаги

6 Эубактерии

7 Архебактерии

467.ГРИБЫ РАЗМНОЖАЮТСЯ:

1 Дизъюнктивно

2 Вегетативно

3 Спорами

4 Фрагментацией мицелия

5 Бинарным делением

6 Половым путём

7 Бесполым путём

468.СПИРОХЕТЫ:

1 Имеют форму запятой

2 Грамотрицательные бактерии

3 Подвижны

4 Имеют жгутики

5 Размножаются дизъюнктивно

6 Относятся к извитым бактериям

7 Плохо окрашиваются анилиновыми красителями

8 Амфитрихи

469.МИКОПЛАЗМЫ:

1 Грамотрицательные бактерии

2 Образуют споры

3 Относятся к Л-формам бактерий

4 Устойчивы к пенициллину

5 Лишены клеточной стенки

6 Вызывают микоплазмозы

7 Содержат стеролы в составе ЦПМ

8 Вызывают микобактериозы

9 Вызывают актиномикозы

470.МИКОБАКТЕРИИ:

1 Грамположительные бактерии

2 Образуют споры

3 Относятся к Л-формам бактерий

4 Устойчивы к кислотам и щелочам

5 Лишены клеточной стенки

6 Вызывают микоплазмозы

7 Вызывают туберкулез

8 Вызывают микобактериозы

9 Вызывают актиномикозы

Сравнение вакцин от коронавируса, ВИЧ и рака

Проверка фейков в рамках партнерства с Facebook

Пользователи фейсбуке распространяют сообщения, в которых сравнивают вакцины от коронавируса, ВИЧ (вирус иммунодефицита человека) и рака. «После 100 лет рака все еще не существует вакцины от рака. После 40 лет СПИДа все еще не существует вакцины от СПИДа. Зато есть вакцина после 10 месяцев COVID-19», — говорится в подписи на картинке.

Эту манипуляцию массово распространяли в англоязычном сегменте соцсетей вскоре после того, как Moderna, AstraZeneca и Pfizer-BioNTech объявили об успешных клинических испытаниях своих препаратов. То есть примерно за 10 месяцев после начала пандемии, как говорится в тексте изображения. Похожие манипуляции уже опровергали независимые иностранные фактчекеры из Reuters.

В подобных сообщениях рак неправильно относят к инфекционным заболеваниям, от которых защищают вакцины. В отличие от СПИДа, который вызывает ВИЧ, или COVID-19, который вызывает вирус SARS-CoV-2, рак обычно вызывают не вирусы или бактерии.

В Стэнфордском университете объясняют, что нет единой причины развития рака. Он возникает в результате взаимодействия многих факторов, например, генетики человека, экологии и других.

Однако существует несколько вирусов, которые повышают риск появления рака: вирус Эпштейна-Барре, вирус гепатита В, вирус гепатита С, ВИЧ, вирус герпеса человека 8 типа, вирус папилломы человека (ВПЧ) и вируса Т-клеточного лейкоза человека. Вакцина против ВПЧ может уменьшить риск возникновения рака шейки матки, а вакцина против гепатита В — рака печени.

Относительно бактерий – длительная инфекция желудка из-за бактерий хеликобактер пилори (Helicobacter pylori) может вызвать язвы, которые со временем могут привести к раку. А заражения хламидиями вида Chlamydia trachomatis, передающихся половым путем, может увеличить риск возникновения рака шейки матки. Пока от этих инфекций нет вакцин, но ведется их разработка (здесь и здесь).

Изобрести вакцину от ВИЧ очень сложно, поскольку вирус быстро мутирует и уникальным способом обходит иммунную систему человека. Вакцины обычно содержат инактивированные или ослабленные вирусы. Но во время клинических испытаний инактивированный ВИЧ не вызвал иммунный ответ у пациентов, а использовать живую форму вируса слишком опасно.

Кстати, сейчас исследуют вакцину от ВИЧ, разработанную по той же мРНК-технологии, что и вакцины Pfizer и Moderna. мРНК должна активировать иммунную систему, чтобы она отвечала на ВИЧ.

Вакцины против COVID-19 необходимо было разработать в сжатые сроки, поскольку инфекция распространялась массово и неконтролируемо, а национальные системы здравоохранения оказались под большим давлением.

Относительно быстро разработать вакцину от COVID-19 помогли беспрецедентные финансовые инвестиции и научное сотрудничество, объясняют в ВОЗ. Они позволили проводить некоторые этапы разработки и испытаний параллельно, что и ускорило процесс. Например, в некоторых клинических испытаниях оценивали несколько вакцин одновременно, хотя стандартов безопасности все равно соблюдались.

Лаборатория молекулярной биологии

Под руководством академика Лапина Б.А. и в.н.с. Чикобава М.Г. защищена кандидатская диссертация Агумава А.А. по специальности вирусология на тему «Характеристика цитомегаловируса у представителей отряда приматов» Диссертационная работа посвящена, разработке ПЦР тест-системы для выявления ЦМВ, мониторингу цитомегаловируса у обезьян Адлерского питомника и сотрудников Института Медицинской Приматологии, а так же филогенетическому анализу цитомегаловирусов (по генуUL56) выявленных в ПЦР у людей и разных видов обезьян. В работе изучались возможности межвидовой трансмиссии вируса

В результате проведенных в 2006-2016гг. исследований получены научные результаты, имеющие не только научное, но и практическое значение:

Разработаны RT-ПЦР тест системы для детекции вирусов: SV40, BKV, JCV, EMC, CMV
Сотрудниками лаборатории разработан эффективный, экспресс метод выделения НК из тканей заключённых в парафиновые блоки, исключающий использование толуола и других, канцерогенных и опасных для здоровья веществ.
На примере проведения детекции вирусов с низкой нагрузкой в крови методом RT-ПЦР установлено, что чувствительность метода зависит не только от качества пробоподготовки и эффективности экстракции нуклеиновых кислот, но так же в первую очередь от правильно подобранных концентраций реактивов, температурного режима амплификации, и в большей степени от качества, используемого в реакции фермента Taq-полимеразы.Установлено что скорость деградации ДНК в водном растворе изменяется по экспоненте со временем, а так же имеет положительную обратную связь с увеличением температуры раствора и повышением объёмной плотность световой энергии.
При плановом исследовании полиомавирусов выявлено, что в крови здоровых людей так же как и в крови людей с онкозаболеваниями вирусная нагрузка по SV40 чрезвычайно низкая (в среднем 1 вирусная копия на 5000 клеток), процент обнаружения вируса от 14 до 33%.Процент детекции SV40 в опухолях мозга довольно высокий от 8 до 50%, в сред-нем 30%, при низкой вирусной нагрузке (1 вирусная копия на 100 – 10000 клеток).
Создана трансляционная модель алкогольной зависимости у лабораторных макак резус.

Сравнение строения клеток бактерий, растений и животных

Сравнение строения клеток бактерий, растений и животных

Клеточная структура	Функция	Бактерии	Растения	Животные
Ядро	Хранение наследственной информации, синтез РНК	Нет	Есть	Есть
Клеточная мембрана	Выполняет барьерную, транспортную, матричную, механическую, рецепторную, энергетическую, ферментативную и маркировочную функции	Есть	Есть	Есть
Капсула	Предохраняет бактерии от повреждений и высыхания. Создаёт дополнительный осмотический барьер и является источником резервных веществ. Препятствует фагоцитозу бактерий	Есть	Нет	Нет
Клеточная стенка	Полисахаридная оболочка над клеточной мембраной, через неё происходит регуляция воды и газов в клетке. Не проницаема даже для мелких молекул. Не препятствует диффузному движению	Есть	Есть	Нет
Контакты между клетками	Связывание между собой клеток ткани. Транспорт веществ между клетками.	Нет	Плазмодесмы	Десмосомы
Хромосома	Нуклеопротеиновый комплекс, содержащий ДНК, а также гистоны и гистоноподобные белки	Нуклеоид	Есть	Есть
Плазмиды	Хранение геномной информации, которая кодирует ферменты, которые разрушают антибиотики, тем самым позволяют избегать их губительного воздействия	Есть	Нет	Нет
Цитоплазма	Содержит в себе органеллы клетки и равномерно распределяет питательные вещества по клетке.	Есть	Есть	Есть
Митохондрии	Органоиды, принимающие участие в превращении энергии в клетке. Имеют внутренние мембраны, на которых осуществляется синтез АТФ	Нет	Есть	Есть
Аппарат Гольджи	Производит синтез сложных белков, полисахаридов, их накопление и секрецию	Нет	Есть	Есть
Эндоплазматический ретикулум	Выполняет синтез и обеспечивает транспорт белков и липидов	Нет	Есть	Есть
Рибосомы	Органоиды, состоящие из двух субъединиц, осуществляют синтез белка (трансляцию).	Есть	Есть	Есть
Центриоль	Во время деления клетки образует веретено деления	Нет	Нет	Есть
Пластиды	Двухмембранные структуры, в которых происходят реакции фотосинтеза (хлоропласты), происходит накопление крахмала (лейкопласты), придают окраску плодам и цветкам (хромопласты)	Нет	Есть	Нет
Лизосомы	Производят расщепление различных органических веществ	Нет	Есть	Есть
Пероксисомы	Производят синтез и транспорт белков и липидов	Нет	Есть	Есть
Вакуоли	Накапливают клеточный сок. Для перемещения бактериальных клеток в толще воды. Поддерживает напряжённое состояние оболочек клеток	Нет	Есть	Нет
Цитоскелет	Опорно-двигательная система клетки. Изменения в белках цитоскелета приводят к изменению формы клетки и расположению в ней органоидов.	Бывает	Есть	Есть
Мезосомы	Артефакты, возникающие во время подготовки образцов для электронной микроскопии	Есть	Нет	Нет
Пили	Служат для прикрепления бактериальной клетки к различным поверхностям	Есть	Нет	Нет
Органеллы для перемещения	Служат для перемещения в пространстве (реснички, жгутики и др.)	Есть	Нет	Есть

Wikimedia Foundation. 2010.

Солнечногорский район Московской области
Кубинка

Полезное

Смотреть что такое «Сравнение строения клеток бактерий, растений и животных» в других словарях:

Сравнение строения клеток бактерий — Сравнение строения клеток бактерий, растений и животных Клеточная структура Функция Бактерии Растения Животные Ядро Хранение наследственной информации, синтез РНК Нет Есть Есть Хромосома Наследственный материал, состоящий из линейной ДНК Нет Есть … Википедия
Клетка — У этого термина существуют и другие значения, см. Клетка (значения). Клетки крови человека (РЭМ) … Википедия
История создания клеточной теории — Клетки эпителия. Клеточная теория одно из общепризнанных биологических обобщений, утверждающих единство принципа строения и развития мира растений и мира животных, в котором клетка рассматривается в качестве общего структурного элемента… … Википедия
Клеточная теория — Клетки эпителия. Клеточная теория одно из общепризнанных биологических обобщений, утверждающих единство принципа строения и развития мира растений, животных и остальных живых организмов с клеточным строением, в котором клетка… … Википедия
Живая клетка — Клетка элементарная единица строения и жизнедеятельности всех живых организмов (кроме вирусов, о которых нередко говорят как о неклеточных формах жизни), обладающая собственным обменом веществ, способная к самостоятельному существованию,… … Википедия
Клетка (биология) — Клетка элементарная единица строения и жизнедеятельности всех живых организмов (кроме вирусов, о которых нередко говорят как о неклеточных формах жизни), обладающая собственным обменом веществ, способная к самостоятельному существованию,… … Википедия
Прокариоты — ? Прокариоты … Википедия
Химический состав клетки — Каждая клетка содержит множество химических элементов, участвующих в различных химических реакциях. Химические процессы, протекающие в клетке одно из основных условий её жизни, развития и функционирования. Одних химических элементов в клетке… … Википедия
Доядерные — ? Прокариоты Строение типичной клетки прокариот: капсула, клеточная стенка, плазмолемма, цитоплазма, рибосомы, плазмида, пили, жгутик, нуклеоид. Научная классификация … Википедия
Монеры — ? Прокариоты Строение типичной клетки прокариот: капсула, клеточная стенка, плазмолемма, цитоплазма, рибосомы, плазмида, пили, жгутик, нуклеоид. Научная классификация … Википедия

откуда он взялся и чего от него ожидать – Наука – Коммерсантъ

Мир легкомысленно отнесся к предыдущим коронавирусным эпидемиям — на сей раз, хочется надеяться, будет иначе, в том числе и в России: быстрое распространение новой инфекции должно к этому стимулировать.

Сергей Нетёсов, член-корреспондент РАН, доктор биологических наук, профессор, заведующий лабораторией биотехнологии и вирусологии факультета естественных наук Новосибирского государственного университета

Эта зима принесла нам тревожные известия о возникновении в Китае и начале активного распространения по всему миру нового коронавируса SARS-CoV-2, вызывающего болезнь под международным названием КоВиД-19 (CoViD-19 — CoronaVirus Disease-19, как ее политкорректно назвали во Всемирной организации здравоохранения). К 10 марта им достоверно, с лабораторным подтверждением, во всем мире заразилось более 110 тыс. человек. Причем сейчас он намного быстрее распространяется вне Китая, чем в самом Китае.

Каковы особенности возбудителя и чем он отличается от других вирусов ОРВИ

Острые респираторные вирусные инфекции (ОРВИ) вызывают более 80% всех острых респираторных заболеваний. Вирусы — это не бактерии, и антибиотики от них не помогают. Наиболее часто ОРВИ вызываются риновирусами (более 50 разновидностей), вирусами гриппа (минимум четыре подтипа), вирусами парагриппа (четыре разновидности), метапневмовирусами, бокавирусами, респираторно-синцитиальными вирусами, аденовирусами и некоторыми другими. Обычные четыре разновидности коронавирусов тоже есть этом списке (229E, OC43, NL43, HKU1) и в зависимости от года занимают второе—пятое места по своей доле в общей заболеваемости. Респираторное заболевание они обычно вызывают слабой и средней тяжести, но иногда случаются и тяжелые случаи.

Как большинство вирусных возбудителей ОРВИ, коронавирусы являются РНК-вирусами, но имеют самый большой из них по размеру геном — около 29 тыс. нуклеотидов. Они содержат липидную оболочку, поэтому легко поддаются разрушению мылом и другими ПАВ. Коронавирусы выявлены практически у всех животных и птиц, но далеко не у всех они вызывают серьезные заболевания. Разработаны живые противокоронавирусные вакцины для собак и домашних кур, потому что у них соответствующие разновидности вызывают тяжелую хроническую инфекцию и большую вирусную смертность.

Уже имеющиеся и циркулирующие среди людей четыре разновидности коронавирусов, по всей видимости, произошли от коронавирусов животных, поскольку имеют с этими вирусами высокую схожесть геномов. Но это произошло давно, и на них особого внимания ученые не обращали, просто недооценивая их на фоне вспышек и эпидемий, вызванных вирусами гриппа. Однако за последние два десятилетия мы стали свидетелями «перескока» на людей уже трех новых разновидностей коронавирусов, и все они имеют предшественников в виде коронавирусов разных видов летучих мышей.

Отметим, что за последнее десятилетие учеными-вирусологами получена масса новых данных о вирусах самых разных животных. И теперь мы знаем, что летучие мыши, по всей видимости, стали для человечества и для животного мира в целом источниками нескольких весьма значимых вирусных заболеваний: это вирусы кори, другие парамиксовирусы, вирус бешенства, коронавирусы,— и этот список растет. Как правило, напрямую на человека эти вирусы от летучих мышей не перескакивают, потому что слишком разные у нас и у них клеточные рецепторы. Как показали результаты исследований последних лет, от летучих мышей к человеку вирусы, как правило, проходят через промежуточного хозяина.

Коронавирусы летучих мышей как источники возникающих инфекций человека

Смотреть

В 2002–2003 годах ТОРС-коронавирус (SARS), вызвавший эпидемию атипичной пневмонии, по всей видимости, перескочил от летучей мыши на человека, пройдя эволюционно-мутационный процесс в организмах пальмовых циветт (зверьков из подотряда кошкообразных). В 2007–2012 годах БВРС-коронавирус (MERS) аналогично перескочил от египетских летучих мышей сначала на верблюдов, а потом на людей. Ну а в этот раз новый коронавирус, явно имеющий происхождение от летучих мышей, уже вызвал колоссальную эпидемию практически во всем мире. Здесь пока что промежуточный хозяин не выявлен, но подозрения падают на панголинов, кошек, бродячих собак, хотя возможны и другие варианты.

Удивляет тот факт, что до сих пор самые близкие по геномным последовательностям к человеческим варианты нынешнего коронавируса — это варианты вирусов от летучих мышей. Хотя, может быть, это и не должно быть удивительным, на диких рынках в Китае сырые и жареные тушки летучих мышей спокойно продавались годами до этой эпидемии. В то же время в последние дни появились публикации в ряде научных журналов о том, что сейчас циркулирует сразу несколько разновидностей коронавируса и поэтому, возможно, было несколько «перескоков» коронавируса на человека разными путями.

Симптоматика нынешней коронавирусной инфекции: отличия от гриппозной и других

Сейчас можно с полной уверенностью сказать, что только по симптомам никакой врач эту инфекцию от других серьезных вирусных инфекций не отличит. Потому что и лихорадка, и высокая температура, и затрудненное дыхание, и слабость, и боли в мышцах, и сухой кашель характерны и для инфекций, вызванных гриппом и респираторно-синцитиальным вирусом.

Вроде бы единственный признак, который, как правило (но не как закон), не характерен для коронавирусной инфекции,— это заложенный нос. Но и для гриппозной инфекции такое тоже может быть. Так что для точной постановки диагноза необходима лабораторная диагностика методом полимеразной цепной реакции (ПЦР) нуклеиновых кислот, выделенных из проб от человека (смывы из носоглотки, мазки из носоглотки и т. д.).

В самом рутинном варианте это занимает четыре—шесть часов (без учета времени на доставку пробы в лабораторию). Коммерческими компаниями, в том числе и в России, разработано несколько экспресс-вариантов диагностикумов, требующих в три-четыре раза меньше времени. Насколько известно автору, в Китае и США федеральные власти уже приняли решение простимулировать коммерческих разработчиков для быстрейшей сертификации и запуска производств этих тест-систем. Они будут доступны любому гражданину, а не только людям с ярко выраженными симптомами ОРВИ, а это позволит усилить и ускорить борьбу с эпидемией.

Эпидемиологические характеристики новой ОРВИ

• Инкубационный период (прибл.) — 2–14 дней

• Бессимптомное течение — до 2 недель, с выделением вируса

Сравнительная смертность от некоторых вирусных заболеваний

• Сезонный (обычный) грипп — менее 0,01% (у пожилых — до 2%)

• ТОРС-коронавирус 2003 года (SARS) — около 10%

• БВРС-коронавирус (MERS) — 34%

• «Свиной» грипп 2009–2010 годов — 0,02%

• Новый коронавирус SARS-CoV-2 — около 2%

Чего ждать и что делать нам

Человечество в настоящее время имеет несколько способов и подходов к борьбе с инфекциями: противоэпидемические мероприятия с как можно более чувствительными и специфичными диагностическими методами, быстрая разработка и применение вакцин. Ну и, конечно же, нужны эффективные методы изоляции и лечения больных.

Зоонозные инфекции и в дальнейшем будут перескакивать с животных на людей, как это и было в течение всей истории человечества. Примеры: вирус ВИЧ, перескочивший на человека от обезьян; вирус гепатита С, который к людям попал от лошадей или от других животных; вирусы кори и паротита, явно перешедшие на людей от копытных животных или тех же летучих мышей; вирусы клещевого энцефалита, Зика, лихорадок денге и Западного Нила и т. д. А различные виды коронавирусов за последние 20 лет, как уже сказано, трижды перескакивали на человека от летучих мышей (коронавирусы атипичной пневмонии SARS-CoV-1, ближневосточного респираторного синдрома (БВРС) и нынешний SARS-CoV-2).

Возможны, а вернее всего неизбежны, и другие аналогичные перескоки в будущем. Готовиться к ним надо гораздо более интенсивно, изучая инфекции животных и разрабатывая новые вакцины. Посмотрите, какая складывается ситуация: после атипичной пневмонии 2002–2003 годов никто так и не разработал вакцины против тогдашнего ТОРС-коронавируса. После открытия коронавируса БВРС в 2012 году тоже не разработали соответствующей вакцины. Если бы эти вакцины были разработаны и доказана их эффективность, то сейчас было бы намного легче разработать вакцину против нынешнего коронавируса. В этом году прозвенел третий звонок от коронавирусов за последние 20 лет. Может, не будем ждать четвертого и разработаем вакцины? В 1950–1970-е годы прошлого века наша страна была лидером не только в космосе, но и в разработках и применении вакцин!

Теперь насчет диагностикумов в России. Россия, пожалуй, единственная среди развитых стран, которая не выставила в интернет состава своего диагностического препарата, разработанного в центре «Вектор». И единственная страна, в которой нет больше никаких диагностикумов на эту инфекцию. А они нужны, поскольку есть множество желающих за свои средства провериться на наличие возбудителя и, возможно, на перенесенную инфекцию. Заинтересованные в разработке и производстве таких тестов частные компании тоже есть. Наверное, стоило бы государственным структурам их на это простимулировать, включив применение таких тестов в страховую медицину и использовав другие способы. Ко всему прочему это помогло бы создать конкуренцию среди тестов и повысить уровень их достоверности до максимально возможного в этой ситуации. Ведущие коммерческие разработчики ПЦР-тест-систем России имеют такое же мнение.

Наконец, про лечебные препараты. Сейчас в Китае клинические испытания проходят несколько десятков препаратов из разных стран. Пока четких данных об эффективности какого-либо из них не опубликовано. Слухи про «Арбидол» пока так и остались слухами. Наибольшую надежду вызывают препараты — ингибиторы протеаз, которые вроде бы на культурах клеток не дают вирусу проникать в клетки, препятствуя его размножению. Здесь понятна логика действия препаратов, часть из которых уже показала свою эффективность против других вирусов: ВИЧ и герпес-вируса. Но не все они пока зарегистрированы в России.

Что дальше

Вернее всего, с этой пандемией человечество справится. Должны справиться и мы в России. Но наша готовность к последующим аналогичным эпидемиям должна быть повышена, потому что они неизбежно будут. А пока среди всех респираторных инфекций у нас есть вакцина только против гриппа. И это XXI век! У нас нет вакцин против вирусов парагриппа, респираторно-синцитиального вируса, метапневмовирусов, других коронавирусов, которые в сумме вызывают более трети всех респираторных инфекционных заболеваний, то есть уж точно больше, чем вирус гриппа. И люди от них умирают не единично. В том числе от того, что мы почему-то не видим в них угрозы, а видим угрозы там, где их и нет вовсе или они намного менее значимы. Может быть, потому, что вирусы маленькие? Но ущерб-то от них очень большой: это неспасенные тысячи жизней граждан России.

кто из «мутантов» наиболее опасен?

Штамм – это чистая изолированная культура. Изначально этот термин используется в отношении бактерий, но в последнее время в СМИ и высказываниях врачей и ученых все чаще применяется словосочетание «штамм коронавируса». Имеется в виду мутация вируса: его генетический код изменился настолько, что он может быть выделен в отдельную «ветвь».

Вирусам свойственно постоянно мутировать. SARS-CoV-2 (COVID-19) – не исключение. Это РНК-вирус, то есть он состоит из последовательности молекул рибонуклеиновой кислоты. Каждый раз, когда вирус копируется, эта последовательность может меняться – вирус мутирует. Соответственно, изменяются и его свойства, включая такие, как летальность и контагиозность (способность заражать). Кстати сказать, коронавирус мутирует медленнее, чем большинство РНК-вирусов.

Тем не менее, штаммов коронавируса – тысячи. Но значимыми признаны шесть: «Кластер 5», «Альфа», «Бета», «Гамма», «Линия B.1.525» и «Дельта», информация о которой в последнее время становится все более тревожной. Четыре из этих штаммов («Альфа», «Бета», «Гамма» и «Дельта») ВОЗ признала «вызывающими озабоченность».

Штамм «Кластер 5» был обнаружен в Норвегии у норок. Это привело к массовому забою зверьков. В ноябре 2020 года этот штамм был объявлен вымершим.

Штамм «Альфа» называется «британским», а также «первым» – его выявили в октябре 2020 года в Великобритании. Летальность такого штамма составляет 59 процентов. Его трансмиссивность (передаваемость от человека к человеку) – 82 процента. Штамм «Бета», или «южноафриканский», найден в ЮАР в мае 2020 года. Его заразность – 52 процента, а летальность пока не изучена. «Гамма» найден в Бразилии в ноябре 2020 года. Он чрезвычайно заразен – 161 процент. Летальность составляет 50 процентов. Штамм «Линия B.1.525» был обнаружен в 15 странах, но более всего он распространен в Нигерии и Британии.

В последнее время на страницах СМИ все чаще фигурирует «Дельта» – «индийский» штамм. Однако выделен он был в октябре прошлого года. В сравнении со штаммом «Альфа», этот вирус на 85 процентов чаще приводит к смерти зараженного. Также он на 64 процента заразнее «британского». И он продолжает мутировать. 14 июня 2021 года в Индии был обнаружен штамм «Дельта плюс» – еще более заразный и опасный. Он поражает в основном молодежь.

9 июня ВОЗ внесла в свой список российский штамм – «AT.1». Данных по нему пока недостаточно. По словам главы Роспотребнадзора Анны Поповой, местные мутации коронавируса не несут эпидемически значимого характера и не влекут за собой какого-либо изменения тяжести или скорости протекания заболевания.

Единственная надежная защита от коронавируса COVID-19 – это вакцинация, напоминают врачи. Она способна либо полностью защитить от заражения, либо существенно снизить тяжесть заболевания. Кроме того, вакцинация важна для формирования коллективного иммунитета.

бактерий и вирусов: в чем разница?

По сценарию Гарри
17 апреля 2020 в 13:35

Бактерии и вирус Диаграмма Венна

Бактерии против вирусов

Между вирусами и бактериями не так много общего.Они похожи по способу распространения, но биологические и патологические различия довольно велики. Оба они могут вызывать заболевания, но на самом деле бактерии могут быть полезны для здоровья людей и животных, в отличие от вируса, который всегда считается вредным. Лечение бактериальных и вирусных инфекций также различается, поскольку вирусные инфекции нельзя лечить антибиотиками.

Вирусов

Вирус определяется как субмикроскопический инфекционный агент, который имеет молекулу нуклеиновой кислоты в белковой оболочке, которая может размножаться только в живых клетках-хозяевах.Вирусы могут нанести ущерб иммунной системе, особенно когда нет вакцины, как это происходит с вирусом COVID-19.

Характеристики вирусов

Вирусы вторгаются в клетки организма и «завладевают» клеточным «механизмом», чтобы делать свои копии.
не имеют метаболизма и по вышеуказанным критериям считаются по существу неживыми.
Антибиотики, как правило, не действуют на вирусы, потому что антибиотики обычно работают, нарушая метаболизм бактерий в некоторой степени.
Необходимо предотвратить прививками, такими как прививка от гриппа, социальное дистанцирование и поддержание чистоты на территории.

Примеры вирусов

COVID-19 (Коронавирус)
SARS-CoV (более известный как SARS)
Вирус Эбола
ВИЧ
Ветряная оспа
Корь
Вирус гриппа
Простуда

Бактерии

Бактерии — это микроскопические одноклеточные организмы, которые классифицируются как прокариоты без ядра.Знаете ли вы это или нет, бактерии повсюду вокруг вас и даже внутри вас! Не все бактерии опасны, поскольку бактерии, живущие в кишечнике, помогают вашей пищеварительной системе.

Характеристики бактерий

Бактерии имеют нормальный метаболизм и основные признаки жизни, т. Е. воспроизводство, производство энергии и т. д.
Некоторые бактерии действительно полезны для здоровья человека.
Бактерии в 50–100 раз больше, чем большинство вирусов.
Бактериальные инфекции можно лечить антибиотиками.

Примеры бактерий

E. coli
Сальмонелла
Менингит
Спирилл
Микробиота кишечника (хороший вид)
Бифидобактерии
Лактобациллы

Как распространяются бактерии?

Тесный контакт, например прикосновения или поцелуи
Контакт с физическими жидкостями инфицированного человека
Передача от родителей, например, от матери к ребенку во время родов
Прикосновение к загрязненным поверхностям, затем прикосновение к лицу

Сходства между бактериями и вирусами

И вирусы, и бактерии могут вызывать заболевания.
Оба могут передаваться при кашле, чихании или при контакте с загрязненными поверхностями, животными, предметами или людьми.
Оба могут лечиться вакцинами.

Как распространяются вирусы и бактерии?

Одно из основных сходств вирусов и бактерий — способы их распространения.

Бактерии и вирусы могут распространяться через:

Тесный контакт, например прикосновения или поцелуи
Контакт с физическими жидкостями инфицированного человека
Передача от родителей, например, от матери к ребенку во время родов
Прикосновение к загрязненным поверхностям, затем прикосновение к лицу
Укус зараженного насекомого
Потребление зараженных продуктов питания или воды

Предотвращение передачи вирусов и бактерий

Важно знать, как защитить себя и других от бактериальных или вирусных инфекций.Многие из нас могут получить вакцинацию, чтобы помочь нам бороться с этими заболеваниями или иметь сильную иммунную систему. Есть люди, которые не могут бороться с болезнью так легко, например, люди с ослабленным иммунитетом или слишком молоды для вакцинации.

Для предотвращения распространения бактериальных и вирусных инфекций необходимо:

Вымойте руки водой с мылом
Регулярно очищайте окружающую среду
Кашель или чихание в локоть
Избегайте контакта с больным
Не касайтесь глаз, носа, рта

Дезинфекция и очистка от вирусов и бактерий

Ultra Pressure Cleaning теперь предлагает услуги по дезинфекции и очистке коммерческих и жилых помещений, чтобы избавить все виды поверхностей от опасных вирусов и бактерий в Южной Флориде.Мы используем раствор гипохлорита натрия, одобренный CDC, NIH и ВОЗ, для уничтожения вирусов, таких как COVID-19 (коронавирус), и обеспечения безопасности нашего сообщества. С внедрением технологии электростатической дезинфекции наша команда может более точно защитить ваш дом и бизнес от вирусов и бактерий.

Свяжитесь с нами, чтобы получить бесплатное предложение сегодня!

10.1: Общая характеристика вирусов

Последнее обновление
Сохранить как PDF

Сводка
Авторы и ссылки

Цели обучения

Укажите 2 живых и 2 неживых характеристики вирусов.
Перечислите 3 критерия, используемых для определения вируса.
Обсудите, почему бактерии можно культивировать в синтетических средах, таких как питательный бульон, а вирусы — нет.
Определите бактериофаг.

Вирусы — это инфекционные агенты, обладающие как живыми, так и неживыми характеристиками. Они могут заражать животных, растения и даже другие микроорганизмы. Вирусы, поражающие только бактерии, называются бактериофагами, а вирусы, поражающие только грибы, называются микофагами.Есть даже некоторые вирусы, называемые вирофагами, которые заражают другие вирусы.

Жизненные характеристики вирусов	Неживые характеристики вирусов
Они размножаются с фантастической скоростью, но только в живых клетках-хозяевах. Они могут мутировать.	Они бесклеточные, то есть не содержат цитоплазмы или клеточных органелл. Они не осуществляют метаболизм сами по себе и должны воспроизводиться с помощью метаболического механизма клетки-хозяина. Другими словами, вирусы не растут и не делятся. Вместо этого в инфицированной клетке-хозяине синтезируются и собираются новые вирусные компоненты. Подавляющее большинство вирусов обладают ДНК или РНК, но не обоими сразу.

Жизненные характеристики вирусов

Неживые характеристики вирусов

Они размножаются с фантастической скоростью, но только в живых клетках-хозяевах.
Они могут мутировать.

Они бесклеточные, то есть не содержат цитоплазмы или клеточных органелл.
Они не осуществляют метаболизм сами по себе и должны воспроизводиться с помощью метаболического механизма клетки-хозяина. Другими словами, вирусы не растут и не делятся. Вместо этого в инфицированной клетке-хозяине синтезируются и собираются новые вирусные компоненты.
Подавляющее большинство вирусов обладают ДНК или РНК, но не обоими сразу.

Недавно вирусы были объявлены живыми существами на основании большого количества белковых складок, кодируемых вирусными геномами, которые являются общими с геномами клеток.Это указывает на то, что вирусы, вероятно, произошли из нескольких древних клеток.

Подавляющее большинство вирусов содержат только один тип нуклеиновой кислоты: ДНК или РНК, но не оба. Репликация вирусов полностью зависит от клетки-хозяина (т.е. они являются строго внутриклеточными паразитами). Более того, вирусные компоненты должны собираться в полные вирусы (вирионы), чтобы переходить от одной клетки-хозяина к другой. Поскольку у вирусов отсутствует собственный метаболический аппарат и их репликация полностью зависит от клетки-хозяина, их нельзя выращивать в синтетических питательных средах.Вирусы животных обычно выращивают на животных, в яйцах с эмбрионами или в культурах клеток, где у животных клетки-хозяева выращивают в синтетической среде, а затем вирусы выращивают в этих клетках.

Сводка

Вирусы — это инфекционные агенты, обладающие как живыми, так и неживыми характеристиками.
Жизненные характеристики вирусов включают способность воспроизводиться — но только в живых клетках-хозяевах — и способность мутировать.
Неживые характеристики включают тот факт, что они не являются клетками, не имеют цитоплазмы или клеточных органелл, не осуществляют метаболизм сами по себе и, следовательно, должны воспроизводиться с помощью метаболического аппарата клетки-хозяина.
Вирусы могут заражать животных, растения и даже другие микроорганизмы.
Поскольку у вирусов отсутствует собственный метаболический аппарат, а репликация полностью зависит от их клетки-хозяина, их нельзя выращивать в синтетических питательных средах.

Авторы и авторство

10.2: Размер и форма вирусов

Цели обучения

Сравните размер большинства вирусов с размерами бактерий.
Перечислите 4 вида вирусов.

Размер

Вирусы обычно намного меньше бактерий, и подавляющее большинство из них являются субмикроскопическими. Хотя большинство вирусов имеют размер от 5 до 300 нанометров (нм), в последние годы был идентифицирован ряд гигантских вирусов, включая мимивирусы и пандоровирусы диаметром 0,4 микрометра (мкм). Чтобы сравнить размер вируса, бактерии и клетки человека, прокрутите вниз до того, насколько велик … на странице Ресурсы размера и масштаба клетки на веб-странице Университета Юты (см. Рисунок \ (\ PageIndex {1}) \) A, рисунок \ (\ PageIndex {1} \) B и рисунок \ (\ PageIndex {1} \) C),

Формы

Рисунок \ (\ PageIndex {1} \) A: Размеры и формы вирусов (вирусы РНК животных) Рисунок \ (\ PageIndex {1} \) B: Размеры и формы вирусов (вирусы ДНК животных)

Рисунок \ (\ PageIndex {1} \) C: Размеры и формы вирусов (бактериофагов)

а.Спиральные вирусы состоят из нуклеиновой кислоты, окруженной полым белковым цилиндром или капсидом и обладающих спиральной структурой (рис. \ (\ PageIndex {2} \) A).

Рисунок \ (\ PageIndex {2} \): Вирусная структура (спиральный вирус). (B) Вирусная структура (полиэдрический вирус), (C) Вирусная структура (оболочечный спиральный вирус), D: вирусная структура (оболочечный полиэдрический вирус), (F) Вирусная структура (бинальный) Иллюстрация Т-четного бактериофага, состоящего из головки , ножны и хвост.

г. Полиэдрические вирусы состоят из нуклеиновой кислоты, окруженной многогранной (многогранной) оболочкой или капсидом, обычно в форме икосаэдра (рисунок \ (\ PageIndex {2} \) B).

г. Оболочечные вирусы состоят из нуклеиновой кислоты, окруженной спиральным или многогранным ядром и покрытой оболочкой (см. Рисунок \ (\ PageIndex {2} \) C и рисунок \ (\ PageIndex {2} \) D).

г. Бинальные (сложные) вирусы не имеют ни спиральной, ни многогранной формы, плеоморфной или неправильной формы (рисунок \ (\ PageIndex {3} \)) или сложной структуры (рисунок \ (\ PageIndex {2} \) F).

Рисунок \ (\ PageIndex {3} \): Электронная микрофотография вирусов нитчатой Эбола, вырастающих из инфицированной клетки-хозяина Нитчатые, покрытые оболочкой зрительные трубы вируса Эбола (красный).Предоставлено Национальным институтом аллергии и инфекционных заболеваний (NIAID).

Просвечивающая электронная микрофотография бактериофага колифага Т4; любезно предоставлено микроскопией Денниса Кункеля.

Упражнение: подумайте — попарно — поделитесь вопросами

Мы только что узнали, что большинство вирусов намного меньше бактерий.

Сравните размеры вирусов и бактерий.
Почему вирусы могут быть намного меньше бактерий

Сводка

Вирусы обычно намного меньше бактерий, причем подавляющее большинство из них субмикроскопические, обычно их размер составляет от 5 до 300 нанометров (нм).
Спиральные вирусы состоят из нуклеиновой кислоты, окруженной полым белковым цилиндром или капсидом и обладающей спиральной структурой.
Полиэдрические вирусы состоят из нуклеиновой кислоты, окруженной многогранной (многогранной) оболочкой или капсидом, обычно в форме икосаэдра.
Оболочечные вирусы состоят из нуклеиновой кислоты, окруженной спиральным или многогранным ядром и покрытой оболочкой.
Бинальные (сложные) вирусы не имеют спиральной или многогранной формы, неправильной формы или сложной структуры.

Авторы и авторство

7 структурных различий между бактериями и вирусами (сравнительная таблица)

Бактерии

Бактерии — это микроскопические организмы, обитающие в различных среды; они могут жить в океане, почве и человеческом кишечнике. Бактерии живые организмы с простой клеточной структурой, содержащей органеллы, ДНК и РНК которые погружены в цитоплазму и окружены клеточной стенкой.

Бактерии могут быть как полезными, так и вредными для человека здоровье. Примеры бактерий, которые могут быть полезны для человека, включают кишечник. бактерии, Escherichia coli, Rhizobium, Bifidobacterium, lactobacillus и т. д. на с другой стороны, бактерии, которые могут быть вредны для здоровья человека, включают: стрептококковая пневмония, золотистый стафилококк, бактерии Helicobacter и т. д.

Вирус

Вирус — это небольшой инфекционный агент, который только размножается внутри живых клеток организма. Вирусы могут заразить все виды жизни формы от животных и растений до микроорганизмов. Им не хватает возможностей для процветания и воспроизводятся вне тела хозяина.

Вирусы содержат ключевые элементы, из которых состоит все живое. организмы (нуклеиновые кислоты, ДНК или РНК). ДНК или РНК, обнаруженные в ядре вирус может быть одноцепочечным или двухцепочечным. Он составляет генотип или совокупность генетической информации вируса.Вирусный геном обычно небольшой по размеру, кодирует только основные белки, такие как капсид белки, ферменты и белок, необходимые для репликации в клетке-хозяине.

Примеры вирусов включают ВИЧ, Эбола, папилломавирус, Зика, вирус гепатита С, грипп, найровиус, зооноз, цитомегаловирус, лимфотропный вирус и др.

Бактерии Vs. Вирус: Разница

Описание

Бактерии обитают практически везде, в том числе в других организмов, на неорганических поверхностях и на других организмах.Они заражают эукариот организмы, такие как животные, растения и грибы. С другой стороны, вирусы могут быть можно найти практически в любой среде. Это патогены, поражающие прокариот и эукариотические организмы, включая животных, растения, бактерии и архейи.

Жилая характеристики

Бактериальные — это прокариотические клетки, которые отображают все характеристики живых организмов. Их клетки содержат органеллы и ДНК. которые свободно плавают в цитоплазме и окружены клеточной стенкой.На С другой стороны, вирусы не считаются клетками, а существуют как частицы нуклеиновых кислот. кислота, заключенная в белковой оболочке.

Форма ячейки

Бактерии бывают самых разных форм, обычные бактериальные формы клеток включают сферическую (кокки), палочковидную (бациллы), спиральную и вибрионную. Форма вирусов определяется количеством нуклеиновой кислоты и белка. в них содержатся.

Размер

Бактерии обычно имеют размер от 200 до 1000 нанометров. в диаметре, тогда как вирусы обычно имеют размер от 20 до 400 нанометров в диаметры.

Репродукция

Большинство бактерий размножаются с помощью процесса, известного как двойное деление. при этом одна бактериальная клетка делает копию своей ДНК и вырастает в больших размерах. за счет удвоения его клеточного содержимого. Вирусы же только копируют с помощью клетки-хозяина, потому что у вирусов нет органелл необходимы для воспроизводства вирусных компонентов, они должны использовать органеллы для репликации.

Инфекция

Патогенные бактерии, вызывающие инфекции, производя токсины, разрушающие клетки.Они вызывают пищевые отравления, гастрит, пневмонию, фурункулы, абсцессы, туберкулез, менингит и др. После того, как вирусы проникли в клетку и продолжают воспроизводить такие заболевания, как поскольку могут возникнуть Эбола, Зика, СПИД, грипп, ветряная оспа и т. д.

Пособие

Некоторые бактерии полезны для человека (нормальная флора) тогда как вирусы не приносят никакой пользы человеку; они могут быть полезны только в генная инженерия.

Также читайте: Разница между грамположительными и грамотрицательными бактериями

Различия между бактериями и вирусами в табличной форме

Структура	Бактерии	Вирус
Описание	Бактерии встречаются во всех средах обитания на земле (в почве, камнях и океаны).Некоторые живут внутри или на других организмах, включая людей.	Вирус — это небольшой инфекционный агент, который размножается только внутри живые клетки других организмов.
Размер	Диапазон размеров от (200 до 1000 нм)	Обычно размер от (20 до 400 нм)
Клеточная стенка	Пептидогликан / Липополисахарид	Клеточная стенка отсутствует, вместо нее присутствует белковая оболочка.
Инфекция	Локализованный	Системный
Репродукция	Размножаются бесполым путем посредством бинарного деления	Он вторгается в клетку-хозяин и изменяет или разрушает ее ДНК / РНК, делая клетка-хозяин для производства новых вирусов.
Видимость	Виден под световым микроскопом	Не виден под световым микроскопом, виден только под электронным микроскопом.
Льготы	Некоторые бактерии полезны для человека (нормальная флора)	Вирусы не приносят никакой пользы человеку; они могут быть полезны только в генная инженерия.
Как с ними обращаются	Использование антибиотиков	Вирусы нельзя лечить антибиотиками; их деятельность может быть только ингибируется антивирусными препаратами.
Примеры	Золотистый стафилококк, бациллы, спириллы, микоплазмы, риккетсии, Helicobacter и др.	Эбола, ВИЧ, птичий грипп, зика, аденовирус, вирус герпеса, поксивирус и др..
Рибосомы	Подарок	Отсутствующий
Форма ячейки	Бактерии могут быть разных форм, обычные бактериальные клетки формы включают сферическую (кокки), палочковидную (палочки), спиралевидную и вибрионную.	Форма вирусов определяется количеством нуклеиновой кислоты и белок они содержат.
Сотовое оборудование	Имеет сотовую технику.	Не имеет клеточного аппарата.
Живая характеристика	Бактерии обладают всеми характеристиками живого организма.	Вирусы не считаются клетками, но существуют как частицы нуклеиновых кислот. кислота
D Структура NA / РНК	Клетки бактерий содержат органеллы и ДНК / РНК, которые погружены в цитоплазму и окружены клеточной стенкой.	ДНК / РНК заключена в белковую оболочку
Болезни, возникшие в результате	Пищевое отравление, пневмония, менингит, гастрит и др.	Грипп, СПИД, ветряная оспа, полиомиелит, лихорадка Эбола, простуда и т. Д.
Тип ячейки	Одноклеточный (одноклеточный)	Клеток нет, не жив

Также читайте: Разница между стафилококками и стрептококками

Сходства между бактериями и вирусами

И вирус, и бактерия не имеют ядра
Ферменты всегда присутствуют в бактериях и некоторых вирусы
Вирулентность присутствует как в бактериях, так и в вирусах.
Оба они вызывают заболевания.
Оба они имеют микроскопические размеры.

Сводка

Также читайте: Разница между жгутиками и пили

Что главное разница между вирусом и бактериями?

Бактерии встречаются во всех средах обитания на земле (почва, камни и океаны). Некоторые живут внутри или на других организмах, включая людей. Вирус на с другой стороны, это небольшой инфекционный агент, который размножается только внутри живые клетки других организмов.

вирусов | Бесплатный полнотекстовый | Сравнительный анализ 37 бактериофагов Acinetobacter

3.2. Сравнение полного генома и протеома фагов Acinetobacter

Для визуализации взаимоотношений между секвенированными фагами Acinetobacter геномы фагов анализировали с использованием точечных диаграмм полного генома, идентичности парных последовательностей и общих белков. Точечные диаграммы и выравнивание нуклеотидных последовательностей после коллинеаризации генома показывают, что, несмотря на значительное разнообразие секвенированных фагов Acinetobacter, существует также достаточное сходство, чтобы эти фаги можно было разместить в шести дискретных кластерах, обозначенных A – G (Рисунок 1 и Рисунок S1. ).Поскольку несколько фагов демонстрируют значительную долю общего содержания генов без существенной нуклеотидной идентичности, кластеры были определены на основе не менее 40% общего содержания генов. За исключением кластеров A и C, каждый кластер имеет не менее 40%. ANI и более чем 50% -ная консервация на уровне белка (Рисунок S2). Это разделение дополнительно подтверждается морфологическим сходством (рис. 2) и низким стандартным отклонением в размере генома, содержании G + C и количестве генов, кодируемых между членами каждой группы (таблица 1).Три из предложенных кластеров соответствуют таксономическому назначению ICTV: кластер A включает фаги, относящиеся к членам подсемейства Tevenvirinae, а два кластера, B и E, соответствуют формально установленным родам Fri1virus и Ap22virus. Два фага, ME3 и Presley, не выявили четкого родства с другими фагами и обозначены как геномные синглтоны. Некоторые фаги демонстрировали низкий ANI для определенных кластеров. В частности, phiAC-1 проявляет ANI в диапазоне от 16,2% до 21,4% с фагами вируса Ap22 (кластер B), в то время как фаги F1245 / 05, Acibel007 и Petty обладают между 9.3% и 25,6% ANI с фагами, отнесенными к вирусу Fri1 (кластер D). Сравнение содержания генов обеспечивает вторичную оценку геномного разнообразия. Во время ручного попарного сравнения было замечено, что некоторые ORF-кандидаты не были идентифицированы, а другие имели оптимальные последовательности связывания рибосом, которые отличаются от опубликованных аннотаций. По этим причинам каждый фаг был повторно аннотирован перед кластеризацией белков (файл S1). Первоначально белки из пяти кластеров были отдельно собраны в группы с помощью OrthoMCL.На основании этих результатов были идентифицированы наборы белков для каждого кластера фагов, которые (i) присутствовали во всех геномах в этом кластере, (ii) кодировались в двух или более, но не на всех геномах в кластере и (iii) белки, которые были уникальны для одного генома фага (рис. 3). Чтобы оценить взаимосвязь содержания генов между всеми 37 фагами, OrthoMCL был использован для кластеризации всех 4065 белков, которые собраны в 737 групп из двух или более белков и 975 сирот (файл S2 ). Этот подход позволил представить межкластерные и внутрикластерные отношения в содержании генов среди фагов Acinetobacter в виде сетевой филогении, результаты которой показывают согласие с кластерами, обозначенными при сравнении нуклеотидных последовательностей (рис. 4).Подчеркивая их статус как одиночных, 260 и 80 белков, кодируемых ME3 и Presley, соответственно, были уникальными сиротами. Взаимосвязь между более удаленными фагами более очевидна из анализа содержания генов, где каждый из Petty, F1245 / 05 и Acibel007 кодирует 22 белка (от 41,5% до 48,9% ORF), которые представляют группы основных белков вируса Fri1. Точно так же 29 белков (35,4% ORF), кодируемых phiAC-1, попадают в группы основных белков вируса Ap22. Эти более далекие отношения представлены общими ветвями сетевой филогении (рис. 4).Функциональные выводы для сгруппированных и уникальных последовательностей белков были получены с использованием комбинации инструментов BLASTP, InterProScan и HHsuite, HHblits и HHsearch. Из 4067 белков предполагаемую функцию, основанную на биоинформатическом анализе, можно было приписать 1762 (322 группы белков и 172 сиротских), в то время как 2305 (56,6%) были аннотированы как гипотетические белки с неизвестной функцией. Большинство белков образуют взаимоисключающие группы, общие для двух или более членов одного кластера (файл S2).

Всего 37 основных и три дополнительных группы белков были общими между двумя кластерами фагов, преимущественно между миовирусами. Кластеры C и D имеют наибольшее количество белковых групп, которые включают 17 структурных и сборочных белков вириона в дополнение к предполагаемому тиоредоксину, эндодезоксирибонуклеазе, репликативной геликазе и ДНК-полимеразе. Каждый из Т4-подобных и Fri1-подобных фагов кодирует предсказанную АТФ-зависимую АТФ-лигазу и дезоксинуклеотидмонофосфат (dNMP) киназу, которые группируются вместе в анализе OrthoMCL.Три основных структурных белка являются общими для сифовирусов Acinetobacter; предсказанный белок портальной вершины, главный белок капсида и предполагаемый белок завершения хвоста.

Три группы вспомогательных белков, общие для кластеров, соответствуют гипотетическому белку (кластеры A и E), эндонуклеазе самонаведения семейства HNH (кластеры B и E) и эндолизину семейства гликозидов 24 (кластеры A и B). Анализ карт попарного сравнения показывает, что включение дополнительных и уникальных орфанных генов в некоторые фаги не равномерно распределено по геному.Геномные модули, содержащие гены, ответственные за сборку структуры вириона, метаболизм нуклеиновых кислот и репликацию генома, имеют тенденцию быть сильно преобразованными как по содержанию генов, так и по порядку. Несмотря на сравнение содержания генов, определяющее четкие границы между кластерами, есть примеры мозаицизма как внутри, так и между кластерами, которые особенно очевидны в генах tailspike и эндолизина.

Одна из основных детерминант специфичности хозяина, белки, связывающие рецептор фага, по-видимому, подвергаются относительно частым событиям рекомбинации [88,89].Было предсказано, что двадцать пять фагов, представляющих кластеры B – D и одноэлементный ME3, кодируют хвостовые шипы, принимающие параллельную структуру β-спирали (файл S2). Белки Tailspike имеют тенденцию демонстрировать бимодульную структуру, состоящую из N-концевого домена связывания вириона и C-концевого домена связывания рецептора, который часто обладает ферментативной активностью [90]. Хотя N-концевая последовательность хвостового шипа является одновременно высококонсервативной и специфичной для каждого кластера фагов Acinetobacter, по-видимому, существуют два ярких примера доменного мозаицизма, когда С-концевая последовательность является высококонсервативной между двумя членами разных кластеров.В частности, С-концевые последовательности миовируса IME-AB2 кластера B и подовируса Abp1 кластера D обнаруживают 97% идентичностей. Миовирусы WCHABP12 и AM24 также обладают очень похожими (94% идентичности) С-концевыми последовательностями, но расходящимися N-концами.

Эндолизины фага Acinetobacter представляют собой смесь однодоменных и многодоменных эндолизинов, где лизоцимоподобный домен сопровождается пептидогликановым связывающим доменом. В то время как положение кассеты для лизиса сохраняется в каждом кластере, эндолизины из 37 фагов образуют четыре группы белков, которые не разделяются в соответствии с кластером.ME3, по-видимому, обладает функциями лизиса, кодируемыми двумя отдельными соседними генами с тегами локуса ME3_7 и ME3_8, кодирующими предсказанный пептидогликан-связывающий белок и лизоцим, соответственно.

В следующих разделах кратко обсуждаются общие характеристики и отличительные особенности каждого кластера фагов.

3.2.1. Кластер A: T4-подобные фаги Acinetobacter

Фаги Acinetobacter 133, Acj9, Acj61, Ac42 и ZZ1 принадлежат к большому и широко распространенному подсемейству миовирусов Tevenvirinae.Т4-подобная морфология характеризуется удлиненным икосаэдрическим капсидом и сократительным хвостом с поперечными бороздками и воротником [86]. Хвост заканчивается опорной пластиной, несущей шесть длинных изогнутых хвостовых волокон и шесть коротких хвостовых шипов. В состоянии покоя длинные волокна хвоста удерживаются в сложенном состоянии за счет нитевидных волокон, отходящих от воротника. За исключением ZZ1, размеры которого были получены без контроля увеличения, все фаги, подобные Acinetobacter T4, имеют аналогичные размеры и состоят из умеренно вытянутой головы размером 120 на 86 нм, сократительного хвоста, идентичного по морфологии T4, размером 111 на 16 нм. оканчивается базовой пластиной с длинными и короткими хвостовыми волокнами [86].Пять секвенированных T4-подобных фагов Acinetobacter инкапсулируют геном от 159 до 169 kbp, кодирующий от 241 до 257 ORF (таблица 1), и демонстрируют низкий внутрикластерный ANI от 10 до 26%. Предыдущие исследования продемонстрировали, что T4-подобные фаги включают основной геном, который состоит из генов, участвующих в репликации ДНК, структурных компонентов вирионов и шаперонов сборки [62]. Каждый из фагов, подобных Acinetobacter T4, имеет 122 общих консервативных коровых белка и от 68 до 89 белков, которые образуют дополнительные белковые группы.Генные продукты, уникальные для каждого фага, занимают примерно 20% генома. По сравнению с другими членами Tevenvirinae, анализ CoreGenes показывает, что> 40% продуктов гена имеют гомолог, кодируемый T4, RB69, RB49, JS98, SP18, JD18 и CC31 (файл S3). , AsiA и gp55 в фагах Acinetobacter кластера A предполагают, что регуляция транскрипции происходит по тому же принципу, что и T4. Alt представляет собой белок внутренней головки, инъецированный геномом Т4 с активностью моно-АДФ-рибозилтранферазы, которая модифицирует бактериальную РНК-полимеразу, усиливая транскрипцию ранних РНК Т4.Средний активатор транскрипции MotA связывается с MotA-боксом для активации транскрипции в присутствии AsiA-ассоциированной РНК-полимеразы хозяина [91]. Gp55 представляет собой белок семейства sigma70, который связывается с РНК-полимеразой хозяина и облегчает распознавание мотива поздней промоторной последовательности [92]. Низкий уровень идентичности последовательностей, проявляемый между Т-подобными фагами Acinetobacter, подтверждает, что каждый из них представляет различные Т4-подобные виды. . С выделением родственных фагов Т4-подобные фаги Acinetobacter могут образовывать дополнительные роды к 11 уже установленным в подсемействе Tevenvirinae, но на данный момент представляют собой неклассифицированные виды [62,93].

3.2.2. Кластер B: AP22-подобные миовирусы Acinetobacter (Ap22virus)

Кластер B состоит из девяти Myoviridae; AP22, AB1, IME-AB2, LZ35, YMC-13-01-C62, YMC11 / 12 / R2315, YMC11 / 12 / R1215, WCHABP1 и WCHABP12, которые инкапсулируют геномы размером от 43,2 до 46,4 кб и кодируют от 82 до 89 ORF ( Таблица 1, Рисунок 5). Три из этих фагов исследованы с помощью электронной микроскопии. Микрофотографии IME-AB2 и AB1 показывают единственный морфотип, состоящий из изометрической головки и сократительного хвоста, оканчивающегося на базовой пластине с короткими хвостовыми волокнами [58,68].Эта группировка была признана независимо, и предложение ICTV о создании нового рода внутри семейства Myoviridae, вируса Ap22, было ратифицировано в 2016 г. [93]. Эти фаги имеют как минимум 40% ANI и разделяют от 61,5 до 100% белков. Мы отмечаем, что YMC-13-01-C62, YMC-11/12 / R2315 и YMC11 / 12 / R1215 имеют среднюю идентичность нуклеотидных последовательностей 99%, что выше нынешних критериев демаркации видов ICTV в 95%, что указывает на то, что они должны быть рассматриваются как изоляты от одного вида фагов [94].AP22-подобные геномы демонстрируют модульную и синтенную организацию, при этом большинство генов кодируется на прямой цепи. В каждом из этих фагов предполагаемый белок морфогенеза головы отделен от прогнозируемой протеазы прогола от семи до 13 открытых рамок считывания неизвестной функции. Эндолизин и холин кодируются в конце структурного и сборочного генного модуля, за которым следуют два модуля, кодирующие гены, участвующие в метаболизме нуклеотидов, рекомбинации и суперинфекционном иммунитете (рис. 5).Основной геном вируса Ap22 состоит из 47 генных продуктов, которые включают в себя структурные и сборочные белки вириона, белок суперинфекционного иммунитета, белок SaV-подобного домена, примаза / геликаза и белки, регулирующие транскрипцию. В то время как члены вируса Ap22 демонстрируют небольшое нуклеотидное сходство с другими фагами в В существующей базе данных последовательностей небольшое количество миовирусов, инфицирующих роды Aeromonas (51 и vB_AsaM-56), Burkholderia (Bcep1, Bcep43 и Bcep781), Edwardsiella (GF-2) и Xanthomonas (OP2), были идентифицированы как кодирующие гомологи белков с помощью tBLASTx.Сравнение CoreGenes показывает, что эти фаги обладают от 19 до 27 гомологов (файл S2) структурным генам и генам сборки вириона вируса Ap22. Фаг phiAC-1 явно более отдаленно связан с членами вируса Ap22, демонстрируя наибольшую идентичность нуклеотидной последовательности с AP22 на уровне 21,4 %. Эта особенность отражена в анализе OrthoMCL, в котором 34 (41,5%) белка phiAC-1 обозначены как уникальные сироты, и эти различия очевидны при визуальном сравнительном анализе (рис. 5). В отличие от других фагов, входящих в кластер B, все из которых инфицируют штаммы A.baumannii, phiAC-1 размножается на штамме Acinetobacter soli KZ-1 и, как сообщается, демонстрирует узкий круг хозяев [73]. Функции можно было предсказать только для семи из 34 орфанных белков phiAC-1, которые включают белок хвостовой части, одноцепочечный ДНК-связывающий белок, YqaJ / RecB-подобную экзонуклеазу, фосфоаденилсульфатредуктазу, предполагаемый загрузчик геликазы и два белка с предсказал EF-область руки и область неизвестной функции (DUF1376), соответственно.

3.2.3. Кластер C: Myoviruses Acibel004 и PhiAbaA1

vB_AbaM_Acibel004 имеет 99.Геном размером 7 т.п.н., кодирующий 156 ORF и 22 тРНК с генами, организованными в несколько функциональных модулей, которые включают кассету лизиса, упаковку ДНК, структуру и сборку вириона, метаболизм нуклеиновых кислот, репликацию генома и модули тРНК. Структура вириона состоит из изометрического капсида диаметром 70 нм и сократительного хвоста длиной 105 нм [59], который в состоянии покоя, по-видимому, показывает треугольный кластер хвостовых волокон на конце хвоста (Рисунок 2). Структура выглядит как гексагональная пирамида, волокна которой пересекаются на вершине.Эта структура также очевидна на микрофотографиях phiAB11 и Abp53 и, по-видимому, теряется при сокращении хвоста. Двадцать шесть белков были идентифицированы в результате анализа вирионов Acibel004 с помощью масс-спектрометрии с ионизацией электрораспылением, и некоторые из них демонстрируют сходство с предполагаемыми структурными белками фагов Pseudomonas PAK-P1, PAK-P3 и KPP10 [59], взаимосвязь, подтвержденная анализом CoreGenes. (Файл S3). Acibel004 содержит 20,5% ANI и 56,4% общих белков с phiAbaA1. Дальнейшие предварительные отношения могут быть обнаружены для частичной последовательности 10290 п.н., доступной для Abp53 [JF317274.1], фаг, морфология сходная с Acibel004 [95] и аннотированная, включающая несколько структурных генов вириона. Неполная последовательность Abp53 показывает 71% идентичности в 4% генома Acibel004 по dc-мегабласту. Наконец, отметим, что Lin et al. [87] описали дополнительный фаг Acinetobacter схожей морфологии, phiAB11.

3.2.4. Кластер D: миовирусы AM24 и YMC13 / 03 / R2096

Группирование фагов AM24 и YMC13 / 03 / R2096 в кластер D поддерживается ANI, равным 75,4%, и в общей сложности 134 белка, общих для двух геномов.Геномы AM24 и R2096 кодируют 18 и 17 тРНК в дополнение к 168 и 170 ORF, соответственно (Таблица 1). Оба фага имеют почти идентичную организацию, состоящую из четырех модулей. Никакая предполагаемая малая субъединица терминазы не может быть идентифицирована в пределах упаковки ДНК и модуля структурного и сборочного гена вириона. Дополнительное хвостовое волокно и SleB-подобная гидролаза клеточной стенки кодируются перед большой субъединицей терминазы, разделенными кластером тРНК. Оба фага изобилуют ORF, кодирующими белки с неизвестной функцией, что составляет примерно 70% всех генов.Никаких родственных фагов в более широкой секвенированной популяции не было обнаружено поисками, проведенными с dc-megablast. Однако сравнение CoreGenes фагов, идентифицированных TBLASTX, демонстрирует, что эти два фага разделяют максимум 20% белков с представителями фагов KIL1, KIL2, KIL3, KIL4 и KIL5 из Pakpunavirus и Pseudomonas syringae (файл S3). Общие генные продукты преимущественно участвуют в структуре и сборке вирионов, но также включают те, которые участвуют в репликации и метаболизме нуклеотидов.На основании нуклеотидной идентичности и общего содержания генов этих двух фагов предлагается создание нового рода в семействе Myoviridae, названного «R2096virus» в честь первого изолированного члена.

3.2.5. Кластер E: фаги Acinetobacter подсемейства Autographivirinae; Род Fri1virus

Фаги Acinetobacter кластера E представляют недавно установленный род Fri1virus в подсемействе Autographivirinae [93] и включают девять подовирусов; AB3, Abp1, IME-200, phiAB1, phiAB6, PD-AB9, PD-6A3, WCHABP5 и типовой вид Fri1 (таблица 1).Подобно другим фагам Autographivirinae, все Fri1-подобные вирусы кодируют свою собственную единственную субъединичную РНК-полимеразу (RNAP) и имеют общую общую геномную организацию с генами, кодируемыми исключительно на прямой цепи [84]. Наряду с Fri1virus шесть других родов, Phikmvirus, Sp6virus, Kp32virus, Kp34virus, Pradovirus и T7virus были определены в пределах Autographivirinae. Fri1-подобные фаги обладают средним размером генома и содержанием G + C 41,7 кб и 40,15% соответственно. Отметим, что в геноме AB3 отсутствует последовательность примерно на 10 т.п.н. по сравнению с его близкими родственниками, что соответствует левому концу генома [96].Предполагается, что две усеченные ORF, которые не аннотированы в связанной записи GenBank, присутствующие на правом и левом концах последовательности, кодируют предполагаемую ДНК-матуразу B и ДНК-геликазу соответственно [96]. Несмотря на то, что они обладают от 40,8% до 34,7% общих белков по сравнению с представителями родов Phikmvvirus и Kp34virus и демонстрируют схожую организацию генома, существует достаточно различий, чтобы отделить эти фаги от ранее установленных родов внутри Autographivirinae.Эти фаги кодируют одну субъединицу РНКП, расположенную рядом со структурными генами, и холин класса I с тремя предсказанными трансмембранными доменами и эндолизин с доменом 19 семейства гликозид гидролаз (InterPro: IPR000726), расположенный между хвостовым волокном и малой субъединицей терминазы. Предполагается, что каждый фаг кодирует два rho-независимых терминатора транскрипции, расположенных ниже RNAP и основных белков капсида. Кроме того, петли узнавания и специфичности РНК-полимеразы консервативны в этих вирусах и существенно отличаются от петель, описанных для Phikmvirus и Kp34virus [17].Филогенетический анализ РНК-полимеразы показывает, что эти фаги попадают в единую монофилетическую кладу (рис. 6).

3.2.6. Кластер F: 531-подобные Acinetobacter Siphoviruses

Кластер F состоит из двух фагов, Bphi-B1251 и YMC11 / 11 / R3177 (R3177), которые имеют 61% ANI и 67% гомологов белка. Bphi-B1251 инкапсулирует геном 45,4 т.п.н. 39,05% G + C, кодирующий 66 ORF, в то время как R3177 инкапсулирует более крупный геном размером 47,6 т.п.н., кодирующий 80 ORF (Таблица 1). Bphi-B1251 описан как подовирус как в регистрационной записи GenBank, так и в соответствующем объявлении генома [84].Однако наличие гомологов структурных генов этих фагов предполагает, что оба фага на самом деле являются сифовирусами, на что указывает присутствие гена рулетки размером 4,9 и 4,3 т.п.н. в Bphi-B1251 и R3177 соответственно. Подтверждая это предположение, R3177 был недавно подтвержден как умеренный член Siphoviridae и обнаруживает 531-подобную морфологию [83]. 531-подобные фаги демонстрируют слегка удлиненную голову 73 × 59 нм и длинный хвост 252 нм, который характеризуется наличием множества поперечных дисков, которые придают хвосту сегментированный вид [29].Анализ ORF R3177 и Bphi-B1251 с использованием HHsuite позволил предсказать дополнительные структурные, репликационные и поддерживающие белки. Изучение выравнивания точечных графиков Bphi-B1215 и R3177 показывает, что ряд геномных модулей демонстрируют локальные различия (рис. 7). В модуле структурных и морфогенетических генов вириона эти негомологичные области соответствуют различным соединяющим белки «голова-хвост» и HicAB-подобной токсин-антитоксиновой кассете типа II в R3177. Кроме того, R3177 кодирует интегразу, эксцизионазу и белки регуляции транскрипции, которые отсутствуют в Bphi-B1251, что указывает на то, что, несмотря на значительное нуклеотидное и протеомное сходство, эти два родственных фага ведут разный образ жизни.Хотя с помощью BLASTp было идентифицировано несколько белковых гомологов в других фагах, R3177 демонстрирует сильное сходство последовательностей (> 70% покрытия,> 95% идентичности BLASTn) с предполагаемыми областями профага в секвенированных геномах штаммов A. baumannii SSA12, KAB04, KAB02, YU- R612 и NCGM237. Поэтому было бы интересно определить, связаны ли Bphi-B1251 и R3177 с несеквенированными фагами 531 и B ₉ PP, двумя профагами схожей морфологии, индуцированными из изолятов HER1032 и HER1096 Acinetobacter, соответственно [29].Явного сходства между этими двумя фагами и отсутствия родственников среди секвенированных фагов достаточно, чтобы предложить создание нового рода, который мы условно называем «B1251virus».

3.2.7. Кластер G: Loki-подобные Acinetobacter Siphoviruses

Два фага кластера G, vB_AbaS_Loki и IME_AB3, тесно связаны. Морфологически Loki представляет собой сифовирус B1, который напоминает фаг Burkholderia vB_BceS_KL1 [99] с изометрическим капсидом размером 57 нм в противоположных вершинах и несокращающимся хвостом длиной 176 нм, диаметром 10 нм и поперечными полосами [85].Loki и IME_AB3 инкапсулируют геном размером 41 и 43 т.п.н. с содержанием молей G + C 44,4 и 45,6% соответственно (таблица 1). ANI между двумя фагами составляет 58,9%, и 109 кодируемых ORF образуют 45 белковых групп и 19 сирот. Геном состоит из трех модулей, содержащих гены, кодирующие структуру и морфогенез вириона, репликацию ДНК и метаболизм, и последний модуль, кодирующий холин и эндолизин, который изобилует генами с неизвестной функцией (рис. 8). Loki и IME_AB3 различаются как составляющими генами, присутствующими в этом последнем модуле, так и структурой эндолизина.Эндолизин Loki является модульным, включающим лизоцимоподобный домен (InterPro: IPR023346) и пептидогликан-связывающие домены (InterPro: IPR018537), тогда как эндолизин IME-AB3 является глобулярным и содержит единственный лизоцимный домен (InterPro: IPR000726). Loki и IME-AB3 имеют от 28 до 31 (от 49,1% до 58,8%) белковых гомологов с фагами Pseudomonas и Burkholderia вируса Septima3. Эти общие белки представляют собой большинство генов, кодируемых в модулях структурных и репликационных генов, и эти фаги различаются преимущественно модулем, кодирующим эндолизин и холин.Из-за сходства нуклеотидной последовательности, содержания гена и организации генома мы предлагаем создать новый род, «локивирус», названный в честь первого полностью охарактеризованного представителя.

Каталог из десятков тысяч вирусов из метагеномов человека раскрывает скрытые ассоциации с хроническими заболеваниями

Виром человека — это совокупность всех вирусов, которые тесно связаны с людьми. Сюда входят вирусы, которые непосредственно инфицируют клетки человека (1, 2), но в основном это вирусы, заражающие резидентные бактерии (т.э., фаги) (3). В то время как подавляющее большинство исследований микробиома было сосредоточено на бактериоме, выявляя многочисленные важные функции бактерий в физиологии человека (4), информация о вироме человека запаздывает. Однако в ряде недавних исследований началось изучение вирома (5⇓⇓⇓⇓⇓⇓⇓ – 13).

Точно так же, как тропические вирусы человека могут оказывать сильное воздействие на людей, фаги способны кардинально изменять физиологию бактерий и регулировать размер популяции хозяев. На арене фага / бактерии может быть задействовано множество эволюционных динамик, включая отношения Красной Королевы (11), гонки вооружений (14) и «совмещение победителя» (15), и это лишь некоторые из них.В кишечнике многие фаги переходят в лизогенное или латентное состояние и сохраняются как интегрированные или эписомальные профаги внутри бактерии-хозяина (16). В некоторых случаях профаг может поддерживать приспособленность хозяина (по крайней мере временно), а не разрушать клетку хозяина. С этой целью профаги часто кодируют гены, которые могут резко изменить фенотип бактерий, такие как токсины (17), факторы вирулентности (18), гены устойчивости к антибиотикам (19), компоненты фотосистемы (20), другие вспомогательные метаболические гены (21). ) и системы CRISPR-Cas (22), а также бесчисленное количество генов с неизвестной функцией.Экспериментальные данные показали, что бактерии, инфицированные определенными фагами (то есть «вироцеллами»), физиологически отличаются от родственных бактерий, у которых отсутствуют эти конкретные фаги (21).

Было несколько задокументированных случаев, когда было показано, что фаги механически участвуют в здоровье и болезнях человека, иногда через прямое взаимодействие с человеческими клетками. Это включает роль в повышении бактериальной вирулентности (17), ответе на иммунотерапию рака (23), устранении бактериальной инфекции (24) и устойчивости к антибиотикам (25).Кроме того, фаговая терапия, целевое уничтожение определенных бактерий с использованием живых фаговых частиц, показала все большие перспективы для лечения устойчивых к антибиотикам бактериальных инфекций (26). Учитывая уже достигнутый прогресс, фаги представляют собой привлекательные цели и инструменты для реструктуризации микробиома в интересах улучшения показателей здоровья.

Кроме того, в нескольких исследованиях было проведено массовое параллельное секвенирование обогащенных вирусами образцов стула человека, обнаружившего различную численность некоторых фагов в условиях болезни (6, 27⇓ – 29).Основная проблема, с которой столкнулись в этих исследованиях, заключается в том, что пока нет исчерпывающей базы данных аннотированных последовательностей вирусного генома, и de novo предсказание вирусных последовательностей на основе метагеномных сборок остается сложной задачей (3). Кроме того, хотя некоторые инструменты могут предсказывать вирусные последовательности с высокой специфичностью (30, 31), эти инструменты не применялись к метагеномам человека в больших масштабах [за возможным исключением (13)], и, к сожалению, большинство раскрытые вирусные геномы не попадают в центральные хранилища.Одно исследование предполагает, что только 31% собранных данных о последовательностях в исследованиях, посвященных виромам, обогащенным вирионами, может быть идентифицирован как распознаваемый вирусный (32). С другой стороны, в другом исследовании с участием 12 человек удалось собрать более 80% считываний из образцов, обогащенных вирусом, в предполагаемые вирусные контиги (11). Тем не менее, большинство потенциальных вирусных контигов из этого исследования представляли собой неклассифицируемые последовательности, и подавляющее большинство контигов, по-видимому, представляли субгеномные фрагменты размером менее 10 т.п.н.

Настоящее исследование направлено на преодоление традиционных проблем, связанных с разреженными вирусными базами данных и плохим обнаружением сильно расходящихся вирусных последовательностей, с помощью Cenote-Taker 2, нового инструмента обнаружения и аннотации вирусов (33).Этот конвейер был применен для секвенирования данных из почти 6000 образцов метагенома человека. Строгие критерии выявили более 180 000 вирусных контигов, представляющих 45 033 специфических таксона. В большинстве случаев от 70 до 99% считываний из наборов данных о стуле, обогащенных вирусами, могут быть выровнены обратно с базой данных вирома человека, составленной из Cenote-Taker 2. Кроме того, тщательно подобранная база данных позволила составить профиль обилия вирома на основе сопоставления по чтению в наборах метагеномных данных человека, что позволило провести повторный анализ панели существующих исследований «случай-контроль».Повторный анализ выявил ранее необнаруженные связи между хроническими заболеваниями и численностью 2265 специфических вирусных таксонов.

Результаты

Характеристики вирома человека.

Считанные данные были загружены из архива считывания последовательностей (SRA) Национального центра биотехнологической информации (NCBI), включая данные Проекта микробиома человека (34) и нескольких других исследований (всего 25 биопроектов), направленных на массовое параллельное секвенирование метагеномных клеток человека. образцы (Dataset S1) (11, 35⇓⇓⇓⇓⇓⇓⇓⇓⇓⇓⇓⇓ – 48).Эти данные охватывают несколько участков тела, включая кишечник (стул), рот, нос, кожу и влагалище. Подмножество проектов выполнило обогащение вирусных последовательностей (49–52). Практически все проекты преследовали цель секвенирования ДНК, но также было проанализировано небольшое количество метатранскриптомных (т. Е. Обедненных рибосом тотальных РНК) образцов (53). Данные для чтения были объединены и собраны Biosample, а не индивидуальным прогоном, чтобы объединить наборы чтения от одного и того же человека. Всего было проанализировано 5 996 биологических образцов, что составило 16 210 запусков секвенирования.

Cenote-Taker 2 (33) использовался для проверки контигов на наличие двух общих конечных характеристик полных вирусных геномов: прямые концевые повторы (DTR) (предполагающие кольцевой или длинный концевой связанный с повторением вирусный геном) или инвертированные концевые повторы (ITR) . Последовательности с DTR были произвольно предположены, чтобы представлять кольцевые геномы ДНК. Затем последовательности сканировали на наличие «генов отличительных признаков вируса». Циркуляризованные последовательности> 1500 нуклеотидов (нуклеотидов) по меньшей мере с одним геном вирусного отличительного признака и контиги, содержащие ITR> 4000 нуклеотидов с по меньшей мере одним геном вирусного отличительного признака, были обозначены как предполагаемые вирусы.Линейные (без видимых конечных признаков) контиги> 12000 нуклеотидов с двумя или более вирусными генами-признаками также сохранялись как предполагаемые вирусы. Поскольку фаги часто интегрируются в бактериальные хромосомы, каждый линейный контиг был обрезан с помощью модуля обрезки профага Cenote-Taker 2 для удаления фланкирующих последовательностей хозяина. В результате анализа было получено более 180 000 предполагаемых вирусных последовательностей. Последовательности были классифицированы в операционные таксономические единицы (OTU) путем кластеризации со средней нуклеотидной идентичностью 95% на 85% длины контига в соответствии со стандартом, рекомендованным сообществом (54, 55) ( Materials and Methods ).Была сгенерирована окончательная база данных из 45 033 последовательностей, представляющих неизбыточные OTU вируса (рис. 1), и эта база данных в настоящем документе будет называться База данных сенотов-виромов человека (CHVD, загрузка доступна по адресу https://zenodo.org/record/4498884) (56).

Рис. 1. Показатели

CHVD. ( A ) Каждый классифицированный контиг представлен в виде точки, при этом положение оси x представляет длину контига. Ширина диаграмм скрипки представляет собой плотность последовательностей в данной позиции и пропорциональна категориям.Более крупные (> 4 т.п.н.) кольцевые Rep-кодирующие одноцепочечные ДНК [CRESS] вирусные OTU состоят из контигов в ранее описанном таксоне, который объединяет CRESS-подобные гены репликации с иновирусоподобными генами вирионов (107, 108). ( B ) Контейнеры качества генома получают из анализа CheckV, а метки участков тела получают из метаданных образца из последовательностей образца каждого OTU вируса. ( C ) Представлены данные для образцов стула, обогащенного вирионами. Чтобы измерить степень достижения обогащения вирусными последовательностями, для каждого образца рассчитывали показатель обогащения ViromeQC (32) ( x -ось).Показатель обогащения — это, по сути, обратная численность известных бактериальных генов-маркеров с одной копией. ( Top ) Пунктирные линии на верхней панели представляют собой скользящие средние значений выборок из того же исследования. Звездочки обозначают биопроекты / образцы с данными, использованными при создании CHVD. ( Bottom ) Производственные образцы удалены. Данные разделены по шкале ViromeQC, а прямоугольные диаграммы представляют значения IQR, центральные линии представляют медианы, а усы — 1,5 IQR. Модифицированная база данных, в которой последовательности были сгруппированы по 99% идентичности вместо 95% идентичности, использовалась для индекса, чтобы лучше отразить микродисперсию и метавиромные острова (109) (e.g., внутривидовые структурные вариации, состоящие из вставок / делеций генных кассет; Материалы и методы ). ( D ) Графики такие же, как у C , но для оральных препаратов вириона.

Всего 8 081 вирусный OTU состоял из контигов с DTR, а 112 были связаны ITR. Чтобы формально оценить полноту генома последовательностей OTU вируса, CheckV (55) был применен ко всему набору данных CHVD (рис. 1 B ). В общей сложности 14 034 контига (31,2%) были оценены как высококачественные (завершены от 90 до 100%), 13 234 контига (29.4%) были оценены как среднее качество (полнота от 50 до 90%), 17 270 контигов (38,3%) были оценены как фрагменты генома низкого качества (полнота от 1 до 50%), а 495 контигов (1,1%) не были -определенный.» Неопределенные контиги могут быть либо последовательностями, слишком расходящимися от ссылок CheckV, чтобы их можно было классифицировать, слишком короткими для категоризации, либо они могут быть ложноположительными. По сравнению с другими базами данных вирусов, связанных с человеческим метагеномом, такими как человеческая подгруппа IMG / VR (версии 1 и 2) (55, 57) (в которых ~ 75% контигов были оценены как фрагменты генома низкого качества или не определено) или в недавно опубликованной базе данных кишечных виромов (GVD) (13) (рис.1 B ), CHVD заселяется более высокой долей и количеством геномов вирусов высокого и среднего качества, см. Рис. 4 B .

Хотя часто бывает сложно получить очень длинные контиги вируса из сборок de novo, в ходе исследования было обнаружено 119 вирусных OTU размером более 200 килобаз (кб), самым большим из которых является Siphoviridae, видов ctpHQ1, размером 501 кб. Всего было обнаружено 33 таксона на уровне семейства или отряда, и 2087 последовательностей не могли быть классифицированы с помощью Cenote-Taker 2, что представляет собой множество непризнанных таксонов высокого уровня ( SI Приложение , рис.S1). Важно отметить, что таксономия вирусов, особенно таксономия фагов с двухцепочечной ДНК (дцДНК), в настоящее время находится в процессе изменения (54, 58⇓ – 60), и эта таксономическая статистика, вероятно, изменится по мере пересмотра таксономических группировок. Подавляющее большинство классифицированных последовательностей представляют собой фаги с хвостом дцДНК в порядке Caudovirales (включая Siphoviridae , Podoviridae , Myoviridae , Ackermannviridae , Cross-подобные вирусы Ackermannviridae и сборка вирусов, подобных Cross-A-, а также сборка вирусов, подобных вирусу Herlgeleviridae , фаг]).Было обнаружено относительно небольшое количество известных тропических вирусов человека, в том числе членов семейств Adenoviridae , Anelloviridae , Circoviridae , Herpesviridae , Caliciviridae (Human noroviridae aviridae, aviridae (Human noroviridae), Polyaviridae ), . Большинство тропических вирусов человека сопоставлено с ранее зарегистрированными видами вирусов, но было обнаружено 16 ранее не обнаруженных анелловирусов (загрузка доступна с: https: // zenodo.org / record / 4498884) (56). Набор данных S2 предоставляет информацию электронной таблицы по каждому вирусу, включая OTU, гены отличительных признаков, совпадения CRISPR (см. Рис. 2) и статистическую информацию. В общей сложности 757/5 996 биопроб были вирусоподобными библиотеками частиц, что привело к 3756 вирусным OTU в окончательной базе данных.

Рис. 2.
Сводка данных соответствия спейсеров CRISPR. ( A ) Графики представляют совпадения кодируемых бактериями спейсеров CRISPR и вирусных контигов. Категории определяются по родам бактерий (или более высокому таксону, если род четко не определен; Материалы и методы ).Отображаются только роды с 200 или более спейсерами CRISPR, совпадающими с CHVD OTU. Значения оси x представляют количество уникальных попаданий бактериального спейсера CRISPR для каждого OTU вируса. Нитчатый фаг = Inoviridae и другие нитчатые фаги (например, некоторые вирусы CRESS). ( B ) Сетевая диаграмма ландшафта взаимодействия фага с фагом на основе совпадений спейсеров CRISPR. Каждая линия представляет совпадение конкретной спейсерной последовательности с ее целевым фагом.
На рис. 1 представлена графическая сводка наблюдаемых таксонов вирусов.Один таксон, обозначенный как «Phyco-like_phage», представлен 36 контигами. Это интересная группа последовательностей, изначально связанных с Phycodnaviridae из-за отдаленного сходства гена терминазы / упаковки этих вирусов с геном, кодируемым эукариотическими фикоднавирусами (~ 30% сходства AA). Однако большинство предполагаемых структурных генов вирионов, которые совместно занимают эти контиги, отдаленно сходны с генами crAss-подобных фагов, а не фикоднавирусов, что позволяет предположить, что они представляют собой фаги.Это и тот факт, что большинство из 2087 «неклассифицированных» вирусных последовательностей имеют гены отличительных признаков вириона, соответствующие моделям фага дцДНК ( SI Приложение , рис. S1) (сетевой файл Cytoscape доступен по адресу https://zenodo.org/record/4498884 ) (56) поддерживает идею о том, что существенное разнообразие фагов остается неклассифицированным и неописанным.
Для оценки степени, в которой наблюдаемые OTU вируса CHVD уже представлены в общедоступных базах данных, Mash (61) был использован для измерения примерно внутривидового сходства нуклеотидных последовательностей с 23 386 геномами аннотированных видов вирусов, обнаруженных в GenBank.При пороговом значении расстояния затора <0,05 (~ 95% средней нуклеотидной идентичности [ANI]) 334/45 033 (0,7%) вируса CHVD имели по крайней мере одну строго родственную последовательность в GenBank (набор данных S3). Если пороговое значение расстояния затора снижено до <0,1 (∼90% ANI, 2310/45033 (5,1%) вирусы CHVD имеют родственник GenBank (набор данных S3).
Недавно Грегори и др. (13) опубликовали GVD человека с использованием различные методы обнаружения вирусов и некоторые перекрывающиеся наборы данных. CHVD, представленный в этой рукописи, содержит последовательности из нескольких участков тела человека, поэтому сравнения не идеальны.Однако мы отмечаем, что у CHVD на 35% больше контигов (45 033 против 33 242) и на 143% больше информации о последовательности (1,446 гигабаз против 0,596 гигабаз), чем у GVD. Тот же анализ расстояния затора был применен для сравнения двух наборов данных. При пороговом значении расстояния затора <0,05 5782 (12,8%) вирусных последовательностей из этого исследования имели родственные связи в GVD (совпадающие с 5614 последовательностями в GVD). Сравнивая только подмножество контигов CHVD, происходящих из кишечника, 5704/30 863 (18,5%) имели родственные GVD. При более слабом пороге (расстояние затора <0.1), 18 002 (40,0%) последовательности CHVD имели сходство с 10 996 последовательностями GVD (набор данных S4).
Карты генома для всех вирусных геномов (за исключением тех, которые были строго родственниками существующих записей) были депонированы в GenBank и им были присвоены номера доступа в ассоциации с биопроектом PRJNA573942. В соответствии с руководящими принципами NCBI файлы будут выпущены после публикации этой рукописи. Номера доступа см. В наборе данных S2.
Подавляющее большинство считываний из хорошо обогащенных препаратов вирома идентифицируемы.
Неясно, какая часть вирома человека каталогизируется CHVD. Один из способов ответить на этот вопрос — посмотреть на наборы данных, которые физически обогащены вирусными последовательностями, и определить, какая часть считываний в наборе данных идентифицируема. Считывание 983 образцов стула человека (представляющих 11 различных исследований), которые были физически обогащены вирионами и подвергнуты расщеплению нуклеазами для удаления неинкапсидированных нуклеиновых кислот, были сопоставлены с CHVD (рис.1 C , Upper ) (набор данных S5).Чтобы количественно оценить, насколько хорошо новобранцы CHVD считывают данные из ранее не проанализированных препаратов вирионов, образцы, использованные для получения CHVD, были удалены, а медиана и межквартильный диапазон были рассчитаны для различных интервалов оценки ViromeQC. Этот анализ показывает, что процент прочтений, совпадающих по шкале CHVD с оценкой обогащения ViromeQC. Плохо обогащенные (<10 баллов ViromeQC) образцы кишечника выровняли в среднем около 10% считываний, а образцы с высокими показателями обогащения (> 30) выровняли в среднем от 70 до 80%, причем многие образцы достигли 99% совпадения.
Хотя хорошо обогащенные виромные данные не были доступны для других участков тела, примерно 75% считываний можно было классифицировать в хорошо обогащенных пероральных образцах, обогащенных вирусной ДНК (рис. 1 D ) (набор данных S5).
Анализ спейсеров CRISPR выявляет потенциальных хозяев для большинства фагов, а также сети фаг-фаговой конкуренции.
Многие бактерии кодируют системы CRISPR-Cas, которые содержат массивы спейсеров CRISPR из коротких (~ 32 нуклеотидов) последовательностей, скопированных и используемых против вторжения мобильных генетических элементов, особенно фагов (62).Сопоставление бактериальных спейсерных последовательностей CRISPR с геномами фага — это один из способов определить, подвергалась ли бактериальная линия ранее действию конкретного фага. Достижения в каталогизации спейсеров CRISPR из бактериальных геномов и оптимизации конвейеров сопоставления фаг / хозяин позволили связать большинство фагов, обнаруженных в этом проекте, с бактериальными хозяевами (http://crispr.genome.ulaval.ca/) (63). В частности, 31 259 из 45 033 вирусных последовательностей имели по крайней мере один спейсер CRISPR, соответствующий известной бактерии или множеству бактерий, при этом 369 465 общих спейсеров совпадали с уникальными локусами в последовательностях CHVD (набор данных S2).Плотность спейсера CRISPR сильно различалась среди разных таксонов бактерий (рис. 2 A ). Например, было подтверждено, что представители рода Bifidobacterium имеют относительно большие и разнообразные библиотеки спейсеров CRISPR (64), в то время как Clostridium , Capnocytophaga и Leptotrichia обычно кодируют только один или несколько спейсеров на фаг.
Сами фаги могут кодировать массивы CRISPR, а некоторые фаги имеют целые и функциональные системы CRISPR-Cas (22, 65).Эти компоненты CRISPR могут быть нацелены на защиту хозяина, а также на другие фаги, конкурирующие за один и тот же хозяин (66). Среди фаговых последовательностей в CHVD, 1971 спейсер CRISPR был обнаружен в массивах из геномов 203 фагов. Из них 799 спейсеров нацелены в общей сложности на 2036 других фагов, что свидетельствует о сложных сетях фаг-фаговой конкуренции в метагеномах человека (рис. 2 B ) (загрузите файл Cytoscape с https://zenodo.org/record/4498884) (56 ). Бактериальный пул-хозяин фага, кодирующего CRISPR, и фага-мишени должны быть одинаковыми.Таким образом, бактериальные совпадения спейсеров CRISPR для пар фаг-фаг были задокументированы, и, когда бактериальный хозяин мог быть определен как для фага, кодирующего CRISPR, так и для фага-мишени, этот бактериальный род был одинаковым для 85,1% пар (набор данных S6).
Самые распространенные вирусы на нескольких участках тела.
С помощью этой библиотеки вирусов и больших усилий по отбору проб в рамках проекта Human Microbiome Project (34, 67) на вопрос, «какие вирусы наиболее распространены» для данного участка тела, можно ответить более уверенно, чем это было возможно раньше.Следует отметить, что данные Проекта микробиома человека были собраны у здоровых американцев в возрасте от 18 до 40 лет, и сделанные здесь выводы нельзя обобщить на другие группы населения.
Часто бывает сложно точно определить границу между интегрированным профагом и хромосомными последовательностями хозяина без экспериментальной проверки, что затрудняет количественную оценку вируса в наборах данных полногеномного дробовика (WGS). Наши предварительные анализы показали, что включение даже нескольких сотен нуклеотидов фланкирующей последовательности хозяина в вирусный контиг OTU может сильно исказить измерения численности из-за непреднамеренного измерения неинфицированных бактериальных последовательностей хозяина.Поэтому мы провели более строгий анализ, в котором контиги были обрезаны от первого распознаваемого гена отличительного признака вируса до последнего гена отличительного признака вируса. Удаляя часть вирусной последовательности, этот метод сохраняет наиболее нестираемые последовательности вирусного генома, почти гарантируя, что ни одна бактериальная хромосома не будет сохранена. Мы называем эти более строгие единицы «вирусными ядрами» (загрузить с https://zenodo.org/record/4498884) (56).
Данные были загружены из SRA и проанализированы для сотен пациентов на шести участках тела (передние ноздри, слизистая оболочка щеки, задний свод, спинка языка, наддесневой налет и кишечник [стул]).Затем чтения были согласованы с более строгой базой данных вирусных ядер. В качестве заместителя для относительной численности данного вирусного OTU было рассчитано среднее количество считываний на килобазу вирусного генома на миллион считываний в родительском наборе данных (RPKM) для каждой последовательности (рис.3, приложение SI, приложение , рис. S2 и S3, а также набор данных S2). Распространенность вируса определялась как доля образцов с> 0,1 об / мин. Наиболее часто встречающиеся OTU вируса рассчитывались как (среднее RPKM × распространенность). Правая панель рис.3 показан предполагаемый хост для каждой из 30 наиболее часто встречающихся вирусных OTU на основе информации о мишени спейсера CRISPR. Большинство наиболее распространенных вирусов, по-видимому, инфицируют членов общего бактериального семейства Bacteroidaceae , которые обычно широко распространены в кишечнике человека. Кроме того, несмотря на значительное увеличение количества выравниваемых вирусных последовательностей по сравнению с предыдущими исследованиями, наблюдение о том, что crAss-подобные фаги широко распространены в экосистемах кишечника человека (12), кажется, весьма убедительным.
Рис. 3.
Наиболее распространенные вирусы Стула (кишечника). ( слева, ) График разброса RPKM (мера относительного количества считываний для данного OTU вируса, y -ось) от распространенности (доля образцов с> 0,1 RPKM, x -ось). Для целей отображения ось y представляет собой линейную шкалу от 0 до 1 (10 ⁰) и log ₁₀ выше 1. 30 самых распространенных вирусных OTU (на основе произведения координат) выделены цветом. . ( Right ) Гистограмма и график значений RPKM по всем образцам для наиболее часто встречающихся вирусных OTU.Цвета точек в Left соответствуют цветам в Right . Оси x и y имеют логарифмический масштаб. Значения RPKM ниже 0,1 помещаются в интервалы на левом краю графиков для целей отображения.
Данные указывают на интересную бифуркацию в распространенности ОТЕ кишечного вируса с высокой численностью (RPKM). Хотя некоторые вирусные OTU, такие как Podoviridae sp. ctBGm1 и Siphoviridae sp. ctrxw1, присутствуют почти во всех образцах и имеют среднюю численность> 10 RPKM, возможно, представляя профаги повсеместно распространенных бактериальных клонов.Остальные, включая все отображаемые crAss-подобные вирусы и Myoviridae sp. ctNBA1, отсутствуют или малочисленны в большинстве проб, но очень распространены в меньшинстве проб. Последняя группа может представлять либо вирусы, которые периодически подвергаются большим репликативным всплескам, либо вирусы, которые конститутивно доминируют над виромом у одних людей, но не у других.
Как и ожидалось, большинство вирусных ОТЕ преобладали только на одном участке тела, но 186 «космополитических» ОТЕ имели распространенность> 0.2 (т.е. 20% образцов) по крайней мере в двух участках тела (набор данных S7). Бактериальные CRISPR нацелены на 128/186 последовательностей, из которых 36 нацелены на род Cutibacterium , 17 — на Staphylococcus , 16 — на Strepococcus и 14 — на Bacteroides .
Определенные вирусные OTU связаны с заболеванием человека.
Ряд предшествующих исследований искали связи между виромом и заболеваниями человека (27⇓ – 29, 52, 68⇓⇓⇓ – 72).Однако эти исследования были ограничены отсутствием всеобъемлющей справочной базы данных по вирусам, и почти во всех исследованиях использовались образцы, физически обогащенные вирусными последовательностями (71). Однако методы обогащения вирусов могут быть очень вариабельными (рис. 1 C ) и могут непреднамеренно удалить некоторые вирусные таксоны без существенного отбора против последовательностей хозяина (10, 32). Действительно, Грегори и др. (13) сообщают, что исследования, в которых используются разные протоколы обогащения вирусов для изучения одного и того же болезненного состояния (например,g., воспалительное заболевание кишечника) редко содержат в своих данных одни и те же популяции вирусов. Вместо этого в исследованиях с использованием аналогичных протоколов обогащения (независимо от болезненного состояния пациентов) было выявлено больше вирусных популяций. Кроме того, последовательности, инкапсидированные в вирионы, могут быть не лучшим отражением всей вирусной популяции, особенно в пищеварительном тракте человека, где многие фаги, как полагают, существуют в основном в лизогенных (нелитических) состояниях (73), а некоторые были «обоснованы», теряют способность самостоятельно вырезать из генома хозяина (74).Возможно, что наиболее важными для физиологии человека фагами являются те, которые экспрессируют вспомогательные гены из интегрированного состояния провируса, в отличие от фагов, которые продуцируют большое количество вирионов. Таким образом, идеально подходит для исследования секвенирования общей ДНК (также известного как WGS), которое может обнаружить все геномы ДНК-вирусов.
В нашем исследовании повторно проанализированы общедоступные данные WGS из 12 крупных исследований «случай-контроль», посвященных анализу стула и / или слюны (35, 41, 75–81). В этих исследованиях изучались болезнь Паркинсона, ожирение, карцинома толстой кишки, аденома толстой кишки, цирроз печени, диабет 1 типа, анкилозирующий спондилит, атеросклероз, диабет 2 типа, гипертония и неалкогольная жировая болезнь печени.База данных ядер вирусов использовалась для сравнения численности каждого ОТЕ вируса между случайными и контрольными когортами. На рис.4 показан анализ сравнения случай-контроль болезни Паркинсона (размер популяции, n = 182) (рис.4 A — C ) и ожирения (размер популяции, n = 595) (рис. .4 D — F ). RPKM использовался для измерения численности OTU вируса в каждом образце, и для каждого сравнения были проведены тесты суммы рангов Вилкоксона со 100 бутстрапами для расчета значения P (рис.4 A и D «Виром», SI Приложение , рис. S4 и S5). Статистически значимые вирусные OTU были определены по уровню ложного обнаружения <1% ( Материалы и методы, ). Во всех анализах сравнивали ассоциации между виромом и «бактериомом», измеряя бактериом с точки зрения бактериальных OTU (т. Е. Изобилия однокопийных бактериальных маркерных генов на уровне вида) с помощью IGGsearch (82) (рис. 4 A, и D). «Бактериом», SI Приложение , рис.S4 и S5). В восьми исследованиях для вирома было обнаружено большее количество статистически значимых таксонов, чем для бактериома. Четыре других проанализированных исследования не выявили значимых ОТЕ ни для вирома, ни для бактериома (рис. 4 и SI, приложение , рис. S4 и S5). Значения P для каждого OTU вируса, обнаруженного в каждом исследовании, задокументированы в наборе данных S2. Кроме того, случайные лесные классификаторы, обученные либо всем вирусным OTU, либо всем бактериальным OTU, в среднем были более успешными или одинаково успешными в различении здоровых и больных пациентов с использованием данных вирома, а не данных бактериома в 7/12 популяциях случай-контроль. (Инжир.4 B и E и SI Приложение , рис. S6 и S7).
Рис. 4.
Ассоциация вирома и бактериома с хроническими заболеваниями. ( A — C ) Анализ считанных данных из PRJEB17784, исследования образцов кала пациентов с болезнью Паркинсона или без нее. ( A ) Связи между виромами и бактериомами в образцах стула от пациентов с болезнью Паркинсона ( n = 74) и здоровых людей контрольной группы ( n = 108), представленных в виде графиков Манхэттена.Каждый OTU представлен в виде точки вдоль оси x , при этом значение оси y является значением, обратным логарифму ₁₀ P . Размер каждой точки соответствует средней относительной численности таксона в когорте болезней. Закрашенные точки представляют собой ОТЕ, обнаруженные в более высоком количестве в больном состоянии, тогда как полые точки представляют меньшее количество в больном состоянии. Пунктирная серая линия представляет уровень ложного обнаружения <1% порога. ( B ) Графики рабочих характеристик приемника из 100 случайных классификаторов лесов с разным посевом, обученных на вироме (, левый, ) или бактериом (, правый, ).( C ) Графики роя величин d-эффекта Коэна (абсолютное значение) для OTU, достигающих значимых значений P . Черные точки — это размер положительного эффекта, а красные точки — размер отрицательного эффекта. Среднее значение всех нанесенных на график размеров эффектов показано синей линией. Размер малого эффекта = от 0,2 до 0,5; средняя величина эффекта = от 0,5 до 0,8; и большая величина эффекта => 0,8 (84). ( D — F ) Аналогичный анализ считанных данных из PRJEB4336, исследования WGS образцов стула от тучных и не страдающих ожирением людей.Графики D , E и F располагаются так же, как графики A , B и C соответственно.
Важность учета размера эффекта при сообщении ассоциаций микробиома стала очевидной в последние годы (83, 84). Следовательно, для всех вирусных и бактериальных ОТЕ со значительными различиями между случаями и контрольными случаями величина эффекта d Коэна указывается для каждого болезненного состояния (Рис. 4 C и F и SI Приложение , Рис.S6 и S7).
Невозможно провести однозначное сравнение вирусных OTU и бактериальных OTU, потому что многие фаги способны инфицировать и реплицироваться у нескольких видов бактерий (85), иногда даже у нескольких родов бактерий (86), в то время как в то же время линии одного вида бактерий обладают разными способностями противостоять конкретному фагу или приобретать иммунитет к нему (87). Таким образом, изучение того, как определенные вирусные OTU могут поддерживать или снижать приспособленность определенных бактериальных OTU в индивидуальных экосистемах кишечника, выходит за рамки данного исследования.Тем не менее, может быть информативным качественное сравнение статистически значимых OTU вирусов и их предполагаемых родов бактерий-хозяев (на соответствие спейсерам CRISPR) ( SI Приложение , рис. S8). На первый взгляд, значительные вирусные OTU, на которые нацелены спейсеры CRISPR из одного и того же бактериального рода, кажутся все тренда в одном направлении и в одном направлении в отношении большинства возможных бактериальных хозяев, которые имеют значительные различия между случаями и контролями. Это согласуется с лизогенными профагами, а также с увеличением числа доступных хозяев, поддерживающих большие популяции вирусов (15).
Обсуждение
Это исследование показывает, что, используя специфические для вируса гены отличительных признаков, можно в больших масштабах анализировать метагеномные данные человека для создания базы данных, состоящей в основном из ранее неизвестных вирусных последовательностей, которая захватывает большинство считываний, генерируемых обогащенными вирионами. наборы данных из стула и слюны. Это продвижение, в свою очередь, выявило скрытые связи между различными состояниями хронических заболеваний и конкретными таксонами вирусов. Следует подчеркнуть, что ассоциация не обязательно подразумевает причинную связь, и возможны различные ассоциативные отношения между вирусами и данным болезненным состоянием.Например, изобилие вируса может быть просто эпифеноменом, отражающим изобилие бактериальных хозяев, генетика человека, предрасполагающая людей к заболеванию, может также обеспечивать более благоприятную среду для вируса или его бактериального хозяина, внешние причины болезни могут создавать более благоприятные условия. окружающая среда для вируса, или вирус может каким-то образом способствовать проявлению болезни, но в конечном итоге не вызывает заболевание в отрыве от других важных факторов. Проверка ассоциаций, которые мы обнаружили с помощью независимых исследований тех же заболеваний в дополнительных популяциях, будет ключом к пониманию степени обобщаемости представленных здесь результатов.Если ассоциации подтвердятся, можно будет экспериментально проверить вопрос о причинно-следственной связи, добавив или удалив интересующие фаги из экосистем кишечника в модельных системах на животных (88).
Ограничение анализируемых здесь исследований случай-контроль состоит в том, что они состояли только из одной временной точки для каждого субъекта. Состав вирома может быть шумным, и продольные данные по отдельным пациентам могут быть более эффективными для определения стабильных вирусных популяций (11). Эта проблема могла быть частично компенсирована использованием больших размеров когорт (в основном, более 150 пациентов).Более того, подобно тому, как отдельные бактериальные штаммы содержат множество несущественных «дополнительных генов», не общих для всех штаммов внутри бактериального вида (89), вирусные штаммы имеют уникальные наборы генов по сравнению с внутривидовыми родственниками (90), отражая вирусные пангеномы или «метавиромные». острова ». При текущем подходе большая часть содержания внутривидовых дополнительных генов не учитывается из-за дерепликации последовательности, и важность этих генов не оценивалась. Другое ограничение заключается в том, что в проанализированных исследованиях случай-контроль использовались только методы ДНК-WGS, тогда как секвенирование метатранскриптомов с помощью РНК могло предоставить больше функциональных данных об экспрессии конкретных вирусных генов, что потенциально привело к проверяемым гипотезам о возможных механизмах действия.Также возможно, что корреляции вирусов с геномами РНК будут обнаружены. Несмотря на эти ограничения, текущее исследование показывает, что при использовании случайных лесных классификаторов виром может быть более диагностическим, чем бактериом, для различных хронических заболеваний. Сильная ассоциация специфических вирусных OTU при хронических заболеваниях, наряду со средними и большими размерами эффекта для многих OTU, требует более механистического исследования возможных причинных ролей вирусов в хронических заболеваниях человека.
Хотя мы считаем, что эти усилия являются значительным шагом вперед, вполне вероятно, что CHVD можно улучшить как в глубине, так и вширь. Могут быть проанализированы метагеномы из большего количества участков тела, таких как легочный тракт (91), и могут быть использованы прогоны секвенирования, представляющие большее географическое разнообразие и разнообразие образа жизни. Кроме того, анализ дополнительных наборов метатранскриптомических данных, вероятно, обнаружит больше РНК-вирусов.
Даже с относительно всеобъемлющими критериями, используемыми Cenote-Taker 2 (различимое аминокислотное сходство вирусного гена отличительного признака с белком из вирусной базы данных RefSeq), тысячи вирусов, живущих на людях, из этого набора данных нельзя было классифицировать таксономически, что позволяет предположить что дополнительные семейства еще не идентифицированных вирусов ожидают официального обнаружения и категоризации.
Материалы и методы
Идентификация вирусных контигов в сборках.
Исследования в рамках проекта «Микробиом человека» и другие произвольно выбранные исследования метагенома человека (набор данных S1) были загружены из SRA, и были выделены уникальные биологические образцы. Все прогоны из данного Biosample были загружены одновременно, предварительно обработаны с помощью Fastp (92) и собраны вместе с Megahit (93) с использованием настроек по умолчанию. Последующие контиги передавались в Cenote-Taker 2 (https://github.com/mtisza1/Cenote-Taker2, https: // cyverse.org / discovery-environment), который, короче говоря, ищет концевые особенности генома (прямые концевые повторы и инвертированные концевые повторы), переводит гены в аминокислотные последовательности, сравнивает каждую аминокислотную последовательность со скрытой базой данных модели Маркова, состоящей из гена отличительного признака вируса выравнивания, сохраняет контиги с минимальным количеством генов, соответствующих базе данных отличительных признаков, затем идентифицирует и удаляет фланкирующие последовательности бактериальных хромосом. Затем все оставшиеся генные особенности аннотируются для создания карты генома.Cenote-Taker 2 использовался с настройками для рассмотрения кольцевых или LTR-несущих контигов (минимум 21 нт идентичных прямых повторов на концах контига) минимум 1500 нуклеотидов, ITR-содержащих контигов не менее 4 т.п.н. и линейных контигов не менее 12 кб. Эти контиги сканировали на наличие генов, соответствующих моделям вирусных отличительных признаков. Контиги, содержащие терминальные повторы, с одним или несколькими вирусными генами-отличительными чертами сохранялись, а также сохранялись линейные контиги с двумя или более вирусными отличительными генами. Для каждого прогона, независимо от того, был ли образец физически обогащен вирионами, использовался модуль обрезки профага Cenote-Taker 2.База данных генов отличительных признаков Cenote-Taker 2 была версией от 15 сентября 2020 г. (https://github.com/mtisza1/Cenote-Taker2). В то время как Cenote-Taker 2 действительно предпринимает шаги для выделения потенциальных плазмид и конъюгированных транспозонов, были предприняты дополнительные меры предосторожности, удалив около 4000 предполагаемых вирусных последовательностей из неизбыточной базы данных, которые содержали связанные с репликацией, но не гены-отличительные черты вириона или генома. Для наборов данных метатранскриптома все контиги более 1500 нуклеотидов с генами отличительных признаков РНК-вируса сохранялись как предполагаемые вирусные последовательности, независимо от конечных характеристик.
Кластеризация похожих контигов для дерепликации.
Для кластеризации геномов был использован двойной подход. Во-первых, контиги были объединены с помощью Mash (61), используя его способность обрабатывать массивные базы данных последовательностей, точность и отсутствие проблем, связанных с цикличностью генома. Все вирусы в каждом таксоне более высокого уровня (например, Microviridae ) использовались для создания эскизов Mash (параметры -k 16 -s 500), а затем эти эскизы сравнивались с самими собой с помощью функции dist Mash. Считается, что в пределах близких геномных расстояний значение шкалы расстояния Маша примерно повторяет среднюю расходимость нуклеотидов.Различия на уровне штаммов вирусов часто определяются по средней расходимости нуклеотидов <5% (54), поэтому сети сходства последовательностей были построены со связями между последовательностями (узлами) с оценкой расстояния Маша ≤0,05 (и P значение ≤1 × 10 ^{— 10}). Алгоритм марковской кластеризации (MCL-кластеризация) (94) был применен к сетям Mash для создания кластеров уровня OTU. Из каждого кластера последовательностей, если присутствовали кольцевые последовательности или последовательности, кодирующие ITR, самая длинная такая последовательность использовалась в качестве репрезентативной последовательности OTU вируса.Если присутствовали только линейные последовательности, в качестве представителя кластера использовалась самая длинная линейная последовательность. Одноэлементные контиги (то есть последовательности, которые не были назначены ни одному кластеру) также были сохранены для окончательной базы данных. Тот же подход был применен для 99% базы данных (для выравнивания последовательностей вирусоподобных частиц), но использовалась оценка расстояния затора ≤0,01.
После кластеризации Mash для окончательной дерепликации был использован подход, основанный на базовом инструменте поиска локального выравнивания (BLAST).Nucleotide BLAST (BLASTN), anicalc.py и aniclust.py использовались из набора инструментов CheckV (55), как описано в CheckV ReadMe (https://bitbucket.org/berkeleylab/checkv/src/master/), с опциями «–min_ani 95 –min_qcov 0 –min_tcov 85», используемыми для aniclust для дерепликации последовательностей в вирусные OTU при «95% средней нуклеотидной идентичности более 85% фракции выравнивания» в соответствии со стандартами сообщества (54). Лучшие репрезентативные последовательности из aniclust.py были использованы в качестве образцов OTU вируса, содержащих версию 1 CHVD.1. В будущих версиях будет дерепликация только с использованием подхода «anicalc / aniclust».
Идентификация когнитивных вирусов в GenBank и GVD человека.

Используя ресурс NCBI Virus Resource, были загружены метаданные для всех вирусных геномов, перечисленных как полные, для следующих таксонов: Adenoviridae , Anelloviridae , Bromoviridae , Caliciviridae , 9025iridae , Luteoviridae , Narnaviridae , Nodaviridae , Papillomaviridae , Polyomaviridae , Tombusviridae , Tophativiridae , неклассифицированные вирусы, вирусы , вирусы классифицированные бактериями, вирусы ).Метаданные были отсортированы таким образом, чтобы была выбрана самая длинная последовательность для каждого уникального названия вида, и эти последовательности впоследствии были загружены. Кроме того, многие геномы вирусов GenBank просто имеют семейную метку, за которой следует неопределенное сокращение «sp.», И, как результат, многие сильно различающиеся последовательности непреднамеренно имеют идентичную родовую метку. Таким образом, были загружены все полные геномы вирусов GenBank из всех неизбыточных таксонов с обозначением «sp.». Скетч Mash был создан для загруженных последовательностей с использованием опций (-k 16 -s 500), и этот эскиз Mash был сравнен с эскизом CHVD Mash (см. Clustering Similar Contigs for Dereplication ).Расстояние затора ≤0,05 и значение P ≤1 × 10 ⁻¹⁰ считались строго родственными (внутривидовыми или внутриштаммовыми) последовательностями. Расстояние затора ≤0,1 и значение P ≤1 × 10 ⁻⁵ были использованы для «рыхлых» родственных последовательностей.

GVD от Gregory et al. (13) был загружен с https://datacommons.cyverse.org/browse/iplant/home/shared/iVirus/Gregory_and_Zablocki_GVD_Jul2020/GVD_Viral_Populations. Для сравнения с этим набором данных использовались те же анализы Mash, что и с базой данных GenBank.

Депонирование вирусных геномов в GenBank.

Все последовательности из CHVD v1.1 рассматривались для депонирования в GenBank. Во-первых, были отброшены последовательности со строгими родственниками GenBank. Мы хотели минимизировать любые нависающие хромосомные последовательности из геномов профагов. Следовательно, последовательности, не кодирующие DTR (то есть линейные) (уже обрезанные с помощью модуля обрезки Cenote-Taker 2), были снова обрезаны с помощью CheckV (v 0.7.0), поскольку мы нашли этот подход более консервативным, чем Cenote-Taker 2.Эти дважды обрезанные последовательности были затем аннотированы с помощью Cenote-Taker 2 с полными метаданными, совпадениями спейсеров CRISPR и считанной информацией о покрытии. Затем соответствующие файлы «.sqn» были отправлены в GenBank как вирусные геномы «сборки TPA». Все представленные последовательности / геномы связаны с биопроектом PRJNA573942 и будут выпущены после публикации этой рукописи. Номера доступа можно найти в наборе данных S2.

Сеть обмена генами для неклассифицированных вирусов.

Vcontact2 (59, 95) был запущен с использованием всех геномов бактериофагов RefSeq v88 с рекомендованными настройками и всех вирусов из CHVD, которые были помечены как «неклассифицированные» в поле таксономии.Полученная сеть отображалась в Cytoscape (96) и раскрашивалась вручную.

Вирусных ядер.

Используя все вирусные OTU из CHVD, координаты ядра вируса были получены расчетным путем. Cenote-Taker 2 сканирует контиги на наличие генов отличительных признаков вирусов и выводит координаты для каждого гена отличительных признаков в контексте контига. Координаты остановки и начала для каждого гена отличительного признака были скомпилированы, и были взяты самые низкие и самые высокие координаты из каждого контига, и bioawk был использован для обрезки каждой нуклеотидной последовательности fasta до начала и конца с этими координатами, отбрасывая периферические последовательности.

Бактериальный анализ спейсеров CRISPR.

CrisprOpenDB (https://github.com/edzuf/CrisprOpenDB) использовался (commit 04e4ffcc55d65cf8e13afe55e081b14773a6bb70) для назначения фагов хостам на основе совпадения спейсеров CRISPR с использованием BLASTN (63). Для совпадений допускалось три несовпадения. Для попаданий в бактерии без присвоенного в настоящее время рода, таксономическая информация на уровне семейства или порядка извлекалась из выходной таблицы, когда это было возможно.

Фаговый анализ спейсеров CRISPR.

Все последовательности OTU вируса были обработаны с помощью MinCED (https://github.com/ctSkennerton/minced) для обнаружения массивов спейсеров CRISPR. Поскольку фаги могут кодировать массивы CRISPR со спейсерами длиной всего 14 нуклеотидов (97), MinCED было разрешено обнаруживать массивы со спейсерами из 14 или более нуклеотидов. Области массива CRISPR фаговых геномов были замаскированы с помощью Bedtools maskfasta (98), а затем все вирусные OTU были опрошены с помощью BLASTN по базе данных спейсеров CRISPR.

Сохранялись только совпадения, совпадающие по всей длине спейсера и со следующими критериями: точное совпадение со спейсерами от 16 до 20 нуклеотидов, совпадение со спейсерами от 20 до 27 нуклеотидов, в которых (несовпадения + пробелы) равно 1 или 0, и совпадения к спейсерам ≥ 28 нуклеотидов, в которых (несовпадения + пробелы) 2 или меньше.

Определение количества отдельных вирусных OTU в метагеномах.

Окончательная база данных последовательностей «ядра вируса» была обработана RepeatMasker для удаления областей низкой сложности, которые неспецифически рекрутируют чтение (99). Bowtie2 (100) использовался для согласования операций чтения с базой данных, а samtools (101) idxstats использовался для расчета покрытия чтения и RPKM для каждого контига.

Сравнение численности ОТЕ и дискриминационной способности в исследованиях случай-контроль.

Для каждого биопроекта, по возможности, определялись образцы по сравнению с контрольными образцами с использованием категорий из Nayfach et al.(82), поскольку пациенты, принимавшие смешанные лекарства, были исключены из этого анализа. Для других биопроектов метаданные были взяты из селектора запуска SRA (102) (набор данных S8 A — K ). Для всех образцов чтения были загружены из SRA, обрезаны и проверены с помощью Fastp (92). Для количественной оценки численности бактериальных таксонов в каждом образце был использован IGGsearch с параметрами по умолчанию, за исключением опции «–все виды» (82).

Тест суммы рангов Вилкоксона был вычислен с использованием 100 бутстрапов с использованием Python, NumPy и SciPy (103) для каждой OTU в данном исследовании, в котором не менее 10% от общего числа выборок имели RPKM не менее 0.05 (бактериальные OTU с «изобилием IGGsearch» не менее 0,005 в не менее 10% образцов сохранялись). Частота ложных открытий (<1%) была определена методом Бенджамини – Хохберга с использованием SciPy. Величина эффекта d Коэна была рассчитана для каждой OTU выше порога значимости с использованием пакета DaBest Python (104) с 5 000 бутстрапов.

Использовались классификаторы случайных лесов из scikit-learn (105). Размеры обучающего / тестового набора составляли 70% / 30%, количество оценщиков составляло 100, и для каждого из 100 классификаторов случайного леса, обученных для каждого набора данных, использовались разные начальные числа.

Бактерии, грибы и вирусы | Спросите у биолога

Вы просыпаетесь и на несколько секунд чувствуете себя хорошо. Но когда ты садишься, тебя внезапно все поражает. Ощущение заложенности в голове, насморк, жар во всем теле. Все эти симптомы являются признаками того, что ваше тело борется с инфекцией. Но как вы заразились?

Инфекция происходит, когда вы попадаете внутрь организма патогеном . Патогены являются паразитическими и выживают, забирая энергию у хозяина, внутри которого они находятся.В этом случае вы будете хозяином. Некоторые патогены также производят токсинов , которые могут навредить вам, если они будут выпущены. Так что же такое патоген?

Возможно, вам лучше распознать три распространенных вида патогенов: бактерии, вирусы и грибы. Эти три вида организмов сильно отличаются друг от друга.

Здесь мы можем сравнить человеческий волос со шкалой грибов, бактерий и вирусов.

Бактерии

Бактерии — это крошечные одноклеточные организмы, которые встречаются почти повсюду.На вашем столе, на коже, внутри вас и даже на экране компьютера есть бактерии. Большинство бактерий не являются патогенами. Это означает, что по большей части они не вызывают болезней.

На этом рисунке показаны бактерии (розовый), атакующие некоторые клетки кожи (желтый). Бактерии считаются простыми клетками, потому что у них нет ядра. Изображение предоставлено NIAID.

Однако, когда бактерия, вызывающая заболевание, попадает в ваш организм, вы можете заболеть. Иногда вы заболеете непосредственно из-за бактерий, а иногда из-за бактериального токсина.К распространенным инфекциям, вызываемым бактериями, относятся розовый глаз и ангина.

Грибок

Вы, наверное, узнали распространенный вид грибов — гриб. Однако грибы — не единственный вид грибка. На самом деле они составляют целое царство жизни, и, хотя большинство из них не вредны для человека, некоторые из них являются патогенами.

Например, грибок Epidermophyton floccosum часто вызывает заболевание стопы спортсмена. Этот гриб намного меньше знакомых нам грибов.Чтобы увидеть это, обычно нужен микроскоп.

Грибы выживают, получая энергию от других организмов. Часто они делают это, питаясь разлагающимися остатками растений. Точно так же многие грибковые патогены питаются неживыми внешними слоями нашей кожи. Именно это кормление приводит к зуду и шелушению, связанным со стопой спортсмена или стригущим лишаем.

Этот гриб, Epidermophytom floccosum , часто вызывает поражение стопы атлета. Изображение предоставлено PD-USGOV-HHS-CDC.

Некоторые грибы также производят токсины, называемые микотоксинами.Самый распространенный способ воздействия микотоксинов — это случайное употребление в пищу ядовитых грибов.

Вирусов

Вирусы — самый мелкий из распространенных возбудителей. Они настолько малы, что многие из них действительно заражают бактерии. Они отличаются от других патогенов, потому что не могут воспроизводиться сами по себе. Вирусы захватывают клетки, которые они заражают, и используют собственные процессы этой клетки для создания большего количества копий вируса. Мы называем это репликацией.

Иногда вирус может долго ждать внутри клетки, прежде чем он начнет реплицироваться.Это означает, что вы можете заболеть еще долго после контакта с вирусом. Ветряная оспа — пример распространенной вирусной инфекции, которая часто остается в спящем состоянии или остается незамеченной в организме. Varicella zoster не покидает ваше тело после выздоровления от ветряной оспы. Он остается в спящем состоянии внутри вас и может появиться снова, вызывая состояние, называемое опоясывающим лишаем, в более позднем возрасте.

Микроскопическое изображение Varicella zoster , вируса, вызывающего ветряную оспу. Изображение предоставлено PD-USGov-HHS-CDC.

Многие распространенные заболевания можно отнести к вирусным инфекциям. Грипп, простуда, бородавки и герпес — вот некоторые примеры. Простуда — это инфекция верхних дыхательных путей. Простуду могут вызывать более 200 различных вирусов. Однако грипп вызывается только тремя типами вирусов: гриппом A, B и C.

Симптомы, включающие першение в горле и заложенность носа, при простуде проявляются гораздо медленнее, чем при гриппе. Симптомы гриппа более тяжелые и обычно включают жар и озноб.У детей температура обычно выше, чем у взрослых. Расстройство желудка обычно не является признаком простуды или гриппа. Если у вас есть признаки гриппа и вы обратитесь к врачу в течение двух дней после появления симптомов, он может прописать вам противовирусные препараты. Эти лекарства могут сократить время проявления симптомов гриппа.

Люди часто путают вирусные инфекции с бактериальными, но важно различать их. Вирусные инфекции лечатся иначе, чем бактериальные.

Разное